RNA specifická pro malé tělo Cajal 24 - Small Cajal body specific RNA 24

RNA specifická pro malé tělo Cajal 24
RF00422.jpg
Identifikátory
SymbolSCARNA24
Alt. SymbolysnoACA12
RfamRF00422
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000275
PDB strukturPDBe

RNA specifická pro malé tělo Cajal 24 (také známý jako scaRNA24 nebo ACA12) je malá nukleolární RNA nalezen v Cajalská těla a předpokládá se, že je zapojen do pseudouridylace (izomerizace z uridin na pseudouridin ) z Spliceozomální RNA U6.

scaRNA jsou specifickou třídou malé nukleolární RNA že lokalizovat do Cajalská těla a řídit úpravy RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.[1]

ACA12 patří do H / ACA box třída naváděcích RNA, protože má předpokládanou strukturu vlásenka-pant-vlásenka-ocas, konzervované motivy boxu H / ACA a je spojena s GAR1 protein.[2] Předpokládá se, že ACA12 řídí pseudouridylaci zbytku U40 spliceosomální U6 snRNA.[2][3]

Reference

  1. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ A b Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (červenec 2004). "Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machines". Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5797–807. doi:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC  480876. PMID  15199136.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy