HIST2H3C - HIST2H3C

H3C14
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2IIJ, 2X4W, 2X4X, 2X4Y, 3AV1, 3DB3, 3MO8, 3R93, 4MZF, 4MZG, 4MZH, 4OUC, 5BO0, 2HIO, 5B0Z, 2ARO, 1EQZ, 1HQ3, 4KGC, 1TZY, 4UUZ, 2F8N, 5B0Y, 4LD9, 5B40, 5CIU
Identifikátory
Aliasy	H3C14, H3, H3.2, H3 / M, H3F2, H3FM, H3FN, histonová klastr 2, H3c, histonová klastr 2 H3 člen rodiny c, HIST2H3C, H3 klastrovaný histon 14, H3C15, H3C13
Externí ID	OMIM: 142780 MGI: 3650546 HomoloGene: 134475 Genové karty: H3C14
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	149,841,193 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • histonová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba chromatinu; • vazba nukleosomální DNA;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • extracelulární oblast; • nukleoplazma; • chromozóm; • nukleosom; • buněčné jádro; • chromatin;
Biologický proces	• buněčný proteinový metabolický proces; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • srážení krve; • umlčování chromatinu při rDNA; • shromáždění nukleosomů; • negativní regulace genové exprese, epigenetická; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • organizace chromatinu; • regulace umlčování genů miRNA; • interleukin-7 zprostředkovanou signální cestu; • regulace diferenciace megakaryocytů; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	126961
	625328
	ENSG00000203811
	ENSMUSG00000082029
	Q71DI3
	P02301
	NM_021059
	NM_001370931
	NP_066403; NP_001116847
	XP_894986
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H3.2 je protein že u lidí je kódován HIST2H3C gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálních vláken u eukaryot. Tato struktura se skládá z přibližně 146 bp DNA obalené kolem nukleosomu, oktameru složeného z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). Chromatinové vlákno se dále zhutňuje prostřednictvím interakce linkeru histonu H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H3. V přepisech z tohoto genu chybí polyA ocasy; místo toho obsahují palindromický ukončovací prvek. Tento gen se nachází v histonovém klastru na chromozomu 1. Tento gen je jedním ze čtyř histonových genů v klastru, které jsou duplikovány; tento záznam představuje telomerickou kopii.^[6]

Interakce

HIST2H3C bylo prokázáno komunikovat s NCOA6.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000203811 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–498. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ Marashi F, Helms S, Shiels A, Silverstein S, Greenspan DS, Stein G, Stein J (červenec 1986). „Exprese prokaryotických a eukaryotických genů podporovaná zesilovačem pomocí 5 'regulačních sekvencí lidského genu pro histon“. Biochem Cell Biol. 64 (4): 277–289. doi:10.1139 / o86-039. PMID 3013246.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST2H3C histon cluster 2, H3c“.
^ Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (leden 2003). „Aktivační signální kointegrátor 2 patří do nového komplexu ustáleného stavu, který obsahuje podmnožinu proteinů skupiny trithorax“. Mol. Buňka. Biol. 23 (1): 140–149. doi:10.1128 / MCB.23.1.140-149.2003. PMC 140670. PMID 12482968.

Další čtení

Green L, Van Antwerpen R, Stein J, Stein G, Tripputi P, Emanuel B, Selden J, Croce C (1984). „Hlavní shluk lidských histonových genů na dlouhém rameni chromozomu 1“. Věda. 226 (4676): 838–840. doi:10.1126 / science.6494913. PMID 6494913.
Ohe Y, Iwai K (1982). "Lidská slezina histon H3. Izolace a aminokyselinová sekvence". J. Biochem. 90 (4): 1205–11. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a 133573. PMID 7309716.
Díaz-Jullien C, Pérez-Estévez A, Covelo G, Freire M (1996). „Prothymosin alfa váže histony in vitro a vykazuje aktivitu v testu sestavování nukleosomů“. Biochim. Biophys. Acta. 1296 (2): 219–27. doi:10.1016/0167-4838(96)00072-6. PMID 8814229.
Albig W, Doenecke D (1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hučení. Genet. 101 (3): 284–294. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Ahn J, Gruen JR (1999). "Genomická organizace histonových shluků na lidském 6p21.3". Mamm. Genom. 10 (7): 768–770. doi:10,1007 / s003359901089. PMID 10384058.
Goto H, Tomono Y, Ajiro K, Kosako H, Fujita M, Sakurai M, Okawa K, Iwamatsu A, Okigaki T, Takahashi T, Inagaki M (1999). "Identifikace nového fosforylačního místa na histonu H3 ve spojení s kondenzací mitotického chromozomu". J. Biol. Chem. 274 (36): 25543–25549. doi:10.1074 / jbc.274.36.25543. PMID 10464286.
Deng L, de la Fuente C, Fu P, Wang L, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Li H, Lee CG, Kashanchi F (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–295. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (2001). „Methylace histonu H3 lysinu 9 vytváří vazebné místo pro proteiny HP1“. Příroda. 410 (6824): 116–120. doi:10.1038/35065132. PMID 11242053.
Shankaranarayanan P, Chaitidis P, Kühn H, Nigam S (2001). „Pro transkripční aktivaci genu 15-lipoxygenázy-1 je vyžadována acetylace histon-acetyltransferázou CREB-vazebný protein / p300 STAT6“. J. Biol. Chem. 276 (46): 42753–42760. doi:10,1074 / jbc.M102626200. PMID 11509556.
Deng L, Wang D, de la Fuente C, Wang L, Li H, Lee CG, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Kashanchi F (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–326. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Goto H, Yasui Y, Nigg EA, Inagaki M (2002). „Aurora-B fosforyluje histon H3 na serinu28 s ohledem na kondenzaci mitotických chromozomů“. Geny buňky. 7 (1): 11–17. doi:10.1046 / j.1356-9597.2001.00498.x. PMID 11856369.
Ganesan S, Silver DP, Greenberg RA, Avni D, Drapkin R, Miron A, Mok SC, Randrianarison V, Brodie S, Salstrom J, Rasmussen TP, Klimke A, Marrese C, Marahrens Y, Deng CX, Feunteun J, Livingston DM (2002). „BRCA1 podporuje koncentraci XIST RNA na neaktivním chromozomu X“. Buňka. 111 (3): 393–405. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01052-8. PMID 12419249.
Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (2003). „Aktivační signální kointegrátor 2 patří do nového komplexu ustáleného stavu, který obsahuje podmnožinu proteinů skupiny trithorax“. Mol. Buňka. Biol. 23 (1): 140–149. doi:10.1128 / MCB.23.1.140-149.2003. PMC 140670. PMID 12482968.
Preuss U, Landsberg G, Scheidtmann KH (2003). "Nová mitospecifická fosforylace histonu H3 na Thr11 zprostředkovaná Dlk / ZIP kinázou". Nucleic Acids Res. 31 (3): 878–885. doi:10.1093 / nar / gkg176. PMC 149197. PMID 12560483.
Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (2003). „Čištění a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a TBLR1“. EMBO J.. 22 (6): 1336–1346. doi:10.1093 / emboj / cdg120. PMC 151047. PMID 12628926.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–6561. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.