Seznam míst štěpení restrikčními enzymy: A - List of restriction enzyme cutting sites: A - Wikipedia
| Legenda o nukleové báze | |
|---|---|
| Kód | Nukleotid zastoupeny |
| A | Adenin (A) |
| C | Cytosin (C) |
| G | Guanine (G) |
| T | Tymin (T) |
| N | A, C, G nebo T |
| M | A nebo C. |
| R | A nebo G. |
| Ž | A nebo T |
| Y | C nebo T |
| S | C nebo G. |
| K. | G nebo T |
| H | A, C nebo T |
| B | C, G nebo T. |
| PROTI | A, C nebo G |
| D | A, G nebo T |
Tento článek obsahuje seznam restrikčních enzymů, jejichž názvy začínají písmenem A a mají jasně definované místo pro řezání.
U každého enzymu jsou uvedeny následující informace:
- Název restrikčního enzymu: Přijatý název molekula, v souladu s mezinárodně přijatými nomenklatura,[1][2] a bibliografické odkazy. Poznámka: Při abecedě jsou enzymy nejprve řazeny abecedně podle zkratek (vše před římskou číslicí); potom jsou enzymy dané zkratky řazeny abecedně podle římské číslice, přičemž s číslicí se zachází jako s číslem a ne s řetězcem písmen. To pomáhá udržovat hierarchicky seřazené položky a zároveň abecední.(Další čtení: viz část „Nomenklatura „v článku“Restrikční enzym ".)
- PDB kód: Kód používaný k identifikaci struktury proteinu v PDB databáze proteinových struktur. 3D atomová struktura proteinu poskytuje velmi cenné informace pro pochopení intimních detailů jeho mechanismu působení.[3][4]
- REBASE Číslo: Číslo použité k identifikaci restrikčních enzymů v REBASE databáze restrikčních enzymů. Tato databáze obsahuje důležité informace o enzymu, jako je Sekvence rozpoznávání, zdroj a Isoschizomery, jakož i další údaje, například komerční dodavatelé enzymu.
- Zdroj: Organismus, který přirozeně produkuje enzym.
- Sekvence rozpoznávání: Sekvence DNA rozpoznávaná enzymem, na kterou se specificky váže.
- Střih: Zobrazí místo řezu a vzor a produkty řezu. The sekvence rozpoznávání a místo řezu se obvykle shoduje, ale někdy může být místo řezu několik desítek nukleotidů od místa rozpoznávání.[5][6]
- Isoschizomery a neoschizomery: An isoschizomer je restrikční enzym který rozpozná stejnou sekvenci jako další. A neoschizomer je speciální typ isoschizomeru, který rozpoznává stejnou sekvenci jako jiný, ale dělí se jiným způsobem. U každého enzymu je uveden maximální počet 8–10 nejběžnějších isoschizomerů, ale může jich být mnohem více. Neoschizomery jsou zobrazeny tučným a zeleným písmem (např .: BamHI). Když je uvedeno „Žádné od [datum]“, znamená to, že k tomuto datu nebyly v databázích zaregistrovány žádné isoschizomery s jasně definovaným místem řezání. Isoschizomery označené bílým písmem a šedým pozadím odpovídají enzymům, které nejsou uvedeny v aktuálních seznamech, jako v tomto neuvedeném enzymu: Abc123I
Restrikční enzymy
A
| Enzym | PDB kód | REBASE Číslo | Zdroj | Sekvence rozpoznávání | Střih | Isoschizomery |
|---|---|---|---|---|---|---|
| AaaI | 1 | Acetobacter aceti | 5 'CGGCCG 3 'GCCGGC | 5 '--- C. GGCCG --- 3 ' 3 '--- GCCGG C --- 5 ' | BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, SenPT16I, XmaIII | |
| AagI | 4 | Achromobacter agilní | 5 'ATCGAT 3 'TAGCTA | 5 '--- AT CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC TA --- 5 ' | BanIII, BavCI, Bsa29I, BseCI, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI | |
| AanI | 15358 | Arthrobacter aurescens RFL2 | 5 'TTATAA 3 'AATATT | 5 '--- TTA TAA --- 3 ' 3 '--- AAT ATT --- 5 ' | PsiI, Csp1BORF7380P | |
| AarI[7] | 2892 | Arthrobacter aurescens SS2-322 | 5 'CACCTGC 3 'GTGGACG | 5 '--- CACCTGCN3N NNNN --- 3 ' 3 '--- GTGGACGN3NNNNN --- 5' | Žádné od května 2010 | |
| AasI | 5465 | Arthrobacter aurescens RFL3 | 5 'GACN6VOP 3 'CTGN6CAG | 5 '--- GACNNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNNCAG --- 5 ' | DrdI, DseDI | |
| AATI[8] | 6 | Acetobacter aceti | 5 'AGGCCT 3 'TCCGGA | 5 '--- AGG CCT --- 3 ' 3 '--- TCC GGA --- 5 ' | AspMI, Eco147I, Eco1524I, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SteI | |
| AATII[8][9][10][11] | 7 | Acetobacter aceti | 5 'GACGTC 3 'CTGCAG | 5 '--- GACGT C --- 3 ' 3 '--- C. TGCAG --- 5 ' | Ssp5230I, ZraI | |
| AauI | 3010 | Arthrobacter aurescens | 5 'TGTACA 3 'ACATGT | 5 '--- T. GTACA --- 3 ' 3 '--- ACATG T --- 5 ' | BsmRI, Bsp1407I, BsrGI, BstAUI, Ssp4800I, SspBI | |
| AbaI | 3029 | Azospirillum brasilense UQ 1796 | 5 'TGATCA 3 'ACTAGT | 5 '--- T. GATCA --- 3 ' 3 '--- ACTAG T --- 5 ' | BclI, BsiQI, BspXII, BstT7I, FbaI, Ksp22I, ParI | |
| AbeI | 3097 | Azotobacter beijerinckii Slo 54-028 | 5 'CCTCAGC 3 'GGAGTCG | 5 '--- CC TCAGC --- 3 ' 3 '--- GGAGT CG --- 5 ' | BbvCI | |
| Abbr | 8 | Azospirillum brasilense | 5 'CTCGAG 3 'GAGCTC | 5 '--- C. TCGAG --- 3 ' 3 '--- GAGCT C --- 5 ' | BluI, BspAAI, BssHI, EscI, PaeR7I, SciI, Sfr274I, Sol10179I, StrI, TliI | |
| AbsI | 14594 | Arthrobacter sp. 7M06 | 5 'CCTCGAGG 3 'GGAGCTCC | 5 '--- CC TCGAGG --- 3 ' 3 '--- GGAGCT CC --- 5 ' | Žádné od 4. dubna 2019 | |
| ACCI[12][13][14][15] | 18 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'GTMKAC 3 'CAKMTG | 5 '--- GT MKAC --- 3 ' 3 '--- CAKM TG --- 5 ' | FblI, XmiI | |
| ÚLOHA[12][16] | 19 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'CGCG 3 'GCGC | 5 '--- CG CG --- 3 ' 3 '--- GC GC --- 5 ' | Bsh1236I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, MvnI, SelI, BceBI, BepI, Bpu95I | |
| Příloha III[17] | 20 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- T. CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC T --- 5 ' | Aor13HI, BbvAIII, BlfI, BseAI, BsiMI, BspEI, CauB3I, Kpn2I, MroI, PtaI | |
| Acc16I | 2638 | Acinetobacter calcoaceticus 16 | 5 'TGCGCA 3 'ACGCGT | 5 '--- TGC GCA --- 3 ' 3 '--- ACG CGT --- 5 ' | AosI, AviII, FdiII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I | |
| Acc36I[18] | 4162 | Acinetobacter calcoaceticus 36 | 5 'ACCTGC 3 'TGGACG | 5 '--- ACCTGCN3N NNNN --- 3 ' 3 '--- TGGACGN3NNNNN --- 5' | BfuAI, BspMI, BveI | |
| Acc65I[19] | 14 | Acinetobacter calcoaceticus 65 | 5 'GGTACC 3 'CCATGG | 5 '--- G. GTACC --- 3 ' 3 '--- CCATG G --- 5 ' | AhaB8I, Asp718I, KpnI, SthI | |
| Acc113I | 2665 | Acinetobacter calcoaceticus 113 | 5 'AGTACT 3 'TCATGA | 5 '--- AGT ZÁKON --- 3 ' 3 '--- TCA TGA --- 5 ' | AssI, BmcAI, Bpa34I, DpaI, Eco255I, RflFII, ScaI, ZrmI | |
| AccB1I | 15 | Acinetobacter calcoaceticus B1 | 5 'GGYRCC 3 'CCRYGG | 5 '--- G. GYRCC --- 3 ' 3 '--- CCRYG G --- 5 ' | BanI, BbvBI, BshNI, BspT107I, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I | |
| AccB2I | 2666 | Acinetobacter calcoaceticus B2 | 5 'RGCGCY 3 'YCGCGR | 5 '--- RGCGC Y --- 3 ' 3 '--- Y CGCGR --- 5 ' | BfoI, Bme142I, Bsp143II, BstH2I, HaeII, LpnI | |
| AccB7I[20] | 16 | Acinetobacter calcoaceticus B7 | 5 'CCAN5TGG 3 'GGTN5ACC | 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 ' 3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' | AcpII, Asp10HII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I | |
| AccBSI[21] | 2733 | Acinetobacter calcoaceticus BS | 5 'CCGCTC 3 'GGCGAG | 5 '--- CCG CTC --- 3 ' 3 '--- GGC GAG --- 5 ' | BsrBI, BstD102I, Bst31NI, MbiI | |
| AccEBI | 17 | Acinetobacter calcoaceticus EBF 65/65 | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G. GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AsiI, BamHI, Bce751I, Bsp98I, BspAAIII, CelI, OkrAI, Uba4009I | |
| AceI | 2571 | Anabaena cedrorum | 5 'GCWGC 3 'CGWCG | 5 '--- G. CWGC --- 3 ' 3 '--- CGWC G --- 5 ' | ApeKI, SuiI, Taq52I, TseI | |
| AceII | 2570 | Anabaena cedrorum | 5 'GCTAGC 3 'CGATCG | 5 '--- GCTAG C --- 3 ' 3 '--- C. GATCG --- 5 ' | AsuNHI, BmtI, BspOI, , LlaG2I, Ne, PstNHI | |
| AceIII | 2569 | Anabaena cedrorum | 5 'CAGCTC 3 'GTCGAG | 5 '--- CAGCTCN5N NNNN --- 3 ' 3 '--- GTCGAGN5NNNNN --- 5' | - Žádné od května 2010 - | |
| AciI[11][22] | 21 | Arthrobacter citreus | 5 'CCGC 3 'GGCG | 5 '--- C. CGC --- 3 ' 3 '--- GGC G --- 5 ' | SsiI | |
| AclI[23] | 2181 | Acinetobacter calcoaceticus M4 | 5 'AACGTT 3 'TTGCAA | 5 '--- AA CGTT --- 3 ' 3 '--- TTGC AA --- 5 ' | Psp1406I | |
| AclNI | 2667 | Acinetobacter calcoaceticus N20 | 5 'ACTAGT 3 'TGATCA | 5 '--- A CTAGT --- 3 ' 3 '--- TGATC A --- 5 ' | AhlI, BcuI, SpeI | |
| AclWI | 2668 | Acinetobacter calcoaceticus W2131 | 5 'GGATC 3 'CCTAG | 5 '--- GGATCN3N N --- 3 ' 3 '--- CCTAGN3NN --- 5' | AlwI, BinI, BpuFI, BsrWI, BspPI, BstH9I, Bst31TI, EacI, Ral8I | |
| AcoI | 11822 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'YGGCCR 3 'RCCGGY | 5 '--- Y GGCCR --- 3 ' 3 '--- RCCGG Y --- 5 ' | EaeI, Bfi89I, CfrI, EcoHK31I | |
| AcpI | 22 | Acidiphilium cryptum 25H | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- TT CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | Asp10HI, Bpu14I, Bsp119I, BstBI, Csp45I, FspII, MlaI, NspV, SspRFI | |
| AcpII | 23 | Acidiphilium cryptum 25H | 5 'CCAN5TGG 3 'GGTN5ACC | 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 ' 3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' | AccB7I, Asp10HII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I | |
| AcrII | 25 | Anabaenopsis circleis | 5 'GGTNACC 3 'CCANTGG | 5 '--- G. GTNACC --- 3 ' 3 '--- CCANTG G --- 5 ' | AspAI, Bse64I, BseT9I, BstEII, BstPI, Eco91I, EcoO65I, PspEI | |
| AcsI[24] | 2184 | Arthrobacter citreus 310 | 5 'RAATTY 3 'YTTAAR | 5 '--- R AATTY --- 3 ' 3 '--- YTTAA R --- 5 ' | ApoI, CfaI, FsiI, XapI | |
| AcuI | 5534 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'CTGAAG 3 'GACTTC | 5 '--- CTGAAGN13NNN --- 3' 3 '--- GACTTCN13N NN --- 5 ' | BspKT5I, Eco57I | |
| AcvI | 5359 | Aeromonas caviae | 5 'CACGTG 3 'GTGCAC | 5 '--- CAC GTG --- 3 ' 3 '--- GTG CAC --- 5 ' | BbrPI, BcoAI, Eco72I, PmaCI, PmlI, PspCI | |
| AcyI[25] | 31 | Anabaena cylindrica | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AhaII, AosII, BbiII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, Hsp92I, Msp17I | |
| AdeI | 2991 | Alcaligenes denitrificans Ss 3-028 | 5 'CACNNNGTG 3 'GTGNNNCAC | 5 '--- CACNNN GTG --- 3 ' 3 '--- GTG NNNCAC --- 5 ' | BstIZ316I, DraIII | |
| AeuI | 33 | Achromobacter eurydice | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | AglI, AjnI, BseBI, BstNI, BstOI, Bst2UI, EcoRII, SleI, SspAI | |
| AfaI[26] | 37 | Acidiphilium facilis 28H | 5 'GTAC 3 'CATG | 5 '--- GT AC --- 3 ' 3 '--- CA TG --- 5 ' | Csp6I, CviQI, CviRII, HpyBI, PabI, PlaAII, RsaI, RsaNI | |
| Afa16RI | 34 | Acidiphilium sp. 16R | 5 'CGATCG 3 'GCTAGC | 5 '--- CGAT CG --- 3 ' 3 '--- GC TAGC --- 5 ' | Afa22MI, BspCI, EagBI, MvrI, NblI, Ple19I, PvuI, Psu161I, RshI, XorII | |
| Afa22MI | 35 | Acidocella facilis | 5 'CGATCG 3 'GCTAGC | 5 '--- CGAT CG --- 3 ' 3 '--- GC TAGC --- 5 ' | Afa16RI, BspCI, EagBI, ErhB9I, NblI, Ple19I, Psu161I, PvuI, RshI | |
| Dobře[27] | 2669 | Alcaligenes faecalis T2774 | 5 'AGCGCT 3 'TCGCGA | 5 '--- AGC GCT --- 3 ' 3 '--- TCG CGA --- 5 ' | AitI, Aor51H, Eco47III, FunI | |
| AfiI | 10489 | Anoxybacillus flavithermus | 5 'CCN7GG 3 'GGN7CC | 5 '--- CCNNNNN NNGG --- 3 ' 3 '--- GGNN NNNNNCC --- 5 ' | Bsc4I, BseLI, BslI, BflI, Bsc107I, BsiYI, Bst22I | |
| AflI[28] | Anabaena flos-aquae | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G. GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | Asp745I, BamNI, BcuAI, CauI, Csp68KI, DsaIV, Eco47I, SinI | ||
| AflII[28][29][30] | 39 | Anabaena flos-aquae | 5 'CTTAAG 3 'GAATTC | 5 '--- C. TTAAG --- 3 ' 3 '--- GAATT C --- 5 ' | BfrI, BspTI, Bst98I, BstAFI, BstPZ740I, Esp4I, MspCI, Vha464I | |
| AflIII[28][10] | 40 | Anabaena flos-aquae | 5 'AKRYGT 3 'TGYRCA | 5 '--- A CRYGT --- 3 ' 3 '--- TGYRC A --- 5 ' | Asp90I | |
| Věk I.[11][31] | 42 | Agrobacterium gelatinovorum | 5 'ACCGGT 3 'TGGCCA | 5 '--- A CCGGT --- 3 ' 3 '--- TGGCC A --- 5 ' | AsiAI, AsiGI, BshTI, CsiAI, CspAI, PinAI | |
| AglI[32] | 6652 | Arthrobacter globiformis | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | AeuI, Bse16I, Bse17I, Bse24I, BshGI, EcoRII, SleI, SniI, SslI | |
| AgsI | Agrococcus sp. 25 | 5 'TTSAA 3 'AASTT | 5 '--- TTS AA --- 3 ' 5 '--- AA STT --- 3 ' | Žádné ze dne 4. května 2019 | ||
| AhaI | 45 | Alteromonas haloplanktis B8 | 5 'CCSGG 3 'GGSCC | 5 '--- CC SGG --- 3 ' 3 '--- GGS CC --- 5 ' | Všechny, BcnI, BpuMI, Běh, Eco1831I, EcoHI, HgiS22I, NciI | |
| AhaII | Aphanothece halophytica | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AstWI, AsuIII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, HgiDI, HgiHII, PamII | ||
| AhaIII[14][29][30][33] | Aphanothece halophytica | 5 'TTTAAA 3 'AAATTT | 5 '--- TTT AAA --- 3 ' 3 '--- AAA TTT --- 5 ' | DraI, PauII, SruI | ||
| AhaB8I | Aphanothece halophytica B8 | 5 'GGTACC 3 'CCATGG | 5 '--- G. GTACC --- 3 ' 3 '--- CCATG G --- 5 ' | Acc65I, Asp718I, KpnI, SthI | ||
| AhdI[34][35] | Aeromonas hydrophila | 5 'GACN5VOP 3 'CTGN5CAG | 5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 ' | AspEI, BmeRI, BspOVI, DriI, Eam1105I, EclHKI, NruGI | ||
| AhlI | 4838 | Alteromonas haloplanktis SP | 5 'ACTAGT 3 'TGATCA | 5 '--- A CTAGT --- 3 ' 3 '--- TGATC A --- 5 ' | AclNI, BcuI, SpeI | |
| AhyI | 49 | Aeromonas hydrophila | 5 'CCCGGG 3 'GGGCCC | 5 '--- C. CCGGG --- 3 ' 3 '--- GGGCC C --- 5 ' | Cfr9I, CfrJ4I, EaeAI, EclRI, PaeBI, SmaI, TspMI, XmaI, XmaCI | |
| AitI | 54 | Aquaspirillum itersonii | 5 'AGCGCT 3 'TCGCGA | 5 '--- AGC GCT --- 3 ' 3 '--- TCG CGA --- 5 ' | AfeI, Aor51H, Eco47III, FunI | |
| AjiI | 10919 | Acinetobacter johnsonii RFL47 | 5 'CACGTC 3 'GTGCAG | 5 '--- CAC GTC --- 3 ' 3 '--- GTG CAG --- 5 ' | BmgBI, BtrI | |
| AjnI | 7185 | Acinetobacter johnsonii R2 | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5' --- CCWGG --- 3 ' 3 '--- GGWCC --- 5' | AorI, ApaORI, ApyI, EcoRII, MvaI, Psp6I, PspGI, SleI, SspAI | |
| AjoI | 2604 | Acinetobacter johnsonii 35 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G. ACGTC --- 5 ' | ApiI, BloHII, BspMAI, CfrA4I, CfuII, PstI, SalPI, SflI, Srl5DI | |
| AjuI | 7740 | Acinetobacter junii RFL46 | 5 'GAAN7TTGG 3'CTTN7AACC | 5 '--- NNNNN NN6GAAN7TTGGN5NNNNNN --- 3' 3' --- NNNNNNN6CTTN7AACCN5N NNNNN --- 5 ' | Žádné k 28. říjnu 2020 | |
| AleI | 5791 | Aureobacterium liquefaciens | 5 'CACN4GTG 3 'GTGN4CAC | 5 '--- CACNN NNGTG --- 3 ' 3 '--- GTGNN NNCAC --- 5 ' | OliI | |
| AlfI | 6110 | Acinetobacter lwoffii BH 32 | 5 'GCAN6TGC 3 'CGTN6ACG | 5 '--- GCAN6TGCN9NNN --- 3' 3 '--- CGTN6ACGN9N NN --- 5 ' | Žádné od května 2010 | |
| AliI | Acetobacter liquefaciens | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G. GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AccEBI, BamHI, Bce751I, Bsp98I, BspAAIII, Nsp29132II, Pfl8I | ||
| AliAJI | 59 | Acetobacter liquefaciens AJ 2881 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G. ACGTC --- 5 ' | ApiI, Asp713I, BspMAI, CflI, CstI, MhaAI, PstI, SalPI, Sst12I, YenI | |
| AloI[36][37] | 2812 | Acinetobacter lwoffii KS 4-8 | 5 'GAACN6TCC 3 'CTTGN6AGG | 5 '--- GAACN6TCCN6NNNNNN --- 3' 3 '--- CTTGN6AGGN6N NNNNN --- 5 ' | Žádné od května 2010 | |
| AluI[12][14][38][39][40][41] | 61 | Arthrobacter luteus | 5 'AGCT 3 'TCGA | 5 '--- AG CT --- 3 ' 3 '--- TC GA --- 5 ' | AluBI, MltI | |
| AluBI | 16189 | Arthrobacter luteus B | 5 'AGCT 3 'TCGA | 5 '--- AG CT --- 3 ' 3 '--- TC GA --- 5 ' | AluI, MltI | |
| AlwI | 65 | Acinetobacter lwoffii | 5 'GGATC 3 'CCTAG | 5 '--- GGATCN3N N --- 3 ' 3 '--- CCTAGN3NN --- 5' | AclWI, BinI, BspPI, BsrWI, BstH9I, BthII, Bth617I, EacI | |
| Alw21I | Acinetobacter lwoffii RFL21 | 5 'GWGCWC 3 'CWCGWG | 5 '--- GWGCW C --- 3 ' 3 '--- C. WCGWG --- 5 ' | AspHI, Bbv12I, Bsh45I, BsiHKAI, Bsm6I, HgiAI, MspV281I | ||
| Alw26I[42] | 63 | Acinetobacter lwoffii RFL26 | 5 'GTCTC 3 'CAGAG | 5 '--- GTCTCN NNNN --- 3 ' 3 '--- CAGAGNNNNN --- 5' | BcoDI, BscQII, BsmAI, BsoMAI, BstMAI | |
| Alw44I | Acinetobacter lwoffii RFL44 | 5 'GTGCAC 3 'CACGTG | 5 '--- G. TGCAC --- 3 ' 3 '--- CACGT G --- 5 ' | Apali, SnoI, VneI | ||
| AlwNI[43] | Acinetobacter lwoffii N | 5 'CAGNNNCTG 3 'GTCNNNGAG | 5 '--- CAGNNN CTG --- 3 ' 3 '--- VOP NNNGAC --- 5 ' | CaiI | ||
| AlwXI | 67 | Acinetobacter lwoffii X | 5 'GCAGC 3 'CGTCG | 5 '--- GCAGCN7N NNNN --- 3 ' 3 '--- CGTCGN7NNNNN --- 5' | BbvI, BseKI, BseXI, Bsp423I, Bst12I, Bst71I, BstV1I | |
| Ama87I | Alteromonas macleodii 87 | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- C. YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | AQUI, AvaI, BmeT110I, BsiHKCI, BsoBI, Eco88I, Nli3877I, NspSAI | ||
| AmaCSI | 26714 | Arthrospira maxima CS-328 | 5 'GCTCCA 3 'CGAGGT | 5 '--- GCTCCAN8NNN --- 3' 3 '--- CGAGGTN8N NN --- 5 ' | Žádné ze dne 4. května 2018 | |
| AocI | 74 | Anabaena sp. | 5 'CCTNAGG 3 'GGANTCC | 5 '--- CC TNAGG --- 3 ' 3 '--- GGANT CC --- 5 ' | AyI, Bse21I, Bsu36I, Eco81I, Lmu60I, OaNI, MstII, SauI, SshAI | |
| AocII | Anabaena sp. | 5 'GDGCHC 3 'CHCGDG | 5 '--- GDGCH C --- 3 ' 3 '--- C. HCGDG --- 5 ' | BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII, SduI | ||
| AorI | 77 | Acetobacter aceti orleanensis | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | BseBI, BstNI, BstOI, Bst2UI, EcoRII, MvaI, Sth117I, Tai | |
| Aor13HI[44] | Acidiphilium organovorum 13H | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- T. CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC T --- 5 ' | AccIII, BbvAIII, BlfI, BseAI, BsiMI, BspEI, CauB3I, Kpn2I, MroI, PtaI | ||
| Aor51HI[45] | 76 | Acidiphilium organovorum 51H | 5 'AGCGCT 3 'TCGCGA | 5 '--- AGC GCT --- 3 ' 3 '--- TCG CGA --- 5 ' | AfiI, AitI, Eco47III, FunI | |
| AosI | Anabaena oscillarioides | 5 'TGCGCA 3 'ACGCGT | 5 '--- TGC GCA --- 3 ' 3 '--- ACG CGT --- 5 ' | Acc16I, AviII, FdiII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I | ||
| AosII | Anabaena oscillarioides | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AstWI, BbiII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, HgiGI, Msp17I, PamII | ||
| ApaI[11][30][46] | Acetobacter pasteurianus pasteurianus | 5 'GGGCCC 3 'CCCGGG | 5 '--- GGGCC C --- 3 ' 3 '--- C. CCGGG --- 5 ' | Bsp120I, PpeI, PspOMI | ||
| ApaBI[47] | Acetobacter pasteurianus B | 5 'GCAN5TGC 3 'CGTN5ACG | 5 '--- GCANNNNN TGC --- 3 ' 3 '--- CGT NNNNNACG --- 5 ' | BstAPI | ||
| ApaCI | Acetobacter pasteurianus C | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G. GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AliI, BamHI, BnaI, Bsp4009I, BstI, NspSAIV, Pfl8I, SolI, SurI | ||
| ApaLI[48][49] | Acetobacter pasteurianus | 5 'GTGCAC 3 'CACGTG | 5 '--- G. TGCAC --- 3 ' 3 '--- CACGT G --- 5 ' | Alw44I, SnoI, VneI | ||
| ApaORI | 86 | Acetobacter pasteurianus | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | AjnI, BstNI, BstOI, Bst1I, Bst2I, Fsp1604I, MvaI, Psp6I, PspGI | |
| ApeKI[50] | Aeropyrum pernix K1 | 5 'GCWGC 3 'CGWCG | 5 '--- G. CWGC --- 3 ' 3 '--- CGWC G --- 5 ' | AceI, SuiI, Taq52I, TseI | ||
| ApiI | 2315 | Arthrobacter picolinophilus | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G. ACGTC --- 5 ' | Asp713I, Bsp63I, CfrA4I, PaePI, Pfl21I, Psp23I, PstI, SflI, Sst12I | |
| ApoI[51] | Arthrobacter protophormiae | 5 'RAATTY 3 'YTTAAR | 5 '--- R AATTY --- 3 ' 3 '--- YTTAA R --- 5 ' | AcsI, CfaI, FsiI, XapI, EcoRI | ||
| AplI | 25962 | Arthrospira platensis NIES-39 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G. ACGTC --- 5 ' | Vidět tato stránka pro úplný seznam. | |
| ApyI | 93 | Arthrobacter pyridinolis | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | BciBII, BptI, BseBI, BstNI, BstOI, Bst2UI, Bst38I, Bst100I, MvaI | |
| ApyPI | 14756 | Arcanobacterium pyogenes | 5 'ATCGAC 3 'TAGCTG | 5 '--- ATCGACN17NNN --- 3' 3 '--- TAGCTGN17N NN --- 5 ' | Žádné ze dne 4. srpna 2019 | |
| AquI | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- C. YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | BCOI, BmeT110I, BsmAI, BsoMAI, BsoBI, BstSI, Eco27kI, OfoI | ||
| AquII | 20238 | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'GCCGNAC 3 'CGGCNTG | 5 '--- GCCGNACN17NNN --- 3' 3 '--- CGGCNTGN17N NN --- 5 ' | Žádné ze dne 4. srpna 2019 | |
| AquIII | 20239 | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'GAGGAG 3 'CTCCTC | 5 '--- GAGGAGN17NNN --- 3' 3 '--- CTCCTCN17N NN --- 5 ' | BseRI | |
| AquIV | 20240 | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'GRGGAAG 3 'CYCCTTC | 5 '--- GRGGAAGN16NNN --- 3' 3 '--- CYCCTTCN16N NN --- 5 ' | Žádný od 4. 4. 19 | |
| ArsI | 19405 | Arthrobacter sp. NTS | 5 'GACN6TTYG 3 'CTGN6AARC | 5 '--- NNNNN NN7GACN6TTYGN5NNNNNN --- 3' 3' --- NNNNNNN7CTGN6AARCN5N NNNNN --- 5 ' | Žádné k 28. říjnu 2020 | |
| AscI[11][52] | Arthrobacter sp. | 5 'GGCGCGCC 3 'CCGCGCGG | 5 '--- GG CGCGCC --- 3 ' 3 '--- CCGCGC GG --- 5 ' | PalAI, SgsI | ||
| AseI[53] | 96 | Aquaspirillum serpens | 5 'ATTAAT 3 'TAATTA | 5 '--- AT TAAT --- 3 ' 3 '--- TAAT TA --- 5 ' | AsnI, BpoAI, PshBI, Sru4DI, VspI | |
| Vše[53] | 97 | Aquaspirillum serpens | 5 'CCSGG 3 'GGSCC | 5 '--- CC SGG --- 3 ' 3 '--- GGS CC --- 5 ' | AhaI, AsuC2I, BcnI, CauII, EcoHI, HgiS22I, Kpn49kII, Mgl14481I, NciI | |
| AsiI | Azotobacter sp. | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G. GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | ApaCI, BamHI, BnaI, Bsp4009I, BstI, OkrAI, Pfl8I, SurI, Uba4009I | ||
| AsiAI | 2853 | Arthrobacter sp. A7359 | 5 'ACCGGT 3 'TGGCCA | 5 '--- A CCGGT --- 3 ' 3 '--- TGGCC A --- 5 ' | AgeI, AsiGI, BshTI, CsiAI, CspAI, PinAI | |
| AsiGI | 10828 | Arthrobacter sp. G | 5 'ACCGGT 3 'TGGCCA | 5 '--- A CCGGT --- 3 ' 3 '--- TGGCC A --- 5 ' | AgeI, AsiAI, BshTI, CsiAI, CspAI, PinAI | |
| AsiSI | Arthrobacter sp. | 5 'GCGATCGC 3 'CGCTAGCG | 5 '--- GCGAT CGC --- 3 ' 3 '--- CGC TAGCG --- 5 ' | RgaI, SfaAI, , SgfI | ||
| Asi256I | 18472 | Arthrobacter sp. Ck256 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5 '--- G. ATC --- 3 ' 3 '--- CTA G --- 5 ' | Vidět tato stránka pro úplný seznam. | |
| Asi372I | 15803 | Arthrobacter sp. Mn372 | 5 'ATGCAT 3 'TACGTA | 5 '--- ATGCA T --- 3 ' 3 '--- T. ACGTA --- 5 ' | Ppu10I, EcoT22I, Mph1103I, NsiI, Zsp2I, BfrBI, Csp68KIII, PinBI, SepI, SspD5II | |
| AsnI[54] | 98 | Arthrobacter sp. N-CM | 5 'ATTAAT 3 'TAATTA | 5 '--- AT TAAT --- 3 ' 3 '--- TAAT TA --- 5 ' | AsseI, BpoAI, PshBI, Sru4DI, VspI | |
| AspI[55] | Achromobacter sp. 699 | 5 'GACNNNGTC 3 'CTGNNNCAG | 5 '--- GACN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NCAG --- 5 ' | AtsI, PflFI, PsyI, TelI, Tth111I | ||
| Asp10HI | Acidiphilium sp. 10H | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- TT CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | AsuII, BspT104I, BstBI, CbiI, Csp68KII, PlaII, PpaAI, Ssp1I | ||
| Asp10HII | 100 | Acidiphilium sp. 10H | 5 'CCAN5TGG 3 'GGTN5ACC | 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 ' 3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' | AccB7I, AcpII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I | |
| Asp26HI | 111 | Acidiphilium sp. 26H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp27HI, Asp35HI, Asp36HI, BsaMI, BscCI, BsmI, PctI | |
| Asp27HI | 112 | Acidiphilium sp. 27H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp35HI, Asp36HI, Asp40HI, BmaHI, BsaMI, BscCI, BsmI | |
| Asp35HI | 117 | Acidiphilium sp. 35H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp36HI, Asp40HI, Asp50HI, BsaMI, BscCI, BsmI, Mva1269I | |
| Asp36HI | 118 | Acidiphilium sp. 36H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp40HI, Asp50HI, BmaHI, BscCI, BsmI, Mva1269I, PctI | |
| Asp40HI | 120 | Acidiphilium sp. 40H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp27HI, Asp36HI, Asp50HI, BsaMI, BscCI, BsmI, Mva1269I | |
| Asp50HI | 122 | Acidiphilium sp. 50H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp26HI, Asp35HI, Asp36HI, BsaMI, BscCI, BsmI, Mva1269I | |
| Asp700I[56] | Achromobacter sp. 700 | 5 'GAAN4TTC 3 'CTTN4AAG | 5 '--- GAANN NNTTC --- 3 ' 3 '--- CTTNN NNAAG --- 5 ' | BbvAI, MroXI, PdmI, XmnI | ||
| Asp713I | 131 | Achromobacter sp. 713 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G. ACGTC --- 5 ' | AjoI, AliAJI, BloHII, CfrA4I, Ecl37kI, MhaAI, PstI, SflI, Srl5DI, YenI | |
| Asp718I[57] | Achromobacter sp. 718 | 5 'GGTACC 3 'CCATGG | 5 '--- G. GTACC --- 3 ' 3 '--- CCATG G --- 5 ' | Acc65I, AhaB8I, KpnI, SthI | ||
| Asp745I | Achromobacter sp. 745 | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G. GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | Bme18I, BsrAI, CauI, Eco47I, ErpI, FdiI, SinI, VpaK11AI, VpaK11BI | ||
| AspAI | Alkaligeny sp. | 5 'GGTNACC 3 'CCANTGG | 5 '--- G. GTNACC --- 3 ' 3 '--- CCANTG G --- 5 ' | AcrII, Bse64I, BseT10I, BstEII, BstPI, Eco91I, EcoO65I, PspEI | ||
| AspA2I | 6959 | Arthrobacter sp. A2 | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- C. CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AvrBII, AvrII, BlnI, BspA2I, XmaJI | |
| AspEI[58] | Aureobacterium sp. | 5 'GACN5VOP 3 'CTGN5CAG | 5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 ' | AhdI, BmeRI, BspOVI, DriI, Eam1105I, EclHKI, NruGI | ||
| AspHI[59] | Achromobacter sp. H | 5 'GWGCWC 3 'CWCGWG | 5 '--- GWGCW C --- 3 ' 3 '--- C. WCGWG --- 5 ' | Alw21I, Bbv12I, Bsh45I, BsiHKAI, Bsm6I, HgiAI, MspV281I | ||
| AspLEI | Arthrobacter sp. LE3860 | 5 'GCGC 3 'CGCG | 5 '--- GCG C --- 3 ' 3 '--- C. GCG --- 5 ' | BspLAI, BstHHI, CfoI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI, SciNI | ||
| AspMI | 2977 | Acinetobacter sp. M | 5 'AGGCCT 3 'TCCGGA | 5 '--- AGG CCT --- 3 ' 3 '--- TCC GGA --- 5 ' | AATI, Eco147I, GdiI, PceI, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI | |
| AspMDI | Alkaligeny sp. MD1 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | BfuCI, Bsp143I, BstMBI, DpnII, Kzo9I, MboI, NdeII, Sau3AI | ||
| AspNI | Anabaena sp. J3 | 5 'GGNNCC 3 'CCNNGG | 5 '--- GGN NCC --- 3 ' 3 '--- CCN NGG --- 5 ' | BmiI, BscBI, BspLI, NlaIV, PspN4I | ||
| AspS9I | Arthrobacter sp. S9 | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G. GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AsuI, AvcI, Bac36I, Bal228I, FmuI, NspIV, PspPI, Sau96I | ||
| AssI | 4930 | Arthrobacter sp. | 5 'AGTACT 3 'TCATGA | 5 '--- AGT ZÁKON --- 3 ' 3 '--- TCA TGA --- 5 ' | Acc113I, BmcAI, Bpa34I, DpaI, Eco255I, RflFII, ScaI, ZrmI | |
| AstWI | Anabaena sp. | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AsuIII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, HgiDI, HgiGI, Msp17I | ||
| AsuI[60] | Anabaena subcylindrica | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G. GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AspS9I, AvcI, CcuI, Cfr13I, FmuI, MaeK81II, Nsp7121I, PspPI, UnbI | ||
| AsuII[61] | Anabaena subcylindrica | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- TT CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | AcpI, Bpu14I, Bsp119I, BspT104I, Csp45I, FspII, LspI, NspV, SfuI | ||
| AsuIII | Anabaena subcylindrica | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AsuIII, BbiII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiHII, Hsp92I, Msp17I | ||
| AsuC2I | 2901 | Actinobacillus suis C2 | 5 'CCSGG 3 'GGSCC | 5 '--- CC SGG --- 3 ' 3 '--- GGS CC --- 5 ' | AhaI, AseII, BcnI, Eco1831I, EcoHI, Kpn49kII, Mgl14481I, NciI | |
| AsuHPI[62] | 2811 | Actinobacillus suis HP | 5 'GGTGA 3 'CCACT | 5 '--- GGTGAN6NN --- 3' 3 '--- CCACTN6N N --- 5 ' | HphI, SspD5I | |
| AsuNHI[62] | Actinobacillus suis NH | 5 'GCTAGC 3 'CGATCG | 5 '--- G. CTAGC --- 3 ' 3 '--- CGATC G --- 5 ' | AceII, BmtI, BspOI, LlaG2I, NheI, PstNHI | ||
| AtsI | Aureobacterium testaceum 4842 | 5 'GACNNNGTC 3 'CTGNNNCAG | 5 '--- GACN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NCAG --- 5 ' | AspI, PflFI, PsyI, TelI, Tth111I | ||
| AvaI[14][63][64] | Anabaena variabilis | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- C. YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | AquI, Ama87I, BsiHKCI, BsoBI, BspLU4I, Eco88I, NspIII, PlaAI | ||
| K dispozici[12][14][41][63][64] | Anabaena variabilis | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G. GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | Bme18I, Bme216I, BsrAI, Eco47I, Kzo49I, Psp03I, SmuEI, VpaK11AI | ||
| AvcI | Actinomyces violaceoniger cristalomycini | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G. GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AspS9I, BshKI, BsiZI, Bsp1894I, BspBII, BspF4I, Bsu54I, Pde12I | ||
| AviII | Anabaena variabillis (halle) | 5 'TGCGCA 3 'ACGCGT | 5 '--- TGC GCA --- 3 ' 3 '--- ACG CGT --- 5 ' | Acc16I, AosI, FdiII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I | ||
| AvrII[11][29] | 173 | Anabaena variabilis UW | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- C. CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AspA2I, AvrBII, BlnI, BspA2I, XmaJI | |
| AvrBII | 171 | Arthrobacter variabilis | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- C. CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AspA2I, AvrII, BlnI, BspA2I, XmaJI | |
| AxyI[65] | 174 | Acetobacter xylinus | 5 'CCTNAGG 3 'GGANTCC | 5 '--- CC TNAGG --- 3 ' 3 '--- GGANT CC --- 5 ' | AocI, BliHKI, Bse21I, BspR7I, Bsu36I, CvnI, Eco81I, Lmu60I |
§ K dispozici je verze HF tohoto enzymu
Poznámky
- ^ Smith HO, Nathans D (prosinec 1973). „Dopis: Navrhovaná nomenklatura pro modifikace a restrikční systémy bakteriálních hostitelů a jejich enzymy“. J. Mol. Biol. 81 (3): 419–23. doi:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
- ^ Roberts RJ, Belfort M, Bestor T, Bhagwat AS, Bickle TA, Bitinaite J, Blumenthal RM, Degtyarev SK, Dryden DT, Dybvig K, Firman K, Gromova ES, Gumport RI, Halford SE, Hattman S, Heitman J, Hornby DP , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (duben 2003). „Názvosloví pro restrikční enzymy, DNA methyltransferázy, naváděcí endonukleázy a jejich geny“. Nucleic Acids Res. 31 (7): 1805–12. doi:10.1093 / nar / gkg274. PMC 152790. PMID 12654995.
- ^ Jeremy MB, John LT, Lubert S (2002). "3. Struktura a funkce proteinů". Biochemie. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
- ^ Anfinsen C.B. (1973). „Principy, kterými se řídí skládání proteinových řetězců“. Věda. 181 (4096): 223–30. Bibcode:1973Sci ... 181..223A. doi:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.
- ^ Kessler C, Manta V (srpen 1990). "Specifičnost restrikčních endonukleáz a modifikace DNA methyltransferáz a recenze (vydání 3)". Gen. 92 (1–2): 1–248. doi:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-B. PMID 2172084.
- ^ Pingoud A, Jeltsch A (září 2001). "Struktura a funkce restrikčních endonukleáz typu II". Nucleic Acids Res. 29 (18): 3705–27. doi:10.1093 / nar / 29.18.3705. PMC 55916. PMID 11557805.
- ^ Grigaite R, Maneliene Z, Janulaitis A (listopad 2002). „Ári, restrikční endonukleáza z Arthrobacter aurescens SS2-322, který rozpoznává novou nepalindromickou sekvenci 5'-CACCTGC (N) 4 / 8-3'". Nucleic Acids Res. 30 (21): 123e – 123. doi:10.1093 / nar / gnf122. PMC 135850. PMID 12409482.
- ^ A b Sugisaki H, Maekawa Y, Kanazawa S, Takanami M (říjen 1982). "Nové restrikční endonukleázy z Acetobacter aceti a Bacillus aneurinolyticus". Nucleic Acids Res. 10 (19): 5747–52. doi:10.1093 / nar / 10.19.5747. PMC 320926. PMID 6292849.
- ^ Nwankwo DO, Maunus RE, Xu S (leden 1997). "Klonování a exprese systému omezení AatII v systému Escherichia coli". Gen. 185 (1): 105–9. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00641-5. PMID 9034320.
- ^ A b Roberts RJ (leden 1983). "Omezení a modifikace enzymů a jejich rozpoznávací sekvence". Nucleic Acids Res. 11 (1): r135–69. PMC 325705. PMID 6306557.
- ^ A b C d E F Wei H, Therrien C, Blanchard A, Guan S, Zhu Z (květen 2008). „Fidelity Index poskytuje systematické kvantifikace hvězdné aktivity restrikčních endonukleáz DNA“. Nucleic Acids Res. 36 (9): e50. doi:10.1093 / nar / gkn182. PMC 2396408. PMID 18413342. S2CID 10463398.
- ^ A b C d Nishigaki K, Kaneko Y, Wakuda H, Husimi Y, Tanaka T (srpen 1985). „Restrikční endonukleázy typu II štěpí jednovláknové DNA obecně“. Nucleic Acids Res. 13 (16): 5747–60. doi:10.1093 / nar / 13.16.5747. PMC 321909. PMID 2994012.
- ^ Shenoy S, Daigle K, Ehrlich KC, Gehrke CW, Ehrlich M (červen 1986). „Hydrolýza restrikčními endonukleázami v jejich DNA rozpoznávacích sekvencích substituovaných neodpovídajícími páry bází“. Nucleic Acids Res. 14 (11): 4407–20. PMC 311455. PMID 3012472.
- ^ A b C d E Nelson M, Christ C, Schildkraut I (červenec 1984). „Změna zjevných specificit pro rozpoznávání restrikčních endonukleáz DNA methylázami“. Nucleic Acids Res. 12 (13): 5165–73. doi:10.1093 / nar / 12.13.5165. PMC 318911. PMID 6087274.
- ^ Nelson PS, Papas TS, Schweinfest CW (únor 1993). „Štěpení restrikční endonukleázou hemimethylované DNA 5-methyl-deoxycytosinu při vysokém poměru enzym-substrát“. Nucleic Acids Res. 21 (3): 681–6. doi:10.1093 / nar / 21.3.681. PMC 309169. PMID 8441677.
- ^ Kita K, Hiraoka N, Kimizuka F, Obayashi A (1984). „Stanovení místa štěpení restrikčním enzymem, AccII, za použití syntetického oligonukleotidu“. Agric Biol Chem. 48 (2): 531–2. doi:10,1271 / bbb1961.48.531.
- ^ Kita K, Hiraoka N, Oshima A, Kadonishi S, Obayashi A (prosinec 1985). „AccIII, nová restrikční endonukleáza z Acinetobacter calcoaceticus“. Nucleic Acids Res. 13 (24): 8685–94. doi:10.1093 / nar / 13.24.8685. PMC 318944. PMID 3001647.
- ^ Bath AJ, Milsom SE, Gormley NA, Halford SE (únor 2002). "Mnoho restrikčních endonukleáz typu II interaguje se dvěma rozpoznávacími místy před štěpením DNA". J Biol Chem. 277 (6): 4024–33. doi:10,1074 / jbc.M108441200. PMID 11729187.
- ^ Prichodko GG, Rechnukova NI, Repin VE, Degtyarev SK (1991). "Stanovení substrátové specificity restrikční endonukleázy Acc65I". Sib Biol J.. 1: 59–60.
- ^ "Screening kmenů produkujících restrikční endonukleázy v Bajkalském jezeře". Izv Sib Otd Akad Nauk SSSR. 1: 35–37. 1990.
- ^ Abdurashitov MA, Kiseleva EV, Miakisheva TV, Dedkov VS, Shevchenko AV, Degtiarev CK (září – říjen 1997). „AccBSI - nová restrikční endonukleáza z Acinetobacter calcoaceticus BS (článek v ruštině)“. Prikl Biokhim Mikrobiol. 33 (5): 556–8 (Překlad do angličtiny na str. 496–8). PMID 9441298.
- ^ Polisson C, Morgan RD (říjen 1990). „AciI, jedinečná restrikční endonukleáza z Arthrobacter citreus, která rozpoznává 5 'CCGC3'". Nucleic Acids Res. 18 (19): 5911. doi:10.1093 / nar / 18.19.5911. PMC 332357. PMID 2170952.
- ^ Degtyarev SK, Abdurashitov MA, Kolyhalov AA, Rechkunova NI (červenec 1992). „AclI, nová restrikční endonukleáza z Acinetobacter calcoaceticus rozpoznávající 5'-AA ^ CGTT-3'". Nucleic Acids Res. 20 (14): 3787. doi:10.1093 / nar / 20.14.3787. PMC 334039. PMID 1322531.
- ^ Degtyarev SK, Kolyhalov AA, Rechkunova NI, Abdurashitov MA (červenec 1992). „AcsI, nová restrikční endonukleáza z Arthrobacter citreus 310 rozpoznávající 5'-Pu snižuje AATTPy-3'". Nucleic Acids Res. 20 (14): 3789. doi:10.1093 / nar / 20.14.3789. PMC 334041. PMID 1322532.
- ^ de Waard A, Korsuize J, van Beveren CP, Maat J (prosinec 1978). "Nová sekvenčně specifická endonukleáza z Anabaena cylindrica". FEBS Lett. 96 (1): 106–10. doi:10.1016/0014-5793(78)81072-2. PMID 103749.
- ^ Dou D, Inagati K, Kita K, Ohshima A, Hiraoka N, Kishimoto N, Sugio T, Tano T (září 1989). „Restriction endonuclease Afa from Acidiphilium facilis, a new isoschizomer of RsaI: purification and properties“. Biochim Biophys Acta. 1009 (1): 83–6. doi:10.1016/0167-4781(89)90082-1. PMID 2790034.
- ^ Macícková-Cahová H, Hocek M (prosinec 2009). "Štěpení adeninem modifikované funkcionalizované DNA restrikčními endonukleázami typu II". Nucleic Acids Res. 37 (22): 7612–22. doi:10.1093 / nar / gkp845. PMC 2794189. PMID 19820117. S2CID 17925157.
- ^ A b C Whitehead PR, Brown NL (duben 1985). "Tři restrikční endonukleázy z Anabaena flos-aquae". J. Gen Microbiol. 131 (4): 951–8. doi:10.1099/00221287-131-4-951. PMID 2985742.
- ^ A b C Rowland GC, Lim PP, Glass RE (červenec 1992). "'Stop-kodonově specifické „restrikční endonukleázy: jejich použití při mapování a genové manipulaci“. Gen. 116 (1): 21–6. doi:10.1016 / 0378-1119 (92) 90624-X. PMID 1628840.
- ^ A b C Roberts RJ (březen 1982). "Omezení a modifikace enzymů a jejich rozpoznávací sekvence". Nucleic Acids Res. 10 (5): r117–44. doi:10.1093 / nar / 10.5.1770. PMC 320569. PMID 6280143.
- ^ Yamada Y, Mizuno H, Sato H, Akagawa M, Yamasato K (1989). „Nová restrikční endonukleáza z Agrobacterium gelatinovorum, mořská agrobakterie (AgeI)“. Agric Biol Chem. 53 (6): 1747–9. doi:10,1271 / bbb1961.53.1747.
- ^ Sokolov NN (1995). Msgstr "Hledání, izolace a studium omezení". Vestn Ross Akad Med Nauk (v ruštině) (2): 47–51. PMID 7756931.
- ^ Whitehead PR, Brown NL (červenec 1982). "AhaIII: Restrikční endonukleáza s rozpoznávací sekvencí obsahující pouze páry bází A: T". FEBS Lett. 143 (2): 296–300. doi:10.1016/0014-5793(82)80120-8. PMID 6288466.
- ^ Marks P, McGeehan J, Wilson G, Errington N, Kneale G (červen 2003). „Purifikace a charakterizace nové DNA methyltransferázy, M. AhdI“. Nucleic Acids Res. 31 (11): 2803–10. doi:10.1093 / nar / gkg399. PMC 156732. PMID 12771207.
- ^ Bogdanova E, Djordjevic M, Papapanagiotou I, Heyduk T, Kneale G, Severinov K (březen 2008). "Regulace transkripce systému omezení a modifikace typu II AhdI". Nucleic Acids Res. 36 (5): 1429–42. doi:10.1093 / nar / gkm 1116. PMC 2275141. PMID 18203750. S2CID 5338430.
- ^ Cesnaviciene E, Petrusyte M, Kazlauskiene R, Maneliene Z, Timinskas A, Lubys A, Janulaitis A (listopad 2001). "Charakterizace AloI, systému omezení a modifikace nového typu". J Mol Biol. 314 (2): 205–16. doi:10.1006 / jmbi.2001.5049. PMID 11718555.
- ^ Jurenaite-Urbanaviciene S, Serksnaite J, Kriukiene E, Giedriene J, Venclovas C, Lubys A (červen 2007). „Generování specifičností štěpení DNA restrikčních endonukleáz typu II přeřazením domén rozpoznávajících cíl“. Proc Natl Acad Sci USA. 104 (25): 10358–63. Bibcode:2007PNAS..10410358J. doi:10.1073 / pnas.0610365104. PMC 1965518. PMID 17553965.
- ^ Blakesley RW, Wells RD (říjen 1975). "'Jednořetězcová 'DNA z phiX174 a M13 je štěpena určitými restrikčními endonukleázami ". Příroda. 257 (5525): 421–2. Bibcode:1975 Natur.257..421B. doi:10.1038 / 257421a0. PMID 809717. S2CID 24619091.
- ^ Roberts RJ, Myers PA, Morrison A, Murray K (březen 1976). „Specifická endonukleáza z Arthrobacter luteus". J Mol Biol. 102 (1): 157–65. doi:10.1016/0022-2836(76)90079-6. PMID 1271462.
- ^ Greene PJ, Heyneker HL, Bolivar F, Rodriguez RL, Betlach MC, Covarrubias AA, Backman K, Russel DJ, Tait R, Boyer HW (červenec 1978). „Obecná metoda čištění restrikčních enzymů“. Nucleic Acids Res. 5 (7): 2373–80. doi:10.1093 / nar / 5.7.2373. PMC 342170. PMID 673857.
- ^ A b Huang LH, Farnet CM, Ehrlich KC, Ehrlich M (březen 1982). "Trávení vysoce modifikované bakteriofágové DNA restrikčními endonukleázami". Nucleic Acids Res. 10 (5): 1579–91. doi:10.1093 / nar / 10.5.1579. PMC 320551. PMID 6280151.
- ^ Bitinaite J, Maneliene Z, Menkevicius S, Klimasauskas S, Butkus V, Janulaitis A (říjen 1992). „Alw26I, Eco31I a Esp3I - methyltransferázy typu II modifikující cytosin a adenin v komplementárních řetězcích cílové DNA“. Nucleic Acids Res. 20 (19): 4981–5. doi:10.1093 / nar / 20.19.4981. PMC 334273. PMID 1408816.
- ^ Morgan RD, Dalton M, Stote R (září 1987). "Unikátní restrikční endonukleáza typu II z Acinetobacter lwoffi N ". Nucleic Acids Res. 15 (17): 7201. doi:10.1093 / nar / 15.17.7201. PMC 306225. PMID 2821501.
- ^ Inagaki K, Hikita T, Yanagidani S, Nomura Y, Kishimoto N, Tano T, Tanaka H (říjen 1993). "Restrikční endonukleáza Aor13HI z Acidiphilium organovorum 13H, nový isoschizomer BspMII: Čištění a charakterizace". Biosci Biotechnol Biochem. 57 (10): 1716–21. doi:10,1271 / bbb.57.1716. PMID 7764267.
- ^ Sagawa H, Takagi M, Nomura Y, Inagaki K, Tano T, Kishimato N, Kotani H, Nakajima K (leden 1992). "Izolace a identifikace restrikční endonukleázy Aor51HI z Acidiphilium organovorum 51 H ". Nucleic Acids Res. 20 (2): 365. doi:10.1093 / nar / 20.2.365. PMC 310379. PMID 1741262.
- ^ Seurinck J, Van, de Voorde A, Van Montagu M (červenec 1983). "Nová restrikční endonukleáza z Acetobacter pasteurianus". Nucleic Acids Res. 11 (13): 4409–15. doi:10.1093 / nar / 11.13.4409. PMC 326055. PMID 6306590.
- ^ Grones J, Turna J (březen 1993). "Některé vlastnosti restrikční endonukleázy ApaBI z Acetobacter pasteurianus". Biochim Biophys Acta. 1162 (3): 323–5. doi:10.1016/0167-4838(93)90297-5. PMID 8457597.
- ^ Xu SY, Xiao JP, Ettwiller L, Holden M, Aliotta J, Poh CL, Dalton M, Robinson DP, Petronzio TR, Moran L, Ganatra M, Ware J, Slatko B, Benner J (listopad 1998). „Klonování a exprese restrikčních modifikačních systémů ApaLI, NspI, NspHI, SacI, ScaI a SapI v Escherichia coli". Mol Gen Genet. 260 (2–3): 226–31. doi:10,1007 / s004380050890. PMID 9862476. S2CID 2275352.
- ^ Xia Y, Van Etten JL, Dobos P, Ling YY, Krell PJ (říjen 1993). „Exprese adenin DNA methyltransferázy M.CviRI urychluje apoptózu v hmyzích buňkách infikovaných bakulovirem“. Virologie. 196 (2): 817–24. doi:10.1006 / viro.1993.1539. PMID 8372450.
- ^ Kawarabayasi Y, Hino Y, Horikawa H, Yamazaki S, Haikawa Y, Jin-no K, Takahashi M, Sekine M, Baba S, Ankai A, Kosugi H, Hosoyama A, Fukui S, Nagai Y, Nishijima K, Nakazawa H, Takamiya M, Masuda S, Funahashi T, Tanaka T, Kudoh Y, Yamazaki J, Kushida N, Oguchi A, Aoki K, Kubota K, Nakamura Y, Nomura N, Sako Y, Kikuchi H (duben 1999). „Kompletní genomová sekvence aerobního hyper-termofilního crenarchaeonu, Aeropyrum pernix K1 ". DNA Res. 6 (2): 83–101, 145–52. doi:10.1093 / dnares / 6.2.83. PMID 10382966.
- ^ Polisson C, Robinson D (červen 1992). „ApoI, jedinečná restrikční endonukleáza z Arthrobacter protophormiae který rozpozná 5 'RAATTY-3'". Nucleic Acids Res. 20 (11): 2888. doi:10.1093 / nar / 20.11.2888. PMC 336940. PMID 1614876.
- ^ Bilcock DT, Daniels LE, Bath AJ, Halford SE (prosinec 1999). „Reakce restrikčních endonukleáz typu II s rozpoznávacími místy 8 bazických párů“. J Biol Chem. 274 (51): 36379–86. doi:10.1074 / jbc.274.51.36379. PMID 10593932.
- ^ A b Polisson C, Morgan RD (listopad 1988). „AsI, restrikční endonukleáza z Aquaspirillum serpens který rozpoznává 5'AT — TAAT3'". Nucleic Acids Res. 16 (21): 10365. doi:10.1093 / nar / 16.21.10365. PMC 338867. PMID 3264065.
- ^ Rexer BU, Jarsch M, Sagmeister C, Glück B, Berger G, Kessler C (srpen 1988). "AsnI: nová restrikční endonukleáza třídy II z Arthrobacter sp., kmen N-CM, rozpoznávající 5'-AT / TAAT-3'". FEBS Lett. 235 (1–2): 241–6. doi:10.1016/0014-5793(88)81271-7. PMID 2841156.
- ^ Bolton BJ, Schmitz GG, Jarsch M, Kessler C (červen 1990). „AspI, nový isoschizomer Tth111I z Achromobacter druh 699 rozpoznávající 5'-GACN / NNGTC-3'". Nucleic Acids Res. 18 (11): 3422. doi:10.1093 / nar / 18.11.3422. PMC 330974. PMID 2162524.
- ^ Bolton BJ, Comer M, Kessler C (listopad 1989). "Asp700I, nový isoschizomer XmnI z Achromobacter druh 700 rozpoznávající 5'-GAANN / NNTTC-3'". Nucleic Acids Res. 17 (21): 8879. doi:10.1093 / nar / 17.21.8879. PMC 335071. PMID 2587236.
- ^ Nástěnná malba RJ (listopad 1987). „Štěpení restrikční endonukleázou Asp718, isoschizomer KpnI, je citlivý na Escherichia coli DCM methylace ". Nucleic Acids Res. 15 (21): 9085. doi:10.1093 / nar / 15.21.9085. PMC 306431. PMID 2825125.
- ^ Frey B, Kaluza K, Auer J, Stratidakis I, Rina M, Bouriotis V, Schmitz G (červenec 1992). "AspEI, nový izoschizomer Eam11051 z Aureobacterium druhy rozpoznávající 5'-GACnnn / nnGTC-3'". Nucleic Acids Res. 20 (14): 3782. doi:10.1093 / nar / 20.14.3782. PMC 334034. PMID 1641345.
- ^ Bolton BJ, Höltke HJ, Schmitz GG, Jarsch M, Kessler C (listopad 1989). „AspHI, nový isoschizomer HgiAI z Achromobacter druh H rozpoznávající 5'-GWGCW / C-3'". Nucleic Acids Res. 17 (22): 9500. doi:10.1093 / nar / 17.22.9500. PMC 335177. PMID 2587281.
- ^ Hughes SG, Bruce T, Murray K (leden 1980). „Izolace a charakterizace sekvenčně specifické endonukleázy z Anabaena subcylindrica". Biochem J.. 185 (1): 59–63. doi:10.1042 / bj1850059. PMC 1161269. PMID 6246880.
- ^ Roberts RJ (březen 1980). "Restrikční a modifikační enzymy a jejich rozpoznávací sekvence". Gen. 8 (4): 329–43. doi:10.1016/0378-1119(80)90040-2. PMID 6245015.
- ^ A b Dedkov VS, Degtyarev SK (duben – květen 1998). "Actinobacillus a Streptococcus: producenti isoschizomerů restrikčních endonukleáz R.HphI, R.SauI, R.NheI, R.MboI a R.SwaI “. Biol Chem. 379 (4–5): 573–4. PMID 9628357.
- ^ A b Kaneko T, Nakamura Y, Wolk CP, Kuritz T, Sasamoto S, Watanabe A, Iriguchi M, Ishikawa A, Kawashima K, Kimura T, Kishida Y, Kohara M, Matsumoto M, Matsuno A, Muraki A, Nakazaki N, Shimpo S , Sugimoto M, Takazawa M, Yamada M, Yasuda M, Tabata S (říjen 2001). „Kompletní genomová sekvence vláknitých cyanobakterií vázajících dusík Anabaena sp. kmen PCC 7120 ". DNA Res. 8 (5): 227–53. doi:10.1093 / dnares / 8.5.205. PMID 11759840.
- ^ A b Hughes SG, Murray K (leden 1980). "Nukleotidové sekvence rozpoznané endonukleázami AvaI a AvaII z Anabaena variabilis". Biochem J.. 185 (1): 65–75. doi:10.1042 / bj1850065. PMC 1161270. PMID 6246881.
- ^ Yoshioka H, Nakamura H, Sasaki J, Tahara Y, Yamada Y (1983). "Čištění, vlastnosti a rozpoznávací sekvence místně specifické restrikční endonukleázy z"Acetobacter xylinus"". Agric Biol Chem. 47 (12): 2871–9. doi:10,1271 / bbb1961.47.2871.