RNA specifická pro malé tělo Cajal 20 - Small Cajal body specific RNA 20

RNA specifická pro malé tělo Cajal 20
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence SCARNA20
Identifikátory
Symbol	SCARNA20
Rfam	RF00601
Další údaje
RNA typ	Gen; snRNA; snoRNA; scaRNA
Domény	Eukaryota
JÍT	GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAK	SO: 0000275
PDB struktur	PDBe

v molekulární biologie, RNA specifická pro malé tělo Cajal 20 (také známý jako scaRNA20 nebo ACA66) je malá nukleolární RNA nalezen v Cajalská těla a věřili, že budou zapojeni do pseudouridylace z U12 minoritní spliceosomální RNA.

scaRNA jsou specifickou třídou malé nukleolární RNA že lokalizovat do Cajalská těla a řídit úpravy RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.^[1]

ACA66 (SCARNA20) je členem H / ACA box třída snoRNA, která vede místa modifikace uridinů na pseudouridiny. Tato snoRNA byla identifikována výpočtovým screeningem a její exprese u myší experimentálně ověřena Northern blot a analýza extenze primeru.^[2]Předpokládá se, že ACA66 řídí pseudouridylaci zbytku U28 v U12 snRNA.^[3]

Reference

^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Malé jaderné RNA specifické pro tělo Cajal: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–2756. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
^ Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (leden 2006). „Výpočetní obrazovka pro průvodce pseudouridilací savců H / ACA RNA“. RNA. 12 (1): 15–25. doi:10,1261 / rna.2210406. PMC 1370881. PMID 16373490.
^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

externí odkazy

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid12032087-1] Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Malé jaderné RNA specifické pro tělo Cajal: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–2756. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.

[pmid16373490-2] Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (leden 2006). „Výpočetní obrazovka pro průvodce pseudouridilací savců H / ACA RNA“. RNA. 12 (1): 15–25. doi:10,1261 / rna.2210406. PMC 1370881. PMID 16373490.

[pmid16381836-3] Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

[1]

[2]

[3]