D-aspartát ligáza - D-aspartate ligase

v enzymologie, a D-aspartát ligáza (ES 6.3.1.12 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

ATP + D-aspartát + [beta-GlcNAc- (1-> 4) -Mur₂Ac (oyl-L-Ala-gama-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n ${ displaystyle rightleftharpoons}$ [beta-GlcNAc- (1-> 4) -Mur₂Ac (oyl-L-Ala-gama-D-Glu-6-N- (beta-D-Asp) -L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n + ADP + fosfát

4 substráty tohoto enzymu jsou ATP, D-aspartát, [[beta-GlcNAc- (1-> 4) -Mur2Ac (oyl-L-Ala-gama-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-]] a [[Ala)] n]] , zatímco jeho 4 produkty jsou [[beta-GlcNAc- (1-> 4) -Mur2Ac (oyl-L-Ala-gama-D-Glu-6-N- (beta-D-Asp) -L-]]], [[Lys-D -Ala-D-Ala)] n]], ADP, a fosfát.

Tento enzym patří do rodiny ligázy, konkrétně těch, které tvoří vazby uhlík-dusík jako kyselé-D-amoniakové (nebo aminové) ligázy (amid syntázy). The systematické jméno této třídy enzymů je D-aspartát: [beta-GlcNAc- (1-> 4) -Mur2Ac (oyl-L-Ala-gama-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)] n ligáza (tvorba ADP). Mezi další běžně používaná jména patří Aslfm, UDP-MurNAc-pentapeptid: D-aspartát ligáza, a Enzym aktivující kyselinu D-asparagovou.

Reference

• Staudenbauer W, Strominger JL (1972). "Aktivace kyseliny D-asparagové pro zabudování do peptidoglykanu". J. Biol. Chem. 247 (16): 5095–102. PMID  4262567.
• Staudenbauer W, Willoughby E, Strominger JL (1972). „Další studie enzymu aktivujícího D-asparagovou kyselinu Streptococcus faecalis a jeho připojení k membráně“. J. Biol. Chem. 247 (17): 5289–96. PMID  4626717.
• Galperin MY, Koonin EV (1997). „Různorodá nadrodina enzymů s aktivitou karboxylát-amin / thiol ligázy závislou na ATP“. Protein Sci. 6 (12): 2639–43. doi:10.1002 / pro.5560061218. PMC  2143612. PMID  9416615.
• Heijenoort J, Legrand R, Brouard JP, Rice L, Mainardi JL (2006). „Aslfm, D-aspartát ligáza odpovědná za přidání kyseliny D-asparagové na prekurzor peptidoglykanu Enterococcus faecium“. J. Biol. Chem. 281 (17): 11586–94. doi:10,1074 / jbc.M600114200. PMID  16510449.