Ligamenvirales - Ligamenvirales - Wikipedia

Ligamenvirales
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:incertae sedis
Království:incertae sedis
Kmen:incertae sedis
Třída:incertae sedis
Objednat:Ligamenvirales
Rodiny

Ligamenvirales je řád lineárních virů, které infikují archaea království Crenarchaeota a mají dvouvláknové DNA genomy.[1] Objednávku navrhl David Prangishvili a Mart Krupovic v roce 2012 a následně vytvořen Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV).

Název je odvozen od latinský ligamen, význam tětiva nebo vlákno.

Taxonomie

V tomto pořadí jsou dvě rodiny - Lipothrixviridae a Rudiviridae.

Virony jsou vláknité se šroubovicí nukleokapsid. Na obou koncích jsou připojena buď vlákna, nebo složitější struktury zapojené do adheze hostitele.

Hlavní obalové proteiny jak lipothrixvirů, tak rudivirů mají neobvyklý čtyřnásobnýspirála topologie svazku.[2][3][4][5] The genom je nesegmentovaná lineární dvouvláknová DNA. Viry ze dvou rodin sdílejí až deset genů. Hlavní rozdíl mezi těmito dvěma rodinami spočívá v tom, že jsou členy rodiny Rudiviridae nejsou obaleny, zatímco nukleokapsidy lipothrixvirů jsou obklopeny lipidovou membránou. Kromě toho, zatímco kapsida rudivirů je konstruována z jediného hlavního kapsidového proteinu, kapsida lipothrixvirů je tvořena ze dvou paralogních hlavních kapsidových proteinů. V obou skupinách virů tvoří hlavní kapsidové proteiny dimer podobný drápům (homodimer v rudivirech a heterodimer v lipothrixvirech), který se obaluje kolem dsDNA.

Členové Ligamenvirales strukturálně souvisí s archaálními viry rodiny Tristromaviridae které, podobně jako lipothrixviry, kódují dva paralogní hlavní kapsidové proteiny se stejným záhybem jako v ligamenvirech.[6] Kvůli těmto strukturálním podobnostem objednávejte Ligamenvirales a rodina Tristromaviridae bylo navrženo, aby byly sjednoceny do třídy „Tokiviricetes“ (toki znamená „vlákno“ v gruzínštině a viricetes je oficiální přípona pro třídu virů).[6]

Reference

  1. ^ Prangishvili D; Krupovic M (2012). „Nový navrhovaný taxon pro dvouvláknové DNA viry, řád Ligamenvirales". Arch Virol. 157 (4): 791–795. doi:10.1007 / s00705-012-1229-7. PMID  22270758.
  2. ^ Goulet A, Blangy S, Redder P, Prangishvili D, Felisberto-Rodrigues C, Forterre P, Campanacci V, Cambillau C (2009) Acidianus filamentous virus 1 obalové proteiny vykazují spirálovitý záhyb zahrnující linii vláknitých archaálních virů. PNAS 106 (50) 21155–60
  3. ^ DiMaio, F; Yu, X; Rensen, E; Krupovic, M; Prangishvili, D; Egelman, EH (2015). „Virologie. Virus, který infikuje hypertermofil, enkapsiduje DNA ve formě A“. Věda. 348 (6237): 914–7. doi:10.1126 / science.aaa4181. PMC  5512286. PMID  25999507.
  4. ^ Kasson, P; DiMaio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Krupovic, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Egelman, EH (2017). „Model nové membránové obálky vláknitého hypertermofilního viru“. eLife. 6: e26268. doi:10,7554 / eLife.26268. PMC  5517147. PMID  28639939.
  5. ^ Liu, Y; Osinski, T; Wang, F; Krupovic, M; Schouten, S; Kasson, P; Prangishvili, D; Egelman, EH (2018). "Strukturální konzervace ve vláknitém viru obaleném membránou infikujícím hypertermofilní acidofil". Příroda komunikace. 9 (1): 3360. Bibcode:2018NatCo ... 9.3360L. doi:10.1038 / s41467-018-05684-6. PMC  6105669. PMID  30135568.
  6. ^ A b Wang, Fengbin; Baquero, Diana P; Su, Zhangli; Osinski, Tomasz; Prangishvili, David; Egelman, Edward H; Krupovic, Mart (2020). „Struktura vláknitého viru odkrývá rodinné vazby v archaické virosféře“. Evoluce virů. 6 (1): veaa023. doi:10.1093 / ve / veaa023. PMC  7189273. PMID  32368353.