Inhibitor disociace guanosin nukleotidů - Guanosine nucleotide dissociation inhibitor - Wikipedia
| Inhibitor disociace GDP | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura dvojnásobně prenylovaného komplexu ypt1: gdi | |||||||||||
| Identifikátory | |||||||||||
| Symbol | GDI | ||||||||||
| Pfam | PF00996 | ||||||||||
| Pfam klan | CL0063 | ||||||||||
| InterPro | IPR018203 | ||||||||||
| SCOP2 | 1 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
V molekulární biologii se Inhibitory disociace guanosinu (GDIs) tvoří a rodina malých GTPasy které plní regulační roli v vezikulární membránový provoz. GDI se váží na formu vázanou na HDP Rho a Rab malé GTPasy a nejen zabránit výměně (udržování malé GTPázy ve vypnutém stavu), ale také zabránit lokalizaci malé GTPázy na membráně, což je místo jejich působení. Tuto inhibici lze odstranit působením faktoru posunutí GDI.[1] GDI také inhibují cdc42 vazbou na ocas a zabráněním jeho vložení do membrán; proto to nemůže spustit WASP a nemůže vést k nukleaci F-aktin.
GDI C-terminál geranylgeranylation je rozhodující pro jejich membránovou asociaci a funkci.[2][3] Tento posttranslační modifikace je katalyzován Rab geranylgeranyl transferázou (Rab-GGTase), více podjednotkou enzym který obsahuje a katalytické heterodimer a součást příslušenství, nazývaná Doprovodný protein Rab (REP) -1.[2] REP-1 představuje nově syntetizovaný Rab bílkoviny do katalytické komponenta a tvoří stabilní komplex s prenylovaný bílkoviny po přenosové reakci. Mechanismus zprostředkovaný REP-1 membrána Asociace Rab5 je podobná asociaci zprostředkované Rab GDP disociačním inhibitorem (GDI). REP-1 a Rab GDI sdílejí také další funkční vlastnosti, včetně schopnosti inhibovat uvolňování GDP a odstraňovat proteiny Rab z membrán.
The Krystalická struktura z hovězí alfa-izoforma Rab GDI bylo stanoveno na rozlišení 1,81 Angstrom.[4] Protein se skládá ze dvou hlavních strukturální jednotky: velký složitý vícelist doména Já a menší alfa-šroubovice doména II.
Se strukturální organizací domény I úzce souvisí FAD - obsahující monooxygenázy a oxidázy.[4] Zachované oblasti společné pro GDI a choroideremii gen produkt, který dodává Rab do katalytické podjednotky Rab geranylgeranyltransferáza II, jsou seskupeny na jedné straně domény.[3] Dva nejvíce konzervovaný regiony tvoří kompaktní struktura na vrcholu molekuly; místně zaměřená mutageneze prokázal, že tyto oblasti hrají rozhodující roli ve vazbě proteinů Rab.[4]
Reference
- ^ Dirac-Svejstrup AB, Sumizawa T, Pfeffer SR (únor 1997). "Identifikace faktoru vytěsnění GDI, který uvolňuje endosomální Rab GTPasy z Rab-GDI". Časopis EMBO. 16 (3): 465–72. doi:10.1093 / emboj / 16.3.465. PMC 1169650. PMID 9034329.
- ^ A b Alexandrov K, Horiuchi H, Steele-Mortimer O, Seabra MC, Zerial M (listopad 1994). „Rab escort protein-1 je multifunkční protein, který doprovází nově prenylované proteiny rab na jejich cílové membrány“. EMBO J.. 13 (22): 5262–73. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06860.x. PMC 395482. PMID 7957092.
- ^ A b Nishimura N, Goji J, Nakamura H, Orita S, Takai Y, Sano K (listopad 1995). "Klonování mozkové izoformy lidského Rab GDI a jeho exprese v buněčných liniích lidského neuroblastomu a ve vzorcích nádorů". Cancer Res. 55 (22): 5445–50. PMID 7585614.
- ^ A b C Schalk I, Zeng K, Wu SK, Stura EA, Matteson J, Huang M, Tandon A, Wilson IA, Balch WE (květen 1996). "Struktura a mutační analýza Rab-GDP disociačního inhibitoru". Příroda. 381 (6577): 42–8. Bibcode:1996 Natur.381 ... 42S. doi:10.1038 / 381042a0. PMID 8609986. S2CID 4249512.
externí odkazy
- Guanin + Nukleotid + Disociace + Inhibitory v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)