Malá Cajalova tělesná specifická RNA - Small Cajal body-specific RNA - Wikipedia

RNA specifická pro malé tělo Cajal 1
RF00553.png
Předpokládaná sekundární struktura RNA specifické pro tělo malého Cajalu 1
Identifikátory
SymbolSCARNA1
RfamRF00553
Další údaje
RNA typgen, snRNA, snoRNA, scaRNA;
DoményObratlovců
PDB strukturPDBe

Malé Cajal tělně specifické RNA (scaRNA) jsou třídou malé nukleolární RNA (snoRNA), které se konkrétně lokalizují do Cajal tělo, a jaderný organela (buněčná sub-organela) podílející se na biogenezi malé nukleární ribonukleoproteiny (snRNPs nebo snurps). Úpravy vedou ScaRNA (methylace a pseudouridylace ) z RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.

První identifikovaná scaRNA byla U85.[1] Je to na rozdíl od typických snoRNA v tom, že se jedná o kompozitní C / D box a H / ACA box snoRNA a může řídit jak pseudouridylaci, tak 2'-O-methylaci. Ne všechny scaRNA jsou složené C / D a H / ACA boxové snoRNA a většina scaRNA je strukturálně a funkčně nerozeznatelná od snoRNA, směrování ribozomální RNA (rRNA) modifikace v jádro.

Drosophila scaRNA

Několik studií identifikovalo scaRNA v Drosophila.[1][2][3][4][5] Jedna ze studií ukázala, že několik Drosophila scaRNA mohou fungovat stejně dobře v nukleoplazmě mutantních mušek, kterým chybí Cajalova těla.[4] Další výzkum ukázal, že scaRNA pugU6-40 cílí na U6 snRNA, jejíž modifikace probíhá v nukleolu, nikoli v CB, a že pugU1-6 a pug U2-55 vedou 2 RNA: snRNA a 28s rRNA.[5]

Malá Cajalova tělně specifická RNA 1

v molekulární biologie „Malá Cajalova tělně specifická RNA 1 (také známá jako SCARNA1 nebo ACA35) je malá nukleolární RNA nalezená v Cajalových tělech a předpokládá se, že se podílí na pseudouridylaci U2 spliceozomální RNA na zbytku U89.

scaRNA1 je a nekódující RNA, což jsou funkční produkty geny ne přeloženo do bílkoviny. Takové molekuly RNA obvykle obsahují důležité sekundární struktura nebo ligandvázací motivy a podílejí se na mnoha důležitých biologických procesech v buňce.[6]

scaRNA1 patří do H / ACA box třída snoRNA, protože má předpokládanou strukturu vlásenka-pant-vlásenka-ocas, konzervované motivy H / ACA-boxu a je spojena s GAR1 protein.[7]

Reference

  1. ^ A b Jády BE, Kiss T (únor 2001). „Malý nukleolární naváděcí RNA funguje jak v methylaci 2′-O-ribózy, tak v pseudouridylaci spliceozomální RNA U5“. Časopis EMBO. 20 (3): 541–551. doi:10.1093 / emboj / 20.3.541. PMC  133463. PMID  11157760.
  2. ^ Tortoriello G, Accardo MC, Scialò F, Angrisani A, Turano M, Furia M (květen 2009). "Nová Drosophila antisense scaRNA s predikovanou vodicí funkcí". Gen. 436 (1–2): 56–65. doi:10.1016 / j.gene.2009.02.005. PMID  19230845.
  3. ^ Tycowski KT, MD Shu, Kukoyi A, Steitz JA (duben 2009). „Konzervovaný protein WD40 váže signál lokalizace těla Cajal z částic scaRNP“. Molekulární buňka. 34 (1): 47–57. doi:10.1016 / j.molcel.2009.02.020. PMC  2700737. PMID  19285445.
  4. ^ A b Deryusheva S, Gall JG (prosinec 2009). „Malé cajalské tělně specifické RNA z Drosophila fungují při absenci cajalových těl“. Molekulární biologie buňky. 20 (24): 5250–5259. doi:10,1091 / mbc.E09-09-0777. PMC  2793299. PMID  19846657.
  5. ^ A b Deryusheva S, Gall JG (prosinec 2013). "Nové malé RNA specifické pro Cajalovo tělo identifikované v Drosophila: funkce průvodce sondováním RNA". RNA. 19 (12): 1802–1814. doi:10.1261 / rna.042028.113. PMC  3884663. PMID  24149844.
  6. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–2756. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  7. ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (červenec 2004). "Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machines". Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5797–5807. doi:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC  480876. PMID  15199136.

externí odkazy