SnRNP70 - SnRNP70
snRNP70 také známý jako U1 malý jaderný ribonukleoprotein 70 kDa je protein[5] že u lidí je kódován SNRNP70 gen.[6][7] snRNP70 je malý nukleární ribonukleoprotein který se sdružuje s U1 spliceozomální RNA, tvořící U1snRNP jako hlavní součást spliceosome. Protein U1-70K a další složky komplexu spliceosome tvoří agregáty nerozpustné v detergentu jak u sporadických, tak u rodinných případů Alzheimerova choroba.[8][9] U1-70K se lokalizuje společně s Tau v neurofibrilární spleti v Alzheimerova choroba.
Interakce
snRNP70 bylo prokázáno komunikovat s ASF / SF2,[10][11] SRPK1,[12][13] a ZRANB2.[14]
Role v autoimunitě
Protilátky proti snRNP70 jsou spojeny s smíšené onemocnění pojivové tkáně.[15]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104852 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000063511 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Spritz RA, Strunk K, Surowy CS, Hoch SO, Barton DE, Francke U (prosinec 1987). „Lidský protein U1-70K snRNP: klonování cDNA, chromozomální lokalizace, exprese, alternativní sestřih a vazba RNA“. Výzkum nukleových kyselin. 15 (24): 10373–91. doi:10.1093 / nar / 15.24.10373. PMC 339950. PMID 2447561.
- ^ „Entrezův gen: SNRP70 malý nukleární ribonukleoproteinový 70kDa polypeptid (RNP antigen)“.
- ^ Spritz RA, Strunk K, Surowy CS, Mohrenweiser HW (říjen 1990). „Gen lidského ribonukleoproteinového antigenu U1-70K: organizace, nukleotidová sekvence a mapování na lokus 19q13.3“. Genomika. 8 (2): 371–9. doi:10.1016/0888-7543(90)90295-6. PMID 2147422.
- ^ Diner I, Hales CM, Bishof I, Rabenold L, Duong DM, Yi H, Laur O, Gearing M, Troncoso J, Thambisetty M, Lah JJ, Levey AI, Seyfried NT (prosinec 2014). "Agregační vlastnosti malého jaderného ribonukleoproteinu U1-70K u Alzheimerovy choroby". The Journal of Biological Chemistry. 289 (51): 35296–313. doi:10,1074 / jbc.M114,562959. PMC 4271217. PMID 25355317.
- ^ Hales CM, Seyfried NT, Dammer EB, Duong D, Yi H, Gearing M, Troncoso JC, Mufson EJ, Thambisetty M, Levey AI, Lah JJ (duben 2014). „U1 malé jaderné ribonukleoproteiny (snRNP) agregují u Alzheimerovy choroby v důsledku autozomálně dominantních genetických mutací a trizomie 21“. Molekulární neurodegenerace. 9: 15. doi:10.1186/1750-1326-9-15. PMC 4022210. PMID 24773620.
- ^ Xiao SH, Manley JL (listopad 1998). „Fosforylace-defosforylace rozdílně ovlivňuje aktivity spojovacího faktoru ASF / SF2“. Časopis EMBO. 17 (21): 6359–67. doi:10.1093 / emboj / 17.21.6359. PMC 1170960. PMID 9799243.
- ^ Cao W, Garcia-Blanco MA (srpen 1998). „Doména bohatá na serin / arginin v lidském proteinu U1 70k je nezbytná a dostatečná pro vazbu ASF / SF2“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20629–35. doi:10.1074 / jbc.273.32.20629. PMID 9685421.
- ^ Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (únor 1998). „SRPK2: diferenciálně exprimovaná kináza specifická pro SR proteiny zapojená do zprostředkování interakce a lokalizace faktorů sestřihu pre-mRNA v buňkách savců“. The Journal of Cell Biology. 140 (4): 737–50. doi:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.
- ^ Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (listopad 2002). „Lidská autoimunní séra jako molekulární sondy pro identifikaci signální dráhy autoantigen kinázy“. The Journal of Experimental Medicine. 196 (9): 1213–25. doi:10.1084 / jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631.
- ^ Adams DJ, van der Weyden L, Mayeda A, Stamm S, Morris BJ, Rasko JE (červenec 2001). „ZNF265 - nový spliceozomální protein schopný indukovat alternativní sestřih“. The Journal of Cell Biology. 154 (1): 25–32. doi:10.1083 / jcb.200010059. PMC 2196870. PMID 11448987.
- ^ Sato T, Fujii T, Yokoyama T, Fujita Y, Imura Y, Yukawa N, Kawabata D, Nojima T, Ohmura K, Usui T, Mimori T (prosinec 2010). „Protilátky anti-U1 RNP v mozkomíšním moku jsou spojeny s centrálními neuropsychiatrickými projevy systémového lupus erythematodes a smíšeného onemocnění pojivové tkáně“. Artritida a revmatismus. 62 (12): 3730–40. doi:10,1002 / čl. 27700. hdl:2433/142082. PMID 20722023.
Další čtení
- Wilk HE, Schaefer KP, Agris PF, Boak AM, Kovacs SA (červenec 1991). „Asociace U1 SnRNP s HnRNP zahrnuje počáteční nespecifickou interakci nezávislou na sestřihu místa proteinu U1 SnRNP s HnRNA.“ Molekulární a buněčná biochemie. 106 (1): 55–66. doi:10.1007 / BF00231189. PMID 1833625. S2CID 22696966.
- Query CC, Bentley RC, Keene JD (duben 1989). "Běžný motiv rozpoznávání RNA identifikovaný v definované doméně vázající RNA U1 proteinu 70K U1 snRNP". Buňka. 57 (1): 89–101. doi:10.1016 / 0092-8674 (89) 90175-X. PMID 2467746. S2CID 22127152.
- Du Clos TW (říjen 1989). „C-reaktivní protein reaguje s U1 malým nukleárním ribonukleoproteinem“. Journal of Immunology. 143 (8): 2553–9. PMID 2477447.
- Theissen H, Etzerodt M, Reuter R, Schneider C, Lottspeich F, Argos P, Lührmann R, Philipson L (prosinec 1986). „Klonování lidské cDNA pro 70K protein asociovaný s U1 RNA“. Časopis EMBO. 5 (12): 3209–17. doi:10.1002 / j.1460-2075.1986.tb04631.x. PMC 1167314. PMID 3028775.
- Romac JM, Graff DH, Keene JD (červenec 1994). „Protein 70K malého nukleárního ribonukleoproteinu (snRNP) je transportován nezávisle na částicích U1 snRNP prostřednictvím signálu nukleární lokalizace v doméně vázající RNA“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (7): 4662–70. doi:10.1128 / MCB.14.7.4662. PMC 358839. PMID 7516470.
- Wu JY, Maniatis T (prosinec 1993). "Specifické interakce mezi proteiny zapojenými do výběru místa sestřihu a regulovaného alternativního sestřihu". Buňka. 75 (6): 1061–70. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90316-I. PMID 8261509. S2CID 22951690.
- Woppmann A, Will CL, Kornstädt U, Zuo P, Manley JL, Lührmann R (červen 1993). „Identifikace aktivity kinázy spojené s snRNP, která fosforyluje domény bohaté na arginin / serin typické pro sestřihové faktory“. Výzkum nukleových kyselin. 21 (12): 2815–22. doi:10.1093 / nar / 21.12.2815. PMC 309659. PMID 8332490.
- Northemann W, Berg H, Stahnke G, Walter M, Hunt N, Fenning S (prosinec 1995). "Identifikace inhibičního prvku v lidském 68-kDa (U1) ribonukleoproteinovém antigenu". Exprese a čištění proteinů. 6 (6): 748–56. doi:10.1006 / prep.1995.0005. PMID 8746626.
- Zhang WJ, Wu JY (říjen 1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. PMC 231539. PMID 8816452.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Hong W, Bennett M, Xiao Y, Feld Kramer R, Wang C, Reed R (leden 1997). "Sdružení U2 snRNP se spliceozomálním komplexem E". Výzkum nukleových kyselin. 25 (2): 354–61. doi:10.1093 / nar / 25.2.354. PMC 146436. PMID 9016565.
- Klein Gunnewiek JM, van Aarssen Y, van der Kemp A, Nelissen R, Pruijn GJ, van Venrooij WJ (srpen 1997). „Jaderná akumulace U1 snRNP-specifického proteinu C je způsobena difúzí a retencí v jádře“. Experimentální výzkum buněk. 235 (1): 265–73. doi:10.1006 / excr.1997.3663. PMID 9281376.
- Zhang WJ, Wu JY (únor 1998). „Sip1, nový protein obsahující RS doménu nezbytný pro sestřih pre-mRNA“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (2): 676–84. doi:10.1128 / MCB.18.2.676. PMC 108778. PMID 9447963.
- Blencowe BJ, Issner R, Nickerson JA, Sharp PA (duben 1998). „Koaktivátor sestřihu pre-mRNA“. Geny a vývoj. 12 (7): 996–1009. doi:10,1101 / gad 12. 7. 996. PMC 316672. PMID 9531537.
- Cao W, Garcia-Blanco MA (srpen 1998). „Doména bohatá na serin / arginin v lidském proteinu U1 70k je nezbytná a dostatečná pro vazbu ASF / SF2“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20629–35. doi:10.1074 / jbc.273.32.20629. PMID 9685421.
- Neubauer G, král A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (září 1998). "Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v EST databázi umožňuje charakterizaci komplexu multiproteinových spliceosomů". Genetika přírody. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
- Xiao SH, Manley JL (listopad 1998). „Fosforylace-defosforylace rozdílně ovlivňuje aktivity spojovacího faktoru ASF / SF2“. Časopis EMBO. 17 (21): 6359–67. doi:10.1093 / emboj / 17.21.6359. PMC 1170960. PMID 9799243.
- Dumortier H, Klein Gunnewiek J, Roussel JP, van Aarssen Y, Briand JP, van Venrooij WJ, Muller S (prosinec 1998). „Na povrchu proteinu v roztoku a na lidské spliceosomální částice U1 snRNP jsou vystaveny nejméně tři lineární oblasti, ale nikoli doména U1C se zinkovým prstem.“. Výzkum nukleových kyselin. 26 (23): 5486–91. doi:10.1093 / nar / 26.23.5486. PMC 147990. PMID 9826776.