Malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid A - Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A - Wikipedia

SNRPA
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1AUD, 1DRZ, 1DZ5, 1 FHT, 1M5K, 1M5O, 1M5P, 1M5V, 1NU4, 1OIA, 1SJ3, 1SJ4, 1SJF, 1U6B, 1 ZPĚT, 1VBX, 1VBY, 1VBZ, 1VC0, 1VC5, 1VC6, 1ZZN, 2A3J, 2NZ4, 2OIH, 2OJ3, 2U1A, 3BO2, 3BO3, 3BO4, 3CUL, 3CUN, 3EGZ, 3G8S, 3G8T, 3G96, 3G9C, 3HHN, 3IIN, 3IRW, 3 IWN, 3K0J, 3L3C, 3MUM, 3 MUR, 3MUT, 3MUV, 3MXH, 3P49, 3PGW, 3R1H, 3R1L, 3UCU, 3UCZ, 3UD3, 3UD4, 4C4W, 4PR6, 4PRF, 4W90, 4YB1, 5DO, 5 DDR, 5DDQ, 5DDP, 5FJ4
Identifikátory
Aliasy	SNRPAMud1, U1-A, U1A, malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid A
Externí ID	OMIM: 182285 HomoloGene: 3380 Genové karty: SNRPA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	40,765,389 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba U1 snRNA; • snRNA vázání kmenové smyčky; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • vazba nukleové kyseliny; • U1 snRNP vazba; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• spliceosomální komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • U1 snRNP;
Biologický proces	• Zpracování mRNA; • regulace polyadenylace mRNA; • Sestřih RNA; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6626
	n / a
	ENSG00000077312
	n / a
	P09012
	n / a
	NM_004596
	n / a
	NP_004587
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

U1 malý jaderný ribonukleoprotein A je protein že u lidí je kódován SNRPA gen.^[3]^[4]

Interakce

Ukázalo se, že malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid A komunikovat s CDC5L.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077312 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schonk D, van Dijk P, Riegmann P, Trapman J, Holm C, Willcocks TC, Sillekens P, van Venrooij W, Wimmer E, Geurts van Kessel A (leden 1991). "Přiřazení sedmi genů k odlišným intervalům na střední části lidského chromozomu 19q obklopující oblast genu pro myotonickou dystrofii". Cytogenetika a genetika buněk. 54 (1–2): 15–9. doi:10.1159/000132946. PMID 1701111.
^ „Entrez Gene: SNRPA malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid A“.
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

Další čtení

Hoffman DW, Query CC, Golden BL, White SW, Keene JD (březen 1991). „Doména vázající RNA proteinové složky A malého jaderného ribonukleoproteinu U1 analyzovaná NMR spektroskopií je strukturně podobná ribozomálním proteinům“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (6): 2495–9. Bibcode:1991PNAS ... 88.2495H. doi:10.1073 / pnas.88.6.2495. PMC 51259. PMID 1826055.
Nelissen RL, Sillekens PT, Beijer RP, Geurts van Kessel AH, van Venrooij WJ (červen 1991). "Struktura, chromozomální lokalizace a evoluční ochrana genu kódujícího lidský protein A specifický pro U1 snRNP". Gen. 102 (2): 189–96. doi:10.1016 / 0378-1119 (91) 90077-O. PMID 1831431.
Jessen TH, Oubridge C, Teo CH, Pritchard C, Nagai K (listopad 1991). „Identifikace molekulárních kontaktů mezi U1 Malý nukleární ribonukleoprotein a U1 RNA“. Časopis EMBO. 10 (11): 3447–56. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb04909.x. PMC 453073. PMID 1833186.
Nagai K, Oubridge C, Jessen TH, Li J, Evans PR (prosinec 1990). „Krystalová struktura domény vázající RNA malého jaderného ribonukleoproteinu A U1“. Příroda. 348 (6301): 515–20. Bibcode:1990Natur.348..515N. doi:10.1038 / 348515a0. PMID 2147232. S2CID 4336326.
Sillekens PT, Habets WJ, Beijer RP, van Venrooij WJ (prosinec 1987). "cDNA klonování lidského proteinu A spojeného s UR snRNA: rozsáhlá homologie mezi proteiny specifickými pro U1 a U2 snRNP". Časopis EMBO. 6 (12): 3841–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02721.x. PMC 553857. PMID 2962859.
Oubridge C, Ito N, Evans PR, Teo CH, Nagai K (prosinec 1994). „Krystalová struktura při 1,92 rozlišení domény vázající RNA spliceozomálního proteinu U1A v komplexu s vlásenkou RNA“. Příroda. 372 (6505): 432–8. Bibcode:1994Natur.372..432O. doi:10.1038 / 372432a0. PMID 7984237. S2CID 9404488.
Howe PW, Nagai K, Neuhaus D, Varani G (srpen 1994). „NMR studie rozpoznávání U1 snRNA N-koncovou RNP doménou lidského proteinu U1A“. Časopis EMBO. 13 (16): 3873–81. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06698.x. PMC 395300. PMID 8070414.
Allain FH, Gubser CC, Howe PW, Nagai K, Neuhaus D, Varani G (duben 1996). "Specifičnost interakce ribonukleoproteinů určená skládáním RNA během komplexní formulace". Příroda. 380 (6575): 646–50. Bibcode:1996 Natur.380..646A. doi:10.1038 / 380646a0. PMID 8602269. S2CID 4265453.
Avis JM, Allain FH, Howe PW, Varani G, Nagai K, Neuhaus D (březen 1996). „Struktura řešení N-koncové RNP domény proteinu U1A: role C-koncových zbytků ve stabilitě struktury a vazbě RNA“. Journal of Molecular Biology. 257 (2): 398–411. doi:10.1006 / jmbi.1996.0171. PMID 8609632.
Lu J, Hall KB (srpen 1997). "Terciární struktura RBD2 a páteřní dynamika RBD1 a RBD2 lidského proteinu U1A stanovena NMR spektroskopií". Biochemie. 36 (34): 10393–405. doi:10.1021 / bi9709811. PMID 9265619.
Allain FH, Howe PW, Neuhaus D, Varani G (září 1997). "Strukturní základ specificity vázání RNA lidského proteinu U1A". Časopis EMBO. 16 (18): 5764–72. doi:10.1093 / emboj / 16.18.5764. PMC 1170207. PMID 9312034.
Neubauer G, král A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (září 1998). „Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v databázi EST umožňuje charakterizaci komplexu víceproteinových spliceosomů“. Genetika přírody. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
Ferré-D'Amaré AR, Zhou K, Doudna JA (říjen 1998). "Krystalová struktura ribozymu viru hepatitidy delta". Příroda. 395 (6702): 567–74. Bibcode:1998 Natur.395..567F. doi:10.1038/26912. PMID 9783582. S2CID 4359811.
Lutz CS, Cooke C, O'Connor JP, Kobayashi R, Alwine JC (prosinec 1998). „Komplex (y) U1A (SF-A) bez snRNP: identifikace největší podjednotky jako PSF, sestřihového faktoru spojujícího protein vázající se na polypyrimidinový trakt“. RNA. 4 (12): 1493–9. doi:10.1017 / S1355838298981183. PMC 1369720. PMID 9848648.
Hetzer M, Mattaj IW (leden 2000). „Mechanismus závislý na ATP, nezávislý na Ran pro jaderný import U1A a U2B„ spliceozomálních proteinů “. The Journal of Cell Biology. 148 (2): 293–303. doi:10.1083 / jcb.148.2.293. PMC 2174293. PMID 10648562.
Klein Gunnewiek JM, Hussein RI, van Aarssen Y, Palacios D, de Jong R, van Venrooij WJ, Gunderson SI (březen 2000). „Čtrnáct zbytků U1 snRNP-specifického proteinu U1A je vyžadováno pro homodimerizaci, kooperativní vazbu RNA a inhibici polyadenylace“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (6): 2209–17. doi:10.1128 / MCB.20.6.2209-2217.2000. PMC 110837. PMID 10688667.
Varani L, Gunderson SI, Mattaj IW, Kay LE, Neuhaus D, Varani G (duben 2000). „Struktura NMR komplexu 38 kDa protein U1A - PIE RNA odhaluje základ kooperativity při regulaci polyadenylace lidským proteinem U1A“. Přírodní strukturní biologie. 7 (4): 329–35. doi:10.1038/74101. PMID 10742179. S2CID 13432764.
Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
Simmons A, Aluvihare V, McMichael A (červen 2001). „Nef spouští transkripční program v T buňkách imitujících aktivaci T-buněk s jedním signálem a indukujících mediátory virulence HIV“. Imunita. 14 (6): 763–77. doi:10.1016 / S1074-7613 (01) 00158-3. PMID 11420046.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077312 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1701111-3] Schonk D, van Dijk P, Riegmann P, Trapman J, Holm C, Willcocks TC, Sillekens P, van Venrooij W, Wimmer E, Geurts van Kessel A (leden 1991). "Přiřazení sedmi genů k odlišným intervalům na střední části lidského chromozomu 19q obklopující oblast genu pro myotonickou dystrofii". Cytogenetika a genetika buněk. 54 (1–2): 15–9. doi:10.1159/000132946. PMID 1701111.

[entrez-4] „Entrez Gene: SNRPA malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid A“.

[pmid11101529-5] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Protein vázající RNA: Ribonukleoproteiny
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70 tis /U1 spliceozomální RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Jiný přepis	Telomeráza
Překlad	Ribozom
Vault ribonukleoprotein částice	Hlavní protein trezoru
jiný	Částice pro rozpoznávání signálu