Arginin deimináza - Arginine deiminase
| arginin deimináza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.5.3.6 | ||||||||
| Číslo CAS | 9027-98-9 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, an arginin deimináza (ES 3.5.3.6 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- L-arginin + H2Ó L-citrulin + NH3
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou L-arginin a H2Ó, zatímco jeho dva produkty jsou L-citrulin a NH3.
Tento enzym patří do rodiny hydrolázy, ty, které působí na vazby uhlík-dusík jiné než peptidové vazby, konkrétně v lineárních amidinách. The systematické jméno této třídy enzymů je L-arginin iminohydroláza. Mezi další běžně používaná jména patří arginin dihydroláza, citrulin imináza, a L-arginin deimináza. Tento enzym se účastní metabolismus argininu a prolinů. Tento enzym je široce exprimován v bakteriích, včetně streptokok a aktinomyces. Exprese bakteriální argininiminiminázy mohla být regulována různými faktory prostředí.
Nedávno nový enzym že katalyzuje the chemická reakce
- L-arginin + 2H2Ó L-ornithin + 2NH3 + CO2 byl identifikován v sinice[1] který by měl být pojmenován jako arginin dihydroláza.
Strukturální studie
Ke konci roku 2007, 7 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1LXY, 1RXX, 1S9R, 2A9G, 2AAF, 2ABR, a 2ACI.
Reference
- OGINSKY EL, GEHRIG RF (1952). „Arginin dihydrolázový systém Streptococcus faecalis. II Vlastnosti arginin desimidázy“. J. Biol. Chem. 198 (2): 799–805. PMID 12999797.
- LIU Y, BURNE RA (2009). „Vícenásobné dvousložkové systémy modulují generaci alkálií u Streptococcus gordonii v reakci na environmentální zátěž“. J. Bacteriol. 191 (23): 7353–7362. doi:10.1128 / JB.01053-09. PMC 2786566. PMID 19783634.
- PETRAK B, SULLIAN L, RETARN S (1957). "Chování purifikované argininiminiminázy ze S. faecalis". Oblouk. Biochem. Biophys. 69: 186–197. doi:10.1016 / 0003-9861 (57) 90485-X. PMID 13445192.
- RATNER S (1954). Syntéza močoviny a metabolismus argininu a citrulinu. Adv. Enzymol. Relat. Subj. Biochem. Pokroky v enzymologii a souvisejících oblastech molekulární biologie. 15. 319–87. doi:10.1002 / 9780470122600.ch8. ISBN 9780470122600. PMID 13158183.
- LIU Y, BURNE RA (2008). „Regulace prostředí a fáze růstu genů argininiminiminázy Streptococcus gordonii“. Appl Environ Microbiol. 74 (16): 5023–5030. doi:10.1128 / AEM.00556-08. PMC 2519279. PMID 18552185.
| Tento EC 3.5 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |