LIG3 - LIG3
DNA ligáza 3 je enzym který je u lidí kódován LIG3 gen.[5][6] Lidský gen LIG3 kóduje ATP -závislý DNA ligázy že přerušení těsnění v fosfodiester páteř z duplexní DNA.
Existují tři rodiny ATP-dependentních DNA ligáz eukaryoty.[7] Tyto enzymy využívají stejný tříkrokový reakční mechanismus; (i) tvorba kovalentního enzym-adenylátového meziproduktu; (ii) přenos adenylátové skupiny na 5 'fosfátový konec DNA nicku; (iii) tvorba fosfodiesterové vazby. Na rozdíl od LIG1 a LIG4 členové rodiny, kteří se vyskytují téměř ve všech eukaryotech, jsou členové rodiny LIG3 méně rozšířeni.[8] Gen LIG3 alternativně kóduje několik odlišných druhů DNA ligáz zahájení překladu a alternativní sestřih mechanismy, které jsou popsány níže.
Struktura, vazba DNA a katalytické aktivity
Eukaryotické ATP-dependentní DNA ligázy mají příbuznou katalytickou oblast, která obsahuje tři domény, a DNA vazebná doména, an adenylace doména a oligonukleotid / oligosacharid vazebně skládací doména. Když tyto enzymy zabírají nick v duplexní DNA, obklopují tyto domény duplex DNA, přičemž každý z nich je v kontaktu s DNA. Struktura katalytické oblasti DNA ligázy III v komplexu s prořezanou DNA byla stanovena pomocí Rentgenová krystalografie a je pozoruhodně podobný tomu, který je tvořen katalytickou oblastí lidské DNA ligázy I navázané na prezývanou DNA.[9] Jedinečnou vlastností DNA ligáz kódovaných genem LIG3 je N-terminál zinkový prst který se podobá dvěma zinkovým prstům na N-konci poly (ADP-ribóza) polymerázy 1 (PARP1 ).[10] Stejně jako u zinkových prstů PARP1 je zinkový prst DNA ligázy III zapojen do vazby na zlomení řetězce DNA.[10][11][12] V polypeptidu DNA ligázy III spolupracuje zinkový prst s vazebnou doménou DNA za vzniku modulu vázajícího DNA.[13] Kromě toho adenylační doména a oligonukleotidová / oligosacharidová vazebná složená doména tvoří druhý vazebný modul DNA.[13] V modelu kudla navrženého laboratoří Ellenberger,[13] modul vazebné domény zinkový prst-DNA slouží jako senzor přerušení řetězce, který se váže na přerušení jednořetězcového řetězce DNA bez ohledu na povahu konců přerušení řetězce. Pokud jsou tyto zlomy ligovatelné, jsou přeneseny do modulu adenylační domény-oligonukleotid / oligosacharid vázající-skládací domény, který se specificky váže na ligovatelné zářezy. Ve srovnání s DNA ligázami I a IV je DNA ligáza III nejaktivnějším enzymem v intermolekulárním spojení DNA duplexů.[14] Tato aktivita je převážně závislá na zinkovém prstu DNA ligázy III, což naznačuje, že dva moduly vázající DNA DNA ligázy III mohou být schopné současně zabírat duplexní konce DNA.[9][13]
Alternativní sestřih
Alternativní mechanismy iniciace a sestřihu translace mění amino - a karboxy-terminál sekvence, které lemují katalytickou oblast DNA ligázy III.[15][16] V alternativním spojovacím mechanismu je exon kódující C-terminální C-terminální protein citlivosti na rakovinu prsu 1 (BRCT ) doména na C-konci DNA ligázy III-alfa je nahrazena krátkou pozitivně nabitou sekvencí, která působí jako a signál jaderné lokalizace, generující DNA ligázu III-beta. Tato alternativně sestřižená varianta byla dosud detekována pouze v mužských zárodečných buňkách.[16] Na základě jejího vzorce exprese během spermatogeneze se zdá pravděpodobné, že se na ní podílí DNA ligáza IIIbeta meiotická rekombinace a / nebo Oprava DNA v haploidní spermie, ale toto nebylo definitivně prokázáno. Ačkoli je interní ATG preferovaným místem pro iniciaci translace v DNA ligáze III otevřený čtecí rámec, iniciace translace se také vyskytují v prvním ATG v otevřeném čtecím rámci, což vede k syntéze polypeptidu s N-koncem sekvence mitochondriálního cílení.[15][17][18]
Buněčná funkce
Jak bylo uvedeno výše, DNA ligáza III-alfa mRNA kóduje jaderný a mitochondriální verze DNA ligázy III-alfa. Jaderná DNA ligáza III-alfa existuje a funguje ve stabilním komplexu s opravným proteinem DNA XRCC1.[19][20] Tyto proteiny interagují prostřednictvím svého C-konce BRCT domény.[16][21] XRCC1 nemá žádnou enzymatickou aktivitu, ale místo toho působí jako lešenový protein interakcí s velkým počtem proteinů zapojených do základní excize a jednovláknová oprava zlomení. Účast XRCC1 na těchto cestách je v souladu s fenotyp buněk xrcc1.[19] Na rozdíl od nukleové DNA ligázy III-alfa, mitochondriální DNA ligáza III-alfa funguje nezávisle na XRCC1, který se v mitochondriích nenachází.[22] Ukazuje se, že nukleová DNA ligáza III-alfa tvoří komplex s XRCC1 v cytoplazma a následné jaderné cílení výsledného komplexu je řízeno XRCC1 signál jaderné lokalizace.[23] Zatímco mitochondriální DNA ligáza III-alfa také interaguje s XRCC1, je pravděpodobné, že aktivita mitochondriální cílené sekvence DNA ligázy III-alfa je větší než aktivita signálu nukleární lokalizace XRCC1 a že DNA ligáza III-alfa / XRCC1 komplex je narušen, když mitochondriální DNA ligáza III-alfa prochází mitochondriální membránou.
Protože gen LIG3 kóduje jedinou DNA ligázu v mitochondriích, vede inaktivace genu LIG3 ke ztrátě mitochondriální DNA, což vede ke ztrátě mitochondriální funkce.[24][25][26] Fibroblasty s inaktivovaným genem Lig3 mohou být propagovány v médiu doplněném uridinem a pyruvátem. Tyto buňky však postrádají mtDNA.[27] Fyziologické hladiny mitochondriální DNA ligázy III se zdají nadměrné a buňky se stokrát sníženým mitochondriálním obsahem mitochondriální DNA ligázy III-alfa udržují normální počet kopií mtDNA.[27] Základní úlohu DNA ligasy III-alfa v mitochondriálním metabolismu DNA mohou plnit další DNA ligázy, včetně NAD-dependentní DNA ligázy E-coli, pokud jsou zaměřeny na mitochondrie.[24][26] Lze tedy generovat životaschopné buňky, které postrádají nukleovou DNA ligázu III-alfa. Zatímco DNA ligáza I je převládajícím enzymem, který se připojuje Okazaki fragmenty během replikace DNA je nyní zřejmé, že komplex DNA ligáza III-alfa / XRCC1 umožňuje buňkám, které buď postrádají, nebo mají sníženou aktivitu DNA ligázy I, dokončit replikaci DNA.[24][26][28][29] Vzhledem k biochemickým a buněčným biologickým studiím spojujícím komplex DNA ligáza III-alfa / XRCC1 s opravou excizí a opravou zlomů DNA jednoho vlákna,[30][31][32][33] bylo překvapivé, že buňky postrádající nukleovou DNA ligázu III-alfa nevykazovaly významně zvýšenou citlivost na látku poškozující DNA.[24][26] Tyto studie naznačují, že v těchto drahách opravy nukleární DNA existuje významná funkční redundance mezi DNA ligázou I a DNA ligázou III-alfa. V savčích buňkách je většina zlomů dvouřetězců DNA opravena nehomologním spojením konce závislým na DNA ligáze IV (NHEJ ).[34] DNA ligáza III-alfa se účastní vedlejší alternativní dráhy NHEJ, která se generuje chromozomální translokace.[35][36] Na rozdíl od ostatních funkcí opravy nukleární DNA se zdá, že role DNA ligázy III-alfa v alternativním NHEJ je nezávislá na XRCC1.[37]
Klinický význam
Na rozdíl od genů LIG1 a LIG4[38][39][40][41] zděděné mutace v genu LIG3 nebyly v lidské populaci identifikovány. DNA ligáza III-alfa se však nepřímo podílí na rakovině a neurodegenerativní onemocnění. U rakoviny je DNA ligáza III-alfa často nadměrně exprimována, což slouží jako a biomarker identifikovat buňky, které jsou více závislé na alternativní cestě NHEJ pro opravu zlomů dvouřetězcových DNA.[42][43][44][45] Ačkoli zvýšená aktivita alternativní dráhy NHEJ způsobuje genomická nestabilita který řídí progresi onemocnění, také představuje nový cíl pro vývoj terapeutických strategií specifických pro rakovinové buňky.[43][44] Bylo identifikováno několik genů kódujících proteiny, které interagují přímo s DNA ligázou III-alfa nebo nepřímo prostřednictvím interakcí s XRCC1 jako mutované v dědičných neurodegenerativních onemocněních.[46][47][48][49][50] Zdá se tedy, že transakce DNA zahrnující DNA ligázu III-alfa hrají důležitou roli při udržování životaschopnosti neuronální buňky.
LIG3 hraje roli v mikrohomologií zprostředkované spojování konců (MMEJ) oprava dvouvláknových zlomů. Je to jeden ze 6 enzymů požadovaných pro tuto cestu opravy DNA náchylnou k chybám.[51] LIG3 je upregulován u chronické myeloidní leukémie,[45] mnohočetný myelom,[52] a rakovina prsu.[43]
Rakoviny velmi často postrádají expresi jednoho nebo více genů pro opravu DNA, ale nadměrná exprese genu pro opravu DNA je u rakoviny méně obvyklá. Například minimálně 36 enzymů na opravu DNA, pokud je mutačně defektní v buňkách zárodečné linie, způsobuje zvýšené riziko rakoviny (dědičná) rakovinové syndromy ).[Citace je zapotřebí ] (Viz také Porucha opravy DNA s nedostatkem.) Podobně bylo u 12 nebo více genů pro opravu DNA často zjištěno, že jsou epigeneticky potlačovány u jednoho nebo více druhů rakoviny.[Citace je zapotřebí ] (Viz také Epigeneticky snížená oprava DNA a rakovina.) Obvykle má nedostatečná exprese enzymu pro opravu DNA za následek zvýšené neopravené poškození DNA, které v důsledku chyb replikace (syntéza překladů ), vést k mutacím a rakovině. Zprostředkováno však LIG3 MMEJ oprava je vysoce nepřesná, takže v tomto případě nadměrná exprese, spíše než nedostatečná exprese, zjevně vede k rakovině.
Poznámky
Verze tohoto článku z roku 2013 byla aktualizována externím odborníkem na základě modelu dvojího publikace. Korespondence akademický recenzent článek byl publikován v Gen a lze jej citovat jako: Alan E Tomkinson, Annahita Sallmyr (5. září 2013). "Struktura a funkce DNA ligáz kódovaných savčím genem LIG3". Gen. 531 (2): 150–157. doi:10.1016 / J.GENE.2013.08.061. PMC 3881560. PMID 24013086.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz) |
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005156 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020697 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: Ligase III, DNA, ATP-dependent“. Citováno 2012-03-12.
- ^ Tomkinson AE, Sallmyr A (prosinec 2013). "Struktura a funkce DNA ligáz kódovaných savčím genem LIG3". Gen. 531 (2): 150–7. doi:10.1016 / j.gene.2013.08.061. PMC 3881560. PMID 24013086.
- ^ Ellenberger T, Tomkinson AE (2008). „Eukaryotické DNA ligázy: strukturální a funkční poznatky“. Annu. Biochem. 77: 313–38. doi:10,1146 / annurev.biochem.77.061306.123941. PMC 2933818. PMID 18518823.
- ^ Simsek D, Jasin M (listopad 2011). „DNA ligáza III: skvrnitá přítomnost u eukaryot, ale základní funkce při testování“. Buněčný cyklus. 10 (21): 3636–44. doi:10,4161 / cc.10.21.18094. PMC 3266004. PMID 22041657.
- ^ A b Cotner-Gohara E, Kim IK, Hammel M, Tainer JA, Tomkinson AE, Ellenberger T (červenec 2010). „Lidská DNA ligáza III rozpoznává konce DNA dynamickým přepínáním mezi dvěma stavy vázanými na DNA“. Biochemie. 49 (29): 6165–76. doi:10.1021 / bi100503w. PMC 2922849. PMID 20518483.
- ^ A b Mackey ZB, Niedergang C, Murcia JM, Leppard J, Au K, Chen J, de Murcia G, Tomkinson AE (červenec 1999). „DNA ligáza III je získávána na štěpení řetězce DNA motivem zinkového prstu homologním s motivem poly (ADP-ribóza) polymerázy. Identifikace dvou funkčně odlišných oblastí vázajících DNA v DNA ligáze III“. Journal of Biological Chemistry. 274 (31): 21679–87. doi:10.1074 / jbc.274.31.21679. PMID 10419478.
- ^ Leppard JB, Dong Z, Mackey ZB, Tomkinson AE (srpen 2003). „Fyzická a funkční interakce mezi DNA ligázou IIIalpha a poly (ADP-Ribose) polymerázou 1 při opravě jednořetězcové DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (16): 5919–27. doi:10.1128 / MCB.23.16.5919-5927.2003. PMC 166336. PMID 12897160.
- ^ Taylor RM, Whitehouse CJ, Caldecott KW (září 2000). „Zinkový prst DNA ligázy III stimuluje vazbu na sekundární strukturu DNA a podporuje spojení na konci“. Nucleic Acids Res. 28 (18): 3558–63. doi:10.1093 / nar / 28.18.3558. PMC 110727. PMID 10982876.
- ^ A b C d Cotner-Gohara E, Kim IK, Tomkinson AE, Ellenberger T (duben 2008). „Dva moduly vázající DNA a rozpoznávající nick v lidské DNA ligase III“. Journal of Biological Chemistry. 283 (16): 10764–72. doi:10,1074 / jbc.M708175200. PMC 2447648. PMID 18238776.
- ^ Chen L, Trujillo K, Sung P, Tomkinson AE (srpen 2000). „Interakce komplexu DNA ligáza IV-XRCC4 s konci DNA a protein-kinázou závislou na DNA“. Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26196–205. doi:10,1074 / jbc.M000491200. PMID 10854421.
- ^ A b Lakshmipathy U, Campbell C (květen 1999). „Gen lidské DNA ligázy III kóduje jaderné a mitochondriální proteiny“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (5): 3869–76. doi:10.1128 / MCB.19.5.3869. PMC 84244. PMID 10207110.
- ^ A b C Mackey ZB, Ramos W, Levin DS, Walter CA, McCarrey JR, Tomkinson AE (únor 1997). „Alternativní sestřih, ke kterému dochází v myších pachytenových spermatocytech, vytváří formu DNA ligázy III se zřetelnými biochemickými vlastnostmi, které mohou fungovat při meiotické rekombinaci“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (2): 989–98. doi:10.1128 / MCB.17.2.989. PMC 231824. PMID 9001252.
- ^ Wei YF, Robins P, Carter K, Caldecott K, Pappin DJ, Yu GL, Wang RP, Shell BK, Nash RA, Schär P (červen 1995). „Molekulární klonování a exprese lidských cDNA kódujících novou DNA ligázu IV a DNA ligázu III, enzym aktivní při opravě a rekombinaci DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (6): 3206–16. doi:10,1128 / mcb.15.6.3206. PMC 230553. PMID 7760816.
- ^ Chen J, Tomkinson AE, Ramos W, Mackey ZB, Danehower S, Walter CA, Schultz RA, Besterman JM, Husain I (říjen 1995). „Savčí DNA ligáza III: molekulární klonování, chromozomální lokalizace a exprese v spermatocytech podstupujících meiotickou rekombinaci“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (10): 5412–22. doi:10.1128 / MCB.15.10.5412. PMC 230791. PMID 7565692.
- ^ A b Caldecott KW, McKeown CK, Tucker JD, Ljungquist S, Thompson LH (leden 1994). „Interakce mezi savčím DNA opravným proteinem XRCC1 a DNA ligázou III“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (1): 68–76. doi:10.1128 / MCB.14.1.68. PMC 358357. PMID 8264637.
- ^ Caldecott KW, Tucker JD, Stanker LH, Thompson LH (prosinec 1995). „Charakterizace komplexu XRCC1-DNA ligáza III in vitro a jeho nepřítomnost v buňkách mutantních křečků“. Nucleic Acids Res. 23 (23): 4836–43. doi:10.1093 / nar / 23.23.4836. PMC 307472. PMID 8532526.
- ^ Nash RA, Caldecott KW, Barnes DE, Lindahl T (duben 1997). „Protein XRCC1 interaguje s jednou ze dvou odlišných forem DNA ligázy III.“. Biochemie. 36 (17): 5207–11. doi:10,1021 / bi962281m. PMID 9136882.
- ^ Lakshmipathy U, Campbell C (říjen 2000). „Funkce mitochondriální DNA ligázy III je nezávislá na Xrcc1“. Nucleic Acids Res. 28 (20): 3880–6. doi:10.1093 / nar / 28.20.3880. PMC 110795. PMID 11024166.
- ^ Parsons JL, Dianova II, Finch D, Tait PS, Ström CE, Helleday T, Dianov GL (červenec 2010). „Fosforylace XRCC1 pomocí CK2 je vyžadována pro její stabilitu a efektivní opravu DNA.“ Oprava DNA (Amst.). 9 (7): 835–41. doi:10.1016 / j.dnarep.2010.04.008. PMID 20471329.
- ^ A b C d Gao Y, Katyal S, Lee Y, Zhao J, Rehg JE, Russell HR, McKinnon PJ (březen 2011). „DNA ligáza III je rozhodující pro integritu mtDNA, ale ne pro opravu nukleární DNA zprostředkovanou Xrcc1“. Příroda. 471 (7337): 240–4. doi:10.1038 / nature09773. PMC 3079429. PMID 21390131.
- ^ Lakshmipathy U, Campbell C (únor 2001). „Antisense zprostředkované snížení exprese DNA ligázy III má za následek sníženou integritu mitochondriální DNA“. Nucleic Acids Res. 29 (3): 668–76. doi:10.1093 / nar / 29.3.668. PMC 30390. PMID 11160888.
- ^ A b C d Simsek D, Furda A, Gao Y, Artus J, Brunet E, Hadjantonakis AK, Van Houten B, Shuman S, McKinnon PJ, Jasin M (březen 2011). „Zásadní role DNA ligázy III v mitochondriích, ale ne při opravě závislé na Xrcc1“. Příroda. 471 (7337): 245–8. doi:10.1038 / nature09794. PMC 3261757. PMID 21390132.
- ^ A b Shokolenko, IN; Fayzulin, RZ; Katyal, S; McKinnon, PJ; Alexejev, MF (13. září 2013). „Mitochondriální DNA ligáza je postradatelná pro životaschopnost kultivovaných buněk, ale nezbytná pro udržování mtDNA“. Journal of Biological Chemistry. 288 (37): 26594–605. doi:10.1074 / jbc.M113.472977. PMC 3772206. PMID 23884459.
- ^ Arakawa H, Bednar T, Wang M, Paul K, Mladenov E, Bencsik-Theilen AA, Iliakis G (březen 2012). „Funkční redundance mezi DNA ligázami I a III při replikaci DNA v buňkách obratlovců“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (6): 2599–610. doi:10.1093 / nar / gkr1024. PMC 3315315. PMID 22127868.
- ^ Le Chalony C, Hoffschir F, Gauthier LR, Gross J, Biard DS, Boussin FD, Pennaneach V (září 2012). „Částečné doplnění deficitu DNA ligázy I DNA ligázou III a její dopad na přežití buněk a stabilitu telomer v buňkách savců“. Buněčné a molekulární biologické vědy. 69 (17): 2933–49. doi:10.1007 / s00018-012-0975-8. PMC 3417097. PMID 22460582.
- ^ Cappelli E, Taylor R, Cevasco M, Abbondandolo A, Caldecott K, Frosina G (září 1997). „Zapojení genových produktů XRCC1 a DNA ligázy III do opravy excize DNA báze“. Journal of Biological Chemistry. 272 (38): 23970–5. doi:10.1074 / jbc.272.38.23970. PMID 9295348.
- ^ Okano S, Lan L, Tomkinson AE, Yasui A (2005). „Translokace XRCC1 a DNA ligázy III-alfa z centrosomů do chromozomů v reakci na poškození DNA v mitotických lidských buňkách“. Nucleic Acids Res. 33 (1): 422–9. doi:10.1093 / nar / gki190. PMC 546168. PMID 15653642.
- ^ Kubota Y, Nash RA, Klungland A, Schär P, Barnes DE, Lindahl T (prosinec 1996). „Rekonstituce excize-opravy DNA báze s čištěnými lidskými proteiny: interakce mezi DNA polymerázou beta a proteinem XRCC1“. EMBO Journal. 15 (23): 6662–70. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb01056.x. PMC 452490. PMID 8978692.
- ^ Moser J, Kool H, Giakzidis I, Caldecott K, Mullenders LH, Fousteri MI (červenec 2007). „Utěsnění chromozomálních DNA zářezů během opravy excizí nukleotidů vyžaduje XRCC1 a DNA ligázu III alfa způsobem specifickým pro buněčný cyklus“ (PDF). Molekulární buňka. 27 (2): 311–23. doi:10.1016 / j.molcel.2007.06.014. PMID 17643379.
- ^ Lieber MR (2010). „Mechanismus opravy zlomení dvouřetězcové DNA nehomologní cestou konce DNA. Annu. Biochem. 79: 181–211. doi:10.1146 / annurev.biochem.052308.093131. PMC 3079308. PMID 20192759.
- ^ Wang H, Rosidi B, Perrault R, Wang M, Zhang L, Windhofer F, Iliakis G (květen 2005). „DNA ligáza III jako kandidátní složka záložních drah nehomologního spojování konců“. Cancer Res. 65 (10): 4020–30. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-3055. PMID 15899791.
- ^ Simsek D, Brunet E, Wong SY, Katyal S, Gao Y, McKinnon PJ, Lou J, Zhang L, Li J, Rebar EJ, Gregory PD, Holmes MC, Jasin M (červen 2011). Haber JE (ed.). „DNA ligáza III podporuje alternativní nehomologní koncové spojení během tvorby chromozomální translokace“. PLOS Genet. 7 (6): e1002080. doi:10.1371 / journal.pgen.1002080. PMC 3107202. PMID 21655080.
- ^ Boboila C, Oksenych V, Gostissa M, Wang JH, Zha S, Zhang Y, Chai H, Lee CS, Jankovic M, Saez LM, Nussenzweig MC, McKinnon PJ, Alt FW, Schwer B (únor 2012). „Robustní oprava chromozomální DNA prostřednictvím alternativního spojování konců při absenci rentgenové opravy křížově komplementárního proteinu 1 (XRCC1)“. Sborník Národní akademie věd, USA. 109 (7): 2473–8. doi:10.1073 / pnas.1121470109. PMC 3289296. PMID 22308491.
- ^ Girard PM, Kysela B, Härer CJ, Doherty AJ, Jeggo PA (říjen 2004). „Analýza mutací DNA ligázy IV u pacientů se syndromem LIG4: dopad dvou spojených polymorfismů“. Lidská molekulární genetika. 13 (20): 2369–76. doi:10,1093 / hmg / ddh274. PMID 15333585.
- ^ O'Driscoll M, Cerosaletti KM, Girard PM, Dai Y, Stumm M, Kysela B, Hirsch B, Gennery A, Palmer SE, Seidel J, Gatti RA, Varon R, Oettinger MA, Neitzel H, Jeggo PA, Concannon P ( Prosince 2001). „Mutace DNA ligázy IV identifikované u pacientů vykazujících vývojové zpoždění a imunodeficienci“. Molekulární buňka. 8 (6): 1175–85. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00408-7. PMID 11779494.
- ^ Riballo E, Critchlow SE, Teo SH, Doherty AJ, Priestley A, Broughton B, Kysela B, Beamish H, Plowman N, Arlett CF, Lehmann AR, Jackson SP, Jeggo PA (červenec 1999). "Identifikace defektu DNA ligázy IV u pacienta s radiosenzitivní leukémií". Curr. Biol. 9 (13): 699–702. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80311-X. PMID 10395545. S2CID 17103936.
- ^ Barnes DE, Tomkinson AE, Lehmann AR, Webster AD, Lindahl T (květen 1992). „Mutace v genu DNA ligázy I jedince s imunodeficiencí a buněčnou přecitlivělostí na látky poškozující DNA“. Buňka. 69 (3): 495–503. doi:10.1016 / 0092-8674 (92) 90450-Q. PMID 1581963. S2CID 11736507.
- ^ Chen X, Zhong S, Zhu X, Dziegielewska B, Ellenberger T, Wilson GM, MacKerell AD, Tomkinson AE (květen 2008). „Racionální návrh inhibitorů lidské DNA ligázy zaměřených na replikaci a opravu buněčné DNA“. Cancer Res. 68 (9): 3169–77. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6636. PMC 2734474. PMID 18451142.
- ^ A b C Tobin LA, Robert C, Nagaria P, Chumsri S, Twaddell W, Ioffe OB, Greco GE, Brodie AH, Tomkinson AE, Rassool FV (2012). „Cílení na abnormální opravu DNA u rakovin prsu rezistentních na terapii“. Výzkum molekulární rakoviny. 10 (1): 96–107. doi:10.1158 / 1541-7786.MCR-11-0255. PMC 3319138. PMID 22112941.
- ^ A b Tobin LA, Robert C, Rapoport AP, Gojo I, Baer MR, Tomkinson AE, Rassool FV (duben 2013). „Cílení na abnormální opravu zlomení dvouřetězcové DNA u chronických myeloidních leukémií rezistentních na inhibitor tyrosinkinázy“. Onkogen. 32 (14): 1784–93. doi:10.1038 / dne 2012.203. PMC 3752989. PMID 22641215.
- ^ A b Sallmyr A, Tomkinson AE, Rassool FV (srpen 2008). „Up-regulace WRN a DNA ligázy III-alfa u chronické myeloidní leukémie: důsledky pro opravu dvouřetězcových zlomů DNA“. Krev. 112 (4): 1413–23. doi:10.1182 / krev-2007-07-104257. PMC 2967309. PMID 18524993.
- ^ Ahel I, Rass U, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements PM, McKinnon PJ, Caldecott KW, West SC (říjen 2006). „Neurodegenerativní chorobný protein aprataxin řeší abortní ligační meziprodukty DNA“. Příroda. 443 (7112): 713–6. doi:10.1038 / nature05164. PMID 16964241. S2CID 4431045.
- ^ Date H, Onodera O, Tanaka H, Iwabuchi K, Uekawa K, Igarashi S, Koike R, Hiroi T, Yuasa T, Awaya Y, Sakai T, Takahashi T, Nagatomo H, Sekijima Y, Kawachi I, Takiyama Y, Nishizawa M , Fukuhara N, Saito K, Sugano S, Tsuji S (říjen 2001). „Ataxie s časným nástupem s oční motorickou apraxií a hypoalbuminemií je způsobena mutacemi v novém genu nadrodiny HIT“. Genetika přírody. 29 (2): 184–8. doi:10.1038 / ng1001-184. PMID 11586299. S2CID 25665707.
- ^ Moreira MC, Barbot C, Tachi N, Kozuka N, Uchida E, Gibson T, Mendonça P, Costa M, Barros J, Yanagisawa T, Watanabe M, Ikeda Y, Aoki M, Nagata T, Coutinho P, Sequeiros J, Koenig M (Říjen 2001). „Gen mutovaný v ataxicko-oční apraxii 1 kóduje nový protein HIT / Zn-finger aprataxin“. Genetika přírody. 29 (2): 189–93. doi:10.1038 / ng1001-189. PMID 11586300. S2CID 23001321.
- ^ El-Khamisy SF, Saifi GM, Weinfeld M, Johansson F, Helleday T, Lupski JR, Caldecott KW (březen 2005). „Vadná oprava zlomení jednořetězcové DNA u spinocerebelární ataxie s axonální neuropatií-1“. Příroda. 434 (7029): 108–13. doi:10.1038 / nature03314. PMID 15744309. S2CID 4423748.
- ^ Shen J, Gilmore EC, Marshall CA, Haddadin M, Reynolds JJ, Eyaid W, Bodell A, Barry B, Gleason D, Allen K, Ganesh VS, Chang BS, Grix A, Hill RS, Topcu M, Caldecott KW, Barkovich AJ , Walsh CA (březen 2010). „Mutace v PNKP způsobují mikrocefalii, záchvaty a defekty v opravě DNA“. Genetika přírody. 42 (3): 245–9. doi:10,1038 / ng.526. PMC 2835984. PMID 20118933.
- ^ Sharma S, Javadekar SM, Pandey M, Srivastava M, Kumari R, Raghavan SC (2015). „Homologie a enzymatické požadavky na mikrohomologii závislé alternativní spojování konců. Cell Death Dis. 6 (3): e1697. doi:10.1038 / cddis.2015.58. PMC 4385936. PMID 25789972.
- ^ Herrero AB, San Miguel J, Gutierrez NC (2015). „Deregulace opravy dvouvláknového zlomu DNA u mnohočetného myelomu: důsledky pro stabilitu genomu“. PLOS ONE. 10 (3): e0121581. doi:10.1371 / journal.pone.0121581. PMC 4366222. PMID 25790254.