Satelitní (biologie) - Satellite (biology)

Nesmí být zaměňována s satelitní chromozom nebo satelitní DNA.

Satelit
Vědecká klasifikace
(bez hodnocení):
Subvirové látky
(bez hodnocení):
Satelit
Skupiny

Satelitní viry
Satelitní nukleové kyseliny

A satelit je subvirový agent to záleží na koinfekce hostitelské buňky s a pomocný virus pro jeho replikaci. Družice lze rozdělit do dvou hlavních tříd: satelitní viry a satelitní nukleové kyseliny.[1] Satelit viry, které jsou nejčastěji spojovány s rostlinami, ale nacházejí se také v savcích, členovcích a bakteriích, kódují strukturní proteiny uzavřít svůj genetický materiál, který se proto liší od strukturních proteinů jejich pomocných virů.[1] Satelit nukleové kyseliny naproti tomu nekódují své vlastní strukturní proteiny, ale místo toho jsou zapouzdřeny proteiny kódovanými jejich pomocnými viry.[1][2] Genomy satelitů se pohybují vzhůru od délky 359 nukleotidů pro RNA viru satelitního tabákového ringspot viru (STobRV).[3]

Většina virů má schopnost používat hostitelské enzymy nebo vlastní replikační aparát k nezávislé replikaci vlastní virové RNA. Družice jsou naopak zcela závislé na a pomocný virus pro replikaci. Symbiotický vztah mezi satelitem a pomocným virem, který katalyzuje replikaci satelitního genomu, závisí také na hostiteli, aby poskytl komponenty jako repliky[4] provést replikaci.[5]

Satelitní virus mamavirus který inhibuje replikaci svého hostitele, byl označen a virofág.[6] Použití tohoto termínu však zůstává kontroverzní kvůli nedostatku zásadních rozdílů mezi virofágy a klasickými satelitními viry.[7]

Historie a objevy

The virus nekrózy tabáku byl virus, který vedl k objevení prvního satelitního viru v roce 1962. Vědci zjistili, že první satelit měl komponenty, aby vytvořil svůj vlastní proteinový obal. O několik let později, v roce 1969, vědci objevili další symbiotický vztah s neopvirem tabákových ringspotů (TobRV) a dalším satelitním virem.[8] Říká se, že vznik satelitní RNA pocházel buď z genomu hostitele nebo jeho koinfekčních látek a z jakýchkoli vektorů vedoucích k přenosu.[9]

Satelitní virus důležitý pro lidské zdraví, který ukazuje potřebu koinfekce replikovat a infikovat v hostiteli, je virus, který způsobuje hepatitida D. Virus hepatitidy D nebo delta (HDV) objevil v roce 1977 Mario Rizzetto[10] a liší se od hepatitidy A, B a C, protože vyžaduje virové částice od žloutenka typu B virus (HBV) replikovat a infikovat jaterní buňky. HBV poskytuje povrchový antigen, HBsAg, který HDV využívá k vytvoření superinfekce vedoucí k selhání jater.[11] HDV se vyskytuje po celém světě, ale nejvíce se vyskytuje v Africe, na Středním východě a v jižní Itálii.[11]

Satelitní ve srovnání s virem

Satelitní ve srovnání s virem
SatelitVirus
ReplikaceZávisí na přítomnosti hostitelských buněk a pomocných virů při replikaci jejich genomůZávisí na přítomnosti hostitelských buněk k replikaci jejich genomů
Nukleová kyselinaObsahují DNA nebo RNAObsahují DNA nebo RNA nebo obojí v různých bodech životního cyklu
Velikost genomu0,22 - 1,5 kb / s<10kbp až> 2000kbp
StrukturaSatelitní viry kódují své vlastní proteinové kapsidy pomocí pomocných virů

Satelitní nukleové kyseliny nemají kapsidy, ale spoléhají se na pomocné viry, že uzavřou své genomy

Zabalte jejich genom do kapsidy (proteinový obal)

Mějte obálku (ne všechny viry)

Rozsah hostitelůRostliny (nejčastěji), savci, členovci, bakterieMůže infikovat všechny typy organismů; zvířata, rostliny, houby, bakterie, archaea

Klasifikace

Klasifikace subvirových látek stále probíhá. Následující text používá obrys subvirových agentů ve zprávě ICTV z roku 2011.[1] Mnohým taxonům bylo od té doby v roce 2019 přiděleno více formálních názvů, takže jsou zahrnuty, kdykoli je to možné.

Satelitní viry

Některé satelitní viry byly přiřazeny taxony. Následující text odráží výsledky návrhu z roku 2015, který byl od té doby přijat (Taxoprop 2015.009a).[12]

Satelitní nukleové kyseliny

Následující text nemusí být úplný v pokrytí ICTV. Nomenklatura pro satelitní RNA je předpona názvu viru hostitele „sat“.

Satelitní nukleové kyseliny připomínají satelitní nukleové kyseliny v tom, že se replikují pomocí pomocných virů. Liší se však v tom, že mohou kódovat funkce, které mohou přispět k úspěchu jejich pomocných virů; i když jsou někdy považovány za genomové prvky svých pomocných virů, ne vždy se v jejich pomocných virech nacházejí.

Viz také

Reference

  1. ^ A b C d „3 - Družice a jiné virově závislé nukleové kyseliny - Subvirové látky - Subvirové látky (2011)“. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV).
  2. ^ Baez, Johne. „Subcelulární formy života“. University of California, Riverside. Citováno 2020-06-04.
  3. ^ Wayne L. Gerlach; Jamal M. Buzayan; Irving R. Schneider; George Bruening (1986). „Satellite Tobacco Ringspot Virus RNA: Biologická aktivita klonů DNA a jejich in vitro transkriptů“. Virologie. 151 (2): 172–185. doi:10.1016/0042-6822(86)90040-1. PMID  18640636.
  4. ^ Hu, Chung-Chi; Hsu, Yau-Heiu; Lin, Na-Sheng (18. 12. 2009). „Satelitní RNA a satelitní viry rostlin“. Viry. 1 (3): 1325–1350. doi:10,3390 / v1031325. PMC  3185516. PMID  21994595.
  5. ^ Krupovic, Mart; Kuhn, Jens H .; Fischer, Matthias G. (01.01.2016). „Klasifikační systém pro virofágy a satelitní viry“. Archivy virologie. 161 (1): 233–247. doi:10.1007 / s00705-015-2622-9. hdl:11858 / 00-001M-0000-0028-DC34-F. ISSN  0304-8608. PMID  26446887.
  6. ^ Bernard La Scola; Christelle Desnues; Isabelle Pagnierová; Catherine Robert; Lina Barrassi; Ghislain Fournous; Michèle Merchat; Marie Suzan-Monti; Patrick Forterre; Eugene Koonin a Didier Raoult (2008). „Virofág jako jedinečný parazit obřího mimiviru“. Příroda. 455 (7205): 100–4. Bibcode:2008 Natur.455..100L. doi:10.1038 / nature07218. PMID  18690211.
  7. ^ Krupovic M; Cvirkaite-Krupovic V (2011). „Virofágy nebo satelitní viry?“. Nat Rev Microbiol. 9 (11): 762–763. doi:10.1038 / nrmicro2676. PMID  22016897.
  8. ^ Roossinck, M. J .; Sleat, D .; Palukaitis, P. (červen 1992). „Satelitní RNA rostlinných virů: struktury a biologické účinky“. Mikrobiologické recenze. 56 (2): 265–279. doi:10.1128 / MMBR.56.2.265-279.1992. ISSN  0146-0749. PMC  372867. PMID  1620065.
  9. ^ Hu, Chung-Chi; Hsu, Yau-Heiu; Lin, Na-Sheng (2009). „Satelitní RNA a satelitní viry rostlin“. Viry. 1 (3): 1325–1350. doi:10,3390 / v1031325. PMC  3185516. PMID  21994595.
  10. ^ „Virus hepatitidy D“. web.stanford.edu. Citováno 2017-12-01.
  11. ^ A b „Hepatitida D: pozadí, etiologie, epidemiologie“. Medscape. Citováno 1. prosince 2017.
  12. ^ Krupovic, Mart; Kuhn, Jens H .; Fischer, Matthias G. (7. října 2015). „Klasifikační systém pro virofágy a satelitní viry“. Archivy virologie. 161 (1): 233–247. doi:10.1007 / s00705-015-2622-9. PMID  26446887.
  13. ^ Taxoprop 2017.004P
  14. ^ Taxoprop 2016.021a-kP

externí odkazy