U12 minoritní spliceozomální RNA - U12 minor spliceosomal RNA

U12 minoritní spliceozomální RNA
RF00007.jpg
Identifikátory
SymbolU12
RfamRF00007
Další údaje
RNA typGen; snRNA; sestřih
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000399
PDB strukturPDBe

U12 minoritní spliceozomální RNA je tvořen z malé jaderné U12 (snRNA ), dohromady s U4atac /U6atac, U5, a U11 snRNA a související proteiny, tvoří a spliceosome který štěpí a odlišný třída pre-abundance pre-mRNA introny. Ačkoli sekvence U12 je velmi odlišná od sekvence U2, dva jsou funkčně analogické.[1] Předpovězeno sekundární struktura je publikována RNA U12,[2] ale alternativní singl sponka do vlasů na zde zobrazeném 3 'konci se zdá, že lépe odpovídá zarovnání divergentního Drosophila melanogaster a Arabidopsis thaliana sekvence.[3] Sekvence intronů U12, které jsou spojeny, jsou shromážděny v a biologická databáze volal Intronová databáze U12.

Reference

  1. ^ Tarn WY, Steitz JA (duben 1997). „Sestřih pre-mRNA: objev nového spliceosomu zdvojnásobuje výzvu“. Trendy v biochemických vědách. 22 (4): 132–7. doi:10.1016 / S0968-0004 (97) 01018-9. PMID  9149533.
  2. ^ Shukla GC, Padgett RA (duben 1999). "Zachování funkčních vlastností snRNA U6atac a U12 mezi obratlovci a vyššími rostlinami". RNA. 5 (4): 525–38. doi:10.1017 / S1355838299982213. PMC  1369779. PMID  10199569.
  3. ^ Otake LR, Scamborova P, Hashimoto C, Steitz JA (únor 2002). „Divergentní spliceosom typu U12 je nutný pro sestřih pre-mRNA a je nezbytný pro vývoj v Drosophile.“ Molekulární buňka. 9 (2): 439–46. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00441-0. PMID  11864616.

externí odkazy