PSME3 - PSME3

PSME3
Identifikátory
Aliasy	PSME3, HEL-S-283, Ki, PA28-gama, PA28G, PA28gamma, REG-GAMMA, podjednotka aktivátoru proteazomu 3
Externí ID	OMIM: 605129 MGI: 1096366 HomoloGene: 2111 Genové karty: PSME3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	42,843,760 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	101,323,537 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba p53; • Vazba proteinů rodiny MDM2 / MDM4; • aktivita aktivátoru endopeptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• membrána; • komplex aktivátoru proteazomu; • nukleoplazma; • komplex proteazomu; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• regulace katabolického procesu proteinu proteinu; • regulace buněčného metabolismu aminokyselin; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I, TAP-dependentní; • regulace stability mRNA; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy; • polyubikvitinace bílkovin; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • Kaskáda MAPK; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • Signalizace NIK / NF-kappaB; • buněčný cyklus; • komplexně závislý katabolický proces podporující anafázu; • Signální dráha receptoru T buněk; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • apoptotický proces; • Signální dráha Wnt, dráha polarity planárních buněk; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • deubikvitinace bílkovin; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • transmembránová doprava; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • posttranslační modifikace; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha; • regulace fázového přechodu mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10197
	19192
	ENSG00000131467
	ENSMUSG00000078652
	P61289
	P61290
	NM_001267045; NM_005789; NM_176863; NM_001330229
	NM_011192
	NP_001253974; NP_001317158; NP_005780; NP_789839
	NP_035322
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu aktivátor proteazomu 3 je protein že u lidí je kódován PSME3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Proteasom 26S je multikatalytický proteinázový komplex s vysoce uspořádanou strukturou složenou ze 2 komplexů, jádra 20S a regulátoru 19S. Jádro 20S se skládá ze 4 kruhů po 28 neidentických podjednotkách; 2 kruhy se skládají ze 7 alfa podjednotek a 2 kruhy se skládají ze 7 beta podjednotek. Regulátor 19S se skládá ze základny, která obsahuje 6 podjednotek ATPázy a 2 podjednotky jiné než ATPázy, a víka, které obsahuje až 10 podjednotek jiných než ATPázy. Proteazomy jsou distribuovány v eukaryotických buňkách při vysoké koncentraci a štěpí peptidy procesem závislým na ATP / ubikvitinu nelyzozomální cestou. Základní funkcí modifikovaného proteazomu, imunoproteasomu, je zpracování MHC peptidů I. třídy. Imunoproteasom obsahuje alternativní regulátor, označovaný jako regulátor 11S nebo PA28, který nahrazuje regulátor 19S. Byly identifikovány tři podjednotky (alfa, beta a gama) regulátoru 11S. Tento gen kóduje gama podjednotku regulátoru 11S. Šest gama podjednotek se spojí a vytvoří homohexamerický kruh. Byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

PSME3 bylo prokázáno komunikovat s P53^[7] a Mdm2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131467 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078652 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Albertsen HM, Smith SA, Mazoyer S, Fujimoto E, Stevens J, Williams B, Rodriguez P, Cropp CS, Slijepcevic P, Carlson M (prosinec 1994). "Fyzická mapa a kandidátské geny v oblasti BRCA1 na chromozomu 17q12-21". Nat Genet. 7 (4): 472–9. doi:10.1038 / ng0894-472. PMID 7951316. S2CID 11075629.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PSME3 proteazom (prosom, makropain) aktivátor podjednotka 3 (PA28 gama; Ki)“.
^ ^A ^b Zhang Z, Zhang R (březen 2008). „Proteazomový aktivátor PA28 gama reguluje p53 zvýšením jeho degradace zprostředkované MDM2“. EMBO J.. 27 (6): 852–64. doi:10.1038 / emboj.2008.25. PMC 2265109. PMID 18309296.

Další čtení

Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). "Struktura a funkce proteazomů 20S a 26S". Annu. Biochem. 65: 801–47. doi:10.1146 / annurev.bi.65.070196.004101. PMID 8811196.
Goff SP (2003). „Smrt deaminací: nový systém omezení hostitele pro HIV-1“. Buňka. 114 (3): 281–3. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID 12914693. S2CID 16340355.
Nikaido T, Shimada K, Shibata M, Hata M, Sakamoto M, Takasaki Y, Sato C, Takahashi T, Nishida Y (1990). „Klonovací a nukleotidová sekvence cDNA pro antigen Ki, vysoce konzervovaný jaderný protein detekovaný pomocí sér od pacientů se systémovým lupus erythematodes“. Clin. Exp. Immunol. 79 (2): 209–14. doi:10.1111 / j.1365-2249.1990.tb05180.x. PMC 1534747. PMID 1968796.
Miki Y, Swensen J, Shattuck-Eidens D, Futreal PA, Harshman K, Tavtigian S, Liu Q, Cochran C, Bennett LM, Ding W (1994). „Silný kandidát na gen pro citlivost na rakovinu prsu a vaječníků BRCA1“. Věda. 266 (5182): 66–71. Bibcode:1994Sci ... 266 ... 66M. doi:10.1126 / science.7545954. PMID 7545954.
Harshman K, Bell R, Rosenthal J, Katcher H, Miki Y, Swenson J, Gholami Z, Frye C, Ding W, Dayananth P (1995). „Srovnání metod pozičního klonování použitých k izolaci genu BRCA1“. Hučení. Mol. Genet. 4 (8): 1259–66. doi:10,1093 / hmg / 4,8,1259. PMID 7581362.
Jacob A, Kandpal G, Patanjali SR, Kandpal RP (1995). „Molekulární klonování a vzor exprese genů z oblasti 470 kB poblíž lokusu BRCA1 na chromozomu 17q21“. Onkogen. 11 (5): 981–6. PMID 7675458.
Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). „HIV-1 tat inhibuje proteasom 20 S a jeho aktivaci zprostředkovanou regulátorem 11 S“. J. Biol. Chem. 272 (13): 8145–8. doi:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID 9079628.
Kandil E, Kohda K, Ishibashi T, Tanaka K, Kasahara M (1997). "Podjednotky PA28 myšího proteazomu: primární struktury a chromozomální lokalizace genů". Imunogenetika. 46 (4): 337–44. doi:10,1007 / s002510050281. PMID 9218537. S2CID 22101213.
McCusker D, Jones T, Sheer D, Trowsdale J (1998). "Genetické vztahy genů kódujících lidské podjednotky proteazomu beta a komplex proteazomu PA28". Genomika. 45 (2): 362–7. doi:10.1006 / geno.1997.4948. PMID 9344661.
Knowlton JR, Johnston SC, Whitby FG, Realini C, Zhang Z, Rechsteiner M, Hill CP (1998). "Struktura aktivátoru proteazomu REGalpha (PA28alpha)". Příroda. 390 (6660): 639–43. Bibcode:1997 Natur.390..639K. doi:10.1038/37670. PMID 9403698. S2CID 4309279.
Kohda K, Ishibashi T, Shimbara N, Tanaka K, Matsuda Y, Kasahara M (1998). „Charakterizace rodiny komplexu genů myšího aktivátoru PA28: kompletní organizace tříčlenných genů a fyzická mapa přibližně 150 kb oblasti obsahující geny alfa- a beta-podjednotky“. J. Immunol. 160 (10): 4923–35. PMID 9590240.
Madani N, Kabat D (1998). „Endogenní inhibitor viru lidské imunodeficience v lidských lymfocytech je překonán virovým proteinem Vif“. J. Virol. 72 (12): 10251–5. doi:10.1128 / JVI.72.12.10251-10255.1998. PMC 110608. PMID 9811770.
Wójcik C, Tanaka K, Paweletz N, Naab U, Wilk S (1999). "Proteazomový aktivátor (PA28) podjednotky, alfa, beta a gama (Ki antigen) v NT2 neuronálních prekurzorových buňkách a HeLa S3 buňkách". Eur. J. Cell Biol. 77 (2): 151–60. doi:10.1016 / s0171-9335 (98) 80083-6. PMID 9840465.
Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (1998). "Důkaz pro nově objevený buněčný fenotyp anti-HIV-1". Nat. Med. 4 (12): 1397–400. doi:10.1038/3987. PMID 9846577. S2CID 25235070.
Mulder LC, Muesing MA (2000). „Degradace HIV-1 integrázy cestou N-end pravidla“. J. Biol. Chem. 275 (38): 29749–53. doi:10,1074 / jbc.M004670200. PMID 10893419.
Araya R, Takahashi R, Nomura Y (2002). „Kvasinkový dvouhybridní screening využívající konstitutivně aktivní kaspázu-7 jako návnadu při identifikaci PA28gammy jako efektorového kaspázového substrátu“. Buněčná smrt se liší. 9 (3): 322–8. doi:10.1038 / SJ.CDD.4400949. PMID 11859414.
Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (2002). „Izolace lidského genu, který inhibuje infekci HIV-1 a je potlačena virovým proteinem Vif“. Příroda. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002 Natur.418..646S. doi:10.1038 / nature00939. PMID 12167863. S2CID 4403228.
Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (2002). „Místo RTP sdílené proteinem HIV-1 Tat a podjednotkou alfa regulátoru 11S je zásadní pro jejich účinky na funkci proteazomu včetně zpracování antigenu.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 771–82. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00998-1. PMID 12419264.

externí odkazy

PSME3 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
PSME3 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131467 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078652 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7951316-5] Albertsen HM, Smith SA, Mazoyer S, Fujimoto E, Stevens J, Williams B, Rodriguez P, Cropp CS, Slijepcevic P, Carlson M (prosinec 1994). "Fyzická mapa a kandidátské geny v oblasti BRCA1 na chromozomu 17q12-21". Nat Genet. 7 (4): 472–9. doi:10.1038 / ng0894-472. PMID 7951316. S2CID 11075629.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PSME3 proteazom (prosom, makropain) aktivátor podjednotka 3 (PA28 gama; Ki)“.

[pmid18309296-7] A ^b Zhang Z, Zhang R (březen 2008). „Proteazomový aktivátor PA28 gama reguluje p53 zvýšením jeho degradace zprostředkované MDM2“. EMBO J.. 27 (6): 852–64. doi:10.1038 / emboj.2008.25. PMC 2265109. PMID 18309296.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Komplex proteazomové endopeptidázy podjednotky (ES 3.4.25.1)
A (alfa podjednotky)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (beta podjednotky)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
C (ATPázy)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (jiné než ATPázy)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (aktivační podjednotky)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (inhibiční podjednotka)	PSMF1