HNRNPL - HNRNPL
Heterogenní jaderný ribonukleoprotein L. je protein že u lidí je kódován HNRNPL gen.[5][6]
Funkce
Heterogenní nukleární RNA (hnRNA), které zahrnují mRNA prekurzory a zralé mRNA jsou spojeny se specifickými proteiny za vzniku komplexů heterogenních ribonukleoproteinů (hnRNP). Heterogenní jaderný ribonukleoprotein L patří mezi proteiny, které jsou stabilně asociovány s komplexy hnRNP a spolu s dalšími proteiny hnRNP pravděpodobně hraje hlavní roli při tvorbě, balení, zpracování a funkci mRNA. Heterogenní jaderný ribonukleoprotein L je přítomen v nukleoplazmě jako součást komplexu HNRP. Proteiny HNRP byly také identifikovány mimo nukleoplazmu. Výměna hnRNP za proteiny vázající se na mRNA doprovází transport mRNA z jádra do cytoplazmy. Vzhledem k tomu, že se ukázalo, že proteiny HNRP se pohybují mezi jádro a cytoplazma je možné, že mají také cytoplazmatické funkce. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.[6]
Interakce
HNRNPL bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C ENSG00000282947 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104824, ENSG00000282947 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015165 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Pinol-Roma S, Swanson MS, Gall JG, Dreyfuss G (leden 1990). „Nový heterogenní jaderný protein RNP s jedinečnou distribucí na rodících se transkriptech“. J Cell Biol. 109 (6 Pt 1): 2575–87. doi:10.1083 / jcb.109.6.2575. PMC 2115934. PMID 2687284.
- ^ A b „Entrez Gene: HNRPL heterogenní jaderný ribonukleoprotein L“.
- ^ Oberdoerffer S, Moita LF, Neems D, Freitas RP, Hacohen N, Rao A (srpen 2008). „Regulace alternativního sestřihu CD45 heterogenním ribonukleoproteinem, hnRNPLL“. Věda. 321 (5889): 686–91. doi:10.1126 / science.1157610. PMC 2791692. PMID 18669861.
- ^ A b C Kim JH, Hahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (květen 2000). "Interakce protein-protein mezi hnRNP pendlujícími mezi jádrem a cytoplazmou". J. Mol. Biol. 298 (3): 395–405. doi:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.
- ^ Hahm B, Cho OH, Kim JE, Kim YK, Kim JH, Oh YL, Jang SK (duben 1998). „Protein vázající polypyrimidinový trakt interaguje s HnRNP L“. FEBS Lett. 425 (3): 401–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00269-5. PMID 9563502. S2CID 4980318.
Další čtení
- Dreyfuss G, Choi YD, Adam SA (1990). "Ribonukleoproteinové struktury podél dráhy tvorby mRNA". Endocr. Res. 15 (4): 441–74. doi:10.3109/07435808909036348. PMID 2576798.
- Rasmussen HH, van Damme J, Puype M a kol. (1993). „Mikrosekvence 145 proteinů zaznamenané v databázi dvourozměrných gelových proteinů normálních lidských epidermálních keratinocytů“. Elektroforéza. 13 (12): 960–9. doi:10,1002 / elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774.
- Hahm B, Cho OH, Kim JE a kol. (1998). „Protein vázající polypyrimidinový trakt interaguje s HnRNP L“. FEBS Lett. 425 (3): 401–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00269-5. PMID 9563502. S2CID 4980318.
- Shih SC, Claffey KP (1999). "Regulace stability mRNA lidského vaskulárního endoteliálního růstového faktoru při hypoxii heterogenním nukleárním ribonukleoproteinem L". J. Biol. Chem. 274 (3): 1359–65. doi:10.1074 / jbc.274.3.1359. PMID 9880507.
- Hamilton BJ, Nichols RC, Tsukamoto H a kol. (1999). „hnRNP A2 a hnRNP L se vážou na 3'UTR mRNA transportéru glukózy 1 a existují jako komplex in vivo“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 261 (3): 646–51. doi:10.1006 / bbrc.1999.1040. PMID 10441480.
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
- Kim JH, Hahm B, Kim YK a kol. (2000). "Interakce protein-protein mezi hnRNP pendlujícími mezi jádrem a cytoplazmou". J. Mol. Biol. 298 (3): 395–405. doi:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.
- Shnyreva M, Schullery DS, Suzuki H a kol. (2000). „Interakce dvou multifunkčních proteinů. Heterogenní jaderný ribonukleoprotein K a protein vázající Y-box“. J. Biol. Chem. 275 (20): 15498–503. doi:10.1074 / jbc.275.20.15498. PMID 10809782.
- Ito M, Shichijo S, Tsuda N a kol. (2001). „Molekulární základ rozpoznávání buněk rakoviny pankreatu zprostředkovaných T buňkami“. Cancer Res. 61 (5): 2038–46. PMID 11280764.
- Kuninger DT, Izumi T, Papaconstantinou J, Mitra S (2002). „Lidská AP-endonukleáza 1 a hnRNP-L interagují s represorovým prvkem podobným nCaRE v promotoru AP-endonukleázy 1“. Nucleic Acids Res. 30 (3): 823–9. doi:10.1093 / nar / 30.3.823. PMC 100287. PMID 11809897.
- Söderberg M, Raffalli-Mathieu F, Lang MA (2002). „Zánět moduluje interakci heterogenního jaderného ribonukleoproteinového (hnRNP) I / proteinu vázajícího polypyrimidinový trakt a hnRNP L s 3'-nepřekládanou oblastí myší mRNA indukovatelné syntázy oxidu dusnatého“. Mol. Pharmacol. 62 (2): 423–31. doi:10,1124 / mol. 62.2.423. PMID 12130696.
- Hui J, Stangl K, Lane WS, Bindereif A (2007). „HnRNP L stimuluje sestřih genu eNOS vazbou na CA opakování s proměnnou délkou“. Nat. Struct. Biol. 10 (1): 33–7. doi:10.1038 / nsb875. PMID 12447348. S2CID 19057994.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Costain WJ, Mishra RK (2003). "PLG reguluje expresi hnRNP-L ve striatu krysy a pre-frontální kůře: identifikace pomocí ddPCR". Peptidy. 24 (1): 137–46. doi:10.1016 / S0196-9781 (02) 00286-3. PMID 12576095. S2CID 44677561.
- Hui J, Reither G, Bindereif A (2003). „Nová funkční role opakování CA a hnRNP L ve stabilitě RNA“. RNA. 9 (8): 931–6. doi:10,1261 / rna.5660803. PMC 1370459. PMID 12869704.
- Gulesserian T, Engidawork E, Fountoulakis M, Lubec G (2004). „Snížení mozkových hladin proteinu Lupus La a zvýšení U5 malého ribonukleoproteinově specifického 40 kDa proteinu u Downova syndromu plodu“. Buňka. Mol. Biol. (Noisy-le-grand). 49 (5): 733–8. PMID 14528909.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Cheng J, Kapranov P, Drenkow J a kol. (2005). "Transkripční mapy 10 lidských chromozomů v rozlišení 5 nukleotidů". Věda. 308 (5725): 1149–54. doi:10.1126 / science.1108625. PMID 15790807. S2CID 13047538.
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |