Aeropyrum pernix - Aeropyrum pernix
| Aeropyrum pernix | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: | A. pernix |
| Binomické jméno | |
| Aeropyrum pernix Sako a kol. 1996 | |
Aeropyrum pernix je druh extremofilní archaean v archaeanském kmeni Crenarchaeota. Je to povinně teplomilné druh. První vzorky byly izolovány z sedimenty v moři u pobřeží Japonsko.
Objev
Aeropyrum pernix byl první přísně aerobní hypertermofilní Archaea být objeven. Původně byl izolován z vyhřívaných mořských sedimentů a odvzdušňovací vody shromážděné v roce 1996 z a solfataric ventilace na ostrově Kodakara-jima v Kjúšú, Japonsko.[1]
Struktura genomu
Je to kompletní genom byl sekvenován v roce 1999 a má velikost 1 669 kilobází, přičemž je možné 2 694 geny zjištěno.[2] Byly nalezeny všechny geny v cyklu TCA, kromě genů z α-ketoglutarát dehydrogenáza. Místo toho byly identifikovány geny kódující dvě podjednotky 2-oxokyseliny: ferredoxin oxidoreduktázu.
Vlastnosti
Buňky Aeropyrum pernix jsou sférického tvaru a přibližně 1 µm v průměru. Obálka obklopující buňky Aeropyrum je široká asi 25 nm. Organismy rostou při teplotě mezi 70 a 100 ° C (optimálně, 90 až 95 ° C), při pH 5 až 9 (optimálně, pH 7) a při slanost 1,8 až 7% (optimální, 3,5% slanost). Růst organismů není detekován při 68 nebo 102 ° C. Pod 1,5% slaností buňky lyžují nízkým osmotickým šokem. Buňky organismů jsou citlivé na chloramfenikol a necitlivé na ampicilin, vankomycin a cykloserin. Dobře roste bílkovinné látky, s a zdvojnásobení času za těchto podmínek asi 200 minut.[1]
Reference
- ^ A b Sako Y, Nomura N, Uchida A a kol. (1996). „Aeropyrum pernix gen. Nov., Sp. Nov., Nový aerobní hypertermofilní archaeon rostoucí při teplotách do 100 stupňů C“ (PDF). Int. J. Syst. Bacteriol. 46 (4): 1070–7. doi:10.1099/00207713-46-4-1070. PMID 8863437. Archivovány od originál (PDF) dne 02.12.2008. Citováno 2007-11-23.
- ^ Kawarabayasi Y, Hino Y, Horikawa H a kol. (1999). „Complete genome sequence of a aerobic hyper-thermophilic crenarchaeon, Aeropyrum pernix K1“ (PDF). DNA Res. 6 (2): 83–101, 145–52. doi:10.1093 / dnares / 6.2.83. PMID 10382966.
Další čtení
- Bhuiya, Mohammad Wadud; Suryadi, Jimmy; Zhou, Zholi; Brown, Bernard Andrew, II (5. srpna 2013). „Struktura multifunkčního proteinu Aeropyrum pernix L7Ae a pohled na jeho extrémní termostabilitu“. Acta Crystallographica oddíl F. 69 (Pt 9): 979–988. doi:10.1107 / S1744309113021799. PMC 3758144. PMID 23989144.
- Daifuku, Takashi; Yoshida, Takashi; Takayuki, Kitamura; Kawaichi, Satoshi; Inoue, Takahiro; Nomura, Keigo; Yoshida, Yui; Kuno, Sotaro; Sako, Yoshihiko (19. července 2013). „Variace prvků souvisejících s viry v rámci syntetických genů hypertermofilního archaeonu aeropyrum“. Appl. Environ. Microbiol. 79 (19): 5891–8. doi:10.1128 / AEM.01089-13. PMC 3811351. PMID 23872576.
- Lee, Pyung Cheon; Mijts, Benjamin N .; Petri, Ralf; Watts, Kevin T .; Schmidt-Dannert, Claudia (16. června 2004). „Změna produktové specificity Aeropyrum pernix farnesylgeranyldifosfát syntázy (Fgs) řízenou evolucí“. Návrh a výběr proteinového inženýrství. 17 (11): 771–777. doi:10,1093 / protein / gzh089. PMID 15548566.
- Ota, Ajda; Gmajner, Dejan; Sentijurc, Marjeta; Ulrih, Natasa Poklar (13. dubna 2012). „Vliv růstového média peeringu Aeropyrum na strukturní vlastnosti a tekutost archeosomů“. Archaea. 2012: 9. doi:10.1155/2012/285152. PMC 3384975. PMID 22778670.
- Sakuraba, Haruhiko; Satoura, Takenori; Kawakam, Ryushi; Kim, Kwang; Kara, Yusuke; Yoneda, Kazunari; Ohshima, Toshihisa (16. dubna 2012). „Krystalová struktura nové barvicí vázané L-prolin dehydrogenázy z Hyperthermophilic Archaeon Aeropyrum Pernix“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (24): 20070–20080. doi:10.1074 / jbc.M111.319038. PMC 3370190. PMID 22511758.