Portogloboviridae - Portogloboviridae

Portogloboviridae
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Varidnaviria

Portogloboviridae je rodina z DNA viry které infikují archaea. Jedná se o navrhovanou rodinu oblast Varidnaviria. Viry v rodině jsou příbuzné Sphaerolipoviridae. The kapsidové proteiny těchto virů a jejich charakteristik má evoluční význam pro původ toho druhého Varidnaviria viry, protože se zdá, že si zachovávají prvotní znaky.[1]

Popis

The viriony v této rodině mají kapsidu s ikosahedrální geometrií a virová obálka který chrání genetický materiál. Průměr je 83 až 87 nanometrů. The genom je kruhový a dvouvláknová DNA s délkou 20 222 párů bází. The genom obsahuje 45 otevřené čtecí rámce (ORF), které jsou úzce uspořádány a zabírají 89,1% genomu. ORF jsou obecně krátké, s průměrnou délkou 103 kodony. Viriony mají 10 bílkoviny v rozmezí od 20 do 32 kDa. Z těchto proteinů 8 kóduje pro kapsidu a dvě pro virovou obálku, včetně jednoho, který je kapsidovým proteinem se svislou rolkou (SJR). Vstup do hostitelské buňky je penetrací. Virová replikace dochází chronickou infekcí bez a lytický cyklus.[2]

The Portogloboviridae viry společně s Sphaerolipoviridae mají evoluční význam ve vývoji toho druhého Varidnaviria viry, protože se jeví jako pozůstatky prvních virů této říše. Portogloboviridae dohromady s Sphaerolipoviridae může infikovat poslední univerzální společný předek (LUCA) a vznikl před tímto organismem.[1]

Bylo navrženo, že to může souviset s původem Varidnaviria následujícím způsobem.[1]

Varidnaviria
 

Portogloboviridae

 
 
 

Sphaerolipoviridae

 
 

Bamfordvirae

 
 
 

Reference

  1. ^ A b C Krupovic M, Dolja VV, Koonin EV (14. července 2020). „LUCA a jeho komplexní virom“. Nat Rev Microbiol. 18 (11): 661–670. doi:10.1038 / s41579-020-0408-x. PMID  32665595. S2CID  220516514. Citováno 22. října 2020.
  2. ^ Liu Y, Ishino S, Ishino Y, Pehau-Arnaudet G, Krupovic M, Prangishvili D (9. července 2017). „Nový typ polyedrických virů infikujících hypertermofilní archaea“. J Virol. 91 (13): e00589-17. doi:10.1128 / JVI.00589-17. PMC  5469268. PMID  28424284. Citováno 22. října 2020.