PSME2 - PSME2 - Wikipedia

PSME2
Identifikátory
Aliasy	PSME2„PA28B, PA28beta, REGbeta, podjednotka aktivátoru proteazomu 2
Externí ID	OMIM: 602161 MGI: 1096365 HomoloGene: 86889 Genové karty: PSME2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	24,147,570 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	55,591,113 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita aktivátoru endopeptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • komplex aktivátoru proteazomu; • nukleoplazma; • komplex proteazomu; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• pozitivní regulace aktivity endopeptidázy; • regulace katabolického procesu proteinu proteinu; • regulace buněčného metabolismu aminokyselin; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I, TAP-dependentní; • regulace stability mRNA; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • polyubikvitinace bílkovin; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • Kaskáda MAPK; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • Signalizace NIK / NF-kappaB; • komplexně závislý katabolický proces podporující anafázu; • Signální dráha receptoru T buněk; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • Signální dráha Wnt, dráha polarity planárních buněk; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • deubikvitinace bílkovin; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • transmembránová doprava; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • posttranslační modifikace; • interleukin-12 zprostředkovaná signální dráha; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha; • regulace fázového přechodu mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5721
	19188
	ENSG00000100911; ENSG00000284889
	ENSMUSG00000079197
	Q9UL46
	P97372
	NM_002818
	NM_001029855; NM_011190
	NP_002809
	NP_001268401; NP_001025026; NP_035320
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu aktivátor proteazomu 2 je protein že u lidí je kódován PSME2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Proteasom 26S je multikatalytický proteinázový komplex s vysoce uspořádanou strukturou složenou ze 2 komplexů, jádra 20S a regulátoru 19S. Jádro 20S se skládá ze 4 kruhů po 28 neidentických podjednotkách; 2 kruhy se skládají ze 7 alfa podjednotek a 2 kruhy se skládají ze 7 beta podjednotek. Regulátor 19S se skládá ze základny, která obsahuje 6 podjednotek ATPázy a 2 podjednotky jiné než ATPázy, a víka, které obsahuje až 10 podjednotek jiných než ATPázy. Proteazomy jsou distribuovány v eukaryotických buňkách při vysoké koncentraci a štěpí peptidy procesem závislým na ATP / ubikvitinu nelyzozomální cestou. Základní funkcí modifikovaného proteazomu, imunoproteasomu, je zpracování MHC peptidů I. třídy. Imunoproteasom obsahuje alternativní regulátor, označovaný jako regulátor 11S nebo PA28, který nahrazuje regulátor 19S. Byly identifikovány tři podjednotky (alfa, beta a gama) regulátoru 11S. Tento gen kóduje beta podjednotku regulátoru 11S, jednu ze dvou podjednotek 11S, která je indukována gama-interferonem. Tři beta a tři alfa podjednotky se spojí a vytvoří heterohexamerický kruh. Na chromozomech 4, 5, 8, 10 a 13 bylo identifikováno šest pseudogenů.^[6]

Interakce

PSME2 bylo prokázáno komunikovat s PSME1.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000284889 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100911, ENSG00000284889 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079197 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ahn JY, Tanahashi N, Akiyama K, Hisamatsu H, Noda C, Tanaka K, Chung CH, Shibmara N, Willy PJ, Mott JD (červenec 1995). „Primární struktury dvou homologních podjednotek PA28, aktivátoru proteinu indukovatelného gama interferonem proteasomu 20S“. FEBS Lett. 366 (1): 37–42. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00492-R. PMID 7789512.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PSME2 proteazom (prozom, makropain) aktivační podjednotka 2 (PA28 beta)“.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
^ Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (červenec 1996). "Charakterizace regulátoru proteazomu PA28 in vivo". J. Biol. Chem. 271 (30): 18237–42. doi:10.1074 / jbc.271.30.18237. PMID 8663520.

Další čtení

Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). "Struktura a funkce proteazomů 20S a 26S". Annu. Biochem. 65: 801–47. doi:10.1146 / annurev.bi.65.070196.004101. PMID 8811196.
Sijts A, Sun Y, Janek K, Kral S, Paschen A, Schadendorf D, Kloetzel PM (2002). "Role proteazomového aktivátoru PA28 při zpracování antigenu MHC třídy I". Mol. Immunol. 39 (3–4): 165–9. doi:10.1016 / S0161-5890 (02) 00099-8. PMID 12200048.
Goff SP (2003). „Smrt deaminací: nový systém omezení hostitele pro HIV-1“. Buňka. 114 (3): 281–3. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID 12914693.
Dubiel W, Pratt G, Ferrell K, Rechsteiner M (1992). "Čištění regulátoru 11 S multikatalytické proteázy". J. Biol. Chem. 267 (31): 22369–77. PMID 1429590.
Mott JD, Pramanik BC, Moomaw CR, Afendis SJ, DeMartino GN, Slaughter CA (1995). „PA28, aktivátor proteazomu 20 S, je složen ze dvou neidentických, ale homologních podjednotek“. J. Biol. Chem. 269 (50): 31466–71. PMID 7989312.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (1996). "In vivo charakterizace regulátoru proteazomu PA28". J. Biol. Chem. 271 (30): 18237–42. doi:10.1074 / jbc.271.30.18237. PMID 8663520.
Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). „HIV-1 tat inhibuje proteasom 20 S a jeho aktivaci zprostředkovanou regulátorem 11 S“. J. Biol. Chem. 272 (13): 8145–8. doi:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID 9079628.
McCusker D, Jones T, Sheer D, Trowsdale J (1998). "Genetické vztahy genů kódujících lidské podjednotky proteazomu beta a komplex proteazomu PA28". Genomika. 45 (2): 362–7. doi:10.1006 / geno.1997.4948. PMID 9344661.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hendil KB, Khan S, Tanaka K (1998). „Současná vazba aktivátorů PA28 a PA700 na 20 S proteazomů“. Biochem. J. 332 (Pt 3) (Pt 3): 749–54. PMC 1219536. PMID 9620878.
Madani N, Kabat D (1998). „Endogenní inhibitor viru lidské imunodeficience v lidských lymfocytech je překonán virovým proteinem Vif“. J. Virol. 72 (12): 10251–5. PMC 110608. PMID 9811770.
Wójcik C, Tanaka K, Paweletz N, Naab U, Wilk S (1999). "Proteazomový aktivátor (PA28) podjednotky, alfa, beta a gama (Ki antigen) v NT2 neuronálních prekurzorových buňkách a HeLa S3 buňkách". Eur. J. Cell Biol. 77 (2): 151–60. doi:10.1016 / s0171-9335 (98) 80083-6. PMID 9840465.
Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (1998). "Důkaz pro nově objevený buněčný fenotyp anti-HIV-1". Nat. Med. 4 (12): 1397–400. doi:10.1038/3987. PMID 9846577.
McCusker D, Wilson M, Trowsdale J (1999). "Organizace genů kódujících lidské aktivátory proteazomu PA28alpha a beta". Imunogenetika. 49 (5): 438–45. doi:10,1007 / s002510050517. PMID 10199920.
Tanahashi N, Murakami Y, Minami Y, Shimbara N, Hendil KB, Tanaka K (2000). „Hybridní proteazomy. Indukce interferonem gama a příspěvek k proteolýze závislé na ATP“. J. Biol. Chem. 275 (19): 14336–45. doi:10.1074 / jbc.275.19.14336. PMID 10799514.
Mulder LC, Muesing MA (2000). „Degradace HIV-1 integrázy cestou N-end pravidla“. J. Biol. Chem. 275 (38): 29749–53. doi:10,1074 / jbc.M004670200. PMID 10893419.
Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (2002). „Izolace lidského genu, který inhibuje infekci HIV-1 a je potlačena virovým proteinem Vif“. Příroda. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002 Natur.418..646S. doi:10.1038 / nature00939. PMID 12167863.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000284889 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100911, ENSG00000284889 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079197 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7789512-5] Ahn JY, Tanahashi N, Akiyama K, Hisamatsu H, Noda C, Tanaka K, Chung CH, Shibmara N, Willy PJ, Mott JD (červenec 1995). „Primární struktury dvou homologních podjednotek PA28, aktivátoru proteinu indukovatelného gama interferonem proteasomu 20S“. FEBS Lett. 366 (1): 37–42. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00492-R. PMID 7789512.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PSME2 proteazom (prozom, makropain) aktivační podjednotka 2 (PA28 beta)“.

[pmid16189514-7] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

[pmid8663520-8] Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (červenec 1996). "Charakterizace regulátoru proteazomu PA28 in vivo". J. Biol. Chem. 271 (30): 18237–42. doi:10.1074 / jbc.271.30.18237. PMID 8663520.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Komplex proteazomové endopeptidázy podjednotky (ES 3.4.25.1)
A (alfa podjednotky)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (beta podjednotky)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
C (ATPázy)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (jiné než ATPázy)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (aktivační podjednotky)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (inhibiční podjednotka)	PSMF1