Histon H3 - Histone H3

H3 histon, rodina 3A (H3.3A)
Identifikátory
SymbolH3F3A
Alt. symbolyH3F3
Gen NCBI3020
HGNC4764
OMIM601128
RefSeqNM_002107
UniProtQ66I33
Další údaje
MístoChr. 1 q41
H3 histon, rodina 3B (H3.3B)
Identifikátory
SymbolH3F3B
Gen NCBI3021
HGNC4765
OMIM601058
RefSeqNM_005324
UniProtP84243
Další údaje
MístoChr. 17 q25
Základní jednotky struktury chromatinu

Histon H3 je jedním z pěti hlavních histony podílí se na struktuře chromatin v eukaryotické buňky.[1][2] Představujeme hlavní kulovou doménu a dlouhou N-koncový ocas, H3 souvisí se strukturou nukleosomy struktury „korálky na provázku“. Histonové proteiny jsou vysoce posttranslačně modifikovány, avšak histon H3 je nejrozsáhleji modifikovaný z pěti histonů. Samotný termín „histon H3“ je záměrně nejednoznačný v tom, že nerozlišuje mezi variantami sekvence nebo stavem modifikace. Histon H3 je důležitým proteinem v rozvíjející se oblasti epigenetika, kde se předpokládá, že jeho sekvenční varianty a stavy variabilních modifikací hrají roli v dynamické a dlouhodobé regulaci genů.

Epigenetika a posttranslační úpravy

N-konec H3 vyčnívá z kulové hvězdice nukleosom jádro a je citlivý na posttranslační modifikace, které ovlivňují buněčné procesy. Tyto modifikace zahrnují kovalentní připojení methylových nebo acetylových skupin k lysin a arginin aminokyseliny a fosforylace serin nebo threonin. Di- a tri-methylace lysinu 9 jsou spojeny s represí a heterochromatin (vidět H3K9me2 a H3K9me3 ), zatímco mono-methylace K4 (K4 odpovídá lysinovému zbytku ve 4. poloze) (viz H3K4me1 ), je spojován s aktivními geny.[3][4] Acetylace histonu H3 v několika polohách lysinu v histonovém ocasu se provádí pomocí histon acetyltransferáza enzymy (HAT). Acetylace lysinu14 se běžně vyskytuje u genů, do kterých se aktivně přepisují RNA (vidět H3K14ac ).

Sekvenční varianty

Savčí buňky mají sedm známých variant sekvencí histonu H3. Ty jsou označovány jako Histone H3.1, Histone H3.2, Histone H3.3, Histone H3.4 (H3T), Histone H3.5, Histone H3.X a Histone H3.Y, ale mají vysoce konzervované sekvence lišící se pouze několik aminokyselin.[5][6] Bylo zjištěno, že histon H3.3 hraje důležitou roli při udržování integrity genomu během vývoje savců.[7] Varianty histonů z různých organismů, jejich klasifikace a varianty specifické rysy lze nalézt v „HistoneDB - s variantami“ databáze.

Genetika

Histony H3 jsou kódovány několika geny v lidském genomu, včetně:


Viz také

Reference

  1. ^ Bhasin M, Reinherz EL, Reche PA (2006). "Rozpoznávání a klasifikace histonů pomocí podpůrného vektorového stroje" (PDF). Journal of Computational Biology. 13 (1): 102–12. doi:10.1089 / cmb.2006.13.102. PMID  16472024.
  2. ^ Hartl DL, Freifelder D, Snyder LA (1988). Základní genetika. Boston: Vydavatelé Jones a Bartlett. ISBN  978-0-86720-090-4.
  3. ^ Rosenfeld JA, Wang Z, Schones DE, Zhao K, DeSalle R, Zhang MQ (březen 2009). „Stanovení obohacených modifikací histonu v negenických částech lidského genomu“. BMC Genomics. 10: 143. doi:10.1186/1471-2164-10-143. PMC  2667539. PMID  19335899.
  4. ^ Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (březen 2001). „Methylace histonu H3 lysinu 9 vytváří vazebné místo pro proteiny HP1“. Příroda. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Natur.410..116L. doi:10.1038/35065132. PMID  11242053. S2CID  4331863.
  5. ^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (listopad 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
  6. ^ Hake SB, Garcia BA, Duncan EM, Kauer M, Dellaire G, Shabanowitz J, Bazett-Jones DP, Allis CD, Hunt DF (leden 2006). „Expresní vzorce a posttranslační modifikace spojené s savčími histonovými variantami H3“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (1): 559–68. doi:10,1074 / jbc.M509266200. PMID  16267050.
  7. ^ Jang CW, Shibata Y, Starmer J, Yee D, Magnuson T (červenec 2015). „Histon H3.3 udržuje integritu genomu během vývoje savců“. Geny a vývoj. 29 (13): 1377–92. doi:10.1101 / gad.264150.115. PMC  4511213. PMID  26159997.