HLA A1-B8-DR3-DQ2 - HLA A1-B8-DR3-DQ2

Vícegénový haplotyp, lidský
HLA-mini.png
HLA oblast na chromozomu 6
HLA A1-B8-DR3-DQ2
Přezdívky„Super-B8“, „AH8.1“, „rodový MHC 8.1“
LociGenAlelaSérotyp
Třída I.HLA-A*0101A1
HLA-C*0701Cw7
HLA-B*0801B8
HLA-DRHLA-DRB1*0301DR3
HLA-DRB3*0101DR52
HLA-DQHLA-DQA1*0501
HLA-DQB1*0201DQ2
Uzly
PopulaceMaximaFrekvenceMax
Západní Irsko>11.0%
Velikost a umístění
GenyUmístěnívelikost (kb / s)
31166p21.34700
Přidružené nemoci
Haplotyp
(gen)		Nemoc (y)
DQ2.5Celiakie
DR3-DQ2Juvenilní diabetes, Sarkoidóza
B8 :: DQ2Autoimunitní hepatitida, Primární biliární cirhóza, Myasthenia gravis, Dermatitis herpetiformis

Haplotyp HLA A1-B8-DR3-DQ2 (Taky: AH8.1, KORMIDELNÍK,[1] Super B8, rodové MHC 8.1[2] nebo 8.1 rodový haplotyp[3]) je multigen haplotyp který pokrývá většinu lidí hlavní komplex histokompatibility na chromozom 6 (nezaměňovat s HLA-DQ heterodimer DQ8.1 ). Multigenní haplotyp je sada zděděných alely pokrývající několik genů nebo genových alel; společné multigenní haplotypy jsou obecně výsledkem sestupu po společném původu (sdílejte nedávného společného předka pro daný segment chromozomu). Chromozomální rekombinace fragmenty multigenních haplotypů, jak se vzdálenost k tomuto předkovi zvyšuje v počtu generací.

Haplotyp lze napsat v rozšířené formě pokrývající hlavní lokusy histokompatibility takto:

HLA A*0101 : Cw*0701 : B*0801 : DRB1*0301 : DQA1*0501 : DQB1*0201 nebo zkratka A1 :: DQ2

V haplotypu existuje mnoho dalších genových alel, včetně více než 250 kódování loci které vytvářejí přepisy.

Na 4,7 milionu nukleotidy na délku je A1 :: DQ2 druhým nejdelším haplotypem identifikovaným v rámci lidský genom.[1] A1 :: DQ2 vytváří hlavolam pro evoluční studium rekombinace. Délka haplotypu je pozoruhodná, protože rychlá rychlost evoluce v místě HLA by měla takové dlouhé haplotypy degradovat. Původ A1 :: DQ2 je obtížné dohledat, byly předloženy návrhy společného předka v Iberii nebo v Africe. Ačkoli jeho místo původu není jisté, existuje shoda, že nositelé evropské AH8.1 nesou haplotyp související se společným původem.[3] A1 :: DQ2 je nejčastějším haplotypem své délky, který se vyskytuje u amerických bělochů, ~ 15% nese tento běžný haplotyp.[4]

Studie naznačují, že důležitost A1 :: DQ2 je pravděpodobně způsobena pozitivní selekcí v období před neolitem a izolací v zemích, kde pšenice nebyla významnou obilovinou. Mimo DR3-DQ2 se známými asociacemi autoimunitní onemocnění, se předpokládá, že další faktory v rámci A1 :: DQ2 také přispívají k autoimunitnímu onemocnění.[3] Také tucet zánětlivých onemocnění imunitního systému může haplotypu připisovat určité riziko. Některá onemocnění mají rádi celiakii spolupracovník s určitými geny. Zatímco jiné nemoci, jako je cukrovka 1. typu, mohou mít několik velmi odlišných genů, které připisují riziko. Ještě další nemoci, jako je myasthenia gravis, mají neurčenou vazbu na haplotyp.

Dynamika rekombinace

Každá osoba má své vlastní chromozomy, pokud to nejsou identická dvojčata. Tyto jedinečné chromozomy jsou produkovány rekombinací každého jedinečného chromozomu předaného každým prarodičem každému rodiči. Tyto chromozomy se chimerizují v reprodukčních buňkách každého z rodičů, které se pak předávají vývojové osobě během oplodnění. K rekombinaci, která vytváří tyto smíšené chromozomy, dochází téměř náhodně po celé délce, 1 Morgan za generaci. Během 100 generací u lidí (asi 2100 let ve starověku) lze očekávat, že několik stovek těchto „směsných“ událostí nastalo na jediném chromozomu, průměrná velikost je 1 centiMorgan (nebo 1 cM). Průměrná délka těchto „haplotypů“ je asi 1 milion nukleotidů.

Multigenní haplotypy sledující standardní dynamiku existují pouze v robustních populacích po krátkou dobu, průměrná vzdálenost mezi geny je asi 200 000 nts, což znamená, že během 250 generací (~ 5000 let) lze očekávat, že 1/2 sousedních genů bude mít nové genové alely , pokud nejsou geny malé a velmi blízko u sebe. Tato dynamika se může změnit, pokud se populace rychle rozšíří z několika jedinců, kteří žili v izolaci, pokud jsou zachovány jiné haplotypy.

A1 :: DQ2 nedodržuje očekávanou dynamiku. Jiné haplotypy existují v oblasti Evropy, kde se tento haplotyp vytvořil a rozšířil, některé z těchto haplotypů jsou také rodové a jsou také poměrně velké. Při délce 4,7 milionu nukleotidů a ~ 300 genech lokus odolával účinkům rekombinace, buď jako důsledek rekombinační obstrukce v DNA, jako důsledek opakované selekce pro celý haplotyp, nebo obojí.

Struktura

A1 :: DQ2 má délku 4 731 878 nukleotidů.[1] Haplotyp začíná před TRIM27 lokus přibližně 28,8 milionu nukleotidů z telomer kratšího ramene chromozomu 6. AH8.1 sahá přes SYNGAP1 asi 33,5 milionu nukleotidů z telomeru. K výraznému zhoršení však dochází po genu DQB1 na 32,8 milionu nukleotidů. A1 :: DQ2 není nejdelší haplotyp, ale nejdelší, HLA A3-Cw7-B7-DR15-DQ6 (A3 :: DQ6), již prošel významnou rekombinací a je téměř stejně frekvenční jako verze nesoucí HLA A2-Cw7 :: DQ6. U kavkazských Američanů sahá 57% haplotypů s hlavní složkou Cw7-B8 z lokusu HLA-A1 do lokusu DQ2. To je ve srovnání s 25% Cw7-B7, které sahají až k A3 :: DQ6 [4] Z 25 potenciálních genetických rekombinantů A1 :: DQ2 žádný nepřesahuje 10% frekvence Cw * 0702-B * 0801. Dva rekombinanti A24-Cw7 ~ DQ2, A1 :: B8-DR1-DQ5 jsou pozoruhodné. Haplotyp A1 :: DQ2 je tedy dlouhý a vykazuje větší nedostatek rekombinace (tzv. Vazebná nerovnováha).

Vývoj

Vývoj A1 :: DQ2 se zdá být klíčem k jeho struktuře. Haplotyp, se 4,7 miliony nukleotidů, existuje v populaci s jinými haplotypy, které v kombinaci překračují frekvenci A1 :: DQ2. Genetika rekombinace u lidí naznačuje, že běžné haplotypy této délky, že složka Cw7-B8 by měla být v jiných haplotypech, Ax-Cw7 :: DQ2, A1-B8-DRx-DQx nebo A1-B8-DR3-DQx (kde Ax je ne A1, DRx není DR3 nebo DQx není DQ2). U haplotypu této délky je proces rychlý, 50% ztráta úplného haplotypu do 500 let. Přesto se haplotyp vyskytuje u lidí, kteří se usadili mimo Evropu před stovkami let, do značné míry neporušený.

Odolnost proti rekombinaci

A1 :: DQ2 se nachází na Islandu, Pomory severního Ruska, Srbové severoslovanského původu, baskičtí a oblasti Mexika, kde se baskičtí usazovali ve větším počtu. Haplotypy velké hojnosti v nejizolovanější zeměpisné oblasti západní Evropy, Irska, ve Skandinávii a Švýcarsku naznačují, že nízká hojnost ve Francii a latinizované Iberii je výsledkem vysídlení, ke kterému došlo po Neolitický počátek. To znamená zakládající přítomnost v Evropě, která přesahuje 8 000 let. Analýza SNP haplotypu naznačuje potenciální zakládající účinek 20 000 let v Evropě, i když nyní jsou zjevné konflikty při interpretaci těchto informací. Posledním možným bodem zúžení nutícího klima byl Mladší Dryas před 11 500 kalendářními lety, a tak haplotyp přijal různé podoby jména, evropský rodový haplotyp, v poslední době nazývaný rodový haplotyp A1-B8 (AH8.1). Je to jeden ze 4, které se zdají společné západoevropanům a dalším Asijcům. Za předpokladu, že frekvence haplotypů byla u Younger Dryas 50% a každých 500 let poklesla o 50%, by haplotypy měly být u jakékoli evropské populace přítomny pouze pod 0,1%. Proto překračuje očekávanou frekvenci pro zakládající haplotyp téměř stokrát.

Dieta v evoluci

Kromě častých interpretací této povahy je známo jen málo toho, proč haplotyp neprošel ekvilibrací. Zdá se, že haplotyp je rezistentní vůči rekombinaci, zdá se, že byl také pod pozitivní selekcí ve srovnání s jinými haplotypy v Evropě, ačkoli v současné době případy onemocnění naznačují, že působí negativní selekce na bázi obilovin. Jedno možné vysvětlení pochází ze studia pozůstatků před neolitu. Vzhledem k tomu, že jídlo si nyní vybírá haplotyp, možná jídlo také v minulosti pozitivně vybralo haplotyp. Během počátečního období evropského osídlení to, co zbylo z pobřežních osad, naznačuje vysoký příjem kalorií v potravě na moři, zejména měkkýšů. Složka mořského uhlíku v západoevropské stravě poklesla z mezolitu do současnosti, avšak haplotyp nepodstoupil rovnováhu, a proto samotná strava nedokáže vysvětlit jeho odolnost vůči rekombinaci.

Formace

Z výše zmíněných haplotypů, A24-Cw * 0702 :: DQ2 nebo A1 :: B8-DR1-DQ5, žádný se nezdá být předkem A1 :: DQ2. Al :: DQ2 se objevuje v Indii, nicméně jeho hlavní geny antigenu povrchně připomínají evropský A1-B8 a zdá se, že je to homoplastický rekombinan od běžného předka DR3-DQ2, asi před 70 000 lety.[5] Složky haplotypu se vyskytují v Evropě (baskičtina má dva hlavní haplotypy DR3-DQ2) a A1-B8 indického původu má velmi nízkou frekvenci. V Maroku B8 :: DQ2, na Západní Sahaře haplotyp A1-B8, pokud je nalezen, a také DQ2.5 se nachází ve vysoké frekvenci, ale ne jako jediný haplotyp. V Keni dvě mírně varianty alel HLA-A a B pro haplotyp A1-B8. Jednou z možností je, že národy ze střední Asie nebo na Středním východě migrovaly do Iberie, když před neolitem přešli do Iberie z jihu lidé z Afriky, došlo k rekombinaci, která vedla k haplotypu, a nositelé se příznivě rozšířili do Evropy před holocénem. Další možností je, že pokud byl vytvořen v západní Africe, ale protože byl méně selektivní v africkém holocenu ve srovnání s evropským holocenním podnebím / kulturou, haplotyp prošel rovnováhou v severní Africe. Jedna hypotéza podporovaná frekvencemi v Iberii a severní Africe naznačuje, že A1 :: DQ2 vytvořený z A1 :: B8-DR7-DQ2 se zdrojem ložiska DR3. Jedním z možných zdrojů je HLA Cw*1701 : B*4201 : DRB1*0302 (Nejběžnějším haplotypem u afroameričanů je rozšířený haplotyp.) Je to však možné, vyžadovalo by to zavedení upravené alely * 0505. Kromě toho je indicko-evropská větev DQ2.5 mnohem starší, takže se zdá, že k vytvoření haplotypu byly zapotřebí alespoň 2 hlavní rekombinantní kroky a po jeho vzniku se vývoj výrazně zpomalil.

Varianty

V Indii existuje varianta A1 ← → B8.[5] Tato varianta nese různé Cw * 07 (Cw * 0702 je velmi stará alela, která se liší od Cw * 0701 z A1 :: DQ2). Nese C4A jinou alelu DRB3, stejně jako množství dalších rozdílů. Tato varianta se pravděpodobně vyvinula z A24 nebo A26-Cw * 0702-B * 0801-DR3-DQ2, které nezávisle dorazily a vyvinuly se v Indii.

Součásti

Velké haplotypy lze považovat za kroky mezi sousedními lokusy. Například A1-Cw * 0701, Cw * 0701-B8, B8 až DR3 a DR3-DQ2 jsou každý krok. Každý krok je samostatným haplotypem, ale čím jsou dva lokusy blíže, tím déle trvá, než se krok změní. Cw-B i DR-DQ jsou blízko u sebe, A-Cw a B-DR jsou daleko od sebe. Výsledkem je, že komponenty haplotypu se vyvíjejí různým tempem.

A1-Cw7-B8

Rané studie rodin v celé Evropě uznaly to, co již většina asociací HLA ukázala, že existuje zděděná (genetická) vazba mezi A1 a B1, toto bylo rozšířeno na lokus Cw7.[6]

Hlavní článek: Haplotyp HLA A1-B8

A zatímco úroveň propojení A-B obecně nebyla nikde blízko vazbě Cw-B, vazba mezi A1-Cw7-B8 byla přiměřeně silná.

B8-DR3

Oblast mezi a včetně B8 a DR3 nese řadu genů, které nás zajímají při studiu lidských onemocnění. Nejdůležitější z nich je TNF (tumor nekrotizující faktory) se 3 lokusy v regionu. Počínaje B8, bezprostředně následovanou MICA a MICB, které představují řetězce A a B. podobné MHC I. Tyto dvě molekuly funkční třídy I jsou exprimovány na intestinálních interocytech a mohou mít zájem o autoimunitní onemocnění, jsou variabilní, ale mutanti MICA dosud nalezené výsledky zřejmě nekorelují s autoimunitními chorobami GI traktu.

HLA DR3-DQ2

DR3-DQ2 je buď známý, nebo vysoce podezřelý faktor u většiny autoimunitních onemocnění, která souvisí s haplotypem A1 :: DQ2.

Další informace: HLA DR3-DQ2

Důležitost pro medicínu

Při transplantaci orgánů

A1 :: DQ2 byl v popředí vědy o histokompatibilitě, A1 byl první numerický antigen HL-A1 identifikovaný na konci 60. let. HL-A8 druhým rafinovaným B-sérotypem, který měl být odkryt, se stal HLA-B8. Kvůli frekvenci haplotypu jsou homozygoti běžní, přibližně 0,6% v případě populace, což je užitečné pro výrobu buněčných linií, které lze použít k testování sérotypových protilátek. Výsledkem je, že HLA-A1 a B8 produkují některé z nejlepších sérotypových protilátek. To napomohlo správné identifikaci shody transplantátu před érou testování genů PCR.

Vícegénový haplotyp, lidský
B8-DR3
Přezdívky„B8-DR3“; "B8-DR3"
"B * 0801: DRB1 * 0301" "
LociGenAlelaIsoform
centomerní region I. třídyHLA-BB * 0801B8
SLÍDA*0801MICA5.1
MICB*0801MICB24
RCCX HVR,
Třída III		TNFA--
TNFB--
C4ANulaC4AQ0
C4BC4BS
CYP21
DR LociHLA-DRB3*0101DR52
HLA-DRB1*0301DR3
Uzly
PopulaceMaximaFrekvenceMax
Západní Irsko>15.0%
Velikost a umístění
GenyUmístěnívelikost (kb / s)
-66p21.31400
Přidružené nemoci
Haplotyp
(gen)		Nemoc (y)
B8 :: DQ2Autoimunitní hepatitida, Primární biliární cirhóza, Juvenilní diabetes
B8 :: DR3Systémový lupus erythematodes

U celiakie a dermatitis herpetiformis

Před rafinovaným typováním pro HLA-DQ a DR byla identifikována asociace s HLA-A1 a B8 celiakie v roce 1973 a dermatitis herpetiformis v roce 1976.[7][8] Díky haplotypu bylo možné identifikovat genetické riziko i když geny způsobující onemocnění, haplotyp DQ2, byly vzdálené 1,3 milionu nukleotidů.

Další informace: HLA-DQ2 u celiakie a HLA-DQ2.5 v glutenové imunochemii

Kromě vysoce studované souvislosti mezi DQ2.5 a celiakií existují další haplotypy B8 :: DQ2, které zvyšují riziko dermatitis herpetiformis u celiakie.[9] Nelze vyloučit ani zapojení dalších alel genu A1 :: DQ2 do celiakie.[3] Například MICA a MICB jsou nalezené geny mhc třídy 1 exprimované v epitelu střeva.

U diabetes mellitus závislého na inzulínu

v cukrovka 1. typu Zdá se, že roli hrají jak DR3, tak DQ2. DR3-DQ2.5 lze navázat na jiné geny, jako je TNF-305A (TNF2), což může také zvyšovat riziko autoimunitního onemocnění jak u celiakie, tak u diabetu 1. typu. U pacientů se systémovým lupus erythematodes (SLE) HLA DR3-DQ2.5-C4AQ0, která byla silně spojena se SLE (poměr šancí [OR] 2,8, 95% CI 1,7-4,5). Novější článek ukazuje, že gen 3 innositol trifosfátového receptoru 3, který je ~ 1 milion párů bází centromerní od DQ2,5, může být také spojen s diabetem 1. typu. Kromě toho je varianta BAT1 a MICB častější u diabetu 1. typu, když chybí B8, ale je přítomen DR3[10] Tyto studie naznačují, že více faktorů na B8 :: DQ2, které mají jiné haplotypy, také vyvolává náchylnost k cukrovce 1. typu. S diabetem 1. typu je spojeno riziko virus coxsackie 4B existuje potenciál pro zapojení lokusů třídy I, zejména těch, které jsou vyjádřeny v GI traktu.

U myasthenia gravis

V roce 1975 byla asociace s „HL-A1,8“ (současný název: HLA A1-B8) potvrzena sérologickou typizací buněk z myasteniky.[11] Ve větším vzorku však byla asociace rizik nalezena blíže k „HL-A8“ (Aktuální název: HLA-B8).[12] Toto přidružení později migrovalo do oblasti „B8-DRw3“ (aktuální: B8-DR3).[13] V Evropě existují dva hlavní haplotypy DR3, A1 :: DQ2 a A30-B18-DR3-DQ2. Spojení s onemocněním lze pevněji připsat části B8 :: DQ2 A1 :: DQ2 ve srovnání s A30-B18 :: DQ2, což naznačuje určité zapojení dalších alel genu B8-DR3 do onemocnění.[14] Asociace regionu B8 :: DQ2 je primárně vidět u žen s relativním věkem hyperplazie brzlíku. Později bylo zjištěno, že hladina protilátek proti acetylcholinovému receptoru u nemoci koreluje s B8 :: DR3.[15] Později bylo zjištěno, že jak DQ2.5, tak DQ2.2 (DQ haplotyp DR7-DQ2) byly pozitivně spojeny s onemocněním.[16] Zůstává polemika o tom, zda DR3 nebo DQ2 propůjčují primární náchylnost k myasthenia gravis. V některých studiích nebyla pozorována žádná souvislost s žádným z nich. Segregovat skupiny chorob se pokusily dále definovat populaci k nejranějšímu nástupu (pravděpodobně nejcitlivější) a ženy. V těchto studiích byla souvislost s B8 větší než DR3, takže se citlivost pohybuje z lokusů třídy II do třídy III nebo třídy I.[3] Spojení s třídou I by bylo neobvyklé, protože produkce autoprotilátek zprostředkovaná T-pomocníkem je charakteristická pro onemocnění, zatímco cytotoxicita zprostředkovaná třídou I není. MICA a MICB jsou exprimovány střevně. Existuje mnoho genů, které leží na obou stranách HLA-B, TNF alfa je nadměrně exprimován. Blíže DR3, C4A je v haplotypu B8-DR3 nulová.

Při autoimunitní hepatitidě

V roce 1972 došlo k propojení mezi „HLA A1,8“ (aktuální: HLA A1-B8) aktivní chronická hepatitida, následně B8 lépe spojeno s autoimunitní hepatitida.[17][18] S objevem DR3 byla vazba rozšířena na DR3 a následně na DQ2-DP4.[19][20] Zatímco HLA A*0101, Cw*0701a DPB1*0402 jsou spojeny s onemocněním, nejsilnější asociace se nachází mezi B8 a DR3-DQ2 nebo subregionem B8 :: DQ2.[21][22][23] Jiné geny v regionu, C4A - null a TNF může souviset s autoimunitní hepatitidou[24][25]

Vzhled anti-nukleární protilátky u autoimunitní hepatitidy bylo zjištěno, že koreluje s A1-B8-DR3.[26] Jedním z problémů s autoimunitní hepatitidou je zvýšené riziko celiakie.[27] Primární biliární cirhóza, která často následuje po chronické aktivní hepatitidě, je spojena s genem „DRw3“, DR3.[28] Celiakie je často zvýšena u autoimunitní hepatitidy a naopak. Nedávné studie naznačují zákeřnější souvislost mezi citlivostí na lepek a autoimunitní hepatitidou. V jedné studii 65% pacientů v konečné fázi autoimunitní hepatitida měl celiakie související s HLA-DQ (DQ2, DQ8), z těchto polovin protilátky proti transglutamináze, ale jen málo z nich mělo endomysiální protilátku.[29] To by mohlo naznačovat spojení s subklinické enteropatie, nebo alternativně výsledek chronické virové infekce, o kterém je známo, že také zvyšuje anti-tranglutaminázovou protilátku. Německá studie zjistila, že riziko bylo více spojeno s B8 než DQ2, tyto protichůdné výsledky naznačují, že v oblasti B8 :: DQ2 existují alespoň dvě asociace rizik.[30]

Při sarkoidóze

Stejně jako tyto další studie spojení mezi „HL-A1,8“ nakonec vede k citlivosti blízké lokusu DR-DQ, zdá se, že sarkoidóza souvisí s HLA-DR3-DQ2.

Další informace: DR3-DQ2 u sarkoidózy

U systémového lupus erythromatosus

Bylo zjištěno, že „fenotyp HL-A1,8“ souvisí s těžkým systémovým lupus erythematodes (SLE) (postižení ledvin a centrálního nervového systému) u pacientů kavkazského původu.[31] Dvoubodová analýza haplotypu mezi TNFB (Alela B * 01) a HLA ukazují, že alela je ve vazebné nerovnováze s HLA-A1, Cw7, B8, C4A (Null), DR3, DQ2.5.[32] Celý haplotyp, A1-Cw7-B8-TNFB * 1-C4A (Null) -DR3-DQ2, je u pacientů zvýšen a nelze rozlišit genetickou náchylnost k SLE.[33] Propojení nelze rozšířit na lokus HLA-DPB1.[34] Mimo Evropu byly lokusy DRB1 * 0301 a DR3-DQ2 spojeny s onemocněním nezávisle na haplotypu A1 :: DQ2.[35] Bylo zjištěno, že DR3 koreluje s anti-Ro / La protilátkami v SLE.[36]

U inkluzních tělísek myositida, polymyositida a dermatomyositida

HLA-DR3 byl u kavkazanů důsledně pozorován při vysokých frekvencích v myositidě s inkluzním tělem.[37] Bylo zjištěno, že DR3 koreluje také s přítomností antiboidy Jo-1.[38]Studie sporadické inkluzní myositidy ukazují na asociaci s haplotypem A1: DQ2.[39]Novější studie naznačují, že riziko spočívá pouze mezi oblastí B8-DR3, což zahrnuje 3 geny třídy I, genovou oblast třídy III a 2 geny třídy II.[40] Výzkum zveřejněný v říjnu 2015 Národním institutem pro environmentální zdravotní vědy porovnával 1710 případů myositidy u dospělých nebo mladistvých s 4724 kontrolními subjekty. Zjistili, že více genů, které tvoří AH8.1, definuje genetické riziko pro všechny typy myositidy.[41]

Viz také

Doporučené čtení

  • Price P, Witt C, Allcock R a kol. (Únor 1999). „Genetický základ pro asociaci 8,1 rodového haplotypu (A1, B8, DR3) s více imunopatologickými chorobami“. Immunol. Rev. 167: 257–74. doi:10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01398.x. PMID  10319267. Archivovány od originál dne 05.01.2013.
  • Horton R, Gibson R, Coggill P a kol. (Leden 2008). „Variační analýza a anotace genů osmi MHC haplotypů: MHC Haplotypový projekt“. Imunogenetika. 60 (1): 1–18. doi:10.1007 / s00251-007-0262-2. PMC  2206249. PMID  18193213.
  • Traherne JA, Horton R, Roberts AN a kol. (Leden 2006). „Genetická analýza zcela sekvenovaných MHC haplotypů souvisejících s onemocněním identifikuje zamíchání segmentů v nedávné lidské historii“. PLOS Genet. 2 (1): e9. doi:10.1371 / journal.pgen.0020009. PMC  1331980. PMID  16440057.

Reference

  1. ^ A b C Horton R, Gibson R, Coggill P a kol. (Leden 2008). „Variační analýza a genová anotace osmi MHC haplotypů: MHC Haplotypový projekt“. Imunogenetika. 60 (1): 1–18. doi:10.1007 / s00251-007-0262-2. PMC  2206249. PMID  18193213.
  2. ^ Rocca P, Codes L, Chevallier M, Trépo C, Zoulim F (listopad 2004). „[Autoimunizace vyvolaná terapií interferonem alfa u chronické hepatitidy C]“. Gastroenterol. Clin. Biol. (francouzsky). 28 (11): 1173–6. doi:10.1016 / S0399-8320 (04) 95201-3. PMID  15657545.
  3. ^ A b C d E Price P, Witt C, Allcock R a kol. (Únor 1999). "Genetický základ pro asociaci 8,1 rodového haplotypu (A1, B8, DR3) s více imunopatologickými chorobami". Immunol. Rev. 167: 257–74. doi:10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01398.x. PMID  10319267.
  4. ^ A b Maiers M, Gragert L, Klitz W (září 2007). „Alely a haplotypy s vysokým rozlišením HLA v populaci Spojených států“. Hučení. Immunol. 68 (9): 779–88. doi:10.1016 / j.humimm.2007.04.005. PMID  17869653.
  5. ^ A b Kaur G, Kumar N, Szilagyi A a kol. (Červenec 2008). „Haplotypy HLA-B8-DR3 spojené s autoimunitou u asijských indiánů jsou jedinečné v počtu kopií genů komplementu C4 a HSP-2 1267A / G“. Hučení. Immunol. 69 (9): 580–7. doi:10.1016 / j.humimm.2008.06.007. PMID  18657583.
  6. ^ Hiller C, Bischoff M, Schmidt A, Bender K (duben 1978). „Analýza HLA-ABC vazebné nerovnováhy: snižující se síla gametické asociace se zvyšující se vzdáleností mapy“. Hučení. Genet. 41 (3): 301–12. doi:10.1007 / BF00284764. PMID  649158.
  7. ^ Ludwig H, Polymenidis Z, Granditsch G, Wick G (listopad 1973). „[Sdružení HL-A1 a HL-A8 s dětskou celiakií]“. Z Immunitatsforsch Exp Klin Immunol (v němčině). 146 (2): 158–67. PMID  4282973.
  8. ^ Reunala T, Salo OP, Tiilikainen A, Mattila MJ (únor 1976). „Histocompatibility antigens and dermatitis herpetiformis with special reference to jejunal abnormalities and acetylator fenotype“. Br. J. Dermatol. 94 (2): 139–43. doi:10.1111 / j.1365-2133.1976.tb04362.x. PMID  1252348.
  9. ^ Ahmed AR, Yunis JJ, Marcus-Bagley D a kol. (Prosinec 1993). „Hlavní geny citlivosti na histokompatibilní komplex pro dermatitis herpetiformis ve srovnání s geny pro enteropatii citlivou na lepek“. J. Exp. Med. 178 (6): 2067–75. doi:10.1084 / jem.178.6.2067. PMC  2191293. PMID  8245782.
  10. ^ Cheong KY, Allcock RJ, Eerligh P a kol. (Prosinec 2001). "Lokalizace centrálních MHC genů ovlivňujících diabetes typu I". Hučení. Immunol. 62 (12): 1363–70. doi:10.1016 / S0198-8859 (01) 00351-2. PMID  11756005.
  11. ^ Hammarström L, Smith E, Möller E, Franksson C, Matell G, Von Reis G (srpen 1975). „Myasthenia gravis: studie antigenu HL-A a subpopulací lymfocytů u pacientů s myasthenia gravis“. Clin. Exp. Immunol. 21 (2): 202–15. PMC  1538268. PMID  1081023.
  12. ^ Pirskanen R (leden 1976). „Genetické asociace mezi myasthenia gravis a systémem HL-A“. J. Neurol. Neurosurg. Psychiatrie. 39 (1): 23–33. doi:10.1136 / jnnp.39.1.23. PMC  492209. PMID  1255208.
  13. ^ Keesey J, Naeim F, Lindstrom J, Zeller E, Herrmann C, Walford R (1978). „Korelace mezi titrem protilátek proti acetylcholinovému receptoru a antigeny HLA-B8 a HLA-DRw3 v myasthenia gravis“. Trans Am Neurol Doc. 103: 188–90. PMID  757055.
  14. ^ Vieira ML, Caillat-Zucman S, Gajdos P, Cohen-Kaminsky S, Casteur A, Bach JF (září 1993). "Identifikace genomovou typizací genů jiné než DR3 HLA třídy II spojených s myasthenia gravis". J. Neuroimmunol. 47 (2): 115–22. doi:10.1016 / 0165-5728 (93) 90021-P. PMID  8370765.
  15. ^ Naeim F, Keesey JC, Herrmann C, Lindstrom J, Zeller E, Walford RL (listopad 1978). „Sdružení protilátek proti HLA-B8, DRw3 a anti-acetylcholinovému receptoru u myasthenia gravis“. Tkáňové antigeny. 12 (5): 381–6. doi:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01347.x. PMID  85353.
  16. ^ Hjelmström P, Giscombe R, Lefvert AK a kol. (1995). „Různé HLA-DQ jsou pozitivně a negativně spojeny se švédskými pacienty s myasthenia gravis.“ Autoimunita. 22 (1): 59–65. doi:10.3109/08916939508995300. PMID  8882423.
  17. ^ Mackay IR, Morris PJ (říjen 1972). „Sdružení autoimunitní chronické aktivní hepatitidy s HL-A1,8“. Lanceta. 2 (7781): 793–5. doi:10.1016 / S0140-6736 (72) 92149-6. PMID  4116233.
  18. ^ Freudenberg J, Baumann H, Arnold W, Berger J, Büschenfelde KH (1977). "HLA v různých formách chronické aktivní hepatitidy. Srovnání mezi dospělými pacienty a dětmi". Trávení. 15 (4): 260–70. doi:10.1159/000198011. PMID  863130.
  19. ^ Donaldson PT, Doherty DG, Hayllar KM, McFarlane IG, Johnson PJ, Williams R (duben 1991). „Citlivost na autoimunitní chronickou aktivní hepatitidu: lidské leukocytové antigeny DR4 a A1-B8-DR3 jsou nezávislé rizikové faktory“. Hepatologie. 13 (4): 701–6. doi:10.1002 / hep. 1840130415. PMID  2010165.
  20. ^ Manabe K, Donaldson PT, Underhill JA a kol. (Prosinec 1993). "Lidský leukocytový antigen A1-B8-DR3-DQ2-DPB1 * 0401 rozšířil haplotyp u autoimunitní hepatitidy". Hepatologie. 18 (6): 1334–7. doi:10.1002 / hep. 1840180608. PMID  8244257.
  21. ^ Strettell MD, Thomson LJ, Donaldson PT, Bunce M, O'Neill CM, Williams R (říjen 1997). "HLA-C geny a náchylnost k autoimunitní hepatitidě typu 1". Hepatologie. 26 (4): 1023–6. doi:10.1002 / hep.510260434. PMID  9328330.
  22. ^ Underhill JA, Donaldson PT, Doherty DG, Manabe K, Williams R (duben 1995). „HLA DPB polymorfismus u primární sklerotizující cholangitidy a primární biliární cirhózy“. Hepatologie. 21 (4): 959–62. doi:10.1002 / hep.1840210411. PMID  7705806.
  23. ^ Muratori P, Czaja AJ, Muratori L a kol. (Březen 2005). „Genetické rozdíly mezi autoimunitní hepatitidou v Itálii a Severní Americe“. Svět J. Gastroenterol. 11 (12): 1862–6. doi:10,3748 / wjg.v11.i12.1862. PMC  4305892. PMID  15793882. Archivovány od originál dne 29. 9. 2011.
  24. ^ Scully LJ, Toze C, Sengar DP, Goldstein R (květen 1993). „Autoimunitní hepatitida s časným nástupem je spojena s delecí genu C4A“. Gastroenterologie. 104 (5): 1478–84. doi:10.1016 / 0016-5085 (93) 90359-K. PMID  8482459.
  25. ^ Cookson S, Constantini PK, Clare M a kol. (Říjen 1999). "Frekvence a povaha polymorfismů genu pro cytokiny u autoimunitní hepatitidy typu 1". Hepatologie. 30 (4): 851–6. doi:10,1002 / hep. 510300412. PMID  10498633.
  26. ^ Czaja AJ, Carpenter HA, Santrach PJ, Moore SB (leden 1995). "Imunologické rysy a asociace HLA u chronické virové hepatitidy". Gastroenterologie. 108 (1): 157–64. doi:10.1016/0016-5085(95)90020-9. PMID  7806037.
  27. ^ Volta U, De Franceschi L, Molinaro N, et al. (Říjen 1998). "Frekvence a význam anti-gliadinových a anti-endomysiálních protilátek u autoimunitní hepatitidy" (PDF). Kopat. Dis. Sci. 43 (10): 2190–5. doi:10.1023 / A: 1026650118759. PMID  9790453.
  28. ^ Ercilla G, Parés A, Arriaga F a kol. (Listopad 1979). "Primární biliární cirhóza spojená s HLA-DRw3". Tkáňové antigeny. 14 (5): 449–52. doi:10.1111 / j.1399-0039.1979.tb00874.x. PMID  12731577.
  29. ^ Rubio-Tapia A, Abdulkarim AS, Wiesner RH, Moore SB, Krause PK, Murray JA (duben 2008). „Autoprotilátky proti celiakii u těžkých autoimunitních onemocnění jater a účinek transplantace jater“. Liver Int. 28 (4): 467–76. doi:10.1111 / j.1478-3231.2008.01681.x. PMC  2556252. PMID  18339073.
  30. ^ Teufel A, Wörns M, Weinmann A a kol. (Září 2006). "Genetická asociace autoimunitní hepatitidy a lidského antigenu leukocytů u německých pacientů". Svět J. Gastroenterol. 12 (34): 5513–6. doi:10,3748 / wjg.v12.i34.5513. PMC  4088235. PMID  17006990. Archivovány od originál dne 29. 9. 2011.
  31. ^ Goldberg MA, Arnett FC, Bias WB, Shulman LE (1976). "Histokompatibilní antigeny v systémovém lupus erythematodes". Artritida Rheum. 19 (2): 129–32. doi:10.1002 / art.1780190201. PMID  1259797.
  32. ^ Parks CG, Pandey JP, Dooley MA a kol. (Červen 2004). „Genetické polymorfismy v tumor nekrotizujícím faktoru (TNF) -alfa a TNF-beta v populační studii systémového lupus erythematodes: asociace a interakce s polymorfismem interleukin-1alfa-889 C / T“. Hučení. Immunol. 65 (6): 622–31. doi:10.1016 / j.humimm.2004.03.001. PMID  15219382.
  33. ^ Bettinotti MP, Hartung K, Deicher H a kol. (1993). „Polymorfismus genu faktoru nekrotizujícího nádory beta u systémového lupus erythematodes: haplotypy TNFB-MHC“. Imunogenetika. 37 (6): 449–54. doi:10.1007 / BF00222469. PMID  8436420.
  34. ^ Bishof NA, Welch TR, Beischel LS, Carson D, Donnelly PA (červen 1993). „DP polymorfismus v HLA-A1, -B8, -DR3 rozšířených haplotypech spojených s membranoproliferativní glomerulonefritidou a systémovým lupus erythematodes“. Pediatr. Nephrol. 7 (3): 243–6. doi:10.1007 / BF00853205. PMID  8100139.
  35. ^ Castaño-Rodríguez N, Diaz-Gallo LM, Pineda-Tamayo R, Rojas-Villarraga A, Anaya JM (únor 2008). „Metaanalýza polymorfismů HLA-DRB1 a HLA-DQB1 u latinskoamerických pacientů se systémovým lupus erythematodes“. Autoimmun Rev. 7 (4): 322–30. doi:10.1016 / j.autrev.2007.12.002. PMID  18295738.
  36. ^ Christian N, Smikle MF, DeCeulaer K, Daniels L, Walravens MJ, Barton EN (březen 2007). „Antinukleární protilátky a alely HLA třídy II u jamajských pacientů se systémovým lupus erythematodes“. West Indian Med J. 56 (2): 130–3. doi:10.1590 / S0043-31442007000200005. PMID  17910142.
  37. ^ Hirsch TJ, Enlow RW, Bias WB, Arnett FC (říjen 1981). "Antigeny související s HLA-D (DR) v různých druzích myositidy". Hučení. Immunol. 3 (2): 181–6. doi:10.1016/0198-8859(81)90055-0. PMID  6948801.
  38. ^ Arnett FC, Hirsch TJ, Bias WB, Nishikai M, Reichlin M (1981). „Systém protilátek Jo-1 v myositidě: vztahy ke klinickým rysům a HLA“. J. Rheumatol. 8 (6): 925–30. PMID  6977032.
  39. ^ Price P, Santoso L, Mastaglia F a kol. (Listopad 2004). „Dva hlavní haplotypy histokompatibilního komplexu ovlivňují náchylnost k sporadické myositidě inkluzního tělíska: kritické hodnocení asociace s HLA-DR3.“ Tkáňové antigeny. 64 (5): 575–80. doi:10.1111 / j.1399-0039.2004.00310.x. PMID  15496200.
  40. ^ O'Hanlon TP, Carrick DM, Arnett FC a kol. (Listopad 2005). „Imunogenetické riziko a ochranné faktory pro idiopatické zánětlivé myopatie: odlišné alelické profily a motivy HLA-A, -B, -Cw, -DRB1 a -DQA1 definují klinickopatologické skupiny u kavkazanů.“ Medicína (Baltimore). 84 (6): 338–49. doi:10.1097 / 01.md.0000189818.63141.8c. PMID  16267409.
  41. ^ Miller FW, Chen W, O'Hanlon TP, Cooper RG, Vencovsky J, Rider LG, Danko K, Wedderburn LR, Lundberg IE, Pachman LM, Reed AM, Ytterberg SR, Padyukov L, Selva-O'Callaghan A, Radstake TR , Isenberg DA, Chinoy H, Ollier WE, Scheet P, Peng B, Lee A, Byun J, Lamb JA, Gregersen PK, Amos CI (2015). „Celá asociační studie genomu identifikuje alely předků haplotypu HLA 8.1 jako hlavní genetické rizikové faktory pro fenotypy myositidy“. Geny a imunita. 16 (7): 470–80. doi:10.1038 / gen. 2015.28. PMC  4840953. PMID  26291516.