PSME4 - PSME4 - Wikipedia

PSME4
Identifikátory
Aliasy	PSME4, PA200, podjednotka aktivátoru proteazomu 4
Externí ID	OMIM: 607705 MGI: 2143994 HomoloGene: 113742 Genové karty: PSME4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	53,970,993 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	30,880,361 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita aktivátoru peptidázy; • vázání histonu na lysin-acetylovaný; • vazba proteazomu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderná skvrna; • komplex proteazomu; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • komplexní komplex proteazomu; • komplex spermatoproteasomu;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • regulace buněčného metabolismu aminokyselin; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I, TAP-dependentní; • regulace stability mRNA; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • polyubikvitinace bílkovin; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • Kaskáda MAPK; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • pozitivní regulace aktivity peptidázy; • vývoj mnohobuněčných organismů; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • Signalizace NIK / NF-kappaB; • spermatogeneze; • komplexně závislý katabolický proces podporující anafázu; • Signální dráha receptoru T buněk; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • Oprava DNA; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • Signální dráha Wnt, dráha polarity planárních buněk; • katabolický proces proteinu nezávislý na ubikvitinu; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • deubikvitinace bílkovin; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • spermatogeneze, výměna chromozomálních proteinů; • transmembránová doprava; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • posttranslační modifikace; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha; • regulace fázového přechodu mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23198
	103554
	ENSG00000068878
	ENSMUSG00000040850
	Q14997
	Q5SSW2
	NM_014614
	NM_134013
	NP_055429
	NP_598774
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu aktivátor proteazomu 4 je protein že u lidí je kódován PSME4 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000068878 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040850 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (prosinec 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0041-KIAA0080) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 1 (5): 223–9. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.
^ Ustrell V, Hoffman L, Pratt G, Rechsteiner M (červenec 2002). „PA200, aktivátor jaderného proteazomu zapojený do opravy DNA“. Časopis EMBO. 21 (13): 3516–25. doi:10.1093 / emboj / cdf333. PMC 126083. PMID 12093752.
^ „Entrez Gene: PSME4 proteazom (prosome, makropain) aktivační podjednotka 4“.

Další čtení

Goff SP (srpen 2003). „Smrt deaminací: nový systém omezení hostitele pro HIV-1“. Buňka. 114 (3): 281–3. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID 12914693. S2CID 16340355.
Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (březen 1997). „HIV-1 tat inhibuje proteasom 20 S a jeho aktivaci zprostředkovanou regulátorem 11 S“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (13): 8145–8. doi:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID 9079628.
Madani N, Kabat D (prosinec 1998). „Endogenní inhibitor viru lidské imunodeficience v lidských lymfocytech je překonán virovým proteinem Vif“. Journal of Virology. 72 (12): 10251–5. doi:10.1128 / JVI.72.12.10251-10255.1998. PMC 110608. PMID 9811770.
Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (prosinec 1998). "Důkaz pro nově objevený buněčný fenotyp anti-HIV-1". Přírodní medicína. 4 (12): 1397–400. doi:10.1038/3987. PMID 9846577. S2CID 25235070.
Mulder LC, Muesing MA (září 2000). „Degradace HIV-1 integrázy cestou N-end pravidla“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (38): 29749–53. doi:10,1074 / jbc.M004670200. PMID 10893419.
Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (srpen 2002). „Izolace lidského genu, který inhibuje infekci HIV-1 a je potlačena virovým proteinem Vif“. Příroda. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002 Natur.418..646S. doi:10.1038 / nature00939. PMID 12167863. S2CID 4403228.
Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (listopad 2002). „Místo RTP sdílené proteinem HIV-1 Tat a podjednotkou alfa regulátoru 11S je zásadní pro jejich účinky na funkci proteazomu včetně zpracování antigenu.“ Journal of Molecular Biology. 323 (4): 771–82. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00998-1. PMID 12419264.
Gaddis NC, Chertova E, Sheehy AM, Henderson LE, Malim MH (květen 2003). „Komplexní vyšetření molekulárního defektu virionů typu 1 viru lidské imunodeficience s deficiencí vif“. Journal of Virology. 77 (10): 5810–20. doi:10.1128 / JVI.77.10.5810-5820.2003. PMC 154025. PMID 12719574.
Lecossier D, Bouchonnet F, Clavel F, Hance AJ (květen 2003). "Hypermutace HIV-1 DNA v nepřítomnosti proteinu Vif". Věda. 300 (5622): 1112. doi:10.1126 / science.1083338. PMID 12750511. S2CID 20591673.
Zhang H, Yang B, Pomerantz RJ, Zhang C, Arunachalam SC, Gao L (červenec 2003). „Cytidindeamináza CEM15 indukuje hypermutaci v nově syntetizované DNA HIV-1“. Příroda. 424 (6944): 94–8. Bibcode:2003 Natur.424 ... 94Z. doi:10.1038 / nature01707. PMC 1350966. PMID 12808465.
Mangeat B, Turelli P, Caron G, Friedli M, Perrin L, Trono D (červenec 2003). „Široká antiretrovirová obrana lidským APOBEC3G smrtící editací rodících se reverzních transkriptů“. Příroda. 424 (6944): 99–103. Bibcode:2003 Natur.424 ... 99 mil. doi:10.1038 / nature01709. PMID 12808466. S2CID 4347374.
Harris RS, Bishop KN, Sheehy AM, Craig HM, Petersen-Mahrt SK, Watt IN, Neuberger MS, Malim MH (červen 2003). „Deaminace DNA zprostředkovává vrozenou imunitu vůči retrovirové infekci“. Buňka. 113 (6): 803–9. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00423-9. PMID 12809610. S2CID 544971.
Harris RS, Sheehy AM, Craig HM, Malim MH, Neuberger MS (červenec 2003). „Deaminace DNA: nejen spouštěč diverzifikace protilátek, ale také mechanismus obrany proti retrovirům“. Přírodní imunologie. 4 (7): 641–3. doi:10.1038 / ni0703-641. PMID 12830140. S2CID 5549252.
Gu Y, Sundquist WI (červenec 2003). "Dobré pro CU". Příroda. 424 (6944): 21–2. Bibcode:2003 Natur.424 ... 21G. doi:10.1038 / 424021a. PMID 12840737. S2CID 4430569.
Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, Navarro F, König R, Bollman B, Münk C, Nymark-McMahon H, Landau NR (červenec 2003). "Druhově specifické vyloučení APOBEC3G z virionů HIV-1 podle Vif". Buňka. 114 (1): 21–31. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00515-4. PMID 12859895. S2CID 1789911.
KewalRamani VN, Coffin JM (srpen 2003). „Virologie. Zbraně mutační destrukce“. Věda. 301 (5635): 923–5. doi:10.1126 / science.1088965. PMID 12920286. S2CID 82480782.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000068878 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040850 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7584044-5] Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (prosinec 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0041-KIAA0080) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 1 (5): 223–9. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.

[pmid12093752-6] Ustrell V, Hoffman L, Pratt G, Rechsteiner M (červenec 2002). „PA200, aktivátor jaderného proteazomu zapojený do opravy DNA“. Časopis EMBO. 21 (13): 3516–25. doi:10.1093 / emboj / cdf333. PMC 126083. PMID 12093752.

[entrez-7] „Entrez Gene: PSME4 proteazom (prosome, makropain) aktivační podjednotka 4“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Komplex proteazomové endopeptidázy podjednotky (ES 3.4.25.1)
A (alfa podjednotky)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (beta podjednotky)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
C (ATPázy)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (jiné než ATPázy)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (aktivační podjednotky)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (inhibiční podjednotka)	PSMF1