Prasinovirus - Prasinovirus

Prasinovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Varidnaviria
Království:Bamfordvirae
Kmen:Nucleocytoviricota
Třída:Megaviricetes
Objednat:Algavirales
Rodina:Phycodnaviridae
Rod:Prasinovirus
Zadejte druh
Virus Micromonas pusilla SP1

Prasinovirus je rod velké dvouvláknové DNA viry, v rodině Phycodnaviridae které infikují fytoplankton v Prasinophyceae. V současné době existují pouze dva druhy tohoto rodu, včetně druhů typu Virus Micromonas pusilla SP1 [1][2], který infikuje kosmopolitní fotosyntetický bičík Micromonas pusilla.[3]

Negativní obarvený obraz MpV-SP1

Existuje však velká skupina geneticky rozmanitých, ale příbuzných virů, které vykazují značné důkazy laterální genový přenos.[4][5]

Vennův diagram sdílených kódujících sekvencí (CDS) čtyř MpV a M. pusilla UTEX LB991, založený na shlucích s 0,5 aminokyselinovou identitou. Přerušované kruhy představují hostitelské geny sdílené s viry [5] .

Taxonomie

Skupina: dsDNA

[2]

Struktura

Viry v prasinoviru jsou obalené, s ikosahedrickou a kulatou geometrií a T = 169 symetrií. Průměr je kolem 104-118 nm.[1]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
PrasinovirusIcosahedralT = 169ObalLineárníMonopartitní

Životní cyklus

Virová replikace je nukleo-cytoplazmatická. Replikace sleduje model vytěsnění řetězce DNA. Transkripce se šablonami DNA je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou pomocí lytických fosfolipidů. Řasa slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
PrasinovirusŘasaŽádnýEndocytóza buněčných receptorůLyzaJádroCytoplazmaPasivní difúze

Reference

  1. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  2. ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ Cottrell, Matthew T .; Suttle, Curtis A. (1991). „Široce rozšířený výskyt a klonální variace virů, které způsobují lýzu kosmopolitního, eukaryotického mořského fytoplankteru,“ Micromonas pusilla"". Série pokroku v ekologii moří. 78: 1–9. Bibcode:1991MEPS ... 78 .... 1C. doi:10,3 354 / meps078001. ISSN  1616-1599.
  4. ^ Bellec, Laure; Grimsley, Nigel; Derelle, Evelyn; Moreau, Herve; Desdevises, Yves (2010). "Hojnost, prostorová distribuce a genetická rozmanitost virů Ostreococcus tauri ve dvou různých prostředích". Zprávy o mikrobiologii životního prostředí. 2 (2): 313–321. doi:10.1111 / j.1758-2229.2010.00138.x. PMID  23766083.
  5. ^ A b Finke, Jan F; Winget, Danielle M; Chan, Amy M; Suttle, Curtis A (2017). "Variace v genetickém repertoáru infikovaných virů Micromonas pusilla odráží horizontální přenos genů a vazby na jejich distribuci v životním prostředí “. Viry. 9 (5): 116. doi:10,3390 / v9050116. PMC  5454428. PMID  28534829.

externí odkazy