COX7B - COX7B

COX7B
Identifikátory
AliasyCOX7B, APLCC, LSDMCA2, podjednotka cytochrom c oxidázy 7B
Externí IDOMIM: 300885 MGI: 1913392 HomoloGene: 1406 Genové karty: COX7B
Umístění genu (člověk)
X chromozom (lidský)
Chr.X chromozom (lidský)[1]
X chromozom (lidský)
Genomické umístění pro COX7B
Genomické umístění pro COX7B
KapelaXq21.1Start77,899,440 bp[1]
Konec77,907,376 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE COX7B 202110 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

1349

66142

Ensembl

ENSG00000131174

ENSMUSG00000031231

UniProt

P24311

P56393

RefSeq (mRNA)

NM_001866

NM_025379

RefSeq (protein)

NP_001857

NP_079655

Místo (UCSC)Chr X: 77,9 - 77,91 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Cytochrom c oxidáza podjednotka 7B, mitochondriální (COX7B) je enzym že u lidí je kódován COX7B gen.[4] COX7B je jaderný -kódovaná podjednotka cytochrom c oxidáza (KORMIDELNÍK). Cytochrom c oxidáza (komplex IV ) je komplex více podjednotkových enzymů, který spojuje přenos elektrony z cytochrom c na molekulární kyslík a přispívá k proton elektrochemický gradient přes vnitřní mitochondriální membrána, působící jako terminální enzym mitochondriální dýchací řetězec.[5] Pracovat s Oryzias latices spojil přerušení v COX7B s mikroftalmie s lineárním kožní léze (MLS), mikrocefalie, a mitochondriální nemoc. Klinicky mutace v COX7B byly spojeny s lineárními kožními defekty s více vrozené anomálie.[6]

Struktura

COX7B se nachází na q rameno z X chromozom v poloze 21,1 a má 3 exony.[5] The COX7B gen produkuje 9,2 kDa protein složený z 80 aminokyseliny.[7][8] COX7B je jedním z nukleárně kódovaných polypeptidových řetězců cytochrom c oxidáza (COX), a heteromerní komplex skládající se ze 3 katalytických podjednotek kódovaných mitochondriální geny a více strukturních podjednotek kódovaných jaderné geny. Protein kódovaný COX7B patří do rodiny cytochrom c oxidázy VIIb. COX7B má 24 aminokyselin tranzitní peptid doména z pozic 1-24, topologická 8 aminokyselin mitochondriální matice doména z pozic 25-32, spirálovitá, 27 aminokyselina transmembránová doména z pozic 33-59, a topologické s 21 aminokyselinami mezimembrána doména z pozic 60-80.[9][10][11][6] COX7B může mít také několik pseudogeny na chromozomech 1, 2, 20 a 22.[5]

Funkce

Cytochrom c oxidáza (COX), terminální enzym mitochondriální dýchací řetězec, katalyzuje přenos elektronů z redukovaného cytochrom c na kyslík. Mitochondriálně kódované podjednotky COX fungují v elektronový přenos, zatímco jaderně kódované podjednotky mohou být zapojeny do regulace a montáže komplexu. The COX7B nukleární gen kóduje podjednotku 7B, která je umístěna na vnitřní mitochondriální membrána ve spojení s několika dalšími proteiny zahrnujícími komplex COX. Nachází se ve všech tkáních a bylo prokázáno, že je velmi podobný bovinnímu proteinu COX VIIb.[5] Předpokládá se, že COX7B je důležitý pro sestavení a činnost COX, funkci mitochondriální dýchací řetězec a správný vývoj centrální nervový systém v obratlovců.[6][9][10]

Modelové organismy

Oryzias latices (také známý jako Medaka ) je japonská rýžová ryba, která byla použita jako a modelový organismus ve studiích COX7B. Použitím a morfolino technikou knockdown se ukázalo, že COX7B je nepostradatelný pro montáž COX, aktivitu COX a mitochondriální dýchání. Navíc down-regulace z ortolog COX7B naznačuje, že může existovat souvislost mezi dysfunkcí COX7B a mikroftalmie s lineárním kožní léze (MLS), mikrocefalie, a mitochondriální nemoc. Práce s Oryzias latices může také naznačovat evoluční konzervativní roli komplexů mitochondriálních dýchacích řetězců v centrální nervový systém rozvoj.[6]

Klinický význam

Mutace v COX7B byly spojeny s lineárními kožními defekty s více vrozené anomálie. Tato porucha je odlišnou formou aplasia cutis congenita projevující se jako více lineárních kožních defektů na obličeji a krku spojených se špatným růstem a nízký vzrůst, mikrocefalie, a obličejový dysmorfismus. Mezi další klinické vlastnosti patří mentální postižení, dystrofie nehtů srdeční abnormality, bránicová kýla, urogenitální abnormality, bledé optické disky a změněno vizuálně evokované potenciály, ageneze corpus callosum, a další centrální nervový systém abnormality.[9][10] The COX7B mutace spojené s onemocněním zahrnují c.196delC, a heterozygotní mutace vedoucí k a shifthift v exonu 3, c.41-2A> G, heterozygot spojovací mutace v novém akceptorovém místě v intron 1 a c.55C> T, heterozygot nesmyslná mutace v exonu 2. Navíc experimenty s Oryzias latices navrhnout COX7B mohou být spojeny s mikroftalmie s lineárními kožními lézemi (MLS), an X-vázaný, dominantní, muž-smrtící mitochondriální porucha.[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že COX7B má 6 binárních interakce protein-protein včetně 3 společných interakcí. GNMT, MYB, MT-CO1, HSCB a SLC25A13 bylo zjištěno, že všichni interagují s COX7B.[12]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131174 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ Sadlock JE, Lightowlers RN, Capaldi RA, Schon EA (únor 1993). "Izolace cDNA specifikující podjednotku VIIb lidské cytochrom c oxidázy". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1172 (1–2): 223–5. doi:10.1016 / 0167-4781 (93) 90301-s. PMID  8382530.
  5. ^ A b C d „Entrez Gene: COX7B cytochrome c oxidase subunit VIIb“. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  6. ^ A b C d E Indrieri A, van Rahden VA, Tiranti V, Morleo M, Iaconis D, Tammaro R, D'Amato I, Conte I, Maystadt I, Demuth S, Zvulunov A, Kutsche K, Zeviani M, Franco B (listopad 2012). „Mutace v COX7B způsobují mikroftalmii s lineárními kožními lézemi, nekonvenční mitochondriální onemocnění“. American Journal of Human Genetics. 91 (5): 942–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.09.016. PMC  3487127. PMID  23122588.
  7. ^ Yao, Daniel. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-08-06.[trvalý mrtvý odkaz ]
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  9. ^ A b C „COX7B - podjednotka cytochrom c oxidázy 7B, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen COX7B a protein“. uniprot.org. Citováno 2018-08-06. Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
  10. ^ A b C „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  11. ^ Van Kuilenburg AB, Van Beeumen JJ, Van der Meer NM, Muijsers AO (leden 1992). "Podjednotky VIIa, b, c lidské cytochrom c oxidázy. Identifikace izoforem typu" srdce "a" jater "podjednotky VIIa v lidském srdci." European Journal of Biochemistry. 203 (1–2): 193–9. doi:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb19847.x. PMID  1309697.
  12. ^ „Bylo nalezeno 6 binárních interakcí pro hledaný výraz COX7B“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-25.

externí odkazy

Další čtení

  • Lenka N, Vijayasarathy C, Mullick J, Avadhani NG (1998). Strukturální organizace a regulace transkripce jaderných genů kódujících komplex savčí cytochrom c oxidázy. Pokrok ve výzkumu nukleových kyselin a molekulární biologie. 61. 309–44. doi:10.1016 / S0079-6603 (08) 60830-2. ISBN  978-0-12-540061-9. PMID  9752724.
  • Stroh A, Kadenbach B (duben 1986). "Tkáňově specifická a druhově specifická distribuce -SH skupin v podjednotkách cytochrom c oxidázy". European Journal of Biochemistry. 156 (1): 199–204. doi:10.1111 / j.1432-1033.1986.tb09568.x. PMID  3007143.
  • Possekel S, Marsac C, Kadenbach B (srpen 1996). „Biochemická analýza fibroblastů od pacientů s Leighovým syndromem spojeným s cytochrom c oxidázou“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molekulární základ choroby. 1316 (3): 153–9. doi:10.1016/0925-4439(96)00005-1. PMID  8781533.
  • Nijtmans LG, Taanman JW, Muijsers AO, Speijer D, Van den Bogert C (červen 1998). "Shromáždění cytochrom-c oxidázy v kultivovaných lidských buňkách". European Journal of Biochemistry. 254 (2): 389–94. doi:10.1046 / j.1432-1327.1998.2540389.x. PMID  9660196.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.