Spliceozomální RNA U5 - U5 spliceosomal RNA
| Spliceozomální RNA U5 | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence U5 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | U5 |
| Rfam | RF00020 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; snRNA; sestřih |
| Domény | Eukaryota |
| JÍT | GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0000395 |
| PDB struktur | PDBe |
U5 snRNA je malá jaderná RNA (snRNA), která se účastní Sestřih RNA jako součást spliceosome. Tvoří U5 snRNP (malý nukleární ribonukleoprotein) spojením s několika proteiny včetně Prp8 - největší a nejkonzervovanější protein ve spliceosomu, Brr2 - a helikáza potřebné pro aktivaci spliceosomu, proteiny Snu114 a 7 Sm.[1] U5 snRNA tvoří koaxiálně naskládanou řadu šroubovic, které vyčnívají do aktivního místa spliceosomu.[2][3] Smyčka 1, která uzavírá tuto sérii šroubovic, tvoří během dvou chemických reakcí sestřihu s 5'-exonem 4-5 párů bází.[4][5] Tato interakce se jeví jako obzvláště důležitá během druhého kroku sestřihu, ligace exonu.[6]
Reference
- ^ Stevens SW, Barta I, Ge HY, Moore RE, Young MK, Lee TD, Abelson J (listopad 2001). „Biochemické a genetické analýzy malých jaderných ribonukleoproteinů U5, U6 a U4 / U6 x U5 ze Saccharomyces cerevisiae“. RNA. 7 (11): 1543–53. PMC 1370197. PMID 11720284.
- ^ Nguyen TH, Galej WP, Bai XC, Savva CG, Newman AJ, Scheres SH, Nagai K (červenec 2015). "Architektura spliceosomálního U4 / U6.U5 tri-snRNP". Příroda. 523 (7558): 47–52. doi:10.1038 / příroda14548. PMC 4536768. PMID 26106855.
- ^ Yan C, Hang J, Wan R, Huang M, Wong CC, Shi Y (září 2015). "Struktura kvasinkového spliceosomu při rozlišení 3,6 angstromu". Věda. 349 (6253): 1182–91. doi:10.1126 / science.aac7629. PMID 26292707.
- ^ Newman AJ, Norman C (únor 1992). "U5 snRNA interaguje s exonovými sekvencemi na 5 'a 3' spojovacích místech". Buňka. 68 (4): 743–54. doi:10.1016/0092-8674(92)90149-7. PMID 1739979.
- ^ Sontheimer EJ, Steitz JA (prosinec 1993). „Malé jaderné RNA U5 a U6 jako složky aktivního místa spliceosomu“. Věda. 262 (5142): 1989–96. doi:10.1126 / science.8266094. PMID 8266094.
- ^ O'Keefe RT, Norman C, Newman AJ (srpen 1996). „Invariantní sekvence smyčky 1 sn5NA U5 je postradatelná pro první katalytický krok sestřihu pre-mRNA v kvasinkách“. Buňka. 86 (4): 679–89. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80140-3. PMID 8752221.
Další čtení
- Zwieb C (leden 1997). „Databáze uRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (1): 102–3. doi:10.1093 / nar / 25.1.102. PMC 146409. PMID 9016512.
- Thomas J, Lea K, Zucker-Aprison E, Blumenthal T (květen 1990). „Spliceozomální snRNA Caenorhabditis elegans“. Výzkum nukleových kyselin. 18 (9): 2633–42. doi:10.1093 / nar / 18.9.2633. PMC 330746. PMID 2339054.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |