HLA-Cw7 - HLA-Cw7

HLA-Cw7
(MHC třída I., C antigen na povrchu buňky)
O
Proteintransmembránový receptor /ligand
Strukturaαβ heterodimer
PodjednotkyHLA-Cw *07--, β2-mikroglobulin
Starší jména-
Podtypy
Podtyp
alela
Dostupné struktury
Cw7*0701
-*0702
{{{{cNick3}}}* 07 {{{{cAllele3}}}
{{{cNick4}}}* 07 {{{{cAllele4}}}
Alleles link-out to IMGT / HLA databáze na EBI

HLA-Cw7 (Cw7) je a lidský leukocytový antigen sérotyp v rámci HLA-C sérotypová skupina. (Více obecných informací o sérotypech HLA najdete v článku: Historie a pojmenování lidských leukocytových antigenů.) Cw7 se stanoví rozpoznáváním protilátek a7 podmnožina HLA-Cw α-řetězců. U sérotypu Cw7 je alfa řetězec kódován HLA-Cw*07 alelová skupina a β-řetězec jsou kódovány B2M místo.[1] Cw7 a Cw*07 jsou významově téměř synonymní. Cw7 je častější v západní Africe v Irsku. Cw7 v Evropě je součástí AH8.1 a HLA B7-DR15-DQ6 haplotypy. Oblast třídy I tohoto supertypu je Haplotyp HLA A1-B8, HLA A3-B7, HLA-A2-B7 a HLA A24-B7.

Sérotyp

Rozpoznávání Cw7 některých produktů genu HLA Cw * 07[2]
Cw * 07Cw7Vzorek
alela%velikost (N)
*070174304
*070268976


Rozdělení

HLA Cw * 0701 frekvence
Populace studieFrekvence
 (v %)[3]
Kamerun Pygmy Baka25.0
Irsko na jih21.2
Německý Essen20.9
Kamerun Sawa19.2
Severní Irsko18.7
Francie západ18.1
Keňa17.8
Burkina Faso Fulani17.4
Austrálie Nový Jižní Wales17.3
Francie jihovýchod17.3
Maroko „Berber“ Nador Me…16.7
súdánský16.5
Bělochové ze Spojeného království16.1
Uganda Kampala16.0
Brazílie15.6
USA bělošský (2)15.5
Keňa Nandi15.2
Pákistán Baloch15.2
Burkina Faso Rimaibe14.9
Finsko14.4
Česká republika14.2
Švýcarská Ženeva13.6
Jihoafrická republika Natal Tamil13.5
Kamerun Bamileke13.0
Indie Khandesh Pawra13.0
Kamerun Beti12.9
Tunisko12.6
Indie Nové Dillí12.5
Saúdská Arábie Guraiat a ...12.3
krocan12.3
Zambie Lusaka12.2
Keňa Luo11.7
Burkina Faso Mossi11.3
Jižní Korea (1)11.1
Španělsko Východní Andalusie11.0
USA hispánský10.9
Libanon10.8
Indie Tamil Nadu Nadar10.7
Zimbabwe Harare Shona10.6
Rusko Arkhangelsk Pomors10.0
Gruzie Tibilisi Gruzínština…9.8
Mexiko Zaptotec Oaxaca9.7
Israel Arab Druse9.0
Senegal Niokholo Mandenka8.7
USA North American Native…8.6
Pákistán Sindhi8.3
Indie Severní Dillí8.0
Írán Baloch7.8
Thajsko7.7
Singapur Riau malajština7.5
Indie Západní pobřeží Parsis7.0
Georgia Tibilisi Kurds6.9
Pákistán Kalash6.5
Mali Bandiagara6.2
Pákistán Burusho5.6
Pákistán Karáčí Parsi5.5
Pákistán Pathan5.5
Rusko Murmansk Saomi4.0
Singapur jávský Indone…4.0
Indie Bombaj Marathas3.7
Austrálie Indig. Cape Yor…3.4
Pákistán Brahui3.4
Indie West Bhils3.0
Čína Severní Han2.9
Jordan Amman2.8
Čína Vnitřní Mongolsko2.5
Itálie Severní Pavia2.5
Rusko Nenets2.4
Čína Qinghai Hui2.3
Austrálie Indig. Groote E…2.1
Rusko Tuva (2)2.0
USA Havaj Okinawa1.9
USA asijské1.8
Čína Jižní Han1.6
Čína Peking1.5
Papua Nová Guinea Wanigela1.4
Frekvence alel pouze předloženo
HLA Cw * 0702 frekvence
Populace studieFrekvence
 (v %)[3]
Venezuela Sierra de Perij…71.4
PNG New Britain Rabaul57.1
Mexiko Mixtec Oaxaca33.3
Čína Yunnan Lisu32.9
Tchaj-wan Taroko31.8
Čína Yunnan Nu30.7
Hora Venezuela Perja…30.3
PNG Madang30.2
Mexiko Zaptotec Oaxaca28.4
Tchaj-wan Tsou27.5
Mexico Mixe Oaxaca26.4
Rusko Arkhangelsk Pomors26.0
Ch. Guangdong Meizhou H…25.8
Pákistán Burusho25.5
USA Jižní Dakota Lakota S…24.4
Rusko Nenets23.8
USA Nové Mexiko Canoncito…23.2
Čína Jižní Han20.8
Brazílie Terena20.2
Čína Guangzhou19.9
USA asijské19.5
Severní Irsko18.6
Švýcarská Ženeva18.2
Taiwan Bunun17.8
Irsko na jih17.4
Singapur jávský Indone…17.0
Filipíny Ivatan16.0
Tchaj-wan Rukai16.0
Austrálie Nový Jižní Wales15.8
Finsko15.6
USA Jižní Texas Hispánci15.6
Pákistán Sindhi15.5
Bělochové ze Spojeného království15.5
Saúdská Arábie Guraiat a ...15.2
Kamerun Pygmy Baka15.0
Indie Tamil Nadu Nadar14.8
Japan Central14.6
Rusko Murmansk Saomi14.0
USA Havaj Okinawa13.8
Čína Peking13.6
Čína tibetská13.3
Čína Qinghai Hui13.2
Thajsko13.0
USA North American Native…12.8
Čína Vnitřní Mongolsko12.7
Japonsko (3)12.7
Pákistán Brahui12.5
PNG Wanigela12.5
USA kavkazský pop212.5
USA hispánský12.4
Česká republika12.3
Čína Severní Han11.9
Tchaj-wan Paiwan11.8
Čína Wuhan11.6
Kamerun Sawa11.5
Tchaj-wan Siraya10.8
Tchaj-wan Ami10.7
Nová Kaledonie10.0
Indie Severní Dillí9.9
Austrálie Indig. Cape Yor…9.6
Pákistán Pathan9.5
Francie západ9.4
Írán Baloch9.4
Jihoafrická republika Natal Tamil9.4
Německý Essen9.1
Tchaj-wan Puyuma9.0
Indie Nové Dillí8.9
Pákistán Kalash8.7
Indie Bombaj Marathas8.6
Rusko Tuva pop 28.6
Jižní Korea (3)8.3
Americká Samoa8.0
Brazílie8.0
USA Afroameričan8.0
Francie jihovýchod7.2
Kamerun Bamileke7.1
Indie West Bhils7.0
Austrálie Indig. Yuendumu6.8
Kamerun Beti6.6
Gruzie Tibilisi Gruzínština…6.5
Uganda Kampala6.1
krocan6.0
Španělsko Východní Andalusie5.5
PNG Wosera5.4
Mali Bandiagara4.7
Zimbabwe Harare Shona4.6
Stát Chihuahua v Mexiku…4.5
Pákistán Baloch4.5
Keňa4.4
Zambie Lusaka4.4
Libanon4.1
Israel Arab Druse4.0
Keňa Luo3.8
Tunisko3.6
PNG Eastern Highlands Gor…3.5
súdánský3.5
Georgia Tibilisi Kurds3.4
Maroko „Berber“ Nador Me…3.2
Anglie Londýn Ashkenazi…2.9
Frekvence alel pouze předloženo

Reference

  1. ^ Arce-Gomez B, Jones EA, Barnstable CJ, Solomon E, Bodmer WF (únor 1978). „Genetická kontrola antigenů HLA-A a B v hybridech somatických buněk: požadavek na beta2 mikroglobulin“. Tkáňové antigeny. 11 (2): 96–112. doi:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID  77067.
  2. ^ Allele Dotazový formulář IMGT / HLA - Evropský bioinformatický institut
  3. ^ A b Middleton, D .; Menchaca, L .; Rood, H .; Komerofsky, R. (2003). Msgstr "Nová databáze frekvencí alel: http://www.allelefrequencies.net". Tkáňové antigeny. 61 (5): 403–407. doi:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.