AMP deamináza 2 - AMP deaminase 2

AMPD2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4NO3, 4NO5
Identifikátory
Aliasy	AMPD2, PCH9, SPG63, adenosinmonofosfát-deamináza 2
Externí ID	OMIM: 102771 MGI: 88016 HomoloGene: 2979 Genové karty: AMPD2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	109,632,053 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	108,086,651 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita hydrolázy; • vazba kovových iontů; • deaminázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita AMP deaminázy;
Buněčná složka	• buněčná složka; • cytosol;
Biologický proces	• proces biosyntézy purin ribonukleosid monofosfát; • Záchrana IMP; • metabolický proces cyklického purinového nukleotidu; • nukleotidový metabolický proces; • záchrana sloučeniny obsahující purin; • IMP biosyntetický proces; • energetická homeostáza; • AMP metabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	271
	109674
	ENSG00000116337
	ENSMUSG00000027889
	Q01433
	Q9DBT5
NM_001257360; NM_001257361; NM_001308170; NM_004037; NM_139156;
	NM_203404; NM_001368809
	NM_001289719; NM_001289720; NM_028779; NM_001346665
NP_001244289; NP_001244290; NP_001295099; NP_004028; NP_631895;
	NP_001355738
	NP_001276648; NP_001276649; NP_001333594; NP_083055
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

AMP deamináza 2 je enzym že v lidé je kódován AMPD2 gen.^[5]^[6]

Vysoké hladiny exprese AMPD2 korelují se špatným výsledkem pacienta a fenotypem proliferativního nádoru u nediferencovaného pleomorfního sarkomu (UPS). ^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116337 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027889 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Mahnke-Zizelman DK, Sabina RL (listopad 1992). "Klonování lidských cDNA izoformy E AMP deaminázy. Důkazy o třetím genu AMPD vykazujícím alternativně sestříhané 5'-exony". J Biol Chem. 267 (29): 20866–77. PMID 1400401.
^ „Entrez Gene: AMPD2 adenosinmonofosfát-deamináza 2 (izoforma L)“.
^ Orth MF, Gerke JS, Knösel T, Altendorf-Hofmann A, Musa J, Alba-Rubio R a kol. (Září 2018). „Funkční genomika identifikuje AMPD2 jako nový prognostický marker pro nediferencovaný pleomorfní sarkom“. International Journal of Cancer. doi:10.1002 / ijc.31903. PMID 30267407.

externí odkazy

Člověk AMPD2 umístění genomu a AMPD2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Bausch-Jurken MT, Mahnke-Zizelman DK, Morisaki T, Sabina RL (1992). "Molekulární klonování AMP deaminázové izoformy L. Sekvence a bakteriální exprese lidské AMPD2 cDNA". J. Biol. Chem. 267 (31): 22407–13. PMID 1429593.
Van den Bergh F, Sabina RL (1996). „Charakterizace genové exprese lidské AMP deaminázy 2 (AMPD2) odhaluje alternativní transkripty kódující variabilní N-terminální rozšíření izoformy L“. Biochem. J. 312 (Pt 2): 401–10. doi:10.1042 / bj3120401. PMC 1136276. PMID 8526848.
Mahnke-Zizelman DK, van den Bergh F, Bausch-Jurken MT a kol. (1996). "Klonování, sekvence a charakterizace lidského genu AMPD2: důkaz transkripční regulace dvěma blízko sebe umístěnými promotory". Biochim. Biophys. Acta. 1308 (2): 122–32. doi:10.1016/0167-4781(96)00089-9. PMID 8764830.
Haas AL, Sabina RL (2003). „N-terminální extenze lidského AMPD2 polypeptidu ovlivňují ATP regulaci izoformy L“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 305 (2): 421–7. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00787-3. PMID 12745092.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116337 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027889 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1400401-5] Mahnke-Zizelman DK, Sabina RL (listopad 1992). "Klonování lidských cDNA izoformy E AMP deaminázy. Důkazy o třetím genu AMPD vykazujícím alternativně sestříhané 5'-exony". J Biol Chem. 267 (29): 20866–77. PMID 1400401.

[entrez-6] „Entrez Gene: AMPD2 adenosinmonofosfát-deamináza 2 (izoforma L)“.

[7] Orth MF, Gerke JS, Knösel T, Altendorf-Hofmann A, Musa J, Alba-Rubio R a kol. (Září 2018). „Funkční genomika identifikuje AMPD2 jako nový prognostický marker pro nediferencovaný pleomorfní sarkom“. International Journal of Cancer. doi:10.1002 / ijc.31903. PMID 30267407.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]