Azospirillum brasilense - Azospirillum brasilense
| Azospirillum brasilense | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: | A. brasilense Tarrand, Krieg & Döbereiner, 1978 |
Azospirillum brasilense je dobře studovaný, fixace dusíkem (diazotrof ), geneticky přitažlivá, gramnegativní bakterie alfa-proteobacterium, poprvé popsaná v Brazílii (v publikaci v roce 1978) skupinou Johanna Döbereiner a poté obdrží jméno „brasilense“.[1] A. brasilense je schopen fixovat dusík v přítomnosti nízkých hladin kyslíku, což z něj dělá mikroaerobní diazotrof. Izolát z rodu Azospirillum byl izolován z půd chudých na dusík v Nizozemsku v roce 1925, nicméně tento druh A. brasilense byl poprvé popsán v roce 1978 v Brazílii,[1] protože tento rod je široce nalezený v rhizosféry trav po celém světě, kde poskytuje podporu růstu rostlin.[2][3] Diskutuje se o tom, zda dochází k podpoře růstu přímým tokem dusíku z bakterií do rostliny nebo regulací hormonů.[4] Dva nejčastěji studované kmeny jsou Sp7 (ATCC 29145) a Sp245, oba jsou brazilské izoláty izolované z tropických trav z Seropedica v Brazílii.[1]
Genom A. brasilense Sp245 byl sekvenován a má velikost 7 Mbps a šíří se na 7 chromozomech. Vysoký obsah GC (70%) z něj činí náročnou práci.[5] Sp245 lze transformovat s počátkem replikace OriV plazmidy přes časování a elektroporace. Kmen je nativně odolný vůči oběma spektinomycin a ampicilin antibiotika. Kanamycin odpor se používá jako volitelný marker.[6] A. brasilense má vysokou rychlost evoluční adaptace způsobenou mutací kodonů a transposon poskakování.
Kmen původně klasifikovaný jako Roseomonas fauriae byl překlasifikován jako A. brasilense. Poprvé byla izolována z rány ženy na Havaji v roce 1971 a byla pojmenována pro Yvonne Faur „pro její přínos bakteriologii v oblasti veřejného zdraví a konkrétně pro její přínos k rozpoznání růžově pigmentovaných bakterií“.[8][9]
Reference
- ^ A b C Tarrand, Jeffrey J .; Krieg, Noel R .; Döbereiner, Johanna (1978). „Taxonomická studie skupiny Spirillum lipoferum s popisy nového rodu Azospirillum gen. Nov. A dvou druhů, Azospirillum lipoferum (Beijerinck) comb. Nov. A Azospirillum brasilense sp. Nov.“ Canadian Journal of Microbiology. 24 (8): 967–980. doi:10,1139 / m78-160. ISSN 0008-4166. PMID 356945.
- ^ Holguin, G .; Patten, C. L .; Glick, B. R. (07.04.1999). "Genetika a molekulární biologie Azospirillum". Biologie a plodnost půd. 29 (1): 10–23. doi:10,1007 / s003740050519. ISSN 0178-2762.
- ^ Tien TM, Gaskins MH, Hubbell DH (květen 1979). „Rostlinné růstové látky produkované Azospirillum brasilense a jejich vliv na růst proso perleťového (Pennisetum americanum L.)“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 37 (5): 1016–24. PMC 243341. PMID 16345372. Citováno 2013-07-18.
- ^ Boddey, Robert M .; Urquiaga, Segundo; Alves, Bruno J.R .; Reis, Veronica (květen 2003). "Endofytická fixace dusíku v cukrové třtině: současné znalosti a budoucí aplikace". Rostlina a půda. 252 (1): 139–149. doi:10.1023 / a: 1024152126541. ISSN 0032-079X.
- ^ Mammedov, TG .; Pienaar, E .; Whitney, SE .; TerMaat, JR .; Carvill, G .; Goliath, R .; Subramanian, A .; Viljoen, HJ. (Prosinec 2008). „Základní studie amplifikace PCR šablon DNA bohatých na GC“. Výpočetní biologie a chemie. 32 (6): 452–457. doi:10.1016 / j.compbiolchem.2008.07.021. ISSN 1476-9271. PMC 2727727. PMID 18760969.
- ^ Přednáška o kvalifikační zkoušce na PhD, katedra Bioinženýrství v Stanfordská Univerzita, Tim Schnabel, 12. 12. 2017
- ^ „KEGG GENOME: Azospirillum brasilense Sp245“. www.genome.jp. Citováno 2018-11-05.
- ^ Helsel, L. O .; Hollis, D. G .; Steigerwalt, A. G .; Levett, P. N. (2006). „Reklasifikace Roseomonas fauriae Rihs et al. 1998 jako pozdější heterotypické synonymum Azospirillum brasilense Tarrand et al. 1979“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 56 (12): 2753–2755. doi:10.1099 / ijs.0.64549-0. PMID 17158972.
- ^ Rihs JD, Brenner DJ, Weaver RE, Steigerwalt AG, Hollis DG, Yu VL. Roseomonas, nový rod spojený s bakteremií a jinými lidskými infekcemi. Časopis klinické mikrobiologie. 1993 1. prosince; 31 (12): 3275-83.
externí odkazy
- Okon Y, Heytler PG, Hardy RW (září 1983). „N (2) Fixation by Azospirillum brasilense and its Incorporation into Host Setaria italica“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 46 (3): 694–7. PMC 239336. PMID 16346386. Citováno 2013-07-18.
- Swędrzyńska, D. „Vliv inokulace Azospirillum brasilense na vývoj a výnos ozimé pšenice a ovsa při různém pěstování.“ Polish Journal of Environmental Studies 9.5 (2000): 423-428.
- Barbieri, Paola; Zanelli, Tiziano; Galli, Enrica; Zanetti, Giuliana (1986). „Pšenice naočkována Azospirillum brasilenseSp6 a některými mutanty změněna při fixaci dusíku a produkci kyseliny indol-3-octové“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 36 (1): 87–90. doi:10.1111 / j.1574-6968.1986.tb01672.x. ISSN 0378-1097.
