TINF2 - TINF2

TINF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3BQO, 3BU8
Identifikátory
Aliasy	TINF2„DKCA3, TIN2, TERF1 interagující jaderný faktor 2
Externí ID	OMIM: 604319 MGI: 107246 HomoloGene: 8264 Genové karty: TINF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	24,242,674 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	55,681,820 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba telomerické DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• komplex jaderných telomer; • jaderná matice; • perinukleolární chromocentrum; • nukleoplazma; • chromozóm; • Shelterin; • chromozom, telomerická oblast; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • buněčné jádro; • jaderné těleso;
Biologický proces	• lokalizace proteinu do chromozomu, telomerické oblasti; • negativní regulace proliferace epiteliálních buněk; • montáž telomer; • negativní regulace proteinové ADP-ribosylace; • omezení telomer; • negativní regulace údržby telomer prostřednictvím telomerázy; • regulace údržby telomer pomocí prodloužení telomer;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26277
	28113
	ENSG00000092330; ENSG00000284915
	ENSMUSG00000007589
	Q9BSI4
	Q9QXG9; Q8K1K3
	NM_001099274; NM_012461; NM_001363668
	NM_145705
	NP_001092744; NP_036593; NP_001350597
	NP_663751
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderný faktor 2 interagující s TERF1 je protein že u lidí je kódován TINF2 gen.^[5]^[6] TIN2 je součástí přístřešek proteinový komplex nalezený na konci roku 2006 telomery.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že TINF2 komunikovat s ACD,^[8]^[9] POT1^[8]^[9]^[10] a TERF1.^[5]^[9]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000284915 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000092330, ENSG00000284915 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000007589 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Kim SH, Kaminker P, Campisi J (prosinec 1999). „TIN2, nový regulátor délky telomer v lidských buňkách“. Genetika přírody. 23 (4): 405–12. doi:10.1038/70508. PMC 4940194. PMID 10581025.
^ „Entrez Gene: TINF2 TERF1 (TRF1) - interagující jaderný faktor 2“.
^ Savage SA, Giri N, Baerlocher GM, Orr N, Lansdorp PM, Alter BP (únor 2008). „TINF2, součást komplexu ochrany Shelterin telomer, je mutován v dyskeratosis congenita“. American Journal of Human Genetics. 82 (2): 501–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2007.10.004. PMC 2427222. PMID 18252230.
^ ^A ^b Ye JZ, Hockemeyer D, Krutchinsky AN, Loayza D, Hooper SM, Chait BT, de Lange T (červenec 2004). „POT1 interagující protein PIP1: regulátor délky telomer, který rekrutuje POT1 do komplexu TIN2 / TRF1“. Geny a vývoj. 18 (14): 1649–54. doi:10.1101 / gad.1215404. PMC 478187. PMID 15231715.
^ ^A ^b ^C Liu D, Safari A, O'Connor MS, Chan DW, Laegeler A, Qin J, Songyang Z (červenec 2004). „PTOP interaguje s POT1 a reguluje jeho lokalizaci do telomer“. Přírodní buněčná biologie. 6 (7): 673–80. doi:10.1038 / ncb1142. PMID 15181449.
^ Loayza D, De Lange T (červen 2003). "POT1 jako koncový měnič regulace délky telomer TRF1". Příroda. 423 (6943): 1013–8. doi:10.1038 / nature01688. PMID 12768206.
^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Li B, Oestreich S, de Lange T (květen 2000). „Identifikace lidského Rap1: důsledky pro vývoj telomer“. Buňka. 101 (5): 471–83. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80858-2. PMID 10850490.
Mignon-Ravix C, Depetris D, Delobel B, Croquette MF, Mattei MG (únor 2002). „Lidský intersticiální telomer se asociuje in vivo se specifickými proteiny TRF2 a TIN2“. European Journal of Human Genetics. 10 (2): 107–12. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200775. PMID 11938440.
Yamada M, Tsuji N, Nakamura M, Moriai R, Kobayashi D, Yagihashi A, Watanabe N (2003). „Down-regulace genů TRF1, TRF2 a TIN2 je důležitá pro udržení telomerické DNA pro rakovinu žaludku“. Protinádorový výzkum. 22 (6A): 3303–7. PMID 12530079.
Loayza D, De Lange T (červen 2003). "POT1 jako koncový měnič regulace délky telomer TRF1". Příroda. 423 (6943): 1013–8. doi:10.1038 / nature01688. PMID 12768206.
Kim SH, Han S, You YH, Chen DJ, Campisi J (červenec 2003). „Protein TIN2 asociovaný s lidskými telomery stimuluje in vitro interakce mezi trakty telomerické DNA“. Zprávy EMBO. 4 (7): 685–91. doi:10.1038 / sj.embor.embor872. PMC 1326318. PMID 12835755.
Loayza D, Parsons H, Donigian J, Hoke K, de Lange T (březen 2004). "DNA vazebné vlastnosti lidského POT1: neamerní 5'-TAGGGTTAG-3 'minimální vazebné místo, sekvenční specificita a vnitřní vazba na multimerní místa". The Journal of Biological Chemistry. 279 (13): 13241–8. doi:10,1074 / jbc.M312309200. PMID 14715659.
Ye JZ, de Lange T (červen 2004). „TIN2 je tankyrasový 1 PARP modulátor v komplexu řízení délky telomer TRF1“. Genetika přírody. 36 (6): 618–23. doi:10.1038 / ng1360. PMID 15133513.
Liu D, Safari A, O'Connor MS, Chan DW, Laegeler A, Qin J, Songyang Z (červenec 2004). „PTOP interaguje s POT1 a reguluje jeho lokalizaci do telomer“. Přírodní buněčná biologie. 6 (7): 673–80. doi:10.1038 / ncb1142. PMID 15181449.
Ye JZ, Hockemeyer D, Krutchinsky AN, Loayza D, Hooper SM, Chait BT, de Lange T (červenec 2004). „POT1 interagující protein PIP1: regulátor délky telomer, který rekrutuje POT1 do komplexu TIN2 / TRF1“. Geny a vývoj. 18 (14): 1649–54. doi:10.1101 / gad.1215404. PMC 478187. PMID 15231715.
Kim SH, Beausejour C, Davalos AR, Kaminker P, Heo SJ, Campisi J (říjen 2004). „TIN2 zprostředkovává funkce TRF2 v lidských telomerách“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (42): 43799–804. doi:10,1074 / jbc.M408650200. PMID 15292264.
Ye JZ, Donigian JR, van Overbeek M, Loayza D, Luo Y, Krutchinsky AN, Chait BT, de Lange T (listopad 2004). „TIN2 váže současně TRF1 a TRF2 a stabilizuje komplex TRF2 na telomerách“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (45): 47264–71. doi:10,1074 / jbc.M409047200. PMID 15316005.
Liu D, O'Connor MS, Qin J, Songyang Z (prosinec 2004). "Telosome, komplex savců spojený s telomerem tvořený několika telomerními proteiny". The Journal of Biological Chemistry. 279 (49): 51338–42. doi:10,1074 / jbc.M409293200. PMID 15383534.
Oh BK, Kim YJ, Park C, Park YN (leden 2005). „Up-regulace proteinů vázajících telomery, TRF1, TRF2 a TIN2 souvisí se zkrácením telomer během lidské vícestupňové hepatokarcinogeneze“. American Journal of Pathology. 166 (1): 73–80. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 62233-X. PMC 1602303. PMID 15632001.
Kaminker P, Plachot C, Kim SH, Chung P, Crippen D, Petersen OW, Bissell MJ, Campisi J, Lelièvre SA (březen 2005). „Jaderná organizace vyššího řádu při zastavování růstu lidských epiteliálních buněk mléčné žlázy: nová role proteinu TIN2 spojeného s telomerem“. Journal of Cell Science. 118 (Pt 6): 1321–30. doi:10.1242 / jcs.01709. PMC 2933191. PMID 15741234.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na Dyskeratosis Congenita
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidský jaderný faktor 2 interagující s TERF1 (TINF2)

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000284915 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000092330, ENSG00000284915 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000007589 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10581025-5] A ^b Kim SH, Kaminker P, Campisi J (prosinec 1999). „TIN2, nový regulátor délky telomer v lidských buňkách“. Genetika přírody. 23 (4): 405–12. doi:10.1038/70508. PMC 4940194. PMID 10581025.

[entrez-6] „Entrez Gene: TINF2 TERF1 (TRF1) - interagující jaderný faktor 2“.

[pmid18252230-7] Savage SA, Giri N, Baerlocher GM, Orr N, Lansdorp PM, Alter BP (únor 2008). „TINF2, součást komplexu ochrany Shelterin telomer, je mutován v dyskeratosis congenita“. American Journal of Human Genetics. 82 (2): 501–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2007.10.004. PMC 2427222. PMID 18252230.

[pmid15231715-8] A ^b Ye JZ, Hockemeyer D, Krutchinsky AN, Loayza D, Hooper SM, Chait BT, de Lange T (červenec 2004). „POT1 interagující protein PIP1: regulátor délky telomer, který rekrutuje POT1 do komplexu TIN2 / TRF1“. Geny a vývoj. 18 (14): 1649–54. doi:10.1101 / gad.1215404. PMC 478187. PMID 15231715.

[pmid15181449-9] A ^b ^C Liu D, Safari A, O'Connor MS, Chan DW, Laegeler A, Qin J, Songyang Z (červenec 2004). „PTOP interaguje s POT1 a reguluje jeho lokalizaci do telomer“. Přírodní buněčná biologie. 6 (7): 673–80. doi:10.1038 / ncb1142. PMID 15181449.

[pmid12768206-10] Loayza D, De Lange T (červen 2003). "POT1 jako koncový měnič regulace délky telomer TRF1". Příroda. 423 (6943): 1013–8. doi:10.1038 / nature01688. PMID 12768206.

[pmid16169070-11] Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]