RNA specifická pro malé tělo Cajal 14 - Small Cajal body specific RNA 14

RNA specifická pro malé tělo Cajal 14
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence SCARNA14
Identifikátory
Symbol	14. SCARNA
Alt. Symboly	snoU100
Rfam	RF00582
Další údaje
RNA typ	Gen; snRNA; snoRNA; scaRNA
Domény	Eukaryota
JÍT	GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAK	SO: 0000275
PDB struktur	PDBe

v molekulární biologie, RNA specifická pro malé tělo Cajal 14 (také známý jako scaRNA14 nebo U100) je malá nukleolární RNA nalezen v Cajalská těla.

scaRNA jsou specifickou třídou malé nukleolární RNA které lokalizují do Cajalská těla a řídit úpravy RNA polymeráza II transkriboval spliceozomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.^[1]^[2]U100 patří do třídy vodicích RNA H / ACA boxu, protože má předpokládanou strukturu vlásenky-pant-vlásenky-ocasy a konzervované motivy H / ACA-boxu.^[3]

U100 je člověk ortolog myší H / ACA snoRNA MBII-201, která je také součástí této rodiny.^[4]Předpokládá se, že U100 řídí pseudouridylaci U2 snRNA ve zbytku U7.^[5]

Reference

^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
^ Vitali P, Royo H, Seitz H, Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (listopad 2003). „Identifikace 13 nových RNA pro lidské úpravy průvodce“. Výzkum nukleových kyselin. 31 (22): 6543–51. doi:10.1093 / nar / gkg849. PMC 275545. PMID 14602913.
^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
^ Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (leden 2006). „Výpočetní obrazovka pro průvodce pseudouridilací savců H / ACA RNA“. RNA. 12 (1): 15–25. doi:10,1261 / rna.2210406. PMC 1370881. PMID 16373490.

externí odkazy

Stránka pro RNA specifickou pro malé tělo Cajal 14 na Rfam

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.

[2] Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

[3] Vitali P, Royo H, Seitz H, Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (listopad 2003). „Identifikace 13 nových RNA pro lidské úpravy průvodce“. Výzkum nukleových kyselin. 31 (22): 6543–51. doi:10.1093 / nar / gkg849. PMC 275545. PMID 14602913.

[4] Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.

[5] Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (leden 2006). „Výpočetní obrazovka pro průvodce pseudouridilací savců H / ACA RNA“. RNA. 12 (1): 15–25. doi:10,1261 / rna.2210406. PMC 1370881. PMID 16373490.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]