FKBP2 - FKBP2

FKBP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2PBC, 4NNR
Identifikátory
Aliasy	FKBP2, FKBP-13, PPIáza, protein vázající FK506 2, FKBP prolylizomeráza 2, FKBP13
Externí ID	OMIM: 186946 MGI: 95542 HomoloGene: 40604 Genové karty: FKBP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	64,244,134 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	6,980,501 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba FK506; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita izomerázy; • aktivita peptidyl-prolyl cis-trans izomerázy;
Buněčná složka	• membrána; • endoplazmatické retikulum; • membrána endoplazmatického retikula;
Biologický proces	• skládání proteinů zprostředkované chaperonem; • proteinová peptidyl-prolyl izomerizace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2286
	14227
	ENSG00000173486
	ENSMUSG00000056629
	P26885
	P45878
	NM_001135208; NM_004470; NM_057092
	NM_001166368; NM_008020; NM_001360286; NM_001360288
	NP_001128680; NP_004461; NP_476433
	NP_001159840; NP_032046; NP_001347215; NP_001347217
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající se na FK506 2 je protein že u lidí je kódován FKBP2 gen.^[5]^[6]

Funkce

The protein kódovaný tímto genem je členem imunofilin rodina proteinů, které hrají roli v imunoregulaci a základních buněčných procesech zahrnujících skládání a obchodování s proteiny. Tento kódovaný protein je a cis-trans prolyl izomeráza který váže imunosupresiva FK506 a rapamycin. Předpokládá se, že funguje jako ER chaperon a může také působit jako složka membránových cytoskeletálních lešení. Tento gen má dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu, které kódují stejnou izoformu. Násobek polyadenylace byla pro tento gen popsána místa, ale povaha tohoto genu v plné délce nebyla stanovena.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že FKBP2 komunikovat s ARFGEF1^[7] a EPB41L2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173486 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056629 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jin YJ, Albers MW, Lane WS, Bierer BE, Schreiber SL, Burakoff SJ (září 1991). "Molekulární klonování membránově asociovaného lidského proteinu vázajícího FK506 a rapamycin, FKBP-13". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (15): 6677–81. doi:10.1073 / pnas.88.15.6677. PMC 52151. PMID 1713687.
^ ^A ^b „Entrez Gene: FKBP2 FK506 binding protein 2, 13kDa“.
^ Padilla PI, Chang MJ, Pacheco-Rodriguez G, Adamik R, Moss J, Vaughan M (březen 2003). „Interakce proteinu 13 vázajícího FK506 s brefeldinem A-inhibovaným proteinem 1 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG1): účinky FK506“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (5): 2322–7. doi:10.1073 / pnas.2628047100. PMC 151339. PMID 12606707.
^ Walensky LD, Gascard P, Fields ME, Blackshaw S, Conboy JG, Mohandas N, Snyder SH (duben 1998). „13-kD FK506 vazebný protein, FKBP13, interaguje s novým homologem cytoskeletálního proteinu membrány erytrocytů 4.1“. J. Cell Biol. 141 (1): 143–53. doi:10.1083 / jcb.141.1.143. PMC 2132710. PMID 9531554.

Další čtení

DiLella AG, Hawkins A, Craig RJ, Schreiber SL, Griffin CA (1992). "Přiřazení chromozomálních pásem genů kódujících lidský FKBP12 a FKBP13". Biochem. Biophys. Res. Commun. 189 (2): 819–23. doi:10.1016 / 0006-291X (92) 92276-4. PMID 1281998.
Hendrickson BA, Zhang W, Craig RJ, Jin YJ, Bierer BE, Burakoff S, DiLella AG (1993). „Strukturální organizace genů kódujících lidský a myší protein vázající FK506 (FKBP) 13 a srovnání s FKBP1“. Gen. 134 (2): 271–5. doi:10.1016 / 0378-1119 (93) 90106-D. PMID 7505249.
Bush KT, Hendrickson BA, Nigam SK (1994). „Indukce proteinu vázajícího FK506, FKBP13, za podmínek, které špatně skládají proteiny v endoplazmatickém retikulu“. Biochem. J. 303 (Pt 3): 705–8. doi:10.1042 / bj3030705. PMC 1137603. PMID 7526846.
Nigam SK, Jin YJ, Jin MJ, Bush KT, Bierer BE, Burakoff SJ (1993). „Lokalizace proteinu vázajícího FK506, FKBP 13, na lumen endoplazmatického retikula“. Biochem. J. 294 (Pt 2): 511–5. doi:10.1042 / bj2940511. PMC 1134484. PMID 8373365.
Walensky LD, Gascard P, Fields ME, Blackshaw S, Conboy JG, Mohandas N, Snyder SH (1998). „13-kD FK506 vazebný protein, FKBP13, interaguje s novým homologem cytoskeletálního proteinu membrány erytrocytů 4.1“. J. Cell Biol. 141 (1): 143–53. doi:10.1083 / jcb.141.1.143. PMC 2132710. PMID 9531554.
Padilla PI, Chang MJ, Pacheco-Rodriguez G, Adamik R, Moss J, Vaughan M (2003). „Interakce proteinu 13 vázajícího FK506 s brefeldinem A-inhibovaným proteinem 1 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG1): účinky FK506“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (5): 2322–7. doi:10.1073 / pnas.2628047100. PMC 151339. PMID 12606707.
Willingham S, Outeiro TF, DeVit MJ, Lindquist SL, Muchowski PJ (2003). "Kvasinkové geny, které zvyšují toxicitu mutantního fragmentu huntingtinu nebo alfa-synukleinu". Věda. 302 (5651): 1769–72. doi:10.1126 / science.1090389. PMID 14657499. S2CID 43221047.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173486 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056629 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1713687-5] Jin YJ, Albers MW, Lane WS, Bierer BE, Schreiber SL, Burakoff SJ (září 1991). "Molekulární klonování membránově asociovaného lidského proteinu vázajícího FK506 a rapamycin, FKBP-13". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (15): 6677–81. doi:10.1073 / pnas.88.15.6677. PMC 52151. PMID 1713687.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: FKBP2 FK506 binding protein 2, 13kDa“.

[pmid12606707-7] Padilla PI, Chang MJ, Pacheco-Rodriguez G, Adamik R, Moss J, Vaughan M (březen 2003). „Interakce proteinu 13 vázajícího FK506 s brefeldinem A-inhibovaným proteinem 1 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG1): účinky FK506“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (5): 2322–7. doi:10.1073 / pnas.2628047100. PMC 151339. PMID 12606707.

[pmid9531554-8] Walensky LD, Gascard P, Fields ME, Blackshaw S, Conboy JG, Mohandas N, Snyder SH (duben 1998). „13-kD FK506 vazebný protein, FKBP13, interaguje s novým homologem cytoskeletálního proteinu membrány erytrocytů 4.1“. J. Cell Biol. 141 (1): 143–53. doi:10.1083 / jcb.141.1.143. PMC 2132710. PMID 9531554.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )