GGA1 - GGA1 - Wikipedia

GGA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1J2J, 1JWF, 1JWG, 1NA8, 1NAF, 1 NWM, 1O3X, 1OM9, 1OXZ, 1PY1, 1UJJ, 1 UJK, 1X79, 2DWX, 2DWY, 3G2S, 3G2T, 3G2U, 3G2V, 3G2W
Identifikátory
Aliasy	GGA1, spojené s golgi, ucho obsahující gama adapin, protein vázající ARF 1
Externí ID	OMIM: 606004 MGI: 2146207 HomoloGene: 39250 Genové karty: GGA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	37,633,564 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	78,894,585 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na ADP-ribosylační faktor; • aktivita heterodimerizace proteinu; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• endozom; • Golgiho aparát; • endosomová membrána; • intracelulární; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • komplex adaptéru clathrin; • nukleoplazma; • časná endosomová membrána; • časný endosom; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• transport bílkovin; • buněčný proteinový metabolický proces; • transport intracelulárních proteinů; • transport toxinů; • pozitivní regulace proteinového katabolického procesu; • transport zprostředkovaný vezikuly; • doprava; • Transport Golgiho plazmatickou membránou; • lokalizace bílkovin; • lokalizace proteinu na povrch buněk; • retrográdní transport, endosom do Golgi; • Transport proteinu Golgiho na plazmatickou membránu; • lokalizace proteinu na ciliární membránu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26088
	106039
	ENSG00000100083
	ENSMUSG00000033128
	Q9UJY5
	Q8R0H9
NM_001001560; NM_001001561; NM_001172687; NM_001172688; NM_013365;
	NM_001363771
	NM_145929
	NP_001001560; NP_001166158; NP_001166159; NP_037497; NP_001350700
	NP_666041
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající ADP-ribosylační faktor GGA1 je protein že u lidí je kódován GGA1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů rodiny Golgiho lokalizovaného gamma adaptinu obsahujícího ucho s vazbou ARF (GGA). Členy této rodiny jsou všudypřítomné obalové proteiny, které regulují přenos proteinů mezi trans-Golgi síť a lysozom. Tyto proteiny sdílejí aminoterminální VHS doménu, která zprostředkovává třídění manosové 6-fosfátové receptory v síti trans-Golgi. Obsahují také karboxyterminální oblast s homologií k ušní doméně gama-adapinů. Pro tento gen bylo nalezeno několik alternativně sestřižených variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že GGA1 komunikovat s Sortilin 1,^[9] BACE2,^[10] RABEP1^[11] a ARF3.^[12]^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100083 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033128 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (květen 2000). „Rodina proteinů s gama-adapinovými a VHS doménami, které usnadňují obchodování mezi trans-Golgiho sítí a vakuolem / lysozomem“. J Cell Biol. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.
^ Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (květen 2000). „GGA: rodina proteinů vázajících ribosylační faktor ADP souvisejících s adaptéry a spojených s komplexem Golgi“. J Cell Biol. 149 (1): 81–94. doi:10.1083 / jcb.149.1.81. PMC 2175099. PMID 10747089.
^ Xie L, Boyle D, Sanford D, Scherer PE, Pessin JE, Mora S (březen 2006). „Intracelulární přenos a sekrece adiponektinu závisí na vezikulích potažených GGA“. J Biol Chem. 281 (11): 7253–9. doi:10,1074 / jbc.M511313200. PMID 16407204.
^ „Entrez Gene: GGA1 golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1“.
^ Jacobsen, Linda; Madsen Peder; Nielsen Morten S; Geraerts Wijnand P M; Gliemann Jørgen; Smit August B; Petersen Claus M (leden 2002). "Cytoplazmatická doména sorLA interaguje s GGA1 a -2 a definuje minimální požadavky na vazbu GGA". FEBS Lett. 511 (1–3): 155–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. ISSN 0014-5793. PMID 11821067.
^ On, Xiangyuan; Chang Wan-Pin; Koelsch Gerald; Tang Jordan (červenec 2002). „Cytosolická doména memapsinu 2 (beta-sekretáza) se váže na domény VHS GGA1 a GGA2: důsledky pro mechanismus endocytózy memapsinu 2“. FEBS Lett. 524 (1–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. ISSN 0014-5793. PMID 12135764.
^ Mattera, Rafael; Arighi Cecilia N; Domek Robert; Zerial Marino; Bonifacino Juan S (leden 2003). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. EMBO J.. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. ISSN 0261-4189. PMC 140067. PMID 12505986.
^ Boman, Annette L; Salo Paul D; Hauglund Melissa J; Strand Nicole L; Rensink Shelly J; Zhdankina Olga (září 2002). „Interakce ADP-ribosylační faktor (ARF) není dostatečná pro funkci nebo lokalizaci kvasinkového GGA proteinu“. Mol. Biol. Buňka. 13 (9): 3078–95. doi:10,1091 / mbc.E02-02-0078. ISSN 1059-1524. PMC 124144. PMID 12221117.
^ Boman, AL; Zhang Cj; Zhu X; Kahn RA (duben 2000). "Rodina efektorů faktoru ADP-ribosylace, které mohou změnit transport membrány přes trans-Golgiho". Mol. Biol. Buňka. 11 (4): 1241–55. doi:10,1091 / mbc.11.4.1241. ISSN 1059-1524. PMC 14844. PMID 10749927.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Boman AL, Zhang C, Zhu X, Kahn RA (2000). "Rodina efektorů faktoru ADP-ribosylace, které mohou změnit transport membrány přes trans-Golgiho". Mol. Biol. Buňka. 11 (4): 1241–55. doi:10,1091 / mbc.11.4.1241. PMC 14844. PMID 10749927.
Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
Zhdankina O, Strand NL, Redmond JM, Boman AL (2001). „Kvasinkové GGA proteiny interagují s GTP vázaným Arf a usnadňují transport přes Golgi“. Droždí. 18 (1): 1–18. doi:10.1002 / 1097-0061 (200101) 18: 1 <1 :: AID-YEA644> 3.0.CO; 2-5. PMID 11124697.
Puertollano R, Randazzo PA, Presley JF a kol. (2001). „GGA podporují nábor klathrinu do TGN závislý na ARF“. Buňka. 105 (1): 93–102. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00299-9. PMID 11301005.
Puertollano R, Aguilar RC, Gorshkova I a kol. (2001). "Třídění manózo-6-fosfátových receptorů zprostředkovaných GGA". Věda. 292 (5522): 1712–6. Bibcode:2001Sci ... 292.1712P. doi:10.1126 / science.1060750. PMID 11387475.
Takatsu H, Katoh Y, Shiba Y, Nakayama K (2001). „Golgiho lokalizace, ušní homologická doména gama-adapinu, proteiny vázající ADP-ribosylační faktor (GGA) interagují s kyselými dileucinovými sekvencemi v cytoplazmatických doménách třídících receptorů prostřednictvím jejich domén Vps27p / Hrs / STAM (VHS)“. J. Biol. Chem. 276 (30): 28541–5. doi:10,1074 / jbc.C100218200. PMID 11390366.
Jacobsen L, Madsen P, Nielsen MS a kol. (2002). "Cytoplazmatická doména sorLA interaguje s GGA1 a -2 a definuje minimální požadavky na vazbu GGA". FEBS Lett. 511 (1–3): 155–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. PMID 11821067.
Shiba T, Takatsu H, Nogi T a kol. (2002). "Strukturální základ pro rozpoznávání sekvence dileucinu v kyselém klastru pomocí GGA1". Příroda. 415 (6874): 937–41. Bibcode:2002 Natur.415..937S. doi:10.1038 / 415937a. PMID 11859376.
Takatsu H, Yoshino K, Toda K, Nakayama K (2002). „GGA proteiny se asociují s Golgiho membránami prostřednictvím interakce mezi jejich GGAH doménami a ADP-ribosylačními faktory“. Biochem. J. 365 (Pt 2): 369–78. doi:10.1042 / BJ20020428. PMC 1222692. PMID 11950392.
Doray B, Bruns K, Ghosh P, Kornfeld SA (2002). "Autoinhibice vazebného místa pro ligand GGA1 / 3 VHS domén interním kyselým motivem klastru-dileucinu". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (12): 8072–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.8072D. doi:10.1073 / pnas.082235699. PMC 123022. PMID 12060753.
He X, Chang WP, Koelsch G, Tang J (2002). „Cytosolická doména memapsinu 2 (beta-sekretáza) se váže na domény VHS GGA1 a GGA2: důsledky pro mechanismus endocytózy memapsinu 2“. FEBS Lett. 524 (1–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. PMID 12135764.
Boman AL, Salo PD, Hauglund MJ a kol. (2003). „Interakce ADP-ribosylační faktor (ARF) není dostatečná pro funkci nebo lokalizaci kvasinkového GGA proteinu“. Mol. Biol. Buňka. 13 (9): 3078–95. doi:10,1091 / mbc.E02-02-0078. PMC 124144. PMID 12221117.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mattera R, Arighi CN, Lodge R a kol. (2003). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. EMBO J.. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. PMC 140067. PMID 12505986.
Mills IG, Praefcke GJ, Vallis Y a kol. (2003). „EpsinR: AP1 / klatrin interagující protein podílející se na obchodování vezikul“. J. Cell Biol. 160 (2): 213–22. doi:10.1083 / jcb.200208023. PMC 2172650. PMID 12538641.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100083 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033128 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10747088-5] Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (květen 2000). „Rodina proteinů s gama-adapinovými a VHS doménami, které usnadňují obchodování mezi trans-Golgiho sítí a vakuolem / lysozomem“. J Cell Biol. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.

[pmid10747089-6] Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (květen 2000). „GGA: rodina proteinů vázajících ribosylační faktor ADP souvisejících s adaptéry a spojených s komplexem Golgi“. J Cell Biol. 149 (1): 81–94. doi:10.1083 / jcb.149.1.81. PMC 2175099. PMID 10747089.

[pmid16407204-7] Xie L, Boyle D, Sanford D, Scherer PE, Pessin JE, Mora S (březen 2006). „Intracelulární přenos a sekrece adiponektinu závisí na vezikulích potažených GGA“. J Biol Chem. 281 (11): 7253–9. doi:10,1074 / jbc.M511313200. PMID 16407204.

[entrez-8] „Entrez Gene: GGA1 golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1“.

[pmid11821067-9] Jacobsen, Linda; Madsen Peder; Nielsen Morten S; Geraerts Wijnand P M; Gliemann Jørgen; Smit August B; Petersen Claus M (leden 2002). "Cytoplazmatická doména sorLA interaguje s GGA1 a -2 a definuje minimální požadavky na vazbu GGA". FEBS Lett. 511 (1–3): 155–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. ISSN 0014-5793. PMID 11821067.

[pmid12135764-10] On, Xiangyuan; Chang Wan-Pin; Koelsch Gerald; Tang Jordan (červenec 2002). „Cytosolická doména memapsinu 2 (beta-sekretáza) se váže na domény VHS GGA1 a GGA2: důsledky pro mechanismus endocytózy memapsinu 2“. FEBS Lett. 524 (1–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. ISSN 0014-5793. PMID 12135764.

[pmid12505986-11] Mattera, Rafael; Arighi Cecilia N; Domek Robert; Zerial Marino; Bonifacino Juan S (leden 2003). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. EMBO J.. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. ISSN 0261-4189. PMC 140067. PMID 12505986.

[pmid12221117-12] Boman, Annette L; Salo Paul D; Hauglund Melissa J; Strand Nicole L; Rensink Shelly J; Zhdankina Olga (září 2002). „Interakce ADP-ribosylační faktor (ARF) není dostatečná pro funkci nebo lokalizaci kvasinkového GGA proteinu“. Mol. Biol. Buňka. 13 (9): 3078–95. doi:10,1091 / mbc.E02-02-0078. ISSN 1059-1524. PMC 124144. PMID 12221117.

[pmid10749927-13] Boman, AL; Zhang Cj; Zhu X; Kahn RA (duben 2000). "Rodina efektorů faktoru ADP-ribosylace, které mohou změnit transport membrány přes trans-Golgiho". Mol. Biol. Buňka. 11 (4): 1241–55. doi:10,1091 / mbc.11.4.1241. ISSN 1059-1524. PMC 14844. PMID 10749927.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]