Anelloviridae - Anelloviridae

Anelloviridae
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:incertae sedis
Království:incertae sedis
Kmen:incertae sedis
Třída:incertae sedis
Objednat:incertae sedis
Rodina:Anelloviridae
Rody

Anelloviridae je rodina z viry. Jsou klasifikovány jako viry obratlovců a mají neobalené kapsid, který je kulatý s izometrickými, icosahedral symetrie a má triangulační číslo 3.

Typový typ je virus teno točivého momentu (rod Alphatorquevirus), objevený v roce 1997.[1] Byly nalezeny v krvi japonského pacienta.[2]

Název je odvozen z italštiny anello „ring“, který odkazuje na kruhový genom anelloviridae.

Genom

The genom není segmentovaný a obsahuje jedinou molekulu oběžník, negativní smysl, jednopramenný DNA. Celý genom je 3000–4000 nukleotidy dlouho.[3] Obsahují také nekódující oblast s jednou až dvěma sekvencemi 80–110 nt, které obsahují vysoký obsah GC, tvořící sekundární strukturu stonků a smyček.[4] Genom má ORF a vysoký stupeň genetické rozmanitosti.[5]

Přestože mechanismus replikace nebyl příliš studován, zdá se, že anelloviridae používají mechanismus klouzavého kruhu, kde se první ssDNA převádí na dsDNA. Vyžaduje hostitelskou polymerázu, aby došlo k replikaci, ale samotný genom nekóduje virovou polymerázu a v důsledku toho se anelloviridae musí replikovat uvnitř jádra buňky.[6]

Anelloviridae má také dva hlavní otevřené čtecí rámce, ORF1 a ORF2. Iniciují na dvou různých kodonech AUG.[7] Mohou být vytvořeny také další ORF. Tyto ORF se mohou částečně překrývat. [4]

Předpokládá se, že ORF1 kóduje domnělý kapsidový protein a protein spojený s replikací anellovirů. Specifická role těchto proteinů souvisejících s replikací se stále studuje.[8]

Předpokládá se, že ORF2 buď kóduje protein s aktivitou fosfatázy (TTMV), nebo peptid, který potlačuje NG-B dráhy (TTV). Bylo vidět, že má vysoce konzervativní motiv v N-terminální části.

Klinický

Druhy anellovirů jsou vysoce rozšířené a geneticky rozmanité. Jejich virom byl přítomen u většiny lidí. Vstupují do buňky na začátku života a vytrvale se replikují.[9] To se děje v prvním měsíci života. Zůstává však debata, zda je první infekce symptomatická či nikoli. Pravděpodobně jsou potlačovány imunitou hostitele, protože anelloviry se zvyšují během imunosuprese hostitele.[7]

Celková prevalence v obecné populaci je více než 90% a byla zjištěna na všech kontinentech.[4] Způsobují chronické lidské virové infekce, které dosud nebyly spojeny s onemocněním. Rovněž neexistují důkazy, které by prokázaly, že virová clearance se vyskytuje u infikovaných lidí.[7] U lidí a zvířat je přítomno nejméně 200 různých druhů.[10]

Tři rody jsou spojeny s lidskými infekcemi: Virus točivého momentu (TTV), Torque teno midi virus (TTMDV) a Momentový virus teno mini (TTMV).

Bylo prokázáno, že několik způsobů přenosu, jako jsou kapičky slin a mateřské nebo sexuální cesty.[4]

Reference

  1. ^ Vasilyev EV, Trofimov DY, Tonevitsky AG, Ilinsky VV, Korostin DO, Rebrikov DV (2009). „Distribuce viru Torque Teno (TTV) u zdravé ruské populace“. Virology Journal. 6: 134. doi:10.1186 / 1743-422X-6-134. PMC  2745379. PMID  19735552.
  2. ^ Nishizawa, T .; Okamoto, H .; Konishi, K .; Yoshizawa, H .; Miyakawa, Y .; Mayumi, M. (08.12.1997). „Nový DNA virus (TTV) spojený se zvýšenými hladinami transamináz v posttransfuzní hepatitidě neznámé etiologie“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 241 (1): 92–97. doi:10.1006 / bbrc.1997.7765. ISSN  0006-291X. PMID  9405239.
  3. ^ Správa ICTVdB (2006). 00.107.0.01. Anellovirus. In: ICTVdB — The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
  4. ^ A b C d Biagini, Philippe (2011). Virus Taxon. Elsevier (Londýn).
  5. ^ Viralzone
  6. ^ Viralzone
  7. ^ A b C Kaczorowska, Joanna; van der Hoek, Lia (01.05.2020). „Lidské anelloviry: různorodí, všudypřítomní a komenzální členové viromu“. Recenze mikrobiologie FEMS. 44 (3): 305–313. doi:10.1093 / femsre / fuaa007. ISSN  0168-6445.
  8. ^ "Anelloviridae - viry ssDNA (2011) - viry ssDNA (2011) - ICTV". talk.ictvonline.org. Citováno 2020-11-20.
  9. ^ Svobodnější, Giulia; Maggi, Fabrizio; Pifferi, Massimo; Di Cicco, Maria E .; Peroni, Diego G .; Pistello, Mauro (10.04.2018). „Virom a jeho hlavní složka, Anellovirus, spletitý systém formující lidskou imunitní obranu a pravděpodobně ovlivňující vývoj astmatu a respiračních onemocnění v dětství“. Hranice v mikrobiologii. 9. doi:10.3389 / fmicb.2018.00686. ISSN  1664-302X. PMC  5902699. PMID  29692764.
  10. ^ Bernardin F, Operskalski E, Busch M, Delwart E (květen 2010). "Transfuzní přenos vysoce rozšířených komenzálních lidských virů". Transfúze. 50 (11): 2474–2483. doi:10.1111 / j.1537-2995.2010.02699.x. PMID  20497515.

externí odkazy