ARFGEF1 - ARFGEF1

ARFGEF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3LTL, 5EE5
Identifikátory
Aliasy	ARFGEF1, ARFGEP1, BIG1, P200, ADP ribosylační faktor guaninový nukleotidový výměnný faktor 1
Externí ID	OMIM: 604141 MGI: 2442988 HomoloGene: 4687 Genové karty: ARFGEF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	67,343,781 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	10,232,670 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • Aktivita výměnného faktoru ARF guanyl-nukleotid; • vazba myosinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba regulační podjednotky proteinkinázy A.;
Buněčná složka	• cytosol; • Golgiho aparát; • membrána; • jaderná matice; • Golgiho membrána; • nukleoplazma; • trans-Golgiho síť; • jádro; • malý nukleární ribonukleoproteinový komplex; • perinukleární oblast cytoplazmy; • buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• organizace endomembránového systému; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.; • negativní regulace polymerace aktinových vláken; • Golgiho organizace; • pozitivní regulace hojení ran; • regulace přenosu signálu proteinu ARF; • pozitivní regulace glykosylace proteinů u Golgiho; • GO: 0034259 negativní regulace aktivity GTPázy; • transport bílkovin; • vývoj neuronové projekce; • regulace stanovení polarity buněk; • exocytóza; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • transport zprostředkovaný vezikuly;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10565
	211673
	ENSG00000066777
	ENSMUSG00000067851
	Q9Y6D6
	G3X9K3
	NM_006421
	NM_001102430
	NP_006412
	NP_001095900
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Brefeldin A-inhibovaný guaninový nukleotidový výměnný protein 1 je protein že u lidí je kódován ARFGEF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Faktory ADP-ribosylace (ARF) hrají důležitou roli v intracelulárním vezikulárním obchodování. Protein kódovaný tímto genem se podílí na aktivaci ARF urychlením nahrazení vázaného GDP GTP. Obsahuje doménu Sec7, která může být zodpovědná za aktivitu výměny guanin-nukleotid a také za inhibici brefeldinu A.^[7]

Interakce

ARFGEF1 bylo prokázáno komunikovat s FKBP2,^[8] ARFGEF2^[9] a PRKAR1A.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000066777 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067851 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Togawa A, Morinaga N, Ogasawara M, Moss J, Vaughan M (duben 1999). "Čištění a klonování brefeldin A-inhibovaného guaninového nukleotidového výměnného proteinu pro ADP-ribosylační faktory". The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12308–15. doi:10.1074 / jbc.274.18.12308. PMID 10212200.
^ Morinaga N, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (listopad 1996). „Izolace proteinu pro výměnu guaninových nukleotidů s inhibicí brefeldinu A pro ribosylační faktor ADP 1 a ARF3, který obsahuje doménu podobnou Sec7“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (23): 12856–60. doi:10.1073 / pnas.93.23.12856. PMC 24010. PMID 8917509.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARFGEF1 ADP-ribosylační faktor guaninový nukleotidový výměnný faktor 1 (brefeldin A-inhibovaný)“.
^ Padilla PI, Chang MJ, Pacheco-Rodriguez G, Adamik R, Moss J, Vaughan M (březen 2003). „Interakce proteinu 13 vázajícího FK506 s brefeldinem A-inhibovaným proteinem 1 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG1): účinky FK506“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (5): 2322–7. doi:10.1073 / pnas.2628047100. PMC 151339. PMID 12606707.
^ Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (březen 2000). "Identifikace a lokalizace dvou brefeldinem A inhibovaných guaninových nukleotidových výměnných proteinů pro ADP-ribosylační faktory v makromolekulárním komplexu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2567–72. doi:10.1073 / pnas.97.6.2567. PMC 15969. PMID 10716990.
^ Li H, Adamik R, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (únor 2003). „Domény kotvící bílkoviny A (AKAP) v proteinu 2 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG2) s inhibicí brefeldinu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (4): 1627–32. doi:10.1073 / pnas.0337678100. PMC 149883. PMID 12571360.

externí odkazy

Člověk ARFGEF1 umístění genomu a ARFGEF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Mansour SJ, Skaug J, Zhao XH, Giordano J, Scherer SW, Melançon P (červenec 1999). „p200 ARF-GEP1: a Golgiho lokalizovaný guanin nukleotidový výměnný protein, jehož doména Sec7 je zaměřena na lék brefeldin A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (14): 7968–73. doi:10.1073 / pnas.96.14.7968. PMC 22171. PMID 10393931.
Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (březen 2000). "Identifikace a lokalizace dvou brefeldinem A inhibovaných guaninových nukleotidových výměnných proteinů pro ADP-ribosylační faktory v makromolekulárním komplexu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2567–72. doi:10.1073 / pnas.97.6.2567. PMC 15969. PMID 10716990.
Kamei Y, Takeda Y, Teramoto K, Tsutsumi O, Taketani Y, Watanabe K (říjen 2000). „Lidský NB-2 molekul podskupiny kontaktinu: chromozomální lokalizace genu (CNTN5) a odlišný vzor exprese od ostatních členů podskupiny“. Genomika. 69 (1): 113–9. doi:10.1006 / geno.2000.6310. PMID 11013081.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Otsuki T, Sugiyama T, Irie R a kol. (Leden 2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Genetika přírody. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Padilla PI, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (březen 2004). „Nukleární lokalizace a molekulární partneři BIG1, proteinu pro výměnu guaninového nukleotidu pro inhibici brefeldinu A pro ADP-ribosylační faktory“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (9): 2752–7. doi:10.1073 / pnas.0307345101. PMC 365693. PMID 14973189.
Saeki N, Tokuo H, Ikebe M (březen 2005). „BIG1 je vazebným partnerem myosinu IXb a reguluje aktivitu proteinu aktivujícího Rho-GTPázu“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (11): 10128–34. doi:10,1074 / jbc.M413415200. PMID 15644318.
Citterio C, Jones HD, Pacheco-Rodriguez G, Islam A, Moss J, Vaughan M (únor 2006). „Vliv protein kinázy A na akumulaci proteinu 1 (BIG1) s inhibicí brefeldinu A v buněčných jádrech HepG2“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (8): 2683–8. doi:10.1073 / pnas.0510571103. PMC 1413798. PMID 16467138.
Belov GA, Altan-Bonnet N, Kovtunovych G, Jackson CL, Lippincott-Schwartz J, Ehrenfeld E (leden 2007). „Únos složek buněčné sekreční dráhy pro replikaci poliovirové RNA“. Journal of Virology. 81 (2): 558–67. doi:10.1128 / JVI.01820-06. PMC 1797456. PMID 17079330.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Shen X, Hong MS, Moss J, Vaughan M (leden 2007). „Pro správnou glykosylaci a funkci integrinu beta1 je nutný BIG1, protein pro výměnu guaninových nukleotidů s inhibicí brefeldinu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (4): 1230–5. doi:10.1073 / pnas.0610535104. PMC 1783117. PMID 17227842.
Kuroda F, Moss J, Vaughan M (únor 2007). „Regulace aktivity proteinu 1 (BIG1) a BIG2-inhibovaného guaninovým nukleotidovým výměníkem prostřednictvím PKA a proteinové fosfatázy 1gamma“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (9): 3201–6. doi:10.1073 / pnas.0611696104. PMC 1805514. PMID 17360629.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000066777 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067851 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10212200-5] Togawa A, Morinaga N, Ogasawara M, Moss J, Vaughan M (duben 1999). "Čištění a klonování brefeldin A-inhibovaného guaninového nukleotidového výměnného proteinu pro ADP-ribosylační faktory". The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12308–15. doi:10.1074 / jbc.274.18.12308. PMID 10212200.

[pmid8917509-6] Morinaga N, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (listopad 1996). „Izolace proteinu pro výměnu guaninových nukleotidů s inhibicí brefeldinu A pro ribosylační faktor ADP 1 a ARF3, který obsahuje doménu podobnou Sec7“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (23): 12856–60. doi:10.1073 / pnas.93.23.12856. PMC 24010. PMID 8917509.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ARFGEF1 ADP-ribosylační faktor guaninový nukleotidový výměnný faktor 1 (brefeldin A-inhibovaný)“.

[pmid12606707-8] Padilla PI, Chang MJ, Pacheco-Rodriguez G, Adamik R, Moss J, Vaughan M (březen 2003). „Interakce proteinu 13 vázajícího FK506 s brefeldinem A-inhibovaným proteinem 1 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG1): účinky FK506“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (5): 2322–7. doi:10.1073 / pnas.2628047100. PMC 151339. PMID 12606707.

[pmid10716990-9] Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (březen 2000). "Identifikace a lokalizace dvou brefeldinem A inhibovaných guaninových nukleotidových výměnných proteinů pro ADP-ribosylační faktory v makromolekulárním komplexu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2567–72. doi:10.1073 / pnas.97.6.2567. PMC 15969. PMID 10716990.

[pmid12571360-10] Li H, Adamik R, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (únor 2003). „Domény kotvící bílkoviny A (AKAP) v proteinu 2 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG2) s inhibicí brefeldinu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (4): 1627–32. doi:10.1073 / pnas.0337678100. PMC 149883. PMID 12571360.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]