TRNAIle-lysidinsyntáza - TRNAIle-lysidine synthase - Wikipedia

TRNAIle-lysidinsyntáza
Identifikátory
EC číslo6.3.4.19
Číslo CAS635304-92-6
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum

TRNAIle-lysidinsyntáza (ES 6.3.4.19, TilS, mesJ (gen), yacA (gen), isoleucinově specifický transfer ribonukleát lysidinsyntetáza, tRNAIle-lysidinsyntetáza) je enzym s systematické jméno L-lysin: (tRNAIle2) -cytidin34 ligáza (tvořící AMP).[1][2][3][4][5] Tento enzym katalýzy následující chemická reakce

[tRNAIle2] -cytidin34 + L-lysin + ATP [tRNAIle2] -lysidin34 + AMP + difosfát + H2Ó

Bakteriální enzym modifikuje kolísavý základ CAU antikodon tRNAIle na oxoskupině v poloze 2 cytidinu34.

Reference

  1. ^ Ikeuchi Y, Soma A, Ote T, Kato J, Sekine Y, Suzuki T (červenec 2005). "molekulární mechanismus syntézy lysidinu, který určuje identitu tRNA a rozpoznávání kodonů". Molekulární buňka. 19 (2): 235–46. doi:10.1016 / j.molcel.2005.06.007. PMID  16039592.
  2. ^ Salowe SP, Wiltsie J, Hawkins JC, Sonatore LM (duben 2009). „Katalytická flexibilita tRNAIle-lysidinsyntetázy může generovat alternativní tRNA substráty pro isoleucyl-tRNA syntetázu“. The Journal of Biological Chemistry. 284 (15): 9656–62. doi:10,1074 / jbc.M809013200. PMC  2665086. PMID  19233850.
  3. ^ Nakanishi K, Fukai S, Ikeuchi Y, Soma A, Sekine Y, Suzuki T, Nureki O (květen 2005). „Strukturální základ pro tvorbu lysidinu pomocí ATP pyrofosfatázy doprovázené lysinově specifickou smyčkou a doménou rozpoznávající tRNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (21): 7487–92. doi:10.1073 / pnas.0501003102. PMC  1140429. PMID  15894617.
  4. ^ Soma A, Ikeuchi Y, Kanemasa S, Kobayashi K, Ogasawara N, Ote T, Kato J, Watanabe K, Sekine Y, Suzuki T (září 2003). „Enzym modifikující RNA, který řídí jak kodonové, tak aminokyselinové specificity isoleucinové tRNA“. Molekulární buňka. 12 (3): 689–98. doi:10.1016 / s1097-2765 (03) 00346-0. PMID  14527414.
  5. ^ Nakanishi K, Bonnefond L, Kimura S, Suzuki T, Ishitani R, Nureki O (říjen 2009). "Strukturální základ pro věrnost translace zajištěný přenosovou RNA lysidinsyntetázou". Příroda. 461 (7267): 1144–8. doi:10.1038 / nature08474. PMID  19847269.

externí odkazy