HNRNPR - HNRNPR

HNRNPR
Dostupné struktury
PDBLidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyHNRNPR, HNRPR, hnRNP-R, heterogenní nukleární ribonukleoprotein R
Externí IDOMIM: 607201 MGI: 1891692 HomoloGene: 4251 Genové karty: HNRNPR
Umístění genu (člověk)
Chromozom 1 (lidský)
Chr.Chromozom 1 (lidský)[1]
Chromozom 1 (lidský)
Genomická poloha pro HNRNPR
Genomická poloha pro HNRNPR
Kapela1p36.12Start23,303,771 bp[1]
Konec23,344,336 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE HNRPR 208765 s na fs.png

PBB GE HNRPR 208766 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

10236

74326

Ensembl

ENSG00000282958
ENSG00000125944

ENSMUSG00000066037

UniProt

O43390

n / a

RefSeq (mRNA)

NM_001277121
NM_001277122
NM_001277123
NM_028871
NM_001355182

RefSeq (protein)

n / a

Místo (UCSC)Chr 1: 23,3 - 23,34 MbChr 4: 136,31 - 136,36 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Heterogenní jaderný ribonukleoprotein R. je protein že u lidí je kódován HNRNPR gen.[5][6]

Funkce

Tento gen patří do podrodiny všudypřítomně exprimovaných heterogenních nukleárních ribonukleoproteinů (hnRNP). HnRNP jsou proteiny vázající RNA a komplexují se s heterogenní jadernou RNA (hnRNA). Tyto proteiny jsou spojeny s pre-mRNA v jádru a zdá se, že ovlivňují zpracování pre-mRNA a další aspekty metabolismu a transportu mRNA. Zatímco všechny hnRNP jsou přítomny v jádru, zdá se, že některé přecházejí mezi jádrem a cytoplazmou. Proteiny hnRNP mají odlišné vlastnosti vázání nukleových kyselin. Protein kódovaný tímto genem má tři opakování kvazi-RRM domén, které se váží na RNA, a také obsahuje motiv nukleární lokalizace.[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že HNRNPR komunikovat s SMN1[7][8] a PRMT1.[9][10]

Reference

  1. ^ A b C ENSG00000125944 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000282958, ENSG00000125944 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000066037 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Hassfeld W, Chan EK, Mathison DA, Portman D, Dreyfuss G, Steiner G, Tan EM (leden 1998). „Molekulární definice heterogenního nukleárního ribonukleoproteinu R (hnRNP R) pomocí autoimunitní protilátky: imunologický vztah s hnRNP P“. Výzkum nukleových kyselin. 26 (2): 439–45. doi:10.1093 / nar / 26.2.439. PMC  147279. PMID  9421497.
  6. ^ A b „Entrez Gene: HNRPR heterogenní jaderný ribonukleoprotein R“.
  7. ^ Mourelatos Z, Abel L, Yong J, Kataoka N, Dreyfuss G (říjen 2001). „SMN interaguje s novou rodinou hnRNP a spliceozomálních proteinů“. Časopis EMBO. 20 (19): 5443–52. doi:10.1093 / emboj / 20.19.5443. PMC  125643. PMID  11574476.
  8. ^ Rossoll W, Kröning AK, Ohndorf UM, Steegborn C, Jablonka S, Sendtner M (leden 2002). „Specifická interakce Smn, produktu genu určujícího svalovou atrofii, s hnRNP-R a gry-rbp / hnRNP-Q: role Smn při zpracování RNA v motorických axonech?“. Lidská molekulární genetika. 11 (1): 93–105. doi:10,1093 / hmg / 11,1,93. PMID  11773003.
  9. ^ Wada K, Inoue K, Hagiwara M (srpen 2002). "Identifikace methylovaných proteinů proteinem arginin N-methyltransferázou 1, PRMT1, s novou strategií klonování exprese". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1591 (1–3): 1–10. doi:10.1016 / S0167-4889 (02) 00202-1. PMID  12183049.
  10. ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070.

Další čtení

externí odkazy