Přenosný virus gastroenteritidy - Transmissible gastroenteritis virus

Přenosný virus gastroenteritidy
02-0042-F1.E.jpg
Elektronový mikrofotografie přenosné gastroenteritidy koronaviru (TGEV)
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Nidovirales
Rodina:Coronaviridae
Rod:Alfacoronavirus
Druh:Alfacoronavirus 1
Virus:
Přenosný virus gastroenteritidy
Izoluje[1]

Přenosný virus gastroenteritidy nebo Přenosná koronavirová gastroenteritida (TGEV) je koronavirus který infikuje prasata. Je to obaleno, pozitivní smysl, jednovláknové RNA virus který vstupuje do své hostitelské buňky vazbou na APN receptor.[2] Virus je členem rodu Alfacoronavirus podrod Tegacovirus, druh Alfacoronavirus 1.[3][4]

Mezi proteiny, které přispívají k celkové struktuře TGEV, patří hrot (S), obálka (E), membrána (M) a nukleokapsid (N). Genomická velikost koronavirů se pohybuje od přibližně 28,6 kilobází.[5] Další koronaviry, které patří k tomuto druhu Alfacoronavirus 1 jsou Kočičí koronavirus, Psí koronavirus a Virus kočičí infekční peritonitidy.

Biologie

TGEV patří do rodiny Coronaviridae rod Alfacoronavirus, druh Alfacoronavirus 1. Jedná se o obalený virus s pozitivním jednořetězcovým genomem RNA. TGEV má tři hlavní strukturní proteiny, kterými jsou fosfoprotein (N), integrální membránový protein (E1) a velký glykoprotein (E2). N protein zapouzdřuje genomovou RNA a S protein tvoří virové projekce.

3 'segment asi 8 000 nukleotidů kóduje subgenomické RNA. Zbývající část genomu kóduje virovou replikázu. Tři největší genové sekvence od 5 'do 3' jsou v řádu E2 až E1 až N. Existuje asi sedm dalších otevřených čtecích rámců, které nejsou strukturálně příbuzné. Mezi geny existuje jen velmi málo přesahů a je hustě zabaleno. Negativní řetězec je syntetizován, aby sloužil jako templát pro transkripci RNA o velikosti jednoho genomu a několika RNA o velikosti subgenomu.

Protein E2 tvoří z povrchu viru projekci ve tvaru okvětního lístku o délce 20 nm. Předpokládá se, že protein E2 se podílí na patogenezi tím, že pomáhá viru vstoupit do hostitelské cytoplazmy. Protein E2 má zpočátku 1447 zbytků a poté je štěpena krátká hydrofobní sekvence. Po glykosylaci proteinu v golgi se protein inkorporuje do nového viru. V proteinu E2 je několik funkčních domén. Hydrofobní segment se 20 zbytky na C-konci ukotví protein v lipidové membráně. Zbytek proteinu je rozdělen na dvě části, hydrofilní úsek, který je uvnitř viru, a úsek bohatý na cysteiny, což jsou možná místa mastné acylace. Protein E1 je většinou uložen v lipidovém obalu, a proto hraje zásadní roli v architektuře viru. Předpokládá se, že protein E1 interaguje s membránou lymfocytů, což vede k indukci genů kódujících IFN.

Koronaviry vstupují do hostitele nejprve připojením k hostitelské buňce pomocí špičkového glykoproteinu. S protein interaguje s prasečí aminopeptidázou N (pAPN), buněčným receptorem, aby napomohl jeho vstupu. Stejný buněčný receptor je také kontaktním místem pro lidské koronaviry. Doména v proteinu S spike je rozpoznávána pomocí pAPN a dochází k transfekci pAPN do nepermisivních buněk a infikuje je TGEV.

Morfologie

Morfologie TGEV byla většinou stanovena technikami elektronové mikroskopie. Morfologie je podobná myxoviru a onkogennímu viru v tom, že mají povrchové projekce a obal. Viry mají převážně kruhový tvar s průměrem v rozmezí od 100 do 150 nm včetně povrchových projekcí. Projekce byly hlavně ve tvaru okvětních lístků připevněné velmi úzkou stopkou. Projekce se zdály být velmi snadno oddělitelné od viru a byly k dispozici pouze ve vybraných oblastech.

Patologie

TGEV infikuje prasata. U selat mladších než 1 týden se úmrtnost blíží 100%. Patologie TGEV je podobná jako u jiných koronavirů. Jakmile virus infikuje hostitele, množí se v buněčné výstelce tenkého střeva, což vede ke ztrátě absorpčních buněk, což vede ke zkrácení klků. Infikované prasata pak mají sníženou schopnost trávení potravy a umírají na dehydrataci.[6]

Výskyt

TGE převládala v USA, když byla původně objevena na počátku 20. století. Koncem 80. let se stal vzácnějším s nárůstem prasečího respiračního koronaviru (PRCV). Předpokládá se, že PRCV poskytuje určitou imunitu vůči TGE.[7]

Inženýrský TGEV koronavirus

Přenosný virus gastroenteritidy byl vytvořen jako expresní vektor. Vektor byl zkonstruován nahrazením neesenciálního 3a a 3b ORF, který je řízen sekvencemi regulujícími transkripci (TRS) zeleným fluorescenčním proteinem. Výsledný konstrukt byl stále enteropatogenní, ale se sníženým růstem. Infekce buněk tímto pozměněným virem vyvolává specifickou laktogenní imunitní odpověď proti heterolognímu proteinu. Použití tohoto vektoru je ve vývoji vakcíny nebo dokonce genové terapie. Motivací pro vytvoření genomu TGEV je, že koronaviry mají velké genomy, takže mají prostor pro inzerci cizích genů. Koronaviry také infikují dýchací trakt a mohou být použity k zacílení antigenů na tuto oblast a generování určité imunitní odpovědi.

Viz také

Reference

  1. ^ „9. zpráva ICTV (2011) Coronaviridae". Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 26. ledna 2019. Alfacoronavirus 1 Přenosný virus gastroenteritidy Přenosný virus gastroenteritidy virulentní Purdue [AJ271965] (TGEV virulent Purdue) Názvy druhů jsou psány kurzívou; názvy poddruhů a izolátů jsou psány latinkou. Seznam přístupových čísel [] a přiřazené zkratky () jsou také uvedeny.
  2. ^ Fehr AR, Perlman S (2015). Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). „Koronaviry: přehled jejich replikace a patogeneze“. Metody v molekulární biologii. Springer. 1282: 1–23. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN  978-1-4939-2438-7. PMC  4369385. PMID  25720466. Viz tabulka 1.
  3. ^ Woo, Patrick C. Y .; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P .; Yuen, Kwok-Yung (24. srpna 2010). „Koronavirová genomika a bioinformatická analýza“. Viry. 2 (8): 1804–1820. doi:10,3390 / v2081803. ISSN  1999-4915. PMC  3185738. PMID  21994708. Obrázek 2. Fylogenetická analýza RNA-závislých RNA polymeráz (Pol) koronavirů s dostupnými úplnými genomovými sekvencemi. Strom byl sestrojen metodou sousedního spojení a zakořeněn pomocí polyproteinu viru Breda.
  4. ^ „Prohlížeč taxonomie (Alphacoronavirus 1)“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 29. února 2020.
  5. ^ Thiel V, ed. (2007). Koronaviry: Molekulární a buněčná biologie (1. vyd.). Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-16-5.[stránka potřebná ]
  6. ^ Harris, D. L. Hank. „Přenosná gastroenteritida u prasat“. Veterinární příručka Merck. Merck. Citováno 7. července 2019.
  7. ^ Přeshraniční a vznikající nemoci zvířat. Iowská státní univerzita. 2016. ISBN  978-0-9846270-5-9.

Interní odkazy

externí odkazy