RNA specifická pro malé tělo Cajal 17 - Small Cajal body specific RNA 17

malá Cajalova tělně specifická RNA 17
RF00492.jpg
Identifikátory
Symbol17. SCARNA
Alt. SymbolysnoU12-22
RfamRF00492
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000275
PDB strukturPDBe

Malá Cajalova tělně specifická RNA 17 (také známý jako U12-22 scaRNA) je typ malá jaderná RNA který se lokalizuje do cajal těla a navrhl jako vodítko pro modifikaci RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.[1][2]

Kompletní lidská U12-22 / U4-8 scaRNA se skládá ze dvou tandemů C / D box domény (označované U12-22 a U4-8). The 5 'a 3' Předpokládá se, že C / D domény řídí methylaci 2'O-ribózy zbytku U22 v U12 a zbytku C8 v U4 snRNA.[1] Tato rodina zahrnuje pouze doménu pole 5 'C / D (U12-22), protože pole 3' C / D je reprezentováno RNA specifická pro malé tělo Cajal 18. 3 'C / D doména (U4-8) byla také dříve klonována Darzacqem a byla nazývána U91.[3] Jak dublet (U12-22 / U4-8), tak singlet (U4-8) formy této snRNA byly purifikovány z HeLa buňky. [1] Ukázalo se, že forma dubletu U12-22 / U4-8 je lokalizována do nukleoplazma a navrhuje se, aby pobýval v tělech Cajal, zatímco se zdá, že se v doméně Kumuluje jedna doména U4-8 jádro. [1] U lidí je genomová poloha U12-88 / U4-8 intergenní a bylo prokázáno, že čištěný přepis vlastní a methylovaný guanosinový uzávěr což naznačuje, že je nezávisle transkribován RNA polymerázou II.[1]

Reference

  1. ^ A b C d E Tycowski KT, Aab A, Steitz JA (listopad 2004). „Průvodce RNA s 5 'čepicemi a novými krabičkovými C / D snoRNA podobnými doménami pro modifikaci snRNA v metazoa“. Aktuální biologie. 14 (22): 1985–95. doi:10.1016 / j.cub.2004.11.003. PMID  15556860.
  2. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  3. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.

externí odkazy