Transportér spojený se zpracováním antigenu - Transporter associated with antigen processing

transportér 1, kazeta vázající ATP, podskupina B (MDR / TAP)
Identifikátory
SymbolTAP1
Alt. symbolyABCB2
Gen NCBI6890
HGNC43
OMIM170260
RefSeqNM_000593
UniProtQ03518
Další údaje
MístoChr. 6 p21.3
transportér 2, kazeta vázající ATP, podskupina B (MDR / TAP)
Identifikátory
SymbolTAP2
Alt. symbolyABCB3
Gen NCBI6891
HGNC44
OMIM170261
RefSeqNM_000544
UniProtQ03519
Další údaje
MístoChr. 6 p21.3

Transportér spojený se zpracováním antigenu (TAP) proteinový komplex patří do Rodina transportérů vazebných kazet ATP.[1] Dodává cytosolické peptidy do endoplazmatické retikulum (ER), kde se váží na rodící se MHC třída I molekuly.[2]

Struktura TAP je tvořena dvěma proteiny: TAP-1 a TAP-2, které mají vždy jednu hydrofobní oblast a jednu oblast vázající ATP. Shromažďují se do heterodimeru, jehož výsledkem je transportér se čtyřmi doménami.[3]

Funkce

Transportér TAP se nachází v lumenu ER spojeném s komplex s obsahem peptidů (PLC). Tento komplex β2 mikroglobulin, kalretikulin, ERp57, TAP, tapasin, a MHC třída I působí tak, že drží molekuly MHC, dokud nejsou plně nabité peptidy.[4]

Transport peptidů

Transport peptidů zprostředkovaný TAP je vícestupňový proces. Kapsa vázající peptid je tvořena TAP-1 a TAP-2. Asociace s TAP je událost nezávislá na ATP, „v rychlém bimolekulárním kroku asociace se peptid váže na TAP a následuje pomalá izomerizace komplexu TAP“.[5] Předpokládá se, že konformační změna struktury spouští hydrolýzu ATP, a tak iniciuje transport peptidů.[6]

Obě nukleotidové vazebné domény (NBD) jsou vyžadovány pro peptidovou translokaci, protože každý NBD nemůže hydrolyzovat samotný ATP. Přesný mechanismus dopravy není znám; nálezy však naznačují, že ATP vazba na TAP-1 je počátečním krokem v transportním procesu a že ATP vázaná na TAP-1 indukuje ATP vazbu v TAP-2. Ukázalo se také, že odpojení načteného MHC třídy I je spojeno s transportním cyklem TAP způsobeným signály z podjednotky TAP-1.[7]

Transport mRNA z jádra

Kvasinkový protein Mex67p a lidský NXF1, také nazývaný TAP, jsou dva nejlépe charakterizované NXF (faktory jaderného transportu). TAP zprostředkovávají interakci messengerové ribonukleoproteinové částice (mRNP) a komplexu jaderných pórů (NPC). NXF nemají žádnou podobnost s prototypovými nukleárními transportními receptory rodiny importin - exportin (karyofherin) a chybí jim charakteristická Ran-vazebná doména nalezená ve všech karyofheriny.

Specifičnost

Aktivita ATPázy TAP je vysoce závislá na přítomnosti správného substrátu a peptidová vazba je předpokladem pro hydrolýzu ATP. Tím se zabrání plýtvání ATP hydrolýzou nezávislou na peptidu.[6]

Specifičnost TAP proteinů byla nejprve zkoumána zachycením peptidů v ER pomocí glykosylace. TAP se váže na peptidy s 8 až 16 zbytky se stejnou afinitou, zatímco translokace je nejúčinnější pro peptidy s délkou 8 až 12 zbytků. Účinnost se snižuje u peptidů delších než 12 zbytků.[8] Peptidy s více než 40 zbytky však byly translokovány, i když s nízkou účinností. Peptidy s nízkou afinitou k molekule MHC třídy I jsou transportovány z ER účinným exportním proteinem závislým na ATP. Tyto nastíněné mechanismy mohou představovat mechanismus zajišťující, že se na MHC třídy I váží pouze peptidy s vysokou afinitou.[9]

Viz také

Reference

  1. ^ Daumke O, Knittler MR (2001). „Funkční asymetrie ATP-vazebných kazet ABC transportéru TAP je dána vnitřními vlastnostmi nukleotidových vazebných domén.“ Eur. J. Biochem. 268 (17): 4776–86. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02406.x. PMID  11532014.
  2. ^ Suh WK, Cohen-Doyle MF, Fruh K, Wang K, Peterson PA, Williams DB (1994). "Interakce molekul MHC třídy I s transportérem spojeným se zpracováním antigenu". Věda. 264 (5163): 1322–6. doi:10.1126 / science.8191286. PMID  8191286.
  3. ^ Janeway CA, Travers P, Walport M, Shlomchik M (2001). „Kapitola 5, Prezentace antigenu T-lymfocytům“. V Janeway, Charles (ed.). Imunobiologie: imunitní systém ve zdraví a nemoci (5. vydání). New York: Garland. ISBN  0-8153-3642-X.
  4. ^ Antoniou AN, Powis SJ, Elliott T (2003). "Sestavení a export peptidů ligandů MHC třídy I". Curr. Opin. Immunol. 15 (1): 75–81. doi:10.1016 / S0952-7915 (02) 00010-9. PMID  12495737.
  5. ^ van Endert PM, Tampé R, Meyer TH, Tisch R, Bach JF, McDevitt HO (1994). "Sekvenční model pro peptidovou vazbu a transport transportéry spojenými se zpracováním antigenu". Imunita. 1 (6): 491–500. doi:10.1016/1074-7613(94)90091-4. PMID  7895159.
  6. ^ A b Neumann L, Tampé R (1999). „Kinetická analýza vazby peptidu na transportní komplex TAP: důkazy o strukturních přeskupeních vyvolaných vazbou na substrát“. J. Mol. Biol. 294 (5): 1203–13. doi:10.1006 / jmbi.1999.3329. PMID  10600378. S2CID  38730297.
  7. ^ Alberts P, Daumke O, Deverson EV, Howard JC, Knittler MR (2001). "Výrazné funkční vlastnosti podjednotek TAP koordinují transportní cyklus závislý na nukleotidech". Curr. Biol. 11 (4): 242–51. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00073-2. PMID  11250152. S2CID  16476417.
  8. ^ Neefjes JJ, Momburg F, Hämmerling GJ (1993). "Selektivní a ATP závislá translokace peptidů transportérem kódovaným MHC". Věda. 261 (5122): 769–71. doi:10.1126 / science.8342042. PMID  8342042.
  9. ^ Lankat-Buttgereit B, Tampé R (2002). „Transportér spojený se zpracováním antigenu: funkce a důsledky pro lidské nemoci“. Physiol. Rev. 82 (1): 187–204. doi:10.1152 / physrev.00025.2001. PMID  11773612. S2CID  12508247.

externí odkazy