Seznam míst štěpení restrikčními enzymy: S - List of restriction enzyme cutting sites: S - Wikipedia

Legenda o nukleové báze
KódNukleotid zastoupeny
AAdenin (A)
CCytosin (C)
GGuanine (G)
TTymin (T)
NA, C, G nebo T
MA nebo C.
RA nebo G.
ŽA nebo T
YC nebo T
SC nebo G.
K.G nebo T
HA, C nebo T
BC, G nebo T.
PROTIA, C nebo G
DA, G nebo T


Tento článek obsahuje seznam nejvíce studovaných restrikčních enzymů, jejichž názvy začínají na S. Obsahuje přibližně 130 enzymů. Následující informace:

  • Enzym: Přijatý název molekula, v souladu s mezinárodně přijatými nomenklatura[1][2], a bibliografické odkazy. (Další čtení: viz část „Nomenklatura „v článku“Restrikční enzym ".)
  • Kód PDB: Kód používaný k identifikaci struktury proteinu v PDB databáze proteinových struktur. 3D atomová struktura proteinu poskytuje velmi cenné informace pro pochopení intimních detailů jeho mechanismu působení[3][4].
  • Zdroj: Organismus, který přirozeně produkuje enzym.
  • Sekvence rozpoznávání: Sekvence DNA rozpoznávaná enzymem, na kterou se specificky váže.
  • Střih: Místo řezu a produkty DNA řezu. The sekvence rozpoznávání a místo řezu se obvykle shoduje, ale někdy může být řezací místo vzdálené od rozpoznávacího místa desítky nukleotidů[5][6].
  • Isoschizomery a neoschizomery: An isoschizomer je enzym který rozpozná stejnou sekvenci jako další. A neoschizomer je speciální typ isoschizomeru, který rozpoznává stejnou sekvenci jako jiný, ale dělí se jiným způsobem. U každého enzymu je uveden maximální počet 8–10 nejběžnějších isoschizomerů, ale může jich být mnohem více. Neoschizomery jsou zobrazeny tučným a zeleným písmem (např .: BamHI). Když „Žádné zapnuto datum„je uvedeno, to znamená, že k tomuto datu nebyly v databázích s jasně definovaným místem řezání zaregistrovány žádné isoschizomery. Isoschizomery označené bílým písmem a šedým pozadím odpovídají enzymům, které nejsou uvedeny v aktuálních seznamech:
jako v tomto neuvedeném enzymu: EcoR70I 


Navigace v celém seznamu

Restrikční enzymy

S

EnzymKód PDBZdrojSekvence rozpoznáváníStřihIsoschizomery
SacI [7]Streptomyces achromogenes 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG
5 '--- GAGCT   C --- 3 '
3 '--- C.   TCGAG --- 5 '
SacIIStreptomyces achromogenes 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Cfr42I
SacNIStreptomyces achromogenes N-J-H 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG
5 '--- GRGCY   C --- 3 '
3 '--- C.   YCGRG --- 5 '
SalI [7]Streptomyces albus 5 'GTCGAC
3 'CAGCTG
5 '--- G.   TCGAC --- 3 '
3 '--- CAGCT   G --- 5 '
SalPIStreptomyces albus 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G.   ACGTC --- 5 '
ApiI, BspMAI, CstI, Ecl37kI, Ecl2zI, Psp23I, PstI, Srl5DI, YenI
SanDIStreptomyces sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG
5 '--- GG   GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG   GG --- 5 '
SapISaccharopolyspora sp. 5 'GCTCTTC
3 'CGAGAAG
5 '--- GCTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- CGAGAAGNNNN   --- 5'
SarIStreptomyces aureomonopodiales 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AATI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI
SatIStaphylococcus arlettae RFL832 5 'GCNGC
3 'CGNCG
5 '--- GC   NGC --- 3 '
3 '--- CGN   CG --- 5 '
SauIStreptomyces aureofaciens IKA 18/4 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC
5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- GGANT   CC --- 5 '
AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI
Sau96IZlatý stafylokok PS96 5 'GGNCC
3 'CCNGG
5 '--- G.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 '
AsuI, Bal228I, Bce22I, BsiZI, BspF4I, Cfr13I, Nsp7121I, UnbI
Sau3239IStreptomyces aureofaciens 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI
Sau3AI2 REUZlatý stafylokok 3A 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
Bce243I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NdeII, Sth368I
SauBMKIStreptomyces aureofaciens BM-K 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauHPIStreptomyces aureofaciens R8 / 26 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauLPIStreptomyces aureofaciens B-96 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauLPIIStreptomyces aureofaciens B-96 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI
SauMIZlatý stafylokok M 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspAI, BstKTI, ChaI, HacI, MkrAI, RalF40I, SsiAI
SauNIStreptomyces aureofaciens NMU 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauSIStreptomyces aureofaciens 16 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SbfIStreptomyces sp. BF-61 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
Sbi68IStreptomyces bikiniensis JAM68 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI
Sbo13IShigella boydii 13 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT
5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 '
SbvIStreptococcus bovis II / 1 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
ScaI [7]Streptomyces caespitosus 5 'AGTACT
3 'TCATGA
5 '--- AGT   ZÁKON --- 3 '
3 '--- TCA   TGA --- 5 '
Acc113I, AssI, BmcAI, Bpa34I, 
DpaI, Eco255I, RflFII, ZrmI
SceIIISaccharomyces cerevisiae 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- G.   CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC   G --- 5 '
SchIStaphylococcus cohnii Lki 19-320 5 'GAGTC
3 'CTCAG
5 '--- GAGTCN4N   --- 3'
3 '--- CTCAGN4N   --- 5'
SchZIStreptomyces chusanensis ZS-2 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SciIStreptoverticillium cinnamoneum 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- CTC   GAG --- 3 '
3 '--- GAG   CTC --- 5 '
BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, SauLPII, SlaI, Sol10179I, XhoI
SciNISpiroplasma citri ASP2 5 'GCGC
3 'CGCG
5 '--- G.   CGC --- 3 '
3 '--- CGC   G --- 5 '
BspLAI, BstHHI, CfoI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinPll, HsoI, HspAI
ScrFIStreptococcus cremoris F 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5 '--- CC   NGG --- 3 '
3 '--- GGN   CC --- 5 '
SdaI2IXStreptomyces diastaticus NG7-324 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
SdiIStreptomyces diastaticus 5 'GGCCN5GGCC
3 'CCGGN5CCGG
5 '--- GGCCNNNN   NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN   NNNNCCGG --- 5 '
SduIStreptococcus durans RFL3 5 'GDGCHC
3 'CHCGDG
5 '--- GDGCH   C --- 3 '
3 '--- C.   HCGDG --- 5 '
AocII, BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII
SecISynechocystis sp. 6701 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC
5 '--- C.   CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC   C --- 5 '
SelISynechococcus elongatus 5 'CGCG
3 'GCGC
5' ---   CGCG --- 3 '
3 '--- GCGC   --- 5'
ÚLOHA, Bsh1236I, Bsp123I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, BtkI, Csp68KVI
SenPT16ISalmonella enteritidis PT16 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC
5 '--- C.   GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG   C --- 5 '
AaaI, BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, XmaIII
SenPT14bISalmonella enteritidis PT14b 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SepIStaphylococcus epidermidis 5 'ATGCAT
3 'TACGTA
5 '--- ATGCA   T --- 3 '
3 '--- T.   ACGTA --- 5 '
BfrBI, Csp68KIII, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SspD5II, Zsp2I
SexAIStreptomyces exfoliatus 5 'ACCWGGT
3 'TGGWCCA
5 '--- A   CCWGGT --- 3 '
3 '--- TGGWCC   A --- 5 '
SexBIStreptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SexCIStreptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SfaIStreptococcus faecalis zymogeny 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
SfaNIStreptococcus faecalis ND547 5 'GCATC
3 'CGTAG
5 '--- GCATCN4N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTAGN4NNNNN   --- 5'
SfcIStreptococcus faecium 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- C.   TRYAG --- 3 '
3 '--- GAYRT   C --- 5 '
SfeIStreptococcus faecalis 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- C.   TRYAG --- 3 '
3 '--- GAYRT   C --- 5 '
SfiI2F03Streptomyces fimbriatus 5 'GGCCN5GGCC
3 'CCGGN5CCGG
5 '--- GGCCNNNN   NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN   NNNNCCGG --- 5 '
SflIStreptoverticillium flavopersicum 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G.   ACGTC --- 5 '
ApiI, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Psp23I, PstI, Sag23I, Srl5DI, YenI
SFISerratia fonticola 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG
5 '--- GGC   GCC --- 3 '
3 '--- CCG   CGG --- 5 '
Sfr274IStreptomyces fradiae 274 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sol10179I, StrI, TliI
Sfr303IStreptomyces fradiae 303 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SfuIStreptomyces fulvissimus 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- TT   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, Csp68KII, PlaII, Ssp1I, SviI
SgfIStreptomyces griseoruber 5 'GCGATCGC
3 'CGCTAGCG
5 '--- GCGAT   CGC --- 3 '
3 '--- CGC   TAGCG --- 5 '
AsiSI, RgaI, SfaAI 
SgrAI3DPG 3N7B 3N78 3MGY 3MG6Streptomyces griseus 5 'CRCCGGYG
3 'GYGGCCRC
5 '--- ČR   CCGGYG --- 3 '
3 '--- GYGGCC   RC --- 5 '
SgrBIStreptomyces griseus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SimIStaphylococcus intermedius 6H 5 'GGGTC
3 'CCCAG
5 '--- GG   GTC --- 3 '
3 '--- CCCAG   --- 5'
SinISalmonella infantis 5 'GGWCC
3 'CCWGG
5 '--- G.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 '
Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, VpaK11BI
SlaIStreptomyces lavendulae 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
SleISynechococcus leopoliensis 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5' ---   CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC   --- 5'
AeuI, AglI, ApaORI, BspNI, Bst2I, EcoRII, SniI, SslI, SspAI, ZanI
Slu1777IStreptomyces lusitanus 1777 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SmaISerratia marcescens Sb 5 'CCCGGG
3 'GGGCCC
5 '--- CCC   GGG --- 3 '
3 '--- GGG   CCC --- 5 '
AhyI, CfrJ4I, EaeAI, EclRI, Pac25I, PspAI, TspMI, XcyI, XmaI, XmaCI
SmiIStreptococcus milleri S 5 'ATTTAAAT
3 'TAAATTTA
5 '--- ATTT   AAAT --- 3 '
3 '--- TAAA   TTTA --- 5 '
SmiMISphingobacterium mizutae M 5 'CAYN4RTG
3 'GTRN4YAC
5 '--- CAYNN   NNRTG --- 3 '
3 '--- GTRNN   NNYAC --- 5 '
SmlIStenotrophomonas maltophilia 5 'CTYRAG
3 'GARYTC
5 '--- C.   TYRAG --- 3 '
3 '--- GARYT   C --- 5 '
SmuISphingobacterium multivorum RFL21 5 'CCCGC
3 'GGGCG
5 '--- CCCGCNNNN   NN --- 3 '
3 '--- GGGCGNNNNNN   --- 5'
SmuEIStreptococcus mutans E 5 'GGWCC
3 'CCWGG
5 '--- G.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 '
Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, VpaK11BI
SnaBISphaerotilus natans 5 'TACGTA
3 'ATGCAT
5 '--- TAC   GTA --- 3 '
3 '--- ATG   KOCOUR --- 5 '
SniIStreptomyces niveus 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, MvaI, SspAI
SnoIStreptomyces novocastria 5 'GTGCAC
3 'CACGTG
5 '--- G.   TGCAC --- 3 '
3 '--- CACGT   G --- 5 '
Alw44I, ApaLI, VneI
SolIStreptoverticillium olivoverticillatum 5 'GGATCC
3 'CCTAGG
5 '--- G.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 '
AccEBI, AliI, ApaCI, BamHI, Bce751I, CelI, OkrAI, SolI, SurI
Sol10179IStreptomyces olivochromogenes ST10179 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI
LázněSynechococus parietina 5 'GCATGC
3 'CGTACG
5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- C.   GTACG --- 5 '
SpeISphaerotilus natans 5 'ACTAGT
3 'TGATCA
5 '--- A   CTAGT --- 3 '
3 '--- TGATC   A --- 5 '
AhII, AclNI, BcuI
SphI [7]Streptomyces phaeochromogenes 5 'GCATGC
3 'CGTACG
5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- C.   GTACG --- 5 '
SplISpirulina platensis 5 'CGTACG
3 'GCATGC
5 '--- C.   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
SpmISphingobacterium multivorum RFL21 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA
5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 '
BanIII, BbvAII, BdiI, BscI, Bsa29I, BspJI, ClaI, LcaI, PgaI, Ssp27144I
SpoISalmonella potsdam 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT
5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 '
SpuIStreptomyces pulveraceus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SrfIStreptomyces sp. 5 'GCCCGGGC
3 'CGGGCCCG
5 '--- GCCC   GGGC --- 3 '
3 '--- CGGG   CCCG --- 5 '
SrlISelenomonas ruminantium lactilytica 84 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- G.   CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC   G --- 5 '
Srl5DISelenomonas ruminantium 5 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G.   ACGTC --- 5 '
AliAJI, Asp713I, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Pfl21I, PstI, SflI, Srl5DI
Srl32DIISelenomonas ruminantium 32 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- G.   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
Srl55DISelenomonas ruminantium lactilytica 55 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- G.   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
Srl56DISelenomonas ruminantium 56 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- C.   TRYAG --- 3 '
3 '--- GAYRT   C --- 5 '
SruISelenomonas ruminantium 18D 5 'TTTAAA
3 'AAATTT
5 '--- TTT   AAA --- 3 '
3 '--- AAA   TTT --- 5 '
AhaIII, DraI, PauAII
Sru4DISelenomonas ruminantium 5 'ATTAAT
3 'TAATTA
5 '--- AT   TAAT --- 3 '
3 '--- TAAT   TA --- 5 '
Asse, AsnI, BpoAI, PshBI, VspI
Sru30DISelenomonas ruminantium 30 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AATI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, SseBI, SteI, StuI
SsbISvrab Streptomyces 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA
5 '--- A   AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA   A --- 5 '
SscL1IStaphylococcus sp. L1 5 'GANTC
3 'CTNAG
5 '--- G.   ANTC --- 3 '
3 '--- CTNA   G --- 5 '
Sse9ISporosarcina sp. 9 5 'AATT
3 'TTAA
5' ---   AATT --- 3 '
3 '--- TTAA   --- 5'
Sse232IStreptomyces sp. RH232 5 'CGCCGGCG
3 'GCGGCCGC
5 '--- CG   CCGGCG --- 3 '
3 '--- GCGGCC   GC --- 5 '
Sse1825IStreptomyces sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG
5 '--- GG   GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG   GG --- 5 '
Sse8387IStreptomyces sp. 8387 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
Sse8647IStreptomyces sp. 5 'AGGWCCT
3 'TCCWGGA
5 '--- AG   GWCCT --- 3 '
3 '--- TCCWG   GA --- 5 '
SseAIStreptomyces sp. 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG
5 '--- GG   CGCC --- 3 '
3 '--- CCGC   GG --- 5 '
SseBIStreptomyces sp. 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AATI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SteI, StuI
SshAISalmonella shikmonah 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC
5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- GGANT   CC --- 5 '
AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI
SsiIStaphylococcus sciuri RFL1 5 'CCGC
3 'GGCG
5 '--- C.   CGC --- 3 '
3 '--- GGC   G --- 5 '
AciI
SsiAIStaphylococcus sp. A 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspAI, BstKTI, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
SsiBIStaphylococcus sp. B 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspFI, BstKTI, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
SslIStreptococcus salivarius thermophilus 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, EcoRII, MvaI
SSOIShigella sonnei 47 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- G.   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
SsoIIShigella sonnei 47 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
SspISphaerotilus sp. 5 'AATATT
3 'TTATAA
5 '--- AAT   ATT --- 3 '
3 '--- TTA   TAA --- 5 '
Ssp1IStreptomyces sp. RFL1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- TT   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PlaII, SfuI, SspRFI, SviI
Ssp4800IStreptomyces sp. BMTU 4800 5 'TGTACA
3 'ACATGT
5 '--- T.   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   T --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I,
BsrGI, BstAUI, SspBI
Ssp5230IStreptomyces sp. 5230 5 'GACGTC
3 'CTGCAG
5 '--- GACGT   C --- 3 '
3 '--- C.   TGCAG --- 5 '
AatII, ZraI
Ssp27144ISynechococcus sp. 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA
5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 '
BanIII, BavCI, BbvAII, BscI, BspJI, BspOVII, BstNZ169I, ClaI, LcaI
SspAISynechococcus sp. 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5' ---   CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC   --- 5'
AeuI, AorI, Bse17I, BspNI, Bst2I, EcoRII, SniI, SslI, SspAI, ZanI
SspBIStreptomyces sp. 5 'TGTACA
3 'ACATGT
5 '--- T.   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   T --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I,
BsrGI, BstAUI, Ssp4800I
SspCIStreptomyces sp. 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SspD5IStaphylococcus sp. D5 5 'GGTGA
3 'CCACT
5 '--- GGTGAN7N   --- 3'
3 '--- CCACTN7N   --- 5'
AsuHPI, HphI
SspD5IIStaphylococcus sp. D5 5 'ATGCAT
3 'TACGTA
5 '--- ATGCA   T --- 3 '
3 '--- T.   ACGTA --- 5 '
Csp68KIII, EcoT22I, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SepI, Zsp2I
SspRFISynechococcus sp. RF-1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- TT   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I, SviI
SSRIStaphylococcus saprophyticus B6 5 'GTTAAC
3 'CAATTG
5 '--- GTT   AAC --- 3 '
3 '--- CAA   TTG --- 5 '
SstIStreptomyces stanford 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG
5 '--- GAGCT   C --- 3 '
3 '--- C.   TCGAG --- 5 '
SstIIStreptomyces stanford 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Sst12IStreptomyces sp. ST-12 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- G.   ACGTC --- 5 '
Asp713I, BloHII, BspMAI, BsuBI, CfuII, Psp23I, PstI, SflI, Srl5DI
SteIStreptomyces tendae 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AATI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SseBI, StuI
SthISalmonella thompson RR356 5 'GGTACC
3 'CCATGG
5 '--- G.   GTACC --- 3 '
3 '--- CCATG   G --- 5 '
Acc65I, AhaB8I, Asp718I, KpnI,
Sth117IStreptococcus thermophilus ST117 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BsiLI, BstNI, BstOI, Bst2UI, EcoRII, MvaI, SspAI
Sth132IStreptococcus thermophilus 5 'CCCG
3 'GGGC
5 '--- CCCGNNNN   NNNN --- 3 '
3 '--- GGGCNNNNNNNN   --- 5'
Sth134IStreptococcus thermophilus 134 5 'CCGG
3 'GGCC
5 '--- C.   CGG --- 3 '
3 '--- GGC   C --- 5 '
Sth368IStreptococcus thermophilus CNRZ368 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspFI, BstKTI, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
StrIStreptomyces thermodiastaticus 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- C.   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
SvStreptococcus sanguis 54 5 'GGATG
3 'CCTAC
5 '--- GGATGN8NN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCTACN8NNNNNN   --- 5'
STUI [8]Streptomyces tubercidicus 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   CCT --- 3 '
3 '--- TCC   GGA --- 5 '
AATI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI
StyISalmonella typhi 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC
5 '--- C.   CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC   C --- 5 '
StyD4ISalmonella typhi D4 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
SuaiSulfolobus acidocaldarius 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
SuiISulfolobus islandicus REN2HI 5 'GCWGC
3 'CGWCG
5 '--- G.   CWGC --- 3 '
3 '--- CGWC   G --- 5 '
AceI, ApeKI, Taq52I, TseI
SunISynechococcus uniformis 5 'CGTACG
3 'GCATGC
5 '--- C.   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
SurISporosarcina ureae 2 5 'GGATCC
3 'CCTAGG
5 '--- G.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 '
AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, Bce751I, OkrAI, RspLKII, SolI
SviIStreptomyces violochromogenes 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- TT   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
AsuII, Bpu14I, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I
SwaIStaphylococcus warneri 5 'ATTTAAAT
3 'TAAATTTA
5 '--- ATTT   AAAT --- 3 '
3 '--- TAAA   TTTA --- 5 '

Poznámky

  1. ^ Smith HO, Nathans D (prosinec 1973). „Dopis: Navrhovaná nomenklatura pro modifikace a restrikční systémy bakteriálních hostitelů a jejich enzymy“. J. Mol. Biol. 81 (3): 419–23. doi:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID  4588280.
  2. ^ Roberts RJ, Belfort M, Bestor T, Bhagwat AS, Bickle TA, Bitinaite J, Blumenthal RM, Degtyarev SK, Dryden DT, Dybvig K, Firman K, Gromova ES, Gumport RI, Halford SE, Hattman S, Heitman J, Hornby DP , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (duben 2003). „Názvosloví pro restrikční enzymy, DNA methyltransferázy, naváděcí endonukleázy a jejich geny“. Nucleic Acids Res. 31 (7): 1805–12. doi:10.1093 / nar / gkg274. PMC  152790. PMID  12654995.
  3. ^ Jeremy MB, John LT, Lubert S (2002). "3. Struktura a funkce proteinů". Biochemie. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN  0-7167-4684-0.
  4. ^ Anfinsen C.B. (1973). „Principy, kterými se řídí skládání proteinových řetězců“. Věda. 181 (4096): 223–30. doi:10.1126 / science.181.4096.223. PMID  4124164.
  5. ^ Kessler C, Manta V (srpen 1990). "Specifičnost restrikčních endonukleáz a modifikace DNA methyltransferáz a recenze (vydání 3)". Gen. 92 (1–2): 1–248. doi:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-B. PMID  2172084.
  6. ^ Pingoud A, Jeltsch A (září 2001). "Struktura a funkce restrikčních endonukleáz typu II". Nucleic Acids Res. 29 (18): 3705–27. doi:10.1093 / nar / 29.18.3705. PMC  55916. PMID  11557805.
  7. ^ A b C d Monty Krieger; Matthew P Scott; Matsudaira, Paul T .; Lodish, Harvey F .; Darnell, James E .; Lawrence Zipursky; Kaiser, Chris; Arnold Berk (2004). Molekulární buněčná biologie (5. vydání). New York: W.H. Freeman a společnost. ISBN  0-7167-4366-3.
  8. ^ Shimotsu H, Takahashi H, Saito H (listopad 1980). „Nová místně specifická endonukleáza StuI od Streptomyces tubercidicus". Gen. 11 (3–4): 219–25. doi:10.1016/0378-1119(80)90062-1. PMID  6260571.