GPX3 - GPX3

GPX3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2R37
Identifikátory
Aliasy	GPX3, GPx-P, GSHPx-3, GSHPx-P, glutathionperoxidáza 3
Externí ID	OMIM: 138321 MGI: 105102 HomoloGene: 20480 Genové karty: GPX3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	151,028,992 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	54,910,377 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita oxidoreduktázy; • aktivita glutathionperoxidázy; • vazba selenu; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita peroxidázy;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární exosom; • extracelulární;
Biologický proces	• oxidačně-redukční proces; • homotetramerizace bílkovin; • reakce na oxidační stres; • reakce na hydroperoxid lipidů; • katabolický proces peroxidu vodíku; • detoxikace buněčných oxidantů; • buněčná odpověď na oxidační stres;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2878
	14778
	ENSG00000211445
	ENSMUSG00000018339
	P22352
	P46412
	NM_002084; NM_001329790
	NM_001083929; NM_008161; NM_001329860
	NP_001316719; NP_002075
	NP_001316789; NP_032187
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Glutathionperoxidáza 3 (GPx-3), také známý jako plazmatická glutathionperoxidáza (GPx-P) nebo extracelulární glutathionperoxidáza je enzym že u lidí je kódován GPX3 gen.^[5]^[6]^[7]

GPx-3 patří do glutathionperoxidáza rodina, která funguje při detoxikaci peroxidu vodíku. Obsahuje a selenocystein (Sec) rezidua na svém aktivním místě. Selenocystein je kódován kodonem UGA, který normálně signalizuje ukončení translace. 3 'UTR genů obsahujících Sec má společnou strukturu kmenové smyčky, sekvenci vkládání sek (SECIS), která je nezbytná pro rozpoznání UGA spíše jako Sec kodon než jako stop signál.^[5]

Thiolová specificita

GPx-3 má širokou thiolovou specificitu. Zdroje snižující energii pro GPx-3 in vitro zahrnují GSH, cystein, merkaptoethanol a dithiothreitol.^[8] Existují důkazy o účinnosti homocysteinu při snižování GPx-3: GSH lze zcela nahradit sníženým homocysteinem in vitro.^[9]^[10]

Změny během ontogeneze

V krevní plazmě potkanů je aktivita GPx-3 během prvních dvou týdnů po narození nízká a rychle se zvyšuje během přechodu z mléčné výživy na pevnou stravu. Stárnutí je doprovázeno poklesem aktivity GPx-3: v krevní plazmě potkanů k němu dochází přibližně ve věku 23-26 měsíců.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000211445 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018339 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: glutathionperoxidáza 3 (plazma)“.
^ Takahashi K, Avissar N, Whitin J, Cohen H (srpen 1987). „Čištění a charakterizace lidské plazmy glutathionperoxidázy: selenoglykoprotein odlišný od známého buněčného enzymu“. Archivy biochemie a biofyziky. 256 (2): 677–86. doi:10.1016/0003-9861(87)90624-2. PMID 3619451.
^ Chu FF (1994). "Lidské geny pro glutathionperoxidázu GPX2, GPX3 a GPX4 mapují chromozomy 14, 5 a 19, v uvedeném pořadí". Cytogenetika a genetika buněk. 66 (2): 96–8. doi:10.1159/000133675. PMID 8287691.
^ Takebe G, Yarimizu J, Saito Y, Hayashi T, Nakamura H, Yodoi J a kol. (Říjen 2002). „Srovnávací studie o hydroperoxidové a thiolové specificitě rodiny glutathionperoxidázy a selenoproteinu P“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 41254–8. doi:10,1074 / jbc.M202773200. PMID 12185074.
^ Razygraev AV, Taborskaya KI, Petrosyan MA, Tumasova Z (květen 2016). "[Činnosti thiolperoxidázy v krevní plazmě potkanů stanovené pomocí peroxidu vodíku a 5,5'-dithio-bis (2-nitrobenzoové kyseliny)]" ". Biomeditsinskaia Khimiia. 62 (4): 431–8. doi:10.18097 / PBMC20166204431. PMID 27562997.
^ ^A ^b Razygraev AV, Petrosyan MA, Tumasova ZN, Taborskaya KI, Polyanskikh LS, Baziian EV, Balashova NN (2019). "Změny v aktivitě glutathionperoxidázy v krevní plazmě a séru potkanů během postnatálního vývoje a stárnutí". Pokroky v gerontologii. 9 (3): 283–288. doi:10.1134 / s2079057019030147. S2CID 202570586.

Další čtení

Guey LT, García-Closas M, Murta-Nascimento C, Lloreta J, Palencia L, Kogevinas M a kol. (Únor 2010). „Genetická náchylnost k odlišným subfenotypům rakoviny močového měchýře“. Evropská urologie. 57 (2): 283–92. doi:10.1016 / j.eururo.2009.08.001. PMC 3220186. PMID 19692168.
Lin JC, Kuo WR, Chiang FY, Hsiao PJ, Lee KW, Wu CW, Juo SH (květen 2009). „Polymorfismy genu pro glutathionperoxidázu 3 a riziko diferencované rakoviny štítné žlázy“. Chirurgická operace. 145 (5): 508–13. doi:10.1016 / j.surg.2008.12.008. PMID 19375609.
Holtzman JL (2002). „Úloha nízkých hladin peroxidázy a glutathionu závislých na glutathionu v séru a vysokých hladin sérového homocysteinu ve vývoji kardiovaskulárních onemocnění“. Klinická laboratoř. 48 (3–4): 129–30. PMID 11934214.
Fullerton JM, Tiwari Y, Agahi G, Heath A, Berk M, Mitchell PB, Schofield PR (srpen 2010). "Hodnocení genů oxidační dráhy jako rizikových faktorů pro bipolární poruchu". Bipolární poruchy. 12 (5): 550–6. doi:10.1111 / j.1399-5618.2010.00834.x. PMID 20712757.
Hosgood HD, Zhang L, Shen M, Berndt SI, Vermeulen R, Li G a kol. (Prosinec 2009). „Sdružení mezi genetickými variantami VEGF, ERCC3 a hematotoxicitou z povolání benzenu. Pracovní a environmentální medicína. 66 (12): 848–53. doi:10.1136 / oem.2008.044024. PMC 2928224. PMID 19773279.
Liang XS, Caporaso N, McMaster ML, Ng D, Landgren O, Yeager M a kol. (Srpen 2009). „Běžné genetické varianty v kandidátských genech a riziko familiárních lymfoidních malignit“. British Journal of Hematology. 146 (4): 418–23. doi:10.1111 / j.1365-2141.2009.07790.x. PMC 2890251. PMID 19573080.
Hosgood HD, Menashe I, He X, Chanock S, Lan Q (prosinec 2009). „PTEN identifikován jako důležitý rizikový faktor chronické obstrukční plicní nemoci“. Respirační medicína. 103 (12): 1866–70. doi:10.1016 / j.rmed.2009.06.016. PMC 2783799. PMID 19625176.
Mistry HD, Kurlak LO, Williams PJ, Ramsay MM, Symonds ME, Broughton Pipkin F (květen 2010). „Diferenciální exprese a distribuce placentárních glutathionperoxidáz 1, 3 a 4 v normálním a preeklamptickém těhotenství“ (PDF). Placenta. 31 (5): 401–8. doi:10.1016 / j.placenta.2010.02.011. PMID 20303587.
Hosgood HD, Menashe I, Shen M, Yeager M, Yuenger J, Rajaraman P a kol. (Říjen 2008). „Hodnocení 380 kandidátních genů a náchylnost k rakovině plic založené na dráze naznačuje důležitost dráhy buněčného cyklu“. Karcinogeneze. 29 (10): 1938–43. doi:10.1093 / carcin / bgn178. PMC 2722857. PMID 18676680.
Iida R, Tsubota E, Yuasa I, Takeshita H, Yasuda T (duben 2009). "Simultánní genotypizace 11 nesynonymních SNP ve 4 genech glutathionperoxidázy pomocí metody multiplexního rozšíření o jednu základnu". Clinica Chimica Acta; International Journal of Clinical Chemistry. 402 (1–2): 79–82. doi:10.1016 / j.cca.2008.12.027. PMID 19161995.
Talmud PJ, Drenos F, Shah S, Shah T, Palmen J, Verzilli C a kol. (Listopad 2009). „Genově centrické asociační signály pro lipidy a apolipoproteiny identifikované prostřednictvím HumanCVD BeadChip“. American Journal of Human Genetics. 85 (5): 628–42. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.10.014. PMC 2775832. PMID 19913121.
Wang JY, Yang IP, Wu DC, Huang SW, Wu JY, Juo SH (říjen 2010). „Funkční polymorfismy glutathionperoxidázy 3 spojené se zvýšeným rizikem tchajwanských pacientů s rakovinou žaludku“. Clinica Chimica Acta; International Journal of Clinical Chemistry. 411 (19–20): 1432–6. doi:10.1016 / j.cca.2010.05.026. PMID 20576521.
Westphal K, Stangl V, Fähling M, Dreger H, Weller A, Baumann G a kol. (Prosinec 2009). "Lidská specifická indukce glutathionperoxidázy-3 inhibicí proteazomu v kardiovaskulárních buňkách". Radikální biologie a medicína zdarma. 47 (11): 1652–60. doi:10.1016 / j.freeradbiomed.2009.09.017. PMID 19766714.
Shen M, Vermeulen R, Rajaraman P, Menashe I, He X, Chapman RS a kol. (Květen 2009). „Polymorfismy v genech vrozené imunity a riziko rakoviny plic v Xuanwei v Číně“. Environmentální a molekulární mutageneze. 50 (4): 285–90. doi:10.1002 / em.20452. PMC 2666781. PMID 19170196.
Saga Y, Ohwada M, Suzuki M, Konno R, Kigawa J, Ueno S, Mano H (prosinec 2008). „Glutathionperoxidáza 3 je kandidátským mechanismem protinádorové rezistence na adenokarcinom z čirých buněk vaječníků“. Zprávy o onkologii. 20 (6): 1299–303. doi:10,3892 / nebo_00000144. PMID 19020706.
Zhang X, Yang JJ, Kim YS, Kim KY, Ahn WS, Yang S (únor 2010). „Podpis 8 genů, včetně methylované a down-regulované glutathionperoxidázy 3, rakoviny žaludku“. International Journal of Oncology. 36 (2): 405–14. doi:10,3892 / ijo_00000513. PMID 20043075.
Chung SS, Kim M, Youn BS, Lee NS, Park JW, Lee IK a kol. (Leden 2009). „Glutathionperoxidáza 3 zprostředkovává antioxidační účinek gama receptoru aktivovaného proliferátorem peroxisomu v buňkách lidského kosterního svalstva“. Molekulární a buněčná biologie. 29 (1): 20–30. doi:10.1128 / MCB.00544-08. PMC 2612482. PMID 18936159.
Wang Y, Fu W, Xie F, Wang Y, Chu X, Wang H a kol. (Srpen 2010). „Běžné polymorfismy v ITGA2, PON1 a THBS2 jsou spojeny s koronární aterosklerózou ve studii asociace kandidátských genů čínské populace Han“. Journal of Human Genetics. 55 (8): 490–4. doi:10.1038 / jhg.2010.53. PMID 20485444.
Moyer AM, Sun Z, Batzler AJ, Li L, Schaid DJ, Yang P, Weinshilboum RM (březen 2010). "Glutathionová cesta genetické polymorfismy a přežití rakoviny plic po chemoterapii na bázi platiny". Epidemiologie rakoviny, biomarkery a prevence. 19 (3): 811–21. doi:10.1158 / 1055-9965.EPI-09-0871. PMC 2837367. PMID 20200426.
Bailey SD, Xie C, Do R, Montpetit A, Diaz R, Mohan V a kol. (Říjen 2010). „Variace na lokusu NFATC2 zvyšuje riziko edému vyvolaného thiazolidindionem ve studii Diabetes REduction Assessment ve studii Ramipril and Rosiglitazone Medication (DREAM)“. Péče o cukrovku. 33 (10): 2250–3. doi:10.2337 / dc10-0452. PMC 2945168. PMID 20628086.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P22352 (Glutathionperoxidáza 3) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000211445 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018339 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: glutathionperoxidáza 3 (plazma)“.

[pmid3619451-6] Takahashi K, Avissar N, Whitin J, Cohen H (srpen 1987). „Čištění a charakterizace lidské plazmy glutathionperoxidázy: selenoglykoprotein odlišný od známého buněčného enzymu“. Archivy biochemie a biofyziky. 256 (2): 677–86. doi:10.1016/0003-9861(87)90624-2. PMID 3619451.

[pmid8287691-7] Chu FF (1994). "Lidské geny pro glutathionperoxidázu GPX2, GPX3 a GPX4 mapují chromozomy 14, 5 a 19, v uvedeném pořadí". Cytogenetika a genetika buněk. 66 (2): 96–8. doi:10.1159/000133675. PMID 8287691.

[8] Takebe G, Yarimizu J, Saito Y, Hayashi T, Nakamura H, Yodoi J a kol. (Říjen 2002). „Srovnávací studie o hydroperoxidové a thiolové specificitě rodiny glutathionperoxidázy a selenoproteinu P“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 41254–8. doi:10,1074 / jbc.M202773200. PMID 12185074.

[9] Razygraev AV, Taborskaya KI, Petrosyan MA, Tumasova Z (květen 2016). "[Činnosti thiolperoxidázy v krevní plazmě potkanů stanovené pomocí peroxidu vodíku a 5,5'-dithio-bis (2-nitrobenzoové kyseliny)]" ". Biomeditsinskaia Khimiia. 62 (4): 431–8. doi:10.18097 / PBMC20166204431. PMID 27562997.

[Razygraev_2019-10] A ^b Razygraev AV, Petrosyan MA, Tumasova ZN, Taborskaya KI, Polyanskikh LS, Baziian EV, Balashova NN (2019). "Změny v aktivitě glutathionperoxidázy v krevní plazmě a séru potkanů během postnatálního vývoje a stárnutí". Pokroky v gerontologii. 9 (3): 283–288. doi:10.1134 / s2079057019030147. S2CID 202570586.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Oxidoreduktázy: peroxidázy (ES 1.11)
1.11.1.1-14	NADH peroxidáza NADPH peroxidáza Mastná kyselina peroxidáza Kataláza Cytochrom c peroxidáza Eosinofilní peroxidáza Glutathionperoxidáza GPX 1 2 3 4 5 6 7 8 Křenová peroxidáza Laktoperoxidáza Myeloperoxidáza Peroxidáza štítné žlázy Deiodináza Jodothyronin deiodinase Jodotyrosin deiodinase
1.11.1.15 (peroxiredoxin )	1 2 3 4 5 6

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )