HIST1H3A - HIST1H3A

H3C1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3 WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4 libry, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4HON, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3 km, 4RM6, 4A7J, 3UEE, 2 KWK, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4LKA, 5 CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3AZH, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2 KWJ, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4RM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2 LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3SOU, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2B2U, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Identifikátory
Aliasy	H3C1, H3 / A, H3FA, histonová klastr 1, H3a, histonová klastr 1 H3 člen rodiny a, HIST1H3A, H3 klastrovaný histon 1, H3C4, H3C7, H3C12, H3C2, H3C8, H3C10, H3C3, H3C6, H3C11
Externí ID	OMIM: 602810 MGI: 2448322 HomoloGene: 134332 Genové karty: H3C1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	26,020,900 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • histonová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • kadherinová vazba; • vazba nukleosomální DNA;
Buněčná složka	• nukleární nukleosom; • membrána; • nukleoplazma; • chromozóm; • extracelulární oblast; • nukleární chromozom; • extracelulární exosom; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • nukleosom; • buněčné jádro; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• organizace telomer; • buněčný proteinový metabolický proces; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • heterotetramerizace proteinů; • srážení krve; • Sestavení nukleosomů závislé na replikaci DNA; • regulace umlčování genů; • umlčování chromatinu při rDNA; • negativní regulace genové exprese, epigenetická; • organizace chromatinu; • regulace umlčování genů miRNA; • shromáždění nukleosomů; • interleukin-7 zprostředkovanou signální cestu; • regulace diferenciace megakaryocytů; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8350
	319149
	ENSG00000275714
	n / a
	P68431
	P84228
	NM_003529
	NM_178204
	NP_066298; NP_003520; NP_003525; NP_003527
NP_835511; NP_835510; NP_783584; NP_038576; NP_473386;
	NP_835734; NP_835512; NP_835587
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H3.1 je protein že u lidí je kódován HIST1H3A gen.^[4]^[5]^[6]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálních vláken u eukaryot. Tato struktura se skládá z přibližně 146 bp DNA obalené kolem nukleosomu, oktameru složeného z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). Chromatinové vlákno se dále zhutňuje prostřednictvím interakce linkeru histonu H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H3. V přepisech z tohoto genu chybí polyA ocasy; místo toho obsahují palindromický ukončovací prvek. Tento gen se nachází ve velkém klastru histonových genů na chromozomu 6p22-p21.3.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275714 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Albig W, Kioschis P, Poustka A, Meergans K, Doenecke D (duben 1997). "Organizace genu pro lidský histon: neregulérní uspořádání ve velkém klastru". Genomika. 40 (2): 314–22. doi:10.1006 / geno.1996.4592. PMID 9119399.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H3A histon cluster 1, H3a“.

Další čtení

Albig W, Kardalinou E, Drabent B a kol. (1991). "Izolace a charakterizace dvou lidských H1 histonových genů v klastrech hlavních histonových genů". Genomika. 10 (4): 940–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-F. PMID 1916825.
Albig W, Doenecke D (1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hučení. Genet. 101 (3): 284–94. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Ahn J, Gruen JR (1999). "Genomická organizace histonových shluků na lidském 6p21.3". Mamm. Genom. 10 (7): 768–70. doi:10,1007 / s003359901089. PMID 10384058. S2CID 28275496.
Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D a kol. (2000). "Regulace chromatinové struktury místně specifickými histonovými H3 methyltransferázami". Příroda. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000Natur.406..593R. doi:10.1038/35020506. PMID 10949293. S2CID 205008015.
Hsu JY, Sun ZW, Li X a kol. (2000). „Mitotická fosforylace histonu H3 je řízena Ipl1 / aurora kinázou a Glc7 / PP1 fosfatázou u začínajících kvasinek a hlístic“. Buňka. 102 (3): 279–91. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00034-9. PMID 10975519. S2CID 16057773.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Lachner M, O'Carroll D, Rea S a kol. (2001). „Methylace histonu H3 lysinu 9 vytváří vazebné místo pro proteiny HP1“. Příroda. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Natur.410..116L. doi:10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Yang L, Xia L, Wu DY a kol. (2002). „Molekulární klonování ESETu, nové methyltransferázy specifické pro histon H3, která interaguje s transkripčním faktorem ERG“. Onkogen. 21 (1): 148–52. doi:10.1038 / sj.onc.1204998. PMID 11791185.
Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR a kol. (2002). "Struktura HP1 chromodomény vázané na histon H3 methylovaný na lysinu 9". Příroda. 416 (6876): 103–7. Bibcode:2002 Natur.416..103N. doi:10.1038 / příroda722. PMID 11882902. S2CID 4423019.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Koessler H, Doenecke D, Albig W (2003). „Aberantní expresní vzorec genů podtypu histonu h3 závislých na replikaci v lidských nádorových buněčných liniích“. DNA Cell Biol. 22 (4): 233–41. doi:10.1089/104454903321908629. PMID 12823900.
Coleman MA, Miller KA, Beernink PT a kol. (2004). "Identifikace proteinových interakcí souvisejících s chromatinem pomocí proteinových čipů". Proteomika. 3 (11): 2101–7. doi:10.1002 / pmic.200300593. PMID 14595808. S2CID 23471253.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Citterio E, Papait R, Nicassio F a kol. (2004). „Np95 je protein vázající histon vybavený aktivitou ubikvitin ligázy“. Mol. Buňka. Biol. 24 (6): 2526–35. doi:10.1128 / MCB.24.6.2526-2535.2004. PMC 355858. PMID 14993289.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275714 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9119399-4] Albig W, Kioschis P, Poustka A, Meergans K, Doenecke D (duben 1997). "Organizace genu pro lidský histon: neregulérní uspořádání ve velkém klastru". Genomika. 40 (2): 314–22. doi:10.1006 / geno.1996.4592. PMID 9119399.

[pmid12408966-5] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HIST1H3A histon cluster 1, H3a“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]