Peroxiredoxin 2 - Peroxiredoxin 2

PRDX2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1QMV
Identifikátory
Aliasy	PRDX2, HEL-S-2a, NKEF-B, NKEFB, PRP, PRX2, PRXII, PTX1, TDPX1, TPX1, TSA, peroxiredoxin 2
Externí ID	OMIM: 600538 MGI: 109486 HomoloGene: 21182 Genové karty: PRDX2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	12,801,800 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	84,974,834 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita oxidoreduktázy; • antioxidační aktivita; • aktivita peroxiredoxinu; • aktivita peroxidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita thioredoxinperoxidázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární exosom; • cytosol;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • negativní regulace apoptotického procesu; • oxidačně-redukční proces; • katabolický proces peroxidu vodíku; • redoxní homeostáza buněk; • reakce na oxidační stres; • buněčná odpověď na oxidační stres; • odstranění superoxidových radikálů; • aktivace aktivity MAPK; • respirační vzplanutí zapojené do zánětlivé odpovědi; • regulace metabolismu peroxidu vodíku; • pozitivní regulace srážení krve; • negativní regulace lipopolysacharidem zprostředkované signální dráhy; • negativní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • reakce na lipopolysacharid; • Proliferace T buněk; • metabolický proces peroxidu vodíku; • negativní regulace diferenciace T buněk; • vývoj brzlíku; • homeostáza počtu buněk; • negativní regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy v nepřítomnosti ligandu; • aktivace leukocytů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7001
	21672
	ENSG00000167815
	ENSMUSG00000005161
	P32119
	Q61171
	NM_181738; NM_005809; NM_181737
	NM_011563; NM_001317385
	NP_005800
	NP_001304314; NP_035693
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Peroxiredoxin-2 je protein že u lidí je kódován PRDX2 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena peroxiredoxin rodina antioxidantů enzymy, které snižují peroxid vodíku a alkylhydroperoxidy. Kódovaný protein může hrát antioxidační ochrannou roli v buňkách a může přispívat k antivirové aktivitě CD8 (+) T-buněk. Tento protein může mít proliferativní účinek a hrát roli ve vývoji nebo progresi rakoviny. Krystalová struktura tohoto proteinu byla rozdělena na 0,27 nm (= 2,7 angstromů). Pro tento gen byly identifikovány varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167815 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005161 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pahl P, Berger R, Hart I, Chae HZ, Rhee SG, Patterson D (srpen 1995). „Lokalizace TDPX1, lidského homologu genu kvasinkové thioredoxin-dependentní peroxidreduktázy (TPX), do chromozomu 13q12“. Genomika. 26 (3): 602–6. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80183-M. PMID 7607688.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PRDX2 peroxiredoxin 2“.

Další čtení

Yao Y, Taylor M, Davey F, RenY, Aiton J, Coote P, Chen X, Yan SD & Gunn-Moore FJ. (2007). „Interakce s amyloidem vázajícím alkohol-dehydrogenázu / Ap zprostředkovává up-regulaci peroxiredoxinu II v mozku pacientů s Alzheimerovou chorobou a myší model transgenní Alzheimerovy choroby“. Molekulární a buněčná neurověda. 35 (2): 377–82. doi:10.1016 / j.mcn.2007.03.013. PMID 17490890. S2CID 2415008.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
Rasmussen HH, van Damme J, Puype M a kol. (1993). „Mikrosekvence 145 proteinů zaznamenané v databázi dvourozměrných gelových proteinů normálních lidských epidermálních keratinocytů“. Elektroforéza. 13 (12): 960–9. doi:10,1002 / elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774.
Shau H, Butterfield LH, Chiu R, Kim A (1994). „Klonování a sekvenční analýza kandidátních genů faktorů zvyšujících přirozený zabiják člověka“. Imunogenetika. 40 (2): 129–34. doi:10.1007 / BF00188176. PMID 8026862. S2CID 7778993.
Chae HZ, Robison K, Poole LB a kol. (1994). „Klonování a sekvenování thiolově specifického antioxidantu z mozku savců: alkylhydroperoxidreduktáza a thiolově specifický antioxidant definují velkou skupinu antioxidačních enzymů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (15): 7017–21. doi:10.1073 / pnas.91.15.7017. PMC 44329. PMID 8041738.
Lim YS, Cha MK, Yun CH a kol. (1994). „Čištění a charakterizace thiolově specifického antioxidačního proteinu z lidských červených krvinek: nový typ antioxidačního proteinu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 199 (1): 199–206. doi:10.1006 / bbrc.1994.1214. PMID 8123012.
Lim YS, Cha MK, Kim HK, Kim IH (1994). „Thiol-specifický antioxidační protein z lidského mozku: klonování genů a analýza konzervovaných cysteinových oblastí“. Gen. 140 (2): 279–84. doi:10.1016/0378-1119(94)90558-4. PMID 8144038.
Golaz O, Hughes GJ, Frutiger S a kol. (1994). „Plazmatické mapy bílkovin a červených krvinek: aktualizace z roku 1993“. Elektroforéza. 14 (11): 1223–31. doi:10,1002 / elps.11501401183. PMID 8313871. S2CID 21447827.
Cha MK, Kim IH (1996). "Thathioperoxidázová aktivita lidského sérového albuminu spojená s glutathionem: možná antioxidační role sérového albuminu v krevní plazmě". Biochem. Biophys. Res. Commun. 222 (2): 619–25. doi:10.1006 / bbrc.1996.0793. PMID 8670254.
Ji H, Reid GE, Moritz RL a kol. (1997). "Dvojrozměrná gelová databáze proteinů lidského karcinomu tlustého střeva". Elektroforéza. 18 (3–4): 605–13. doi:10,1002 / elps.1150180344. PMID 9150948. S2CID 25454450.
Wang ZM, Liu C, Dziarski R (2000). „Chemokiny jsou hlavními prozánětlivými mediátory v lidských monocytech aktivovaných Staphylococcus aureus, peptidoglykanem a endotoxinem“. J. Biol. Chem. 275 (27): 20260–7. doi:10,1074 / jbc.M909168199. PMID 10751418.
Cha MK, Yun CH, Kim IH (2000). "Interakce lidského thiol-specifického antioxidačního proteinu 1 s erytrocytovou plazmatickou membránou". Biochemie. 39 (23): 6944–50. doi:10.1021 / bi000034j. PMID 10841776.
Schröder E, Littlechild JA, Lebedev AA a kol. (2000). "Krystalová struktura dekamerního 2-Cys peroxiredoxinu z lidských erytrocytů při rozlišení 1,7". Struktura. 8 (6): 605–15. doi:10.1016 / S0969-2126 (00) 00147-7. PMID 10873855.
Harris JR, Schröder E, Isupov MN, et al. (2001). „Srovnání dekamerické struktury peroxiredoxinu-II transmisní elektronovou mikroskopií a rentgenovou krystalografií“. Biochim. Biophys. Acta. 1547 (2): 221–34. doi:10.1016 / s0167-4838 (01) 00184-4. PMID 11410278.
Noh DY, Ahn SJ, Lee RA a kol. (2001). "Nadměrná exprese peroxiredoxinu u lidské rakoviny prsu". Anticancer Res. 21 (3B): 2085–90. PMID 11497302.
Kim SH, Fountoulakis M, Cairns N, Lubec G (2002). „Hladiny bílkovin v lidském podtypu peroxiredoxinu v mozku pacientů s Alzheimerovou chorobou a Downovým syndromem“. J. Neural Transm. Suppl. (61): 223–35. doi:10.1007/978-3-7091-6262-0_18. ISBN 978-3-211-83704-7. PMID 11771746.
Rabilloud T, Heller M, Gasnier F a kol. (2002). „Proteomická analýza buněčné reakce na oxidační stres. Důkazy o in vivo nadměrné oxidaci peroxiredoxinů v jejich aktivním místě“. J. Biol. Chem. 277 (22): 19396–401. doi:10,1074 / jbc.M106585200. PMID 11904290.
Anahory T, Dechaud H, Bennes R a kol. (2002). "Identifikace nových proteinů ve folikulární tekutině zralých lidských folikulů". Elektroforéza. 23 (7–8): 1197–202. doi:10.1002 / 1522-2683 (200204) 23: 7/8 <1197 :: AID-ELPS1197> 3.0.CO; 2-2. PMID 11981869.
Shen C, Nathan C (2002). „Neredundantní antioxidační obrana pomocí více dvou cysteinperoxiredoxinů v lidských buňkách rakoviny prostaty“. Mol. Med. 8 (2): 95–102. doi:10.1007 / BF03402079. PMC 2039972. PMID 12080185.
Geiben-Lynn R, Kursar M, Brown NV a kol. (2003). „Antivirová aktivita HIV-1 rekombinantních faktorů podporujících přirozené zabíječské buňky, NKEF-A a NKEF-B, členů rodiny peroxiredoxinů“. J. Biol. Chem. 278 (3): 1569–74. doi:10,1074 / jbc.M209964200. PMID 12421812.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167815 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005161 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7607688-5] Pahl P, Berger R, Hart I, Chae HZ, Rhee SG, Patterson D (srpen 1995). „Lokalizace TDPX1, lidského homologu genu kvasinkové thioredoxin-dependentní peroxidreduktázy (TPX), do chromozomu 13q12“. Genomika. 26 (3): 602–6. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80183-M. PMID 7607688.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PRDX2 peroxiredoxin 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Oxidoreduktázy: peroxidázy (ES 1.11)
1.11.1.1-14	NADH peroxidáza NADPH peroxidáza Mastná kyselina peroxidáza Kataláza Cytochrom c peroxidáza Eosinofilní peroxidáza Glutathionperoxidáza GPX 1 2 3 4 5 6 7 8 Křenová peroxidáza Laktoperoxidáza Myeloperoxidáza Peroxidáza štítné žlázy Deiodináza Jodothyronin deiodinase Jodotyrosin deiodinase
1.11.1.15 (peroxiredoxin )	1 2 3 4 5 6