TAP2 - TAP2

TAP2
Identifikátory
Aliasy	TAP2, ABC18, ABCB3, APT2, D6S217E, PSF-2, PSF2, RING11, transportér 2, kazeta vázající ATP, podskupina B (MDR / TAP), transportér 2, kazeta ATP vázající kazetu podrodina B
Externí ID	OMIM: 170261 MGI: 98484 HomoloGene: 37323 Genové karty: TAP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,838,770 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na MHC protein; • Aktivita ATPázy spojená s transmembránovým pohybem látek; • vazba nukleotidů; • Aktivita transmembránového transportéru peptidu spojeného s ATPázou; • aktivita transportéru; • vazba tapasin; • Vazba na protein MHC třídy Ib; • aktivita ATPázy přenášející peptidový antigen; • Aktivita ATPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba TAP1; • ATP vazba; • aktivita peptidového transmembránového transportéru; • Vazba na protein MHC I. třídy; • Vazba TAP2;
Buněčná složka	• TAP komplex; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • integrální součást membrány; • endoplazmatické retikulum; • jaderná skvrna; • membrána fagocytických vezikul; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostorová membrána; • Komplex pro nakládání s peptidy MHC třídy I;
Biologický proces	• adaptivní imunitní odpověď; • proces imunitního systému; • zpracování antigenu a prezentace peptidového antigenu prostřednictvím MHC I. třídy; • zpracování antigenu a prezentace endogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy Ib cestou ER, závislou na TAP; • transmembránová doprava; • transport bílkovin; • transport peptidů; • GO: virový proces 0022415; • transport cytosolu do ER; • zpracování antigenu a prezentace endogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I.; • transport peptidového antigenu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I, TAP-dependentní; • fúze vezikul s membránou endoplazmatického retikula-Golgiho meziprostoru (ERGIC); • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6891
	21355
ENSG00000204267; ENSG00000206299; ENSG00000228582; ENSG00000206235; ENSG00000225967;
	ENSG00000237599; ENSG00000223481; ENSG00000232326
	ENSMUSG00000024339
	Q03519
	P36371
	NM_018833; NM_000544; NM_001290043
	NM_011530
	NP_000535; NP_001276972; NP_061313
	NP_035660
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

TAP2 je gen u lidí, který kóduje protein Antigenový peptidový transportér 2.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Membránově asociovaný protein kódovaný tímto genem je členem nadrodiny transportérů vázajících ATP (ABC). ABC proteiny transportují různé molekuly přes extra- a intracelulární membrány. Geny ABC jsou rozděleny do sedmi odlišných podrodin (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Tento protein je členem podrodiny MDR / TAP. Členové podrodiny MDR / TAP jsou zapojeni do multidrogové rezistence. Tento gen je lokalizován 7 kb telomericky na člena rodiny genové ABCB2 (TAP1 ). Podílí se na proteinu kódovaném tímto genem prezentace antigenu. Tento protein tvoří heterodimer s ABCB2 za účelem transportu peptidů z cytoplazma do endoplazmatické retikulum. Mutace v tomto genu mohou být spojeny s ankylozující spondylitida závislé na inzulínu diabetes mellitus, schizofrenie,^[7] a celiakie. Alternativní sestřih tohoto genu produkuje dva produkty, které se liší peptidovou selektivitou a úrovní obnovení povrchové exprese molekul MHC třídy I.^[8]

Viz také

Transportér kazety vázající ATP

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000206299, ENSG00000228582, ENSG00000206235, ENSG00000225967, ENSG00000237599, ENSG00000223481, ENSG00000232326 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000204267, ENSG00000206299, ENSG00000228582, ENSG00000206235, ENSG00000225967, ENSG00000237599, ENSG00000223481, ENSG00000232326 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bodmer JG, Marsh SG, Albert ED, Bodmer WF, Dupont B, Erlich HA, Mach B, Mayr WR, Parham P, Sasazuki T (říjen 1992). „Nomenklatura pro faktory systému HLA, 1991. Výbor pro nomenklaturu WHO pro faktory systému HLA“. Tkáňové antigeny. 39 (4): 161–73. doi:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb01932.x. PMID 1529427.
^ Bahram S, Arnold D, Bresnahan M, Strominger JL, Spies T (prosinec 1991). „Dvě domnělé podjednotky peptidové pumpy kódované v oblasti lidského hlavního histokompatibilního komplexu třídy II“. Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (22): 10094–8. doi:10.1073 / pnas.88.22.10094. PMC 52874. PMID 1946428.
^ Hahn Y, Lee B (únor 2006). „Humánně specifické nesmyslové mutace identifikované porovnáním sekvencí genomu“. Hum Genet. 119 (1–2): 169–78. doi:10.1007 / s00439-005-0125-6. PMID 16395595. S2CID 21059468.
^ Yu H (2014). "Proteinová interakce - síťová analýza pro analýzu genomové asociační schizofrenie u čínské populace Han". Journal of Psychiatric Research. 50: 73–8. doi:10.1016 / j.jpsychires.2013.11.014. PMID 24365204.
^ „Entrez Gene: TAP2 transportér 2, kazeta vázající ATP, podskupina B (MDR / TAP)“.

Další čtení

Townsend A, Trowsdale J (1993). "Transportéry spojené s prezentací antigenu". Semin. Cell Biol. 4 (1): 53–61. doi:10.1006 / scel.1993.1007. PMID 8453065.
Beck S, Kelly A, Radley E, Khurshid F, Alderton RP, Trowsdale J (1992). "DNA sekvenční analýza 66 kb oblasti lidského MHC třídy II kódující shluk genů pro zpracování antigenu". J. Mol. Biol. 228 (2): 433–41. doi:10.1016/0022-2836(92)90832-5. PMID 1453454.
Kelly A, Powis SH, Kerr LA, Mockridge I, Elliott T, Bastin J, Uchanska-Ziegler B, Ziegler A, Trowsdale J, Townsend A (1992). "Sestava a funkce dvou transportních proteinů ABC kódovaných v lidském hlavním histokompatibilním komplexu". Příroda. 355 (6361): 641–4. doi:10.1038 / 355641a0. PMID 1538751. S2CID 32569414.
Colonna M, Bresnahan M, Bahram S, Strominger JL, Spies T (1992). „Alelické varianty transportéru lidského domnělého peptidu zapojeného do zpracování antigenu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (9): 3932–6. doi:10.1073 / pnas.89.9.3932. PMC 525605. PMID 1570316.
Powis SH, Mockridge I, Kelly A, Kerr LA, Glynne R, Gileadi U, Beck S, Trowsdale J (1992). „Polymorfismus ve druhém genu transportéru ABC lokalizovaném v oblasti třídy II lidského hlavního histokompatibilního komplexu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (4): 1463–7. doi:10.1073 / pnas.89.4.1463. PMC 48471. PMID 1741401.
Trowsdale J, Hanson I, Mockridge I, Beck S, Townsend A, Kelly A (1991). "Sekvence kódované v oblasti třídy II MHC související s nadrodinou transportérů" ABC "." Příroda. 348 (6303): 741–4. doi:10.1038 / 348741a0. PMID 2259383. S2CID 4279033.
de la Salle H, Hanau D, Fricker D, Urlacher A, Kelly A, Salamero J, Powis SH, Donato L, Bausinger H, Laforet M (1994). „Homozygotní mutace transportéru lidského TAP peptidu při deficitu HLA třídy I“. Věda. 265 (5169): 237–41. doi:10.1126 / science.7517574. PMID 7517574.
Cano P, Baxter-Lowe LA (1995). „Nová lidská alela TAP2 * 103 vykazuje další polymorfismus v doméně vázající ATP“. Tkáňové antigeny. 45 (2): 139–42. doi:10.1111 / j.1399-0039.1995.tb02431.x. PMID 7792761.
Roby KF, Fei K, Yang Y, Hunt JS (1995). „Exprese genů pro transport peptidů asociovaných s HLA třídy II a buněčných liniích lidských placent a trofoblastů“. Imunologie. 83 (3): 444–8. PMC 1415039. PMID 7835969.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Singal DP, Ye M, Qiu X, D'Souza M (1994). "Polymorfismy v genu TAP2 a jejich asociace s revmatoidní artritidou". Clin. Exp. Revmatol. 12 (1): 29–33. PMID 8162639.
Powis SH, Tonks S, Mockridge I, Kelly AP, Bodmer JG, Trowsdale J (1993). "Alely a haplotypy MHC kódovaných ABC transportérů TAP1 a TAP2". Imunogenetika. 37 (5): 373–80. doi:10.1007 / BF00216802. PMID 8428770. S2CID 35123181.
Glynne R, Kerr LA, Mockridge I, Beck S, Kelly A, Trowsdale J (1993). "Hlavní složka proteazomu kódovaná komplexem histokompatibility LMP7: alternativní první exony a posttranslační zpracování". Eur. J. Immunol. 23 (4): 860–6. doi:10.1002 / eji.1830230414. PMID 8458375.
Beck S, Abdulla S, Alderton RP, Glynne RJ, Gut IG, Hosking LK, Jackson A, Kelly A, Newell WR, Sanseau P, Radley E, Thorpe KL, Trowsdale J (1996). "Evoluční dynamika nekódujících sekvencí v oblasti třídy II lidského MHC". J. Mol. Biol. 255 (1): 1–13. doi:10.1006 / jmbi.1996.0001. PMID 8568858.
Ahn K, Meyer TH, Uebel S, Sempé P, Djaballah H, Yang Y, Peterson PA, Früh K, Tampé R (1996). "Molekulární mechanismus a druhová specificita inhibice TAP virem herpes simplex ICP47". EMBO J.. 15 (13): 3247–55. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00689.x. PMC 451885. PMID 8670825.
Pattanakitsakul S, Takeuchi F, Nabeta H, Nakano K, Kuwata S, Yanagisawa M, Shibata Y, Ito K (1996). "Nový TAP 2 gen RFLP pozorovaný u Japonce". Tkáňové antigeny. 47 (4): 353–5. doi:10.1111 / j.1399-0039.1996.tb02567.x. PMID 8773329.
Lewis JW, Neisig A, Neefjes J, Elliott T (1997). „Bodové mutace v doméně alfa 2 HLA-A2.1 definují funkčně relevantní interakci s TAP“. Curr. Biol. 6 (7): 873–83. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00611-5. PMID 8805302.

externí odkazy

TAP2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000206299, ENSG00000228582, ENSG00000206235, ENSG00000225967, ENSG00000237599, ENSG00000223481, ENSG00000232326 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000204267, ENSG00000206299, ENSG00000228582, ENSG00000206235, ENSG00000225967, ENSG00000237599, ENSG00000223481, ENSG00000232326 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1529427-4] Bodmer JG, Marsh SG, Albert ED, Bodmer WF, Dupont B, Erlich HA, Mach B, Mayr WR, Parham P, Sasazuki T (říjen 1992). „Nomenklatura pro faktory systému HLA, 1991. Výbor pro nomenklaturu WHO pro faktory systému HLA“. Tkáňové antigeny. 39 (4): 161–73. doi:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb01932.x. PMID 1529427.

[pmid1946428-5] Bahram S, Arnold D, Bresnahan M, Strominger JL, Spies T (prosinec 1991). „Dvě domnělé podjednotky peptidové pumpy kódované v oblasti lidského hlavního histokompatibilního komplexu třídy II“. Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (22): 10094–8. doi:10.1073 / pnas.88.22.10094. PMC 52874. PMID 1946428.

[pmid16395595-6] Hahn Y, Lee B (únor 2006). „Humánně specifické nesmyslové mutace identifikované porovnáním sekvencí genomu“. Hum Genet. 119 (1–2): 169–78. doi:10.1007 / s00439-005-0125-6. PMID 16395595. S2CID 21059468.

[7] Yu H (2014). "Proteinová interakce - síťová analýza pro analýzu genomové asociační schizofrenie u čínské populace Han". Journal of Psychiatric Research. 50: 73–8. doi:10.1016 / j.jpsychires.2013.11.014. PMID 24365204.

[8] „Entrez Gene: TAP2 transportér 2, kazeta vázající ATP, podskupina B (MDR / TAP)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Membránové proteiny, nosné proteiny: membránové transportní proteiny ABC transportér (TC 3A1 )
A	A1 A2 A3 A4 A7 A8 A12 A13
B	B1 B2-3 (B2 B3 ) B4 B5 B6 B7 B9 B11
C	C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8-9 (C8, C9 ) C10 C11 C13
D	D1 D2 D3 D4
E	E1
F	F1 F2
G	G1 G2 G4 Sterolin (G5, G8 )
viz také Poruchy transportéru ABC