Prasinophyceae - Prasinophyceae - Wikipedia

Prasinophyceae
Pyramimonas sp color.jpg
Pyramimonas sp.
Vědecká klasifikace
Království:
Viridiplantae
Divize:
Chlorophyta
Třída:
Prasinophyceae

Objednávky[1]

The Prasinofyty (vč. Tetraphytina ) nebo chlorofyta jsou třída jednobuněčných zelené řasy.[je zapotřebí objasnění ][2] Prasinofyty zahrnují hlavně mořské planktonika druhy, stejně jako někteří zástupci sladkovodních.[2][3] Prasinofyty jsou morfologicky rozmanité, včetně bičíky s jedním až osmi bičíky a nepohyblivými (kokcoidními) jednobunkami. Buňky mnoha druhů jsou pokryty organickými tělními šupinami; ostatní jsou nazí.[3] Dobře prostudované rody Ostreococcus, považována za nejmenší (cca 0,95 μm ) volně žijící eukaryot,[4] a Micromonas, které se oba nacházejí v mořských vodách po celém světě. Prasinofyty mají jednoduché buněčné struktury, obsahující jedinou chloroplast a jeden mitochondrie. The genomy jsou ve srovnání s jinými eukaryoty relativně malé (přibližně 12 Mbp pro Ostreococcus[5][6] a 21 Mbp za Micromonas[7]).

Někteří autoři považují prasinofyty za polyfyletický seskupení zelených řas z různých subtypů. Když se Tet Pratinothyta objevila u Prasinofytů, nedávno ji autoři zahrnuli, což ji činí monofyletickou a odpovídá chlorofytě.[8][9]

Ekologie

Micromonas pusilla

Studie fotosyntetické rozmanitosti genových sekvencí (rbcL) v Mexický záliv uvedla, že na rostlině jsou obzvláště převládající prasinofyty Maximum podpovrchového chlorofylu (SCM)[10] a několik různých ekotypů Ostreococcus byly detekovány v prostředí.[11] Předpokládalo se, že tyto ekotypy se v prostředí odlišují adaptací na intenzitu světla. O. lucimarinus byl izolován od vysoce osvětleného prostředí[12] a pozorováno celoročně v pobřežním severním Tichém oceánu.[13] RCC141 byl považován za slabé světlo, protože byl izolován od dolního eufotická zóna. U těchto kmenů nebo ekotypů se později ukázalo, že žijí na různých stanovištích (na otevřeném oceánu nebo v mezotrofních oblastech) a zdá se, že jejich distribuce nesouvisí s dostupností světla.[14] O. tauri byl izolován od pobřežní laguny a zdá se, že je vícemocný. Genetická data naznačují, že mezi různými detekovanými ekotypy existují výrazné molekulární rozdíly.[15]

Prasinofyty jsou infikovány velkými dvouvláknovými DNA viry patřícími do rodu Prasinovirus v rodině Phycodnaviridae,[16][17][18] stejně jako a Reovirus.[19] Odhaduje se, že od 2 do 10% Micromonas pusilla populace je lyžována denně viry.[20]

Fylogeneze

Nedávné studie se shodují, že prasinofyty nejsou přirozenou skupinou, jsou vysoce paraphyletic.[3][21][22][23] Vztahy mezi skupinami, které tvoří chlorofyt, nejsou zcela vyřešeny. The kladogram produkci Leliaert et al. 2011[3] a některé úpravy podle Silaru 2016,[24] Leliaert 2016[25] a Lopes dos Santos et al. 2017[26] je zobrazen níže. The modře zastíněné skupiny jsou nebo byly tradičně umístěny v Prasinophyceae[2]). Druh Mezostigma viride bylo prokázáno, že je členem Streptophyta nebo bazální zelené řasy. Ostatní jsou členy Chlorophyta.

Zelené řasy
Chlorophyta /
Palmophyllophyceae
 

Prasinococcales („prasinophyte clade VI“)

 
 

Palmophyllales

 
 
 
 
 

Pyramimonadophyceae („prasinophyte clade I“)

 
Mamiellophyceae
 

Monomastigales

 
 
 

Dolichomastigales

 
 

Mamiellales

 
 
(„prasinophyte clade II“)
 
 
Nephroselmidophyceae

Nephroselmidales („prasinophyte clade III“)

 
 
 

?Pycnococcaceae („prasinophyte clade V“)

 
 

Picocystophyceae („prasinofyt clade VII C“)

 
 
 

Chloropicophyceae („prasinophyte clade VII A / B“)

 
Tetraphytina
 

Pedinophyceae

 
Chlorofytina
 

Chlorodendrophyceae („prasinophyte clade IV“)

 
 
 

Trebouxiophyceae

 
 
 

Ulvophyceae

 
 

Chlorophyceae

 
 
 
 
 
 
 
 
 
Prasinophyta
Streptophyta
 
 

Chlorokybophyceae

 
 

Mesostigmatophyceae

 
 
 
 

Klebsormidiophyceae

 
 
 

Charophyceae

 
 
 

Zygnematophyceae

 
 

Coleochaetophyceae

 
 

Suchozemské rostliny

 
 
 
 
 
 

Reference

  1. ^ Guiry, M.D. a Guiry, G.M. (2007). "Třída: Prohlížeč taxonomie Prasinophyceae". AlgaeBase verze 4.2 Celosvětová elektronická publikace, National University of Ireland, Galway. Citováno 2007-09-23.
  2. ^ A b C Sym, S. D. a Pienaar, R. N. 1993. Třída Prasinophyceae. In Round, F. E. a Chapman, D. J. (eds) Pokrok ve fykologickém výzkumu, Sv. 9. Biopress Ltd., Bristol, str. 281-376.
  3. ^ A b C d Leliaert F, Verbruggen H, Zechman FW (září 2011). „Do hlubin: nové objevy na základně fylogeneze zelené rostliny“. BioEssays. 33 (9): 683–92. doi:10.1002 / bies.201100035. PMID  21744372.
  4. ^ Courties C, Vaquer A, Troussellier M, Lautier J, Chrétiennot-Dinet MJ, Neveux J a kol. (1994). "Nejmenší eukaryotický organismus". Příroda. 370 (6487): 255. Bibcode:1994 Natur.370..255C. doi:10.1038 / 370255a0.
  5. ^ Derelle E, Ferraz C, Rombauts S, Rouzé P, Worden AZ, Robbens S, Partensky F, Degroeve S, Echeynié S, Cooke R, Saeys Y, Wuyts J, Jabbari K, Bowler C, Panaud O, Piégu B, Ball SG „Ral JP, Bouget FY, Piganeau G, De Baets B, Picard A, Delseny M, Demaille J, Van de Peer Y, Moreau H (srpen 2006). „Analýza genomu nejmenšího volně žijícího eukaryota Ostreococcus tauri odhaluje mnoho jedinečných vlastností“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. doi:10.1073 / pnas.0604795103. PMC  1544224. PMID  16868079.
  6. ^ Palenik B, Grimwood J, Aerts A, Rouzé P, Salamov A, Putnam N a kol. (Květen 2007). „Malý eukaryot Ostreococcus poskytuje genomický pohled na paradox speciace planktonu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (18): 7705–10. Bibcode:2007PNAS..104,7705P. doi:10.1073 / pnas.0611046104. PMC  1863510. PMID  17460045.
  7. ^ Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL a kol. (Duben 2009). „Zelená evoluce a dynamické adaptace odhalené genomy mořských pikoeukaryotů Micromonas“. Věda. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. doi:10.1126 / science.1167222. PMID  19359590.
  8. ^ Tevatia R, Oyler GA (01.01.2018). "Vývoj DDB1-vázajícího WD40 (DWD) ve viridiplantae". PLOS ONE. 13 (1): e0190282. Bibcode:2018PLoSO..1390282T. doi:10.1371 / journal.pone.0190282. PMC  5749748. PMID  29293590.
  9. ^ Rockwell NC, Martin SS, Li FW, Mathews S, Lagarias JC (květen 2017). „Fykocyanobilinový chromofor fytochromů řas streptophytu je syntetizován HY2“. Nový fytolog. 214 (3): 1145–1157. doi:10,1111 / nph.14422. PMC  5388591. PMID  28106912.
  10. ^ Wawrik B, Paul JH, Campbell L, Griffin D, Houchin L, Fuentes-Ortega A, Müller-Karger F (2003). „Vertikální struktura komunity fytoplanktonu spojená s pobřežním oblakem v Mexickém zálivu“. Série pokroku v ekologii moří. 251: 87–101. Bibcode:2003MEPS..251 ... 87W. doi:10 3354 / meps251087.
  11. ^ Guillou L, Eikrem W, Chrétiennot-Dinet MJ, Le Gall F, Massana R, Romari K, Pedrós-Alió C, Vaulot D (červen 2004). „Rozmanitost pikoplanktonických prasinofytů hodnocena přímým sekvenováním jaderných SSU rDNA vzorků životního prostředí a nových izolátů získaných z oceánských a pobřežních mořských ekosystémů“. Protist. 155 (2): 193–214. doi:10.1078/143446104774199592. PMID  15305796.
  12. ^ Worden AZ, Nolan JK, Palenik B (2004). „Posouzení dynamiky a ekologie mořského pikofytoplanktonu: Význam eukaryotické složky“. Limnologie a oceánografie. 49 (1): 168–179. Bibcode:2004LimOc..49..168W. doi:10.4319 / lo.2004.49.1.0168.
  13. ^ Worden AZ (2006). „Picoeukaryote diverzita v pobřežních vodách Tichého oceánu“ (PDF). Vodní mikrobiální ekologie. 43 (2): 165–175. doi:10,3 354 / ame043165.
  14. ^ Demir-Hilton E, Sudek S, Cuvelier ML, Gentemann CL, Zehr JP, Worden AZ (červenec 2011). „Globální distribuční vzorce odlišných subtypů fotosyntetického pikoeukaryotu Ostreococcus“. Časopis ISME. 5 (7): 1095–107. doi:10.1038 / ismej.2010.209. PMC  3146286. PMID  21289652.
  15. ^ Rodríguez F, Derelle E, Guillou L, Le Gall F, Vaulot D, Moreau H (červen 2005). "Diverzita ekotypů v mořských pikoeukaryotech Ostreococcus (Chlorophyta, Prasinophyceae)". Mikrobiologie prostředí. 7 (6): 853–9. doi:10.1111 / j.1462-2920.2005.00758.x. PMID  15892704.
  16. ^ Mayer JA, Taylor FJ (1979). „Virus, který lyžuje mořský nanoflagelát,“ Micromonas pusilla"". Příroda. 281 (5729): 299–301. Bibcode:1979Natur.281..299M. doi:10.1038 / 281299a0.
  17. ^ Cottrell MT, Suttle CA (1991). „Široce rozšířený výskyt a klonální variace virů, které způsobují lýzu kosmopolitního, eukaryotického mořského fytoplankteru,“ Micromonas pusilla"". Série pokroku v ekologii moří. 78: 1–9. Bibcode:1991MEPS ... 78 .... 1C. doi:10,3 354 / meps078001.
  18. ^ Bellec L, Grimsley N, Derelle E, Moreau H, Desdevises Y (duben 2010). "Hojnost, prostorová distribuce a genetická rozmanitost virů Ostreococcus tauri ve dvou různých prostředích". Zprávy o mikrobiologii životního prostředí. 2 (2): 313–21. doi:10.1111 / j.1758-2229.2010.00138.x. PMID  23766083.
  19. ^ Attoui H, Jaafar FM, Belhouchet M, de Micco P, de Lamballerie X, Brussaard CP (květen 2006). "Micromonas pusilla reovirus: nový člen rodiny Reoviridae přiřazený k novému navrhovanému rodu (Mimoreovirus)". The Journal of General Virology. 87 (Pt 5): 1375–1383. doi:10.1099 / vir.0.81584-0. PMID  16603541.
  20. ^ Cottrell MT, Suttle CA (01.06.1995). „Dynamika lytického viru infikujícího fotosyntetický mořský pikoflagelát“ Micromonas pusilla"". Limnologie a oceánografie. 40 (4): 730–739. Bibcode:1995LimOc..40..730C. CiteSeerX  10.1.1.517.2324. doi:10.4319 / lo.1995.40.4.0730. ISSN  1939-5590.
  21. ^ Lewis LA, McCourt RM (říjen 2004). "Zelené řasy a původ suchozemských rostlin". American Journal of Botany. 91 (10): 1535–56. doi:10,3732 / ajb.91.10.1535. PMID  21652308.
  22. ^ Becker B, Marin B (květen 2009). "Řasy Streptophyte a původ embryofytů". Annals of Botany. 103 (7): 999–1004. doi:10.1093 / aob / mcp044. PMC  2707909. PMID  19273476.
  23. ^ Marin B (září 2012). "Vnořeno do skupiny Chlorellales nebo nezávislé třídy? Fylogeneze a klasifikace Pedinophyceae (Viridiplantae) odhalená molekulárními fylogenetickými analýzami úplných nukleonových a plastidem kódovaných rRNA operonů". Protist. 163 (5): 778–805. doi:10.1016 / j.protis.2011.11.004. PMID  22192529.
  24. ^ Silar, Philippe (2016), „Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes“, Archivy HAL - převody: 1–462
  25. ^ Leliaert F, Tronholm A, Lemieux C, Turmel M, DePriest MS, Bhattacharya D, Karol KG, Fredericq S, Zechman FW, Lopez-Bautista JM (květen 2016). „Fylogenomické analýzy chloroplastů odhalily nejhlubší větev větví řady Chlorophyta, Palmophyllophyceae. Nov.“. Vědecké zprávy. 6 (1): 25367. Bibcode:2016NatSR ... 625367L. doi:10.1038 / srep25367. PMC  4860620. PMID  27157793.
  26. ^ Lopes Dos Santos A, Pollina T, Gourvil P, Corre E, Marie D, Garrido JL, Rodríguez F, Noël MH, Vaulot D, Eikrem W (říjen 2017). „Chloropicophyceae, nová třída pikofytoplanktonických prasinofytů“. Vědecké zprávy. 7 (1): 14019. Bibcode:2017NatSR ... 714019L. doi:10.1038 / s41598-017-12412-5. PMC  5656628. PMID  29070840.

externí odkazy