Chorismát lyáza - Chorismate lyase
v enzymologie, a chorismát lyáza (ES 4.1.3.40 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
| Chorismát lyáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 4.1.3.40 | ||||||||
| Číslo CAS | 157482-18-3 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
- chorismát 4-hydroxybenzoát + pyruvát
Reakce katalyzovaná chorismát pyruvát lyázou (CPL).
Tento enzym tedy jeden má Podklad, chorismát a dva produkty, 4-hydroxybenzoát a pyruvát.
Tento enzym patří do rodiny lyázy konkrétně oxokyselinové lyázy, které štěpí vazby uhlík-uhlík. The systematické jméno této třídy enzymů je chorismát pyruvát-lyáza (tvořící 4-hydroxybenzoát). Mezi další běžně používaná jména patří CL, CPL, a UbiC.
Tento enzym katalýzy první krok dovnitř biosyntéza ubichinonu odstranění pyruvátu z chorismátu za vzniku 4-hydroxybenzoátu v Escherichia coli a další Gramnegativní bakterie.[1] Jeho činnost nevyžaduje kov kofaktory.[2]
Aktivita[3]
| Chorismát lyáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 chorismate lyase s produktem, rozlišení 1,0 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Chor_lyase | ||||||||
| Pfam | PF04345 | ||||||||
| Pfam klan | CL0122 | ||||||||
| InterPro | IPR007440 | ||||||||
| SCOP2 | 1jd3 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Katalytická aktivita
- Chorismát = 4HB + pyruvát[4]
- Tento enzym má optimální pH při 7,5
Enzymatická aktivita
Blokováno:
- Vanilka
- 4-hydroxybenzaldehyd
- Kyselina 3-karboxylmethylaminmethyl-4-hydroxybenzoová
- 4HB - ubiC je inhibován produktem reakce, o kterém se vědci domnívají, že slouží jako kontrolní mechanismus pro cestu
Cesta
Použitá cesta se nazývá cesta biosyntézy ubichinonu, katalyzuje první krok v biosyntéze ubichinonu v E-coli. Ubichinon je lipidem rozpustný koenzym přenášející elektrony. Jsou základními nosiči elektronů u prokaryot a jsou nezbytné v aerobních organismech k dosažení ATP.[1]
Nomenklatura[3]
Existuje několik různých názvů pro chorismate lyase. také se nazývá chorismát pyruvát lyáza (tvořící 4-hydroxybenzoát) a také se zkracuje několika různými způsoby: CPL, CL a ubiC. Někdy se jí říká ubiC, protože to je genové jméno. Tento enzym patří do třídy lyáz; konkrétněji ox-kyselina-lyáza nebo uhlík-uhlík-lyázy.
- taxonomická linie: bakterie → proteobakterie → gammaproteobakterie → enterobacteriales → enterobacteriaceae → escherichia → escherichia coli
Struktura[3]
Tento enzym je monomer. Jeho sekundární struktura obsahuje šroubovice, obraty a beta vlákna.
- Má hmotnost 18 777 daltonů
- Jeho sekvence je 165 aminokyselin dlouhá
Závazné stránky
- pozice: 35 (M)
- pozice: 77 (R)
- pozice: 115 (L)
Mutageneze[3]
- poloha: 91- G → A; zvyšuje inhibici produktu o 40%. Žádný vliv na afinitu substrátu.
- poloha: 156 - E → K; ztráta činnosti
Reference
- ^ Nichols BP, Green JM (srpen 1992). "Klonování a sekvenování Escherichia coli ubiC a čištění chorismát lyázy". J. Bacteriol. 174 (16): 5309–16. doi:10.1128 / jb.174.16.5309-5316.1992. PMC 206367. PMID 1644758.
- ^ Siebert M, Severin K, Heide L (duben 1994). „Tvorba 4-hydroxybenzoátu v Escherichia coli: charakterizace genu ubiC a jeho kódovaného enzymu chorismát pyruvát-lyáza“. Mikrobiologie. 140 (4): 897–904. doi:10.1099/00221287-140-4-897. PMID 8012607.
- ^ A b C d „UniprotID: P26602“.
- ^ „EC 4.1.3.40“.
Další čtení
- Nichols BP, Green JM (1992). "Klonování a sekvenování Escherichia coli ubiC a čištění chorismát lyázy". J. Bacteriol. 174 (16): 5309–16. doi:10.1128 / jb.174.16.5309-5316.1992. PMC 206367. PMID 1644758.
- Siebert M, Severin K, Heide L (1994). „Tvorba 4-hydroxybenzoátu v Escherichia coli: charakterizace genu ubiC a jeho kódovaného enzymu chorismát pyruvát-lyáza“. Mikrobiologie. 140 (4): 897–904. doi:10.1099/00221287-140-4-897. PMID 8012607.
- Meganathan R (2001). "Biosyntéza ubichinonu v mikroorganismech". FEMS Microbiol. Lett. 203 (2): 131–9. doi:10.1111 / j.1574-6968.2001.tb10831.x. PMID 11583838.
| Tento EC 4.1 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |