CENPA - CENPA - Wikipedia

CENPA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3AN2, 3NQJ, 3NQU, 3R45, 3 WTP, 5CVD
Identifikátory
Aliasy	CENPA, CENP-A, CenH3, centromérový protein A
Externí ID	OMIM: 117139 MGI: 88375 HomoloGene: 1369 Genové karty: CENPA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	26,801,067 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	30,674,830 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba nukleosomální DNA;
Buněčná složka	• kondenzovaný chromozomový vnitřní kinetochor; • kondenzovaný chromozomový kinetochor; • cytosol; • nukleoplazma; • chromozóm; • kondenzovaný jaderný chromozom kinetochore; • chromozom, centromerická oblast; • buněčné jádro; • kinetochore; • kondenzovaný jaderný chromozom, centromerická oblast; • nukleární nukleosom; • nukleární pericentrický heterochromatin; • nukleosom;
Biologický proces	• Sestava nukleosomů obsahující CENP-A; • vytvoření orientace mitotického vřetena; • lokalizace proteinu do chromozomu, centromerická oblast; • GO: virový proces 0022415; • kinetochore montáž; • soudržnost sesterských chromatid; • mitotická cytokineze; • buněčný cyklus; • buněčné dělení; • shromáždění nukleosomů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1058
	12615
	ENSG00000115163
	ENSMUSG00000029177
	P49450
	O35216
	NM_001809; NM_001042426
	NM_007681; NM_001302129; NM_001302130; NM_001302131; NM_001302132
	NP_001035891; NP_001800
	NP_001289058; NP_001289059; NP_001289060; NP_001289061; NP_031707
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Centromere protein A, také známý jako CENPA, je protein který je u lidí kódován CENPA gen.^[5]

Funkce

Centromery jsou chromozomální domény, které určují mitotické chování chromozomů.^[6] Gen CENPA kóduje protein centromery, který obsahuje a histon H3 související histonová skládací doména, která je nutná pro cílení na centromeru. CENPA se navrhuje být součástí modifikovaného nukleosom nebo struktura podobná nukleosomu, ve které nahrazuje 1 nebo obě kopie konvenčního histonu H3 v (H3-H4) 2 tetramerickém jádru nukleosomové částice. Alternativní sestřih má za následek více variant přepisu kódujících odlišně izoformy.^[5]

U vyšších eukaryot je nábor nukleosomů CENP-A do stávajících centromer epigenetickým procesem, nezávislým na podkladové sekvenci DNA.^[6] v S. pombe„Předpokládá se, že nábor CENP-A de novo do centromery je řízen„ centromerickým “ heterochromatin obklopující centromeru a RNAi mechanismus. RNAi je rozřezán na formu siRNA; toto komplexuje s proteinem Chp1, který se potom váže na centromerický heterochromatin. To pomáhá získávat další bílkoviny, což nakonec vede k tvorbě proteinového komplexu kohesin mezi dvěma sesterské chromatidy na centromerním heterochromatinu. Předpokládá se, že tento kohezin je nezbytný při nahrazování centromery H3 CENP-A. CENP-A je jedním z epigenetický změny, o nichž se věří, že odlišují centromerickou DNA od jiné DNA.^[7] Jakmile je přidán CENP-A, centromera se stává samovolně se množícím a okolní mechanismus heterochromatinu / RNAi již není nutný.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115163 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029177 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b EntrezGene 1058
^ ^A ^b Mitra, Sreyoshi; Srinivasan, Bharath; Jansen, Lars E.T. (2020-09-15). "Stabilní dědičnost chromatinu CENP-A: Vnitřní síla versus dynamická kontrola". Journal of Cell Biology. 219 (10). doi:10.1083 / jcb.202005099. ISSN 0021-9525.
^ Chueh AC, Wong LH, Wong N, Choo KH (leden 2005). „Proměnlivá a hierarchická distribuce velikostí klastrů CENP-A obohacených o L1 o retroelement ve funkčním lidském neocentromeru“. Hučení. Mol. Genet. 14 (1): 85–93. doi:10,1093 / hmg / ddi008. PMID 15537667.
^ Folco HD, Pidoux AL, Urano T, Allshire RC (leden 2008). „Heterochromatin a RNAi jsou povinni stanovit CENP-A chromatin v centromerech“. Věda. 319 (5859): 94–7. doi:10.1126 / science.1150944. PMC 2586718. PMID 18174443.

externí odkazy

Člověk CENPA umístění genomu a CENPA stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Palmer DK, O'Day K, Trong HL, Charbonneau H, Margolis RL (1991). „Čištění proteinu specifického pro centromery CENP-A a demonstrace, že se jedná o výrazný histon“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (9): 3734–8. doi:10.1073 / pnas.88.9.3734. PMC 51527. PMID 2023923.
Sullivan KF, Hechenberger M, Masri K (1994). „Lidský CENP-A obsahuje histonovou skládací doménu spojenou s histonem H3, která je nutná pro cílení do centromery“. J. Cell Biol. 127 (3): 581–92. doi:10.1083 / jcb.127.3.581. PMC 2120219. PMID 7962047.
Shelby RD, Vafa O, Sullivan KF (1997). „Sestavení CENP-A do centromerického chromatinu vyžaduje kooperativní řadu kontaktních míst nukleosomální DNA“. J. Cell Biol. 136 (3): 501–13. doi:10.1083 / jcb.136.3.501. PMC 2134286. PMID 9024683.
Valdivia MM, Figueroa J, Iglesias C, Ortíz M (1998). „Nové centromérové monospecifické sérum k lidskému autoepitopu na proteinu CENP-A typu histonu H3“. FEBS Lett. 422 (1): 5–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 01583-4. PMID 9475158. S2CID 40104381.
Fowler KJ, Newson AJ, MacDonald AC, Kalitsis P, Lyu MS, Kozak CA, Choo KH (1998). "Chromozomální lokalizace myšího genu Cenpa". Cytogenet. Cell Genet. 79 (3–4): 298–301. doi:10.1159/000134748. PMID 9605877.
Muro Y, Azuma N, Onouchi H, Kunimatsu M, Tomita Y, Sasaki M, Sugimoto K (2000). „Autoepitopy na autoantigenovém centromérovém proteinu-A (CENP-A) jsou omezeny na N-koncovou oblast, která nemá homologii s histonem H3“. Clin. Exp. Immunol. 120 (1): 218–23. doi:10.1046 / j.1365-2249.2000.01189.x. PMC 1905620. PMID 10759786.
Lomonte P, Sullivan KF, Everett RD (2001). „Degradace centromerického histonu H3 podobného proteinu souvisejícího s nukleosomy CENP-A vyvolaná proteinem viru herpes simplex typu 1 ICP0“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5829–35. doi:10,1074 / jbc.M008547200. PMID 11053442.
Uren AG, Wong L, Pakusch M, Fowler KJ, Burrows FJ, Vaux DL, Choo KH (2001). „Survivin a protein vnitřní centromery INCENP vykazují podobnou lokalizaci buněčného cyklu a fenotyp genového knockoutu“. Curr. Biol. 10 (21): 1319–28. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00769-7. PMID 11084331. S2CID 18455745.
Zeitlin SG, Shelby RD, Sullivan KF (2002). „CENP-A je fosforylován kinázou Aurora B a hraje nečekanou roli při dokončení cytokineze“. J. Cell Biol. 155 (7): 1147–57. doi:10.1083 / jcb.200108125. PMC 2199334. PMID 11756469.
Ando S, Yang H, Nozaki N, Okazaki T, Yoda K (2002). „Komplex CENP-A, -B a -C chromatin, který obsahuje alfa-satelitní pole typu I, tvoří prekinetochor v buňkách HeLa“. Mol. Buňka. Biol. 22 (7): 2229–41. doi:10.1128 / MCB.22.7.2229-2241.2002. PMC 133672. PMID 11884609.
Saxena A, Saffery R, Wong LH, Kalitsis P, Choo KH (2002). „Centromérové proteiny Cenpa, Cenpb a Bub3 interagují s proteinem poly (ADP-ribóza) polymerázy-1 a jsou poly (ADP-ribosyl) ated“. J. Biol. Chem. 277 (30): 26921–6. doi:10,1074 / jbc.M200620200. PMID 12011073.
Figueroa J, Pendón C, Valdivia MM (2003). "Molekulární klonování a sekvenční analýza křečka CENP-A cDNA". BMC Genomics. 3: 11. doi:10.1186/1471-2164-3-11. PMC 113255. PMID 12019018.
Saxena A, Wong LH, Kalitsis P, Earle E, Shaffer LG, Choo KH (2003). „Poly (ADP-ribóza) polymeráza 2 se lokalizuje na savčí aktivní centromery a interaguje s PARP-1, Cenpa, Cenpb a Bub3, ale ne Cenpc“. Hučení. Mol. Genet. 11 (19): 2319–29. doi:10,1093 / hmg / 11,19,2319. PMID 12217960.
Tomonaga T, Matsushita K, Yamaguchi S, Oohashi T, Shimada H, Ochiai T, Yoda K, Nomura F (2003). „Nadměrná exprese a nesprávné cílení proteinu-centromery A u lidského primárního kolorektálního karcinomu“. Cancer Res. 63 (13): 3511–6. PMID 12839935.
Kunitoku N, Sasayama T, Marumoto T, Zhang D, Honda S, Kobayashi O, Hatakeyama K, Ushio Y, Saya H, Hirota T (2004). „Fosforylace CENP-A pomocí Aurora-A v profáze je nutná pro obohacení Aurora-B ve vnitřních centromerech a pro funkci kinetochore.“ Dev. Buňka. 5 (6): 853–64. doi:10.1016 / S1534-5807 (03) 00364-2. PMID 14667408.
Obuse C, Yang H, Nozaki N, Goto S, Okazaki T, Yoda K (2004). „Proteomická analýza komplexu centromér z HeLa mezifázových buněk: UV-poškozený DNA vazebný protein 1 (DDB-1) je součástí komplexu CEN, zatímco BMI-1 je přechodně ko-lokalizován s centromerickou oblastí v mezifázi.“ Geny buňky. 9 (2): 105–20. doi:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID 15009096. S2CID 21813024.
Yasuda S, Oceguera-Yanez F, Kato T, Okamoto M, Yonemura S, Terada Y, Ishizaki T, Narumiya S (2004). "Cdc42 a mDia3 regulují připojení mikrotubulů ke kinetochorům". Příroda. 428 (6984): 767–71. doi:10.1038 / nature02452. PMID 15085137. S2CID 4401953.
Black BE, Foltz DR, Chakravarthy S, Luger K, Woods VL Jr, Cleveland DW (2004). "Strukturální determinanty pro generování centromerického chromatinu". Příroda. 430 (6999): 578–82. doi:10.1038 / nature02766. PMID 15282608. S2CID 4392941.
Sullivan BA, Karpen GH (2004). „Centromerický chromatin vykazuje vzor modifikace histonu, který je odlišný od euchromatinu i heterochromatinu“. Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (11): 1076–83. doi:10.1038 / nsmb845. PMC 1283111. PMID 15475964.
Nikolina S, Basset EA, Robers DJ, Black BE (2010). „Struktura (CENP-A? H4) 2 odhaluje fyzikální vlastnosti, které označují centromery“. Příroda. 467 (7313): 347–351. doi:10.1038 / nature09323. PMC 2946842. PMID 20739937.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115163 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029177 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[gene_uid_1058-5] A ^b EntrezGene 1058

[:0-6] A ^b Mitra, Sreyoshi; Srinivasan, Bharath; Jansen, Lars E.T. (2020-09-15). "Stabilní dědičnost chromatinu CENP-A: Vnitřní síla versus dynamická kontrola". Journal of Cell Biology. 219 (10). doi:10.1083 / jcb.202005099. ISSN 0021-9525.

[pmid15537667-7] Chueh AC, Wong LH, Wong N, Choo KH (leden 2005). „Proměnlivá a hierarchická distribuce velikostí klastrů CENP-A obohacených o L1 o retroelement ve funkčním lidském neocentromeru“. Hučení. Mol. Genet. 14 (1): 85–93. doi:10,1093 / hmg / ddi008. PMID 15537667.

[pmid18174443-8] Folco HD, Pidoux AL, Urano T, Allshire RC (leden 2008). „Heterochromatin a RNAi jsou povinni stanovit CENP-A chromatin v centromerech“. Věda. 319 (5859): 94–7. doi:10.1126 / science.1150944. PMC 2586718. PMID 18174443.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]