Sushi doména - Sushi domain - Wikipedia
Sushi doména (SCR / CCP) | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||
Symbol | Sushi | ||||||||||
Pfam | PF00084 | ||||||||||
InterPro | IPR000436 | ||||||||||
KOCOUR | 1g4g | ||||||||||
SCOP2 | 1hfi / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd00033 | ||||||||||
|
Sushi doména je evolučně konzervovaný proteinová doména. Je také známý jako Doplňte kontrolní protein (CCP) moduly nebo krátké opakování shody (SCR). Název je odvozen od vizuální podobnosti domény s nigiri sushi když primární struktura je nakreslena a ukazuje smyčky vytvořené pomocí disulfid vazby.[1]
Sushi domény existují v široké škále proteinů komplementu a adheze. Struktura je pro tuto doménu známá; je založen na a beta sendvič uspořádání - jedna tvář složená ze tří β-řetězce vodíkově vázané tvořit ve svém středu trojvláknovou oblast a druhá tvář se vytvořila ze dvou samostatných β-řetězců.[2]
CD21 (také nazývaný C3d receptor, CR2, Virus Epstein Barr nebo EBV-R) je receptor pro EBV a pro C3d, C3dg a iC3b. Komponenty komplementu se mohou aktivovat B buňky prostřednictvím CD21. CD21 je součástí velkého komplexu přenosu signálu, který zahrnuje také CD19, CD81 a Leu13.
Některé z proteinů v této skupině jsou zodpovědné za molekulární bázi antigenů krevních skupin, povrchových markerů na vnější straně membrány červených krvinek. Většina z těchto markerů jsou proteiny, ale některé jsou sacharidy připojené k lipidům nebo proteinům.[3] Faktor urychlující rozpad komplementu (Antigen CD55) patří do systému krevních skupin Cromer a je spojen s Cr (a), Dr (a), Es (a), Tc (a / b / c), Wd (a), WES (a / b), antigeny IFC a UMC. Receptor komplementu typu 1 (receptor C3b / C4b) (Antigen CD35) patří do systému krevních skupin Knops a je spojován s antigeny Kn (a / b), McC (a), Sl (a) a Yk (a).
Podskupiny
Příklady
Lidské geny kódující proteiny obsahující tuto doménu zahrnují:
- AGC1, APOH,
- BCAN, BF,
- C1R, C1S, C2, C4BPA, C4BPB, C6, C7, CD46, CD55, CFB, CFH, CFHR1, CFHR2, CFHR3, CFHR4, CFHR5, CR1, CR1L, CR2, CSMD1, CSMD2, CSMD3, CSPG3,
- DAF,
- F13B, FHR4, GABBR1,
- HP,
- IL2RA,
- KIAA0247,
- MASP1, MASP2,
- PAPPA, PAPPA2, psk-3,
- RAMPA,
- SEL-OB, SELE, PRODAT, SELP, SEZ6, SEZ6L, SEZ6L2, SNED1, SRPX, SRPX2, SUSD1, SUSD2, SUSD4, SVEP1, SEZ6L2,
- TAOK1, TPO, VCAN
Reference
- ^ Ichinose, Akitada; Bottenus, Ralph E .; Davie, hrabě W. "Struktura transglutamináz". The Journal of Biological Chemistry. 265: 13411–13414. PMID 1974250.
- ^ Campbell ID, Baron M, den AJ, Sim RB, Norman DG, Barlow PN (1991). "Trojrozměrná struktura proteinového modulu kontroly komplementu v roztoku". J. Mol. Biol. 219 (4): 717–725. doi:10.1016 / 0022-2836 (91) 90666-T. PMID 1829116.
- ^ Lomas-Francis, Christine; Reid, Marion E. (2004). Antigen krevní skupiny: Factbook. Boston: Academic Press. ISBN 0-12-586585-6.