RNA specifická pro malé tělo Cajal 18 - Small Cajal body specific RNA 18

malá Cajalova tělně specifická RNA 18
RF00283.jpg
Identifikátory
SymbolSCARNA18
Alt. SymbolyU91
RfamRF00283
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000275
PDB strukturPDBe

malá Cajalova tělesná specifická RNA 18 (také známý jako U91 nebo U4-8) je typ malá jaderná RNA který se lokalizuje do cajal těla a navrhl jako vodítko pro modifikaci RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.[1]

Zdá se, že tato snoRNA U91 patří k C / D box třída snoRNA.[2] Identifikoval to Darzacq[1] a předpokládá se, že řídí methylaci 2'O-ribózy U4 snRNA C8. Tato C / D doména byla později shledána přidruženou v tandemu s jinou C / D doménou pole U12-22. Jak dubletové (U12-22 / U4-8), tak singletové (U4-8) formy této snRNA byly purifikovány z buněk Hela.[1] Ukázalo se, že forma dubletu U12-22 / U4-8 se lokalizuje do nukleoplazmy a navrhuje se, aby se nacházela v Cajalových tělech, zatímco se zdá, že se jediná doména U4-8 hromadí v nukleolu.[3] U lidí je genomová poloha U12-88 / U4-8 intergenní a bylo prokázáno, že purifikovaný transkript má methylovanou guanosinovou čepičku, což naznačuje, že je nezávisle transkribována RNA pol II.[3]

Reference

  1. ^ A b C Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. EMBO J.. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  3. ^ A b Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Dodatek 1: Vydání databáze): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy