RNA specifická pro malé tělo Cajal 6 - Small Cajal body specific RNA 6
| RNA specifická pro malé tělo Cajal 6 | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence SCARNA6 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | SCARNA6 |
| Alt. Symboly | U88 |
| Rfam | RF00478 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; snRNA; snoRNA; scaRNA |
| Domény | Eukaryota |
| JÍT | GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0000275 |
| PDB struktur | PDBe |
RNA specifická pro malé tělo Cajal 6 (také známý jako SCARNA6 nebo U88) je malá nukleolární RNA nalezen v Cajalská těla a předpokládá se, že je zapojen do pseudouridylace (izomerizace z uridin na pseudouridin ) z Spliceozomální RNA U5.
scaRNA jsou specifickou třídou malé nukleolární RNA že lokalizovat do Cajalská těla a řídit úpravy RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12[1]
U88 je spojen s fibrillarinem i Gar1p a v Cajalových tělech se lokalizuje společně s coilinem.[1]Jedná se o neobvyklou vodicí RNA v tom, že se skládá z obou H / ACA box a a C / D box konzervované domény. Předpokládá se, že povede 2'-Ó-methylace zbytku U41 ze sn5NA U5.[1]
U88 je také úzce příbuzný s jinými lidskými snoRNA scaRNA U87 a myším homologem MBI-46.[2]V lidském genomu sdílejí scaRNA U88 i U87 stejný hostitelský gen.[1][3]
Reference
- ^ A b C d Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
- ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |